EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000017411 (Gene tree)
Gene ID: 109967520
Gene Symbol: urb1
Alias: mp:zf637-1-000544|zf637-1-000544
Full Name: URB1 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16957 bases
Position: chrKV884818.1:396737-413693
Accession: 109967520
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000025223	Npa1	PF11707.8	5.6e-83	1	1
ENSMALP00000025248	Npa1	PF11707.8	6.1e-83	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000025694	-	6375	XM_020613153	ENSMALP00000025223	2124 (aa)	XP_020468809	-
ENSMALT00000025721	-	6330	-	ENSMALP00000025248	2109 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000017411	urb1	97	52.576	ENSG00000142207	URB1	94	52.160	Homo_sapiens
ENSMALG00000017411	urb1	97	74.331	ENSAPOG00000020308	urb1	99	74.331	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000017411	urb1	99	52.687	ENSAMEG00000011998	URB1	99	42.563	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000017411	urb1	95	70.647	ENSACIG00000003248	urb1	96	70.647	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000017411	urb1	99	71.053	ENSAOCG00000010364	urb1	99	71.053	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000017411	urb1	99	71.202	ENSAPEG00000010758	urb1	99	71.202	Amphiprion_percula
ENSMALG00000017411	urb1	99	74.142	ENSATEG00000011790	urb1	99	74.142	Anabas_testudineus
ENSMALG00000017411	urb1	94	56.733	ENSAPLG00000012791	URB1	97	45.665	Anas_platyrhynchos
ENSMALG00000017411	urb1	99	42.629	ENSACAG00000002817	URB1	99	42.606	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000017411	urb1	99	53.448	ENSANAG00000024617	URB1	96	52.754	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000017411	urb1	99	74.895	ENSACLG00000024865	urb1	98	74.895	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017411	urb1	96	49.744	ENSAMXG00000012306	urb1	99	48.611	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000017411	urb1	97	51.522	ENSBTAG00000012412	URB1	96	42.786	Bos_taurus
ENSMALG00000017411	urb1	99	53.112	ENSCJAG00000009118	URB1	96	52.416	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000017411	urb1	97	52.306	ENSCAFG00000008892	URB1	94	51.979	Canis_familiaris
ENSMALG00000017411	urb1	97	52.110	ENSCAFG00020025987	-	94	51.782	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000017411	urb1	97	52.637	ENSCAFG00020025994	-	94	52.306	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000017411	urb1	97	51.739	ENSCHIG00000015645	URB1	93	51.739	Capra_hircus
ENSMALG00000017411	urb1	99	52.229	ENSTSYG00000013286	URB1	97	52.335	Carlito_syrichta
ENSMALG00000017411	urb1	95	50.279	ENSCAPG00000015589	URB1	96	42.445	Cavia_aperea
ENSMALG00000017411	urb1	97	52.077	ENSCPOG00000006748	URB1	99	41.630	Cavia_porcellus
ENSMALG00000017411	urb1	99	52.688	ENSCCAG00000021299	URB1	96	52.704	Cebus_capucinus
ENSMALG00000017411	urb1	96	53.805	ENSCATG00000042630	URB1	93	53.586	Cercocebus_atys
ENSMALG00000017411	urb1	99	51.852	ENSCLAG00000005262	URB1	99	42.743	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000017411	urb1	96	52.229	ENSCSAG00000009584	URB1	94	51.840	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000017411	urb1	99	56.620	ENSCPBG00000006454	URB1	96	56.344	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000017411	urb1	96	53.863	ENSCANG00000031088	URB1	96	53.202	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000017411	urb1	98	51.343	ENSCGRG00001010616	Urb1	99	42.264	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000017411	urb1	97	51.864	ENSCGRG00000015840	Urb1	99	42.666	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMALG00000017411	urb1	99	74.242	ENSCSEG00000012616	urb1	97	74.242	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000017411	urb1	99	62.781	ENSCVAG00000009076	urb1	98	67.968	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000017411	urb1	99	60.593	ENSDARG00000060308	urb1	97	60.593	Danio_rerio
ENSMALG00000017411	urb1	85	52.804	ENSDNOG00000015586	URB1	99	52.804	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000017411	urb1	99	51.538	ENSDORG00000006735	Urb1	96	51.538	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000017411	urb1	85	52.207	ENSETEG00000009080	URB1	84	52.207	Echinops_telfairi
ENSMALG00000017411	urb1	97	51.266	ENSEASG00005007711	URB1	93	51.371	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000017411	urb1	97	52.331	ENSECAG00000013206	URB1	96	45.416	Equus_caballus
ENSMALG00000017411	urb1	99	56.843	ENSELUG00000020516	urb1	95	64.742	Esox_lucius
ENSMALG00000017411	urb1	97	52.542	ENSFCAG00000002177	URB1	93	52.542	Felis_catus
