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Description

Ensembl ID: ENSMALG00000019363 (Gene tree)
Gene ID: 109965227
Gene Symbol: prpf38a
Alias: fa04h11|fc83e08|wu:fa04h11|wu:fc83e08|zgc:92059
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9767 bases
Position: chrKV884786.1:689084-698850
Accession: 109965227
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000027916	PRP38	PF03371.15	1.6e-63	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000028430	-	5204	XM_020609079	ENSMALP00000027916	318 (aa)	XP_020464735	-

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Pathway ID	Pathway Name	Source
malb03040	Spliceosome	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSG00000134748	PRPF38A	71	88.235	Homo_sapiens
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	97.735	ENSAPOG00000011652	prpf38a	100	97.735	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	71	88.235	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	93.204	ENSACIG00000012292	prpf38a	100	93.204	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	97.735	ENSAOCG00000018004	prpf38a	100	97.735	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	97.735	ENSAPEG00000021414	prpf38a	100	97.735	Amphiprion_percula
ENSMALG00000019363	prpf38a	69	93.665	ENSATEG00000004608	prpf38a	72	93.665	Anabas_testudineus
ENSMALG00000019363	prpf38a	77	77.823	ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	85.256	Anas_platyrhynchos
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSACAG00000008249	PRPF38A	71	88.235	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSANAG00000027839	PRPF38A	71	88.235	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	60.317	ENSANAG00000029204	-	70	56.000	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	96.440	ENSACLG00000021595	prpf38a	100	96.440	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	84.984	ENSAMXG00000029274	prpf38a	71	94.570	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	75	88.235	Bos_taurus
ENSMALG00000019363	prpf38a	61	63.590	WBGene00008380	prp-38	68	60.274	Caenorhabditis_elegans
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	74	88.235	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	71	88.235	Canis_familiaris
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	71	88.235	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	71	88.235	Capra_hircus
ENSMALG00000019363	prpf38a	84	78.148	ENSTSYG00000031994	-	63	85.393	Carlito_syrichta
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSTSYG00000009868	-	71	88.235	Carlito_syrichta
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	83.280	ENSCPOG00000005079	PRPF38A	71	88.235	Cavia_porcellus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	79.167	ENSCCAG00000026502	PRPF38A	71	88.235	Cebus_capucinus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSCATG00000032296	PRPF38A	71	88.235	Cercocebus_atys
ENSMALG00000019363	prpf38a	90	53.633	ENSCATG00000044190	-	57	55.851	Cercocebus_atys
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	71	88.235	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.150	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	71	87.783	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000019363	prpf38a	73	68.831	ENSCSAVG00000009580	-	71	70.968	Ciona_savignyi
ENSMALG00000019363	prpf38a	73	87.446	ENSCANG00000032608	PRPF38A	74	88.235	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSCGRG00001018502	-	71	88.235	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000019363	prpf38a	82	70.881	ENSCGRG00001002557	-	74	74.208	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	71	88.235	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMALG00000019363	prpf38a	92	94.558	ENSCSEG00000001269	prpf38a	76	94.118	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	96.440	ENSCVAG00000012305	prpf38a	100	96.440	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	84.345	ENSDARG00000039213	prpf38a	71	94.118	Danio_rerio
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSDNOG00000042326	PRPF38A	72	88.235	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000019363	prpf38a	82	74.144	ENSDORG00000025371	-	75	80.734	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000019363	prpf38a	82	74.144	ENSDORG00000023691	-	75	80.734	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000019363	prpf38a	82	95.833	ENSDORG00000023857	-	64	95.833	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000019363	prpf38a	64	70.732	FBgn0050342	Prp38	57	73.404	Drosophila_melanogaster
ENSMALG00000019363	prpf38a	75	80.335	ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	79.821	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSEASG00005014427	PRPF38A	71	88.235	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSECAG00000022628	PRPF38A	71	88.235	Equus_caballus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	95.793	ENSELUG00000021094	prpf38a	100	95.793	Esox_lucius
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSFCAG00000002518	PRPF38A	71	88.235	Felis_catus
ENSMALG00000019363	prpf38a	84	79.412	ENSFALG00000005598	-	66	86.667	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	76.129	ENSFALG00000003612	-	73	83.486	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	82.958	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	72	88.235	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000019363	prpf38a	88	83.513	ENSFHEG00000014317	prpf38a	75	95.023	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000019363	prpf38a	52	96.988	ENSGMOG00000011384	prpf38a	54	96.988	Gadus_morhua
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.789	ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	88.688	Gallus_gallus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	96.117	ENSGAFG00000012422	prpf38a	100	96.117	Gambusia_affinis
