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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000017889 (Gene tree)
Gene ID: 109954841
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18188 bases
Position: chrKV884700.1:2981450-2999637
Accession: 109954841
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000025766	RRM_1	PF00076.22	6.1e-33	1	2
ENSMALP00000025766	RRM_1	PF00076.22	6.1e-33	2	2
ENSMALP00000025743	RRM_1	PF00076.22	7e-33	1	2
ENSMALP00000025743	RRM_1	PF00076.22	7e-33	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000026219	MSI1-201	3049	XM_020590461	ENSMALP00000025743	348 (aa)	XP_020446117	UPI0009B32D04
ENSMALT00000026242	MSI1-202	1005	-	ENSMALP00000025766	334 (aa)	-	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
malb03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000017889	MSI1	56	40.625	ENSMALG00000014091	hnrnpa1a	57	40.000
ENSMALG00000017889	MSI1	55	45.238	ENSMALG00000016024	hnrnpd	58	45.238
ENSMALG00000017889	MSI1	54	45.989	ENSMALG00000015091	hnrnpaba	81	38.406
ENSMALG00000017889	MSI1	67	35.526	ENSMALG00000022327	rbm38	58	35.526
ENSMALG00000017889	MSI1	54	35.119	ENSMALG00000001764	tardbp	55	35.119
ENSMALG00000017889	MSI1	100	79.739	ENSMALG00000000071	msi2a	100	79.739
ENSMALG00000017889	MSI1	56	39.303	ENSMALG00000009691	hnrnpa3	99	31.250
ENSMALG00000017889	MSI1	50	30.460	ENSMALG00000019079	-	88	31.579
ENSMALG00000017889	MSI1	51	47.337	ENSMALG00000010467	-	82	39.080
ENSMALG00000017889	MSI1	53	35.354	ENSMALG00000016939	TRA2B	51	37.179
ENSMALG00000017889	MSI1	66	35.052	ENSMALG00000021161	tardbpl	67	35.052
ENSMALG00000017889	MSI1	51	36.628	ENSMALG00000008866	hnrnpa0b	69	35.714
ENSMALG00000017889	MSI1	94	92.661	ENSMALG00000001426	-	100	92.661
ENSMALG00000017889	MSI1	77	35.227	ENSMALG00000014068	rbm24a	65	33.673
ENSMALG00000017889	MSI1	51	40.462	ENSMALG00000008886	-	88	40.659

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.978	ENSG00000135097	MSI1	100	83.978	Homo_sapiens
ENSMALG00000017889	MSI1	100	99.140	ENSAPOG00000023458	-	100	99.140	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	92.571	ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.571	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000017889	MSI1	95	69.003	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	66.846	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000017889	MSI1	91	90.785	ENSACIG00000017754	-	80	86.462	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	92.571	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	92.571	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000017889	MSI1	98	90.244	ENSAOCG00000009031	-	98	90.244	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000017889	MSI1	100	92.571	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	92.571	Amphiprion_percula
ENSMALG00000017889	MSI1	100	99.140	ENSAPEG00000006857	-	84	99.140	Amphiprion_percula
ENSMALG00000017889	MSI1	100	84.463	ENSATEG00000023779	-	100	84.463	Anabas_testudineus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	95.211	ENSATEG00000017059	MSI1	100	95.211	Anabas_testudineus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	84.211	ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.765	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.978	ENSANAG00000027151	MSI1	100	83.978	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000017889	MSI1	82	84.266	ENSANAG00000027901	-	88	84.266	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000017889	MSI1	100	99.713	ENSACLG00000000117	-	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017889	MSI1	100	92.593	ENSACLG00000011230	MSI1	100	92.593	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000017889	MSI1	94	93.730	ENSAMXG00000038960	msi1	76	93.730	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.978	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	85.337	Bos_taurus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.978	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	83.978	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.702	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	83.702	Canis_familiaris
ENSMALG00000017889	MSI1	94	85.531	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	85.531	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000017889	MSI1	100	81.744	ENSCHIG00000024304	MSI1	100	81.744	Capra_hircus
ENSMALG00000017889	MSI1	94	84.709	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.709	Carlito_syrichta
ENSMALG00000017889	MSI1	95	80.586	ENSCAPG00000003919	MSI1	78	84.615	Cavia_aperea
ENSMALG00000017889	MSI1	95	85.174	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	85.380	Cavia_porcellus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.978	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	83.978	Cebus_capucinus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.978	ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.978	Cercocebus_atys
