EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000018604 (Gene tree)
Gene ID: 109959537
Gene Symbol: srrt
Alias: CHUNP6881|ars2|zgc:92060
Full Name: serrate RNA effector molecule homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7625 bases
Position: chrKV884727.1:1943310-1950934
Accession: 109959537
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000026868	ARS2	PF04959.13	8.6e-72	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000027362	-	2499	XM_020598988	ENSMALP00000026868	832 (aa)	XP_020454644	-

Gene Model

Click here to download ENSMALG00000018604's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMALG00000018604's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000018604	srrt	57	45.621	ENSMALG00000005567	-	84	48.913

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000018604	srrt	86	71.398	ENSG00000087087	SRRT	98	83.871	Homo_sapiens
ENSMALG00000018604	srrt	86	88.840	ENSAPOG00000002304	srrt	90	84.309	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000018604	srrt	80	72.247	ENSAMEG00000014506	SRRT	90	61.899	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000018604	srrt	87	87.912	ENSACIG00000015795	srrt	89	86.737	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000018604	srrt	55	60.504	ENSAOCG00000009189	-	88	54.937	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000018604	srrt	86	88.621	ENSAOCG00000009693	srrt	90	84.519	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000018604	srrt	86	88.403	ENSAPEG00000003646	srrt	89	87.368	Amphiprion_percula
ENSMALG00000018604	srrt	55	60.504	ENSAPEG00000020016	-	88	54.937	Amphiprion_percula
ENSMALG00000018604	srrt	99	79.736	ENSATEG00000014425	srrt	85	86.920	Anabas_testudineus
ENSMALG00000018604	srrt	55	59.336	ENSATEG00000003652	-	85	62.069	Anabas_testudineus
ENSMALG00000018604	srrt	54	71.087	ENSACAG00000001014	SRRT	90	62.313	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSANAG00000031718	SRRT	90	61.922	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000018604	srrt	55	60.879	ENSACLG00000009423	-	88	54.078	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000018604	srrt	99	78.802	ENSACLG00000013156	srrt	87	82.272	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000018604	srrt	83	76.116	ENSAMXG00000016671	srrt	84	68.823	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000018604	srrt	80	70.968	ENSBTAG00000001134	SRRT	90	62.010	Bos_taurus
ENSMALG00000018604	srrt	68	44.270	WBGene00017085	E01A2.2	85	41.513	Caenorhabditis_elegans
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.183	ENSCJAG00000014917	SRRT	90	61.800	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000018604	srrt	99	60.071	ENSCAFG00000023538	SRRT	90	62.225	Canis_familiaris
ENSMALG00000018604	srrt	99	60.000	ENSCAFG00020013358	SRRT	95	59.681	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.183	ENSCHIG00000010495	SRRT	90	61.963	Capra_hircus
ENSMALG00000018604	srrt	53	71.367	ENSTSYG00000036426	SRRT	94	60.662	Carlito_syrichta
ENSMALG00000018604	srrt	53	71.806	ENSCAPG00000013586	SRRT	95	62.005	Cavia_aperea
ENSMALG00000018604	srrt	84	70.815	ENSCPOG00000001739	SRRT	90	61.951	Cavia_porcellus
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSCCAG00000015877	SRRT	90	61.922	Cebus_capucinus
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.183	ENSCATG00000036306	SRRT	92	61.548	Cercocebus_atys
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.183	ENSCLAG00000007568	SRRT	89	67.238	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSCSAG00000017996	SRRT	90	62.149	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000018604	srrt	54	73.333	ENSCHOG00000007815	SRRT	64	71.061	Choloepus_hoffmanni
ENSMALG00000018604	srrt	71	62.727	ENSCPBG00000011553	SRRT	77	61.135	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000018604	srrt	100	41.731	ENSCING00000003506	-	86	43.622	Ciona_intestinalis
ENSMALG00000018604	srrt	100	38.309	ENSCSAVG00000008394	-	81	54.545	Ciona_savignyi
