EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Paralogs
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSMALG00000019536 (Gene tree)
Gene ID
109958323
Gene Symbol
RBMS3
Alias
-
Full Name
RNA-binding motif%2C single-stranded-interacting protein 3-like
Gene Type
protein_coding
Species
Monopterus_albus
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
137421 bases
Position
chrKV884719.1:5886304-6023724
Accession
109958323
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSMALP00000028233RRM_1PF00076.223.2e-3212
ENSMALP00000028233RRM_1PF00076.223.2e-3222
ENSMALP00000028216RRM_1PF00076.224.7e-3212
ENSMALP00000028216RRM_1PF00076.224.7e-3222
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSMALT00000028749RBMS3-2021140-ENSMALP00000028233379 (aa)--
ENSMALT00000028732RBMS3-2016112XM_020596863ENSMALP00000028216425 (aa)XP_020452519UPI0009B3599F
Gene Model
Click here to download ENSMALG00000019536's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMALG00000019536's network
Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSMALG00000019536RBMS35533.010ENSMALG00000011017pabpc46033.010
ENSMALG00000019536RBMS37958.805ENSMALG00000014235rbms1a8262.461
ENSMALG00000019536RBMS38368.452ENSMALG00000015715-8966.667
ENSMALG00000019536RBMS39983.529ENSMALG00000009155-9983.294
ENSMALG00000019536RBMS38669.106ENSMALG00000014520rbms2b8568.564
ENSMALG00000019536RBMS35436.250ENSMALG00000001696celf46736.250
ENSMALG00000019536RBMS37933.750ENSMALG00000007438celf3b5433.750
ENSMALG00000019536RBMS36933.750ENSMALG00000011641celf3a8833.333
ENSMALG00000019536RBMS36435.000ENSMALG00000012778-6535.000
ENSMALG00000019536RBMS38671.196ENSMALG00000016900rbms2a8770.924
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSMALG00000019536RBMS310080.607ENSG00000144642RBMS310085.075Homo_sapiens
ENSMALG00000019536RBMS310090.414ENSAPOG00000007266rbms310090.414Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000019536RBMS39980.896ENSAPOG00000003432-9982.824Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000019536RBMS36875.896ENSAMEG00000005947RBMS310075.738Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000019536RBMS38785.598ENSACIG00000021113RBMS39686.179Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000019536RBMS37187.748ENSACIG00000006987-8088.514Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000019536RBMS39974.718ENSAOCG00000024104-9976.351Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000019536RBMS310097.658ENSAOCG00000021274rbms310097.658Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000019536RBMS39974.232ENSAPEG00000009481-9976.415Amphiprion_percula
ENSMALG00000019536RBMS39191.136ENSAPEG00000016299rbms39397.721Amphiprion_percula
ENSMALG00000019536RBMS310098.122ENSATEG00000024295rbms310098.122Anabas_testudineus
ENSMALG00000019536RBMS39980.896ENSATEG00000008433-9982.824Anabas_testudineus
ENSMALG00000019536RBMS39977.273ENSAPLG00000012270RBMS310076.430Anas_platyrhynchos
ENSMALG00000019536RBMS310078.689ENSACAG00000028664RBMS39980.607Anolis_carolinensis
ENSMALG00000019536RBMS310078.231ENSANAG00000021899RBMS310078.005Aotus_nancymaae
ENSMALG00000019536RBMS39973.826ENSACLG00000008976-9475.446Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000019536RBMS310096.479ENSACLG00000018506rbms310096.479Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000019536RBMS36379.775ENSAMXG00000043770-8185.646Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000019536RBMS310081.542ENSAMXG00000020388rbms310084.112Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000019536RBMS310081.075ENSBTAG00000044062RBMS310080.841Bos_taurus