ENSMALG00000019363	prpf38a	53	95.294	ENSGACG00000000182	-	100	95.294	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000019363	prpf38a	69	94.619	ENSGACG00000005423	prpf38a	72	94.619	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.150	ENSGAGG00000020547	PRPF38A	71	87.783	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSGGOG00000003940	PRPF38A	71	88.235	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000019363	prpf38a	64	97.044	ENSHBUG00000020572	prpf38a	86	97.044	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSHGLG00000000475	PRPF38A	71	88.235	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	73.955	ENSHGLG00000007918	-	71	76.018	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	73.955	ENSHGLG00100003928	-	71	76.018	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSHGLG00100008935	PRPF38A	71	88.235	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000019363	prpf38a	57	93.956	ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	94.149	Hippocampus_comes
ENSMALG00000019363	prpf38a	88	79.298	ENSIPUG00000005757	prpf38a	71	91.441	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSSTOG00000015610	PRPF38A	71	88.235	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSJJAG00000015811	Prpf38a	71	88.235	Jaculus_jaculus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	96.117	ENSKMAG00000006588	prpf38a	100	96.117	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	95.793	ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	95.793	Labrus_bergylta
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.789	ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	87.783	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	92.581	ENSLOCG00000006262	prpf38a	72	90.090	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSLAFG00000025862	PRPF38A	71	88.235	Loxodonta_africana
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSMFAG00000039449	PRPF38A	74	88.235	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000019363	prpf38a	84	79.044	ENSMMUG00000014333	PRPF38A	65	85.635	Macaca_mulatta
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSMNEG00000031221	PRPF38A	71	88.235	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000019363	prpf38a	90	53.633	ENSMNEG00000040242	-	65	57.971	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSMLEG00000041105	PRPF38A	71	88.235	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	98.382	ENSMAMG00000015431	prpf38a	100	98.382	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	96.440	ENSMZEG00005017838	prpf38a	100	96.440	Maylandia_zebra
ENSMALG00000019363	prpf38a	73	87.879	ENSMGAG00000011176	PRPF38A	74	88.688	Meleagris_gallopavo
ENSMALG00000019363	prpf38a	82	82.955	ENSMAUG00000018029	-	84	83.710	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSMICG00000014193	PRPF38A	71	88.235	Microcebus_murinus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSMOCG00000013080	Prpf38a	71	88.235	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	89.711	ENSMMOG00000016972	prpf38a	85	90.076	Mola_mola
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	79.299	ENSMODG00000000644	PRPF38A	71	85.135	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.150	MGP_CAROLIEiJ_G0026269	Prpf38a	71	87.783	Mus_caroli
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.150	ENSMUSG00000063800	Prpf38a	71	87.783	Mus_musculus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.150	MGP_PahariEiJ_G0028602	Prpf38a	71	87.783	Mus_pahari
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	80.831	MGP_SPRETEiJ_G0027238	Prpf38a	93	91.489	Mus_spretus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSMPUG00000006896	PRPF38A	71	88.235	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	83.601	ENSNGAG00000011884	Prpf38a	72	88.235	Nannospalax_galili
ENSMALG00000019363	prpf38a	70	94.595	ENSNBRG00000004013	prpf38a	71	94.595	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000019363	prpf38a	90	56.014	ENSNLEG00000033398	-	60	50.685	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000019363	prpf38a	90	80.345	ENSNLEG00000017999	PRPF38A	63	87.374	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000019363	prpf38a	94	63.158	ENSNLEG00000012592	-	67	58.371	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	78.594	ENSMEUG00000003860	PRPF38A	71	84.163	Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000019363	prpf38a	72	87.719	ENSOPRG00000008985	PRPF38A	92	88.235	Ochotona_princeps
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSODEG00000005869	PRPF38A	71	88.235	Octodon_degus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	95.469	ENSONIG00000007816	prpf38a	100	95.469	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000019363	prpf38a	73	44.635	ENSOANG00000009541	-	71	43.304	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSOCUG00000000963	PRPF38A	71	88.235	Oryctolagus_cuniculus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	95.779	ENSORLG00000013485	prpf38a	79	95.475	Oryzias_latipes
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	95.779	ENSORLG00020002130	prpf38a	90	96.063	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	95.455	ENSORLG00015021393	prpf38a	75	95.023	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	94.822	ENSOMEG00000016333	prpf38a	72	94.570	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSOGAG00000005423	PRPF38A	71	88.235	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSOARG00000005373	PRPF38A	71	88.235	Ovis_aries
ENSMALG00000019363	prpf38a	90	68.385	ENSPPAG00000033867	-	68	68.778	Pan_paniscus
ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.470	ENSPPAG00000030905	PRPF38A	71	88.235	Pan_paniscus
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