ENSMALG00000017411	urb1	95	42.494	ENSFALG00000004636	URB1	96	42.494	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000017411	urb1	99	51.691	ENSFDAG00000007288	URB1	95	42.149	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000017411	urb1	99	61.173	ENSFHEG00000000202	urb1	99	62.640	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000017411	urb1	93	56.168	ENSGMOG00000001838	urb1	94	56.430	Gadus_morhua
ENSMALG00000017411	urb1	95	56.545	ENSGALG00000015887	URB1	92	56.545	Gallus_gallus
ENSMALG00000017411	urb1	99	64.337	ENSGAFG00000020694	urb1	98	66.254	Gambusia_affinis
ENSMALG00000017411	urb1	99	70.249	ENSGACG00000011703	urb1	99	70.382	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000017411	urb1	96	55.451	ENSGAGG00000022544	URB1	93	55.451	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000017411	urb1	97	52.798	ENSGGOG00000000285	URB1	94	52.376	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000017411	urb1	99	74.790	ENSHBUG00000001904	urb1	98	74.790	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000017411	urb1	99	49.898	ENSHGLG00000004907	URB1	97	49.898	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000017411	urb1	99	51.531	ENSHGLG00100010749	URB1	97	51.531	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000017411	urb1	79	68.712	ENSHCOG00000018683	urb1	99	68.712	Hippocampus_comes
ENSMALG00000017411	urb1	99	55.713	ENSIPUG00000014721	urb1	96	55.713	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000017411	urb1	96	52.535	ENSSTOG00000004539	URB1	94	51.543	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000017411	urb1	93	72.586	ENSKMAG00000006001	urb1	99	72.586	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000017411	urb1	97	72.662	ENSLBEG00000027208	urb1	99	72.662	Labrus_bergylta
ENSMALG00000017411	urb1	99	50.625	ENSLACG00000017059	URB1	97	50.780	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000017411	urb1	99	65.180	ENSLOCG00000009190	urb1	97	65.180	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000017411	urb1	96	53.055	ENSLAFG00000010407	URB1	93	53.055	Loxodonta_africana
ENSMALG00000017411	urb1	96	53.326	ENSMFAG00000034391	URB1	90	53.128	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000017411	urb1	96	53.326	ENSMMUG00000010295	URB1	94	52.697	Macaca_mulatta
ENSMALG00000017411	urb1	96	52.043	ENSMNEG00000032981	URB1	94	51.399	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000017411	urb1	96	53.541	ENSMLEG00000041435	URB1	94	52.844	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000017411	urb1	99	71.429	ENSMAMG00000011238	urb1	99	71.429	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000017411	urb1	99	68.471	ENSMZEG00005011862	urb1	98	68.471	Maylandia_zebra
ENSMALG00000017411	urb1	95	56.550	ENSMGAG00000014512	URB1	95	56.550	Meleagris_gallopavo
ENSMALG00000017411	urb1	84	52.719	ENSMAUG00000010516	Urb1	96	51.917	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000017411	urb1	97	51.949	ENSMICG00000016424	URB1	94	51.753	Microcebus_murinus
ENSMALG00000017411	urb1	99	51.505	ENSMOCG00000012613	Urb1	99	42.126	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000017411	urb1	97	43.156	ENSMODG00000021076	URB1	96	43.156	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000017411	urb1	97	51.579	MGP_CAROLIEiJ_G0020948	Urb1	96	43.019	Mus_caroli
ENSMALG00000017411	urb1	97	51.366	ENSMUSG00000039929	Urb1	96	42.753	Mus_musculus
ENSMALG00000017411	urb1	97	51.423	MGP_PahariEiJ_G0016653	Urb1	97	42.831	Mus_pahari
ENSMALG00000017411	urb1	97	51.471	MGP_SPRETEiJ_G0021854	Urb1	96	42.890	Mus_spretus
ENSMALG00000017411	urb1	97	52.280	ENSMPUG00000001123	URB1	98	43.111	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000017411	urb1	99	51.876	ENSNGAG00000001905	Urb1	98	42.316	Nannospalax_galili
ENSMALG00000017411	urb1	82	69.858	ENSNBRG00000001049	urb1	99	70.121	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000017411	urb1	95	51.954	ENSNLEG00000026872	URB1	92	51.955	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000017411	urb1	92	54.255	ENSMEUG00000010828	URB1	94	40.275	Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000017411	urb1	99	50.000	ENSOPRG00000013482	URB1	99	40.805	Ochotona_princeps
ENSMALG00000017411	urb1	99	52.431	ENSODEG00000002587	URB1	97	52.431	Octodon_degus
ENSMALG00000017411	urb1	99	70.318	ENSONIG00000005599	urb1	99	70.318	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000017411	urb1	96	52.114	ENSOCUG00000009381	URB1	95	43.464	Oryctolagus_cuniculus
