EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000017137 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1398 bases
Position: chrKV884974.1:91729-93126
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000024620	RVT_1	PF00078.27	2.7e-15	1	1

Transcripts

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ENSMALT00000025083	-	1398	-	ENSMALP00000024620	323 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000017137	-	99	54.062	ENSMALG00000002768	-	70	54.062
ENSMALG00000017137	-	63	57.073	ENSMALG00000001646	-	57	57.073
ENSMALG00000017137	-	83	47.636	ENSMALG00000021319	-	95	47.636
ENSMALG00000017137	-	99	54.375	ENSMALG00000001465	-	71	54.375
ENSMALG00000017137	-	89	54.138	ENSMALG00000015519	-	73	54.138
ENSMALG00000017137	-	93	57.807	ENSMALG00000000074	-	54	57.807
ENSMALG00000017137	-	86	40.780	ENSMALG00000015464	-	74	40.780
ENSMALG00000017137	-	99	53.538	ENSMALG00000016365	-	81	53.538
ENSMALG00000017137	-	52	63.905	ENSMALG00000015013	-	74	63.905
ENSMALG00000017137	-	99	48.780	ENSMALG00000018446	-	63	48.780
ENSMALG00000017137	-	97	49.068	ENSMALG00000009319	-	90	49.068
ENSMALG00000017137	-	99	68.224	ENSMALG00000006027	-	89	68.224
ENSMALG00000017137	-	99	47.866	ENSMALG00000016351	-	57	47.866

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000017137	-	100	59.697	ENSAOCG00000004576	-	88	59.697	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000017137	-	100	59.394	ENSAPEG00000024502	-	88	59.394	Amphiprion_percula
ENSMALG00000017137	-	99	51.084	ENSATEG00000015931	-	64	51.084	Anabas_testudineus
ENSMALG00000017137	-	99	51.084	ENSATEG00000014607	-	62	51.084	Anabas_testudineus
ENSMALG00000017137	-	99	51.084	ENSATEG00000015490	-	52	51.084	Anabas_testudineus
ENSMALG00000017137	-	94	38.235	ENSATEG00000014055	-	53	38.235	Anabas_testudineus
ENSMALG00000017137	-	94	38.889	ENSATEG00000004798	-	54	38.889	Anabas_testudineus
ENSMALG00000017137	-	97	50.789	ENSATEG00000004857	-	68	50.789	Anabas_testudineus
ENSMALG00000017137	-	97	38.413	ENSATEG00000019241	-	89	38.413	Anabas_testudineus
ENSMALG00000017137	-	99	51.084	ENSATEG00000002739	-	52	51.084	Anabas_testudineus
ENSMALG00000017137	-	98	48.742	ENSACLG00000004998	-	71	48.742	Astatotilapia_calliptera
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ENSMALG00000017137	-	85	44.604	ENSACLG00000000802	-	84	44.604	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017137	-	99	45.342	ENSACLG00000025562	-	73	45.342	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017137	-	99	45.963	ENSACLG00000016639	-	70	45.963	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017137	-	99	45.652	ENSACLG00000000182	-	57	45.652	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017137	-	99	45.342	ENSACLG00000000437	-	86	45.342	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017137	-	76	51.230	ENSACLG00000022104	-	66	51.230	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017137	-	99	45.963	ENSACLG00000004232	-	73	45.963	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017137	-	99	45.342	ENSACLG00000017363	-	73	45.342	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017137	-	99	45.652	ENSACLG00000017093	-	73	45.652	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017137	-	63	42.927	ENSACLG00000005259	-	63	42.927	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017137	-	76	51.230	ENSACLG00000000907	-	65	51.230	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017137	-	98	49.371	ENSACLG00000022853	-	59	49.371	Astatotilapia_calliptera
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ENSMALG00000017137	-	97	50.633	ENSACLG00000003937	-	79	50.633	Astatotilapia_calliptera
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ENSMALG00000017137	-	99	45.652	ENSACLG00000010664	-	57	45.652	Astatotilapia_calliptera
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ENSMALG00000017137	-	99	45.511	ENSACLG00000006202	-	86	45.342	Astatotilapia_calliptera
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ENSMALG00000017137	-	98	50.313	ENSACLG00000020926	-	84	50.313	Astatotilapia_calliptera
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ENSMALG00000017137	-	99	52.174	ENSACLG00000012076	-	86	52.174	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017137	-	74	53.942	ENSACLG00000010474	-	53	53.942	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017137	-	83	50.000	ENSACLG00000024587	-	69	50.000	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017137	-	95	50.809	ENSACLG00000022741	-	89	50.000	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017137	-	96	37.179	ENSAMXG00000032827	-	90	37.179	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000017137	-	99	36.957	ENSAMXG00000035545	-	92	36.646	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000017137	-	98	47.352	ENSAMXG00000043740	-	64	47.352	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000017137	-	80	37.548	ENSAMXG00000036759	-	79	37.548	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000017137	-	99	45.963	ENSAMXG00000043461	-	65	45.963	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000017137	-	73	38.174	ENSAMXG00000041932	-	58	38.174	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000017137	-	68	39.381	ENSAMXG00000029786	-	58	39.381	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000017137	-	98	36.335	ENSAMXG00000037298	-	92	37.267	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000017137	-	70	56.769	ENSAMXG00000038571	-	56	56.769	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000017137	-	96	37.179	ENSAMXG00000043932	-	90	37.179	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000017137	-	99	37.888	ENSAMXG00000029419	-	93	37.578	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000017137	-	96	37.500	ENSAMXG00000025823	-	79	37.500	Astyanax_mexicanus
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ENSMALG00000017137	-	82	37.453	ENSAMXG00000032194	-	70	37.453	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000017137	-	80	54.231	ENSAMXG00000038658	-	77	54.231	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000017137	-	99	37.578	ENSAMXG00000039054	-	92	37.578	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000017137	-	80	36.882	ENSAMXG00000032328	-	79	36.882	Astyanax_mexicanus
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