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.367	ENSCANG00000034556	SRRT	90	61.840	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.613	ENSCGRG00001001594	Srrt	90	62.990	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000018604	srrt	70	71.306	ENSCGRG00000007292	Srrt	89	67.666	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMALG00000018604	srrt	99	70.833	ENSCSEG00000017878	srrt	87	73.684	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000018604	srrt	54	60.041	ENSCSEG00000005233	-	87	51.443	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000018604	srrt	90	52.720	ENSCVAG00000017344	-	94	50.798	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000018604	srrt	99	78.897	ENSCVAG00000019848	srrt	90	81.750	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000018604	srrt	99	68.713	ENSDARG00000017762	srrt	87	70.935	Danio_rerio
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSDNOG00000003851	SRRT	90	62.027	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.584	ENSDORG00000005584	Srrt	89	67.100	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000018604	srrt	72	69.979	ENSETEG00000016175	SRRT	75	79.091	Echinops_telfairi
ENSMALG00000018604	srrt	63	58.471	ENSEBUG00000008517	-	77	58.422	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSEASG00005016956	SRRT	90	62.086	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSECAG00000012292	SRRT	90	62.086	Equus_caballus
ENSMALG00000018604	srrt	56	73.034	ENSEEUG00000009117	SRRT	70	65.957	Erinaceus_europaeus
ENSMALG00000018604	srrt	99	68.786	ENSELUG00000006651	srrt	87	69.887	Esox_lucius
ENSMALG00000018604	srrt	96	54.567	ENSELUG00000021216	-	88	56.015	Esox_lucius
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSFCAG00000006855	SRRT	90	62.149	Felis_catus
ENSMALG00000018604	srrt	53	71.652	ENSFDAG00000021347	SRRT	88	68.080	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000018604	srrt	55	53.138	ENSFHEG00000004105	-	93	53.863	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000018604	srrt	78	81.643	ENSFHEG00000002756	srrt	84	85.167	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000018604	srrt	68	63.636	ENSGMOG00000018694	-	72	61.765	Gadus_morhua
ENSMALG00000018604	srrt	99	69.784	ENSGMOG00000018619	srrt	87	72.585	Gadus_morhua
ENSMALG00000018604	srrt	99	77.938	ENSGAFG00000005423	srrt	90	80.625	Gambusia_affinis
ENSMALG00000018604	srrt	98	77.209	ENSGACG00000020387	srrt	87	81.130	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000018604	srrt	96	51.199	ENSGACG00000001100	-	88	52.218	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000018604	srrt	86	71.398	ENSGGOG00000001508	SRRT	91	61.840	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000018604	srrt	86	86.813	ENSHBUG00000002942	srrt	87	82.272	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000018604	srrt	80	70.878	ENSHGLG00000008344	Srrt	89	67.024	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.150	ENSHGLG00100018857	Srrt	89	66.811	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000018604	srrt	98	71.578	ENSHCOG00000005403	srrt	90	77.000	Hippocampus_comes
ENSMALG00000018604	srrt	96	50.803	ENSHCOG00000008904	-	87	51.613	Hippocampus_comes
ENSMALG00000018604	srrt	97	68.370	ENSIPUG00000021150	srrt	88	68.926	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.367	ENSSTOG00000013776	SRRT	90	62.209	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000018604	srrt	80	72.247	ENSJJAG00000010446	Srrt	89	67.462	Jaculus_jaculus
ENSMALG00000018604	srrt	55	60.041	ENSKMAG00000008468	-	88	53.043	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000018604	srrt	99	77.605	ENSKMAG00000013599	srrt	90	80.400	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000018604	srrt	99	75.563	ENSLBEG00000016308	srrt	98	76.084	Labrus_bergylta
ENSMALG00000018604	srrt	99	50.646	ENSLACG00000001089	SRRT	90	52.898	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000018604	srrt	95	61.091	ENSLOCG00000013658	srrt	89	67.354	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.613	ENSLAFG00000007725	SRRT	90	62.149	Loxodonta_africana