ENSMALG00000017411	urb1	99	63.636	ENSORLG00000003429	urb1	99	63.681	Oryzias_latipes
ENSMALG00000017411	urb1	99	63.906	ENSORLG00020013785	urb1	99	63.995	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000017411	urb1	96	71.459	ENSORLG00015019421	urb1	99	77.457	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000017411	urb1	80	70.944	ENSOMEG00000002094	urb1	98	70.944	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000017411	urb1	96	51.820	ENSOGAG00000017140	URB1	93	52.034	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000017411	urb1	88	51.974	ENSOARG00000013679	URB1	89	51.258	Ovis_aries
ENSMALG00000017411	urb1	97	52.798	ENSPPAG00000003423	URB1	94	52.376	Pan_paniscus
ENSMALG00000017411	urb1	97	52.542	ENSPPRG00000023131	URB1	93	52.643	Panthera_pardus
ENSMALG00000017411	urb1	88	51.872	ENSPTIG00000016125	URB1	91	51.872	Panthera_tigris_altaica
ENSMALG00000017411	urb1	97	52.587	ENSPTRG00000013852	URB1	94	52.169	Pan_troglodytes
ENSMALG00000017411	urb1	96	53.433	ENSPANG00000021964	URB1	94	52.801	Papio_anubis
ENSMALG00000017411	urb1	99	50.659	ENSPKIG00000003683	urb1	99	50.704	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000017411	urb1	97	50.951	ENSPEMG00000021205	Urb1	96	42.612	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000017411	urb1	74	38.038	ENSPMAG00000009733	URB1	93	38.121	Petromyzon_marinus
ENSMALG00000017411	urb1	99	41.541	ENSPCIG00000016350	URB1	99	41.839	Phascolarctos_cinereus
ENSMALG00000017411	urb1	97	64.201	ENSPLAG00000004371	urb1	100	64.247	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000017411	urb1	99	64.510	ENSPMEG00000006634	urb1	99	64.555	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000017411	urb1	99	64.542	ENSPREG00000013453	urb1	99	64.630	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000017411	urb1	97	52.335	ENSPPYG00000011359	URB1	94	51.913	Pongo_abelii
ENSMALG00000017411	urb1	93	49.000	ENSPCAG00000007430	URB1	90	49.000	Procavia_capensis
ENSMALG00000017411	urb1	97	52.266	ENSPCOG00000022695	URB1	94	52.165	Propithecus_coquereli
ENSMALG00000017411	urb1	99	52.099	ENSPVAG00000000889	URB1	96	52.099	Pteropus_vampyrus
ENSMALG00000017411	urb1	99	68.857	ENSPNYG00000010589	urb1	99	68.857	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000017411	urb1	97	48.881	ENSPNAG00000019324	urb1	99	48.197	Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000017411	urb1	96	51.014	ENSRNOG00000002080	Urb1	95	42.916	Rattus_norvegicus
ENSMALG00000017411	urb1	96	53.391	ENSRBIG00000033122	URB1	94	52.850	Rhinopithecus_bieti
ENSMALG00000017411	urb1	96	53.341	ENSRROG00000040237	URB1	96	52.648	Rhinopithecus_roxellana
ENSMALG00000017411	urb1	99	53.219	ENSSBOG00000027672	URB1	96	52.532	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMALG00000017411	urb1	99	41.982	ENSSHAG00000005140	URB1	99	42.026	Sarcophilus_harrisii
ENSMALG00000017411	urb1	93	54.073	ENSSFOG00015000339	urb1	99	54.073	Scleropages_formosus
ENSMALG00000017411	urb1	99	72.115	ENSSMAG00000003782	urb1	99	72.203	Scophthalmus_maximus
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ENSMALG00000017411	urb1	99	74.867	ENSSLDG00000023179	urb1	99	74.867	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000017411	urb1	99	54.214	ENSSPUG00000012447	URB1	97	54.214	Sphenodon_punctatus
ENSMALG00000017411	urb1	99	71.776	ENSSPAG00000006325	urb1	99	71.776	Stegastes_partitus
ENSMALG00000017411	urb1	97	51.312	ENSSSCG00000032024	URB1	94	51.312	Sus_scrofa
ENSMALG00000017411	urb1	73	46.802	ENSTGUG00000013442	URB1	100	46.802	Taeniopygia_guttata
ENSMALG00000017411	urb1	99	66.254	ENSTRUG00000009372	urb1	99	66.254	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000017411	urb1	99	63.043	ENSTNIG00000016277	urb1	99	63.043	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000017411	urb1	73	55.556	ENSTBEG00000010044	URB1	68	55.556	Tupaia_belangeri
ENSMALG00000017411	urb1	87	50.332	ENSTTRG00000007712	URB1	85	50.332	Tursiops_truncatus
ENSMALG00000017411	urb1	99	52.266	ENSUAMG00000012231	URB1	99	42.495	Ursus_americanus
ENSMALG00000017411	urb1	88	52.585	ENSUMAG00000017419	URB1	95	44.306	Ursus_maritimus
ENSMALG00000017411	urb1	65	61.111	ENSVPAG00000001164	URB1	61	61.806	Vicugna_pacos
ENSMALG00000017411	urb1	98	52.992	ENSVVUG00000000551	URB1	94	52.992	Vulpes_vulpes
ENSMALG00000017411	urb1	97	53.983	ENSXETG00000009895	urb1	93	53.983	Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000017411	urb1	98	71.939	ENSXCOG00000005500	urb1	99	71.939	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000017411	urb1	98	72.449	ENSXMAG00000007253	urb1	99	72.449	Xiphophorus_maculatus