ENSMALG00000019536RBMS310078.231ENSCJAG00000004312RBMS310078.005Callithrix_jacchus
ENSMALG00000019536RBMS310077.703ENSCAFG00000005464RBMS39977.602Canis_familiaris
ENSMALG00000019536RBMS310077.703ENSCAFG00020024980RBMS310077.602Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000019536RBMS310080.607ENSCHIG00000009144RBMS39980.374Capra_hircus
ENSMALG00000019536RBMS37578.443ENSTSYG00000002615RBMS310078.144Carlito_syrichta
ENSMALG00000019536RBMS38679.292ENSCAPG00000017783RBMS39379.019Cavia_aperea
ENSMALG00000019536RBMS310080.607ENSCPOG00000006457RBMS39980.374Cavia_porcellus
ENSMALG00000019536RBMS310078.231ENSCCAG00000008671RBMS310078.005Cebus_capucinus
ENSMALG00000019536RBMS310078.005ENSCATG00000013222RBMS310077.778Cercocebus_atys
ENSMALG00000019536RBMS310080.841ENSCLAG00000005866RBMS39980.607Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000019536RBMS36478.832ENSCSAG00000009655RBMS39978.467Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000019536RBMS38684.000ENSCHOG00000000758RBMS38178.873Choloepus_hoffmanni
ENSMALG00000019536RBMS310078.923ENSCPBG00000022678RBMS39883.073Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000019536RBMS310078.231ENSCANG00000032137RBMS310078.005Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000019536RBMS310077.570ENSCGRG00001007243Rbms39978.505Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000019536RBMS310077.570ENSCGRG00000004599Rbms39978.505Cricetulus_griseus_crigri
ENSMALG00000019536RBMS310080.562ENSCSEG00000014677-9486.905Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000019536RBMS310095.540ENSCSEG00000010011RBMS310095.540Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000019536RBMS310092.019ENSCVAG00000022354rbms310094.131Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000019536RBMS39982.783ENSCVAG00000022814-9982.311Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000019536RBMS310082.670ENSDARG00000044574rbms39097.674Danio_rerio
ENSMALG00000019536RBMS310079.907ENSDNOG00000016645RBMS39779.673Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000019536RBMS310080.140ENSDORG00000007220Rbms39979.907Dipodomys_ordii
ENSMALG00000019536RBMS38065.254ENSETEG00000009485-8165.254Echinops_telfairi
ENSMALG00000019536RBMS36556.225ENSEBUG00000005830rbms38355.769Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000019536RBMS310080.374ENSEASG00005006152RBMS39980.140Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000019536RBMS310080.374ENSECAG00000017871RBMS39980.140Equus_caballus
ENSMALG00000019536RBMS39072.070ENSEEUG00000014337RBMS310071.930Erinaceus_europaeus
ENSMALG00000019536RBMS310079.812ENSELUG00000002862rbms310079.812Esox_lucius
ENSMALG00000019536RBMS39282.353ENSELUG00000006905-9886.508Esox_lucius
ENSMALG00000019536RBMS310080.140ENSFCAG00000002130RBMS39979.907Felis_catus
ENSMALG00000019536RBMS310078.923ENSFALG00000009165RBMS39980.841Ficedula_albicollis
ENSMALG00000019536RBMS310080.374ENSFDAG00000008278RBMS39980.140Fukomys_damarensis
ENSMALG00000019536RBMS39976.540ENSFHEG00000004787RBMS39585.095Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000019536RBMS38778.734ENSGMOG00000002600-9378.663Gadus_morhua
ENSMALG00000019536RBMS310078.923ENSGALG00000011439RBMS39980.841Gallus_gallus
ENSMALG00000019536RBMS310092.958ENSGAFG00000000168rbms310094.836Gambusia_affinis
ENSMALG00000019536RBMS39980.660ENSGAFG00000003329-9982.353Gambusia_affinis
ENSMALG00000019536RBMS36479.273ENSGAGG00000004039RBMS310078.909Gopherus_agassizii
ENSMALG00000019536RBMS310078.231ENSGGOG00000007228RBMS310078.005Gorilla_gorilla