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.367	ENSMFAG00000033745	SRRT	94	61.548	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSMMUG00000021255	SRRT	90	62.149	Macaca_mulatta
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSMNEG00000041864	SRRT	92	61.548	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.367	ENSMLEG00000029479	SRRT	93	61.548	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000018604	srrt	55	60.460	ENSMAMG00000010681	-	88	53.885	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000018604	srrt	99	80.889	ENSMAMG00000014311	srrt	90	84.211	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000018604	srrt	55	61.088	ENSMZEG00005028002	-	88	54.203	Maylandia_zebra
ENSMALG00000018604	srrt	86	87.033	ENSMZEG00005016135	srrt	87	82.272	Maylandia_zebra
ENSMALG00000018604	srrt	80	70.968	ENSMAUG00000011386	Srrt	89	67.021	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.613	ENSMICG00000009471	SRRT	92	61.893	Microcebus_murinus
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSMOCG00000001971	Srrt	89	67.957	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000018604	srrt	99	76.775	ENSMMOG00000016399	srrt	90	78.491	Mola_mola
ENSMALG00000018604	srrt	88	53.004	ENSMMOG00000011137	-	88	52.533	Mola_mola
ENSMALG00000018604	srrt	53	67.949	ENSMODG00000004862	SRRT	89	67.735	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000018604	srrt	80	72.271	MGP_CAROLIEiJ_G0027870	Srrt	99	65.543	Mus_caroli
ENSMALG00000018604	srrt	80	72.271	ENSMUSG00000037364	Srrt	99	65.543	Mus_musculus
ENSMALG00000018604	srrt	80	72.271	MGP_PahariEiJ_G0024456	Srrt	99	65.543	Mus_pahari
ENSMALG00000018604	srrt	80	72.271	MGP_SPRETEiJ_G0028875	Srrt	99	65.543	Mus_spretus
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSMPUG00000015839	SRRT	90	62.271	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000018604	srrt	84	71.183	ENSMLUG00000009975	SRRT	90	62.759	Myotis_lucifugus
ENSMALG00000018604	srrt	84	71.398	ENSNGAG00000023715	Srrt	100	61.792	Nannospalax_galili
ENSMALG00000018604	srrt	54	86.726	ENSNBRG00000019100	srrt	90	80.326	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000018604	srrt	85	61.454	ENSNLEG00000011987	SRRT	95	55.092	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000018604	srrt	97	51.711	ENSMEUG00000011941	SRRT	87	52.685	Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000018604	srrt	62	73.171	ENSOPRG00000002502	-	65	77.273	Ochotona_princeps
ENSMALG00000018604	srrt	80	72.026	ENSODEG00000016856	SRRT	89	67.028	Octodon_degus
ENSMALG00000018604	srrt	98	50.447	ENSONIG00000016080	-	88	52.158	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000018604	srrt	86	87.473	ENSONIG00000004242	srrt	90	80.802	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000018604	srrt	99	77.858	ENSORLG00000008120	srrt	90	79.497	Oryzias_latipes
ENSMALG00000018604	srrt	99	77.738	ENSORLG00020003058	srrt	90	79.245	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000018604	srrt	99	77.738	ENSORLG00015008062	srrt	90	79.119	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000018604	srrt	96	54.392	ENSOMEG00000006963	-	88	55.371	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000018604	srrt	99	78.339	ENSOMEG00000003155	srrt	89	85.957	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSOGAG00000017242	SRRT	90	62.271	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000018604	srrt	80	70.933	ENSOARG00000015645	SRRT	90	61.840	Ovis_aries
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.367	ENSPPAG00000041090	SRRT	90	62.239	Pan_paniscus
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.522	ENSPPRG00000009557	SRRT	90	62.531	Panthera_pardus
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSPTIG00000014355	SRRT	90	62.149	Panthera_tigris_altaica
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.367	ENSPTRG00000019511	SRRT	95	59.759	Pan_troglodytes
ENSMALG00000018604	srrt	53	70.190	ENSPANG00000020763	SRRT	91	61.548	Papio_anubis