ENSMALG00000017889	MSI1	94	85.380	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	85.380	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000017889	MSI1	78	84.116	ENSCSAG00000002265	MSI1	96	84.116	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	87.464	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	87.464	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000017889	MSI1	94	84.756	ENSCANG00000040651	MSI1	100	84.756	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.978	ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.978	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000017889	MSI1	94	84.802	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.802	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMALG00000017889	MSI1	100	91.714	ENSCSEG00000005834	-	100	91.714	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000017889	MSI1	100	98.276	ENSCSEG00000008352	-	100	98.276	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000017889	MSI1	95	92.429	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	92.429	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000017889	MSI1	100	98.563	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	98.563	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000017889	MSI1	62	74.654	ENSCVAG00000017463	-	89	74.654	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000017889	MSI1	51	66.418	ENSCVAG00000017430	zgc:110796	94	66.418	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000017889	MSI1	79	92.558	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	98	92.558	Danio_rerio
ENSMALG00000017889	MSI1	95	92.131	ENSDARG00000010710	msi1	100	94.860	Danio_rerio
ENSMALG00000017889	MSI1	94	82.278	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	82.278	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000017889	MSI1	94	84.132	ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.132	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000017889	MSI1	94	81.707	ENSETEG00000004756	MSI1	100	81.707	Echinops_telfairi
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.978	ENSEASG00005004736	MSI1	100	83.978	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.978	ENSECAG00000017526	MSI1	100	83.978	Equus_caballus
ENSMALG00000017889	MSI1	95	88.474	ENSELUG00000023280	-	100	88.162	Esox_lucius
ENSMALG00000017889	MSI1	94	90.544	ENSELUG00000023219	MSI1	92	90.544	Esox_lucius
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.978	ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.978	Felis_catus
ENSMALG00000017889	MSI1	94	89.333	ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.333	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000017889	MSI1	94	84.451	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.451	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000017889	MSI1	100	92.571	ENSFHEG00000003560	-	100	92.571	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	98.567	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	98.567	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.333	ENSGMOG00000017838	-	100	83.333	Gadus_morhua
ENSMALG00000017889	MSI1	100	95.690	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	95.402	Gadus_morhua
ENSMALG00000017889	MSI1	94	88.931	ENSGALG00000007227	MSI1	98	75.959	Gallus_gallus
ENSMALG00000017889	MSI1	94	92.378	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	92.378	Gambusia_affinis
ENSMALG00000017889	MSI1	100	75.214	ENSGAFG00000005860	-	100	75.214	Gambusia_affinis
ENSMALG00000017889	MSI1	100	84.765	ENSGACG00000008674	-	100	84.765	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	97.994	ENSGACG00000012679	MSI1	100	97.994	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	87.464	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	87.464	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000017889	MSI1	94	85.350	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	85.350	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000017889	MSI1	100	99.713	ENSHBUG00000011841	-	100	99.713	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000017889	MSI1	100	92.593	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	92.593	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.702	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	83.702	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000017889	MSI1	94	84.451	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.451	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000017889	MSI1	100	92.898	ENSHCOG00000012067	-	100	92.898	Hippocampus_comes
ENSMALG00000017889	MSI1	95	88.644	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	88.644	Hippocampus_comes
ENSMALG00000017889	MSI1	100	91.977	ENSIPUG00000001976	msi1	100	91.977	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000017889	MSI1	94	85.531	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.531	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	72.853	ENSJJAG00000010643	-	100	74.138	Jaculus_jaculus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.978	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	83.978	Jaculus_jaculus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	98.563	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	98.563	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000017889	MSI1	95	89.905	ENSKMAG00000019877	-	100	89.905	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	92.571	ENSLBEG00000001375	-	100	92.571	Labrus_bergylta
ENSMALG00000017889	MSI1	100	98.854	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	98.854	Labrus_bergylta
ENSMALG00000017889	MSI1	95	83.529	ENSLACG00000018287	MSI1	100	83.918	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000017889	MSI1	52	78.182	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	71	78.182	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000017889	MSI1	91	75.529	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	75.529	Loxodonta_africana
ENSMALG00000017889	MSI1	94	85.380	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	85.380	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000017889	MSI1	94	85.380	ENSMMUG00000031527	MSI1	97	84.483	Macaca_mulatta