ENSMALG00000019536RBMS310077.252ENSHBUG00000019785-9678.876Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000019536RBMS36495.941ENSHBUG00000021196rbms39495.941Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000019536RBMS310080.374ENSHGLG00000002170RBMS39980.140Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000019536RBMS310080.374ENSHGLG00100014278RBMS39980.140Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000019536RBMS39979.529ENSHCOG00000007894-9981.221Hippocampus_comes
ENSMALG00000019536RBMS310082.243ENSIPUG00000017680rbms310084.813Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000019536RBMS310078.454ENSSTOG00000006324RBMS39980.374Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000019536RBMS310077.570ENSJJAG00000014708Rbms38781.572Jaculus_jaculus
ENSMALG00000019536RBMS310095.105ENSKMAG00000020500rbms310095.338Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000019536RBMS39980.660ENSKMAG00000012586-9982.588Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000019536RBMS36485.448ENSLBEG00000006677rbms39985.448Labrus_bergylta
ENSMALG00000019536RBMS39980.142ENSLBEG00000027388-9982.311Labrus_bergylta
ENSMALG00000019536RBMS310082.944ENSLACG00000010581RBMS310082.710Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000019536RBMS36983.673ENSLOCG00000002328rbms310083.333Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000019536RBMS310077.703ENSLAFG00000000354RBMS310077.602Loxodonta_africana
ENSMALG00000019536RBMS310080.607ENSMFAG00000033300RBMS39980.374Macaca_fascicularis
ENSMALG00000019536RBMS310080.607ENSMMUG00000004404RBMS39980.374Macaca_mulatta
ENSMALG00000019536RBMS310078.231ENSMNEG00000035839RBMS310078.005Macaca_nemestrina
ENSMALG00000019536RBMS310078.005ENSMLEG00000029464RBMS310077.778Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000019536RBMS310098.122ENSMAMG00000024043rbms310098.122Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000019536RBMS39083.333ENSMAMG00000002176-8385.455Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000019536RBMS310077.854ENSMZEG00005026469-9679.954Maylandia_zebra
ENSMALG00000019536RBMS310096.479ENSMZEG00005006308rbms310096.479Maylandia_zebra
ENSMALG00000019536RBMS310077.570ENSMAUG00000016436Rbms39978.505Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000019536RBMS310078.231ENSMICG00000049249RBMS310078.005Microcebus_murinus
ENSMALG00000019536RBMS310077.103ENSMOCG00000006997Rbms39978.037Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000019536RBMS39979.905ENSMMOG00000015071-9982.075Mola_mola
ENSMALG00000019536RBMS39290.191ENSMMOG00000008471RBMS39598.286Mola_mola
ENSMALG00000019536RBMS310073.497ENSMODG00000015125RBMS39973.942Monodelphis_domestica
ENSMALG00000019536RBMS310077.103MGP_CAROLIEiJ_G0032783Rbms39984.112Mus_caroli
ENSMALG00000019536RBMS310077.570ENSMUSG00000039607Rbms39985.047Mus_musculus
ENSMALG00000019536RBMS310077.389MGP_PahariEiJ_G0015650Rbms39985.047Mus_pahari
ENSMALG00000019536RBMS310077.570MGP_SPRETEiJ_G0033930Rbms39985.047Mus_spretus
ENSMALG00000019536RBMS310077.703ENSMPUG00000011956RBMS310077.602Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000019536RBMS310080.607ENSMLUG00000000659RBMS310080.374Myotis_lucifugus
ENSMALG00000019536RBMS38683.198ENSNGAG00000014039Rbms39979.673Nannospalax_galili
ENSMALG00000019536RBMS39980.660ENSNBRG00000018065-9982.588Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000019536RBMS310078.231ENSNLEG00000004129RBMS310078.005Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000019536RBMS39971.558ENSMEUG00000004772RBMS310072.109Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000019536RBMS39977.878ENSOPRG00000006808RBMS38577.778Ochotona_princeps