ENSMALG00000018604	srrt	99	65.398	ENSPKIG00000022212	-	87	67.871	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000018604	srrt	99	65.035	ENSPKIG00000005434	srrt	90	70.247	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000018604	srrt	53	71.903	ENSPSIG00000016311	SRRT	90	62.829	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000018604	srrt	97	71.864	ENSPMGG00000002841	srrt	87	74.520	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000018604	srrt	80	72.247	ENSPEMG00000010834	Srrt	89	67.028	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000018604	srrt	86	69.528	ENSPCIG00000000816	SRRT	90	62.103	Phascolarctos_cinereus
ENSMALG00000018604	srrt	99	77.725	ENSPFOG00000005704	srrt	90	80.774	Poecilia_formosa
ENSMALG00000018604	srrt	99	77.143	ENSPLAG00000021992	srrt	90	79.602	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000018604	srrt	99	77.485	ENSPMEG00000001182	srrt	90	80.524	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000018604	srrt	99	78.375	ENSPREG00000022308	srrt	90	80.400	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000018604	srrt	80	57.353	ENSPPYG00000017432	SRRT	89	60.726	Pongo_abelii
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSPCOG00000025751	SRRT	90	62.377	Propithecus_coquereli
ENSMALG00000018604	srrt	68	63.656	ENSPVAG00000000834	SRRT	100	54.816	Pteropus_vampyrus
ENSMALG00000018604	srrt	86	87.033	ENSPNYG00000018710	srrt	90	82.397	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000018604	srrt	99	50.059	ENSPNAG00000010629	srrt	85	52.792	Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000018604	srrt	53	62.582	ENSRNOG00000048277	AABR07035787.1	92	61.926	Rattus_norvegicus
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSRBIG00000035718	SRRT	92	61.548	Rhinopithecus_bieti
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSRROG00000030622	SRRT	93	61.548	Rhinopithecus_roxellana
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSSBOG00000033570	SRRT	91	61.736	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMALG00000018604	srrt	75	58.143	ENSSHAG00000007349	-	99	59.056	Sarcophilus_harrisii
ENSMALG00000018604	srrt	99	70.309	ENSSFOG00015017293	srrt	87	71.795	Scleropages_formosus
ENSMALG00000018604	srrt	53	59.062	ENSSMAG00000018195	-	86	50.255	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000018604	srrt	99	81.677	ENSSMAG00000015342	srrt	98	76.345	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000018604	srrt	99	83.573	ENSSDUG00000012049	srrt	90	83.000	Seriola_dumerili
ENSMALG00000018604	srrt	55	52.137	ENSSDUG00000002051	-	93	53.744	Seriola_dumerili
ENSMALG00000018604	srrt	86	87.281	ENSSLDG00000017477	srrt	81	88.646	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000018604	srrt	53	53.602	ENSSPAG00000018943	-	93	55.385	Stegastes_partitus
ENSMALG00000018604	srrt	99	80.430	ENSSPAG00000005665	srrt	89	83.333	Stegastes_partitus
ENSMALG00000018604	srrt	51	69.683	ENSSSCG00000024789	SRRT	95	59.632	Sus_scrofa
ENSMALG00000018604	srrt	99	75.534	ENSTRUG00000016075	srrt	90	77.543	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000018604	srrt	90	51.042	ENSTRUG00000000023	-	82	50.616	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000018604	srrt	78	72.321	ENSTNIG00000011779	srrt	100	72.429	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000018604	srrt	96	50.792	ENSTNIG00000003111	-	90	51.171	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.183	ENSTTRG00000011104	SRRT	90	62.255	Tursiops_truncatus
ENSMALG00000018604	srrt	53	71.398	ENSUAMG00000027997	SRRT	93	61.963	Ursus_americanus
ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	ENSUMAG00000011295	SRRT	90	61.963	Ursus_maritimus
ENSMALG00000018604	srrt	99	60.071	ENSVVUG00000023572	SRRT	90	62.225	Vulpes_vulpes
ENSMALG00000018604	srrt	76	66.443	ENSXETG00000025124	srrt	75	76.786	Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000018604	srrt	56	50.429	ENSXCOG00000013105	-	91	50.216	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000018604	srrt	99	77.458	ENSXMAG00000007627	srrt	89	83.682	Xiphophorus_maculatus