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.978	ENSMNEG00000040034	MSI1	100	83.978	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000017889	MSI1	94	84.756	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	84.756	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	98.851	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	98.851	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	92.000	ENSMAMG00000018426	-	100	92.000	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	92.593	ENSMZEG00005026892	MSI1	100	92.593	Maylandia_zebra
ENSMALG00000017889	MSI1	100	99.713	ENSMZEG00005000340	-	100	99.713	Maylandia_zebra
ENSMALG00000017889	MSI1	66	94.083	ENSMGAG00000016518	-	100	94.083	Meleagris_gallopavo
ENSMALG00000017889	MSI1	70	89.300	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	89.300	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.978	ENSMICG00000033181	MSI1	100	83.978	Microcebus_murinus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.702	ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.702	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000017889	MSI1	95	88.498	ENSMMOG00000012265	-	99	88.498	Mola_mola
ENSMALG00000017889	MSI1	97	88.923	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	88.923	Mola_mola
ENSMALG00000017889	MSI1	91	57.831	ENSMODG00000003189	-	100	57.831	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.425	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	98	85.662	Mus_caroli
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.425	ENSMUSG00000054256	Msi1	99	87.346	Mus_musculus
ENSMALG00000017889	MSI1	100	86.286	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	100	86.286	Mus_pahari
ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.425	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	98	85.662	Mus_spretus
ENSMALG00000017889	MSI1	94	85.531	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	85.531	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000017889	MSI1	94	76.190	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	76.190	Myotis_lucifugus
ENSMALG00000017889	MSI1	94	84.802	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	Nannospalax_galili
ENSMALG00000017889	MSI1	100	99.713	ENSNBRG00000000841	-	100	99.713	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000017889	MSI1	89	84.836	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	84.836	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000017889	MSI1	90	75.305	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.305	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000017889	MSI1	94	64.939	ENSMEUG00000015759	MSI1	100	64.939	Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000017889	MSI1	91	77.778	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.778	Ochotona_princeps
ENSMALG00000017889	MSI1	94	84.756	ENSODEG00000006328	MSI1	100	84.756	Octodon_degus
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ENSMALG00000017889	MSI1	94	85.531	ENSOCUG00000027716	MSI1	100	85.531	Oryctolagus_cuniculus
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ENSMALG00000017889	MSI1	100	91.429	ENSORLG00015003916	MSI1	100	91.429	Oryzias_latipes_hsok
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ENSMALG00000017889	MSI1	100	98.854	ENSOMEG00000017536	MSI1	100	98.854	Oryzias_melastigma
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ENSMALG00000017889	MSI1	100	93.391	ENSPKIG00000016497	MSI1	100	93.391	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000017889	MSI1	50	84.615	ENSPSIG00000016295	-	95	84.615	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000017889	MSI1	79	81.140	ENSPSIG00000009621	-	100	81.140	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000017889	MSI1	94	85.976	ENSPSIG00000011608	-	93	85.976	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000017889	MSI1	91	96.393	ENSPMGG00000000514	MSI1	97	96.393	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000017889	MSI1	97	72.321	ENSPMGG00000007743	-	98	68.768	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000017889	MSI1	94	83.383	ENSPEMG00000010491	Msi1	95	83.383	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSMALG00000017889	MSI1	100	98.567	ENSPLAG00000014025	-	100	98.567	Poecilia_latipinna
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ENSMALG00000017889	MSI1	100	91.429	ENSPMEG00000007025	-	97	83.082	Poecilia_mexicana
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ENSMALG00000017889	MSI1	76	89.848	ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.848	Procavia_capensis
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ENSMALG00000017889	MSI1	100	99.713	ENSPNYG00000002529	-	100	99.713	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000017889	MSI1	100	92.837	ENSPNAG00000019337	msi1	100	92.837	Pygocentrus_nattereri
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ENSMALG00000017889	MSI1	94	84.545	ENSRROG00000041076	MSI1	93	84.545	Rhinopithecus_roxellana
ENSMALG00000017889	MSI1	94	85.380	ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.380	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSMALG00000017889	MSI1	94	94.260	ENSSFOG00015005350	MSI1	100	91.824	Scleropages_formosus
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ENSMALG00000017889	MSI1	99	75.831	ENSXCOG00000017605	MSI1	93	75.831	Xiphophorus_couchianus
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ENSMALG00000017889	MSI1	100	91.714	ENSXMAG00000018237	-	100	91.714	Xiphophorus_maculatus