ENSMALG00000019536RBMS310078.220ENSODEG00000003651RBMS38783.469Octodon_degus
ENSMALG00000019536RBMS310090.610ENSONIG00000007172rbms310093.269Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000019536RBMS310079.412ENSOANG00000010529RBMS39978.733Ornithorhynchus_anatinus
ENSMALG00000019536RBMS310077.252ENSOCUG00000004840RBMS39977.149Oryctolagus_cuniculus
ENSMALG00000019536RBMS310093.192ENSORLG00000005370RBMS310090.588Oryzias_latipes
ENSMALG00000019536RBMS39981.132ENSORLG00000002306-9983.059Oryzias_latipes
ENSMALG00000019536RBMS39981.132ENSORLG00020008496-9983.059Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000019536RBMS310092.958ENSORLG00020022674RBMS310090.353Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000019536RBMS310090.824ENSORLG00015005509rbms310090.588Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000019536RBMS39981.132ENSORLG00015015719-9983.059Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000019536RBMS39282.609ENSOMEG00000007677-9585.246Oryzias_melastigma
ENSMALG00000019536RBMS310091.059ENSOMEG00000014805RBMS310093.192Oryzias_melastigma
ENSMALG00000019536RBMS310077.252ENSOARG00000014684RBMS39977.149Ovis_aries
ENSMALG00000019536RBMS310078.231ENSPPAG00000036519RBMS310078.005Pan_paniscus
ENSMALG00000019536RBMS310077.551ENSPPRG00000002761RBMS310077.324Panthera_pardus
ENSMALG00000019536RBMS310079.907ENSPTIG00000011568RBMS310079.673Panthera_tigris_altaica
ENSMALG00000019536RBMS310080.607ENSPTRG00000014709RBMS39980.374Pan_troglodytes
ENSMALG00000019536RBMS310078.005ENSPANG00000010234RBMS310077.778Papio_anubis
ENSMALG00000019536RBMS36385.019ENSPKIG00000007989-10085.019Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000019536RBMS310078.454ENSPSIG00000005269RBMS39980.374Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000019536RBMS39282.821ENSPMGG00000021683-9585.479Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000019536RBMS38988.764ENSPMGG00000021544rbms38596.330Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000019536RBMS39974.648ENSPEMG00000001117Rbms310075.587Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000019536RBMS38383.146ENSPCIG00000006106RBMS38885.581Phascolarctos_cinereus
ENSMALG00000019536RBMS310092.958ENSPFOG00000017887rbms310094.836Poecilia_formosa
ENSMALG00000019536RBMS37694.099ENSPLAG00000016866-8394.099Poecilia_latipinna
ENSMALG00000019536RBMS39980.425ENSPMEG00000002993-9982.118Poecilia_mexicana
ENSMALG00000019536RBMS39992.671ENSPREG00000011880rbms39993.144Poecilia_reticulata
ENSMALG00000019536RBMS38784.677ENSPREG00000018221-9784.674Poecilia_reticulata
ENSMALG00000019536RBMS310065.766ENSPPYG00000014050RBMS38265.611Pongo_abelii
ENSMALG00000019536RBMS310059.234ENSPCAG00000006307RBMS39959.050Procavia_capensis
ENSMALG00000019536RBMS310078.458ENSPCOG00000017136RBMS310078.231Propithecus_coquereli
ENSMALG00000019536RBMS38884.000ENSPVAG00000014037RBMS38378.846Pteropus_vampyrus
ENSMALG00000019536RBMS310096.244ENSPNYG00000010546rbms310096.244Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000019536RBMS39980.660ENSPNYG00000012624-9982.588Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000019536RBMS310081.542ENSPNAG00000001800rbms310084.112Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000019536RBMS35083.158ENSPNAG00000026763-6991.083Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000019536RBMS38680.488ENSRNOG00000025881Rbms310078.505Rattus_norvegicus
ENSMALG00000019536RBMS310078.458ENSRBIG00000035863RBMS310078.231Rhinopithecus_bieti
ENSMALG00000019536RBMS38681.152ENSRROG00000027512RBMS39380.890Rhinopithecus_roxellana
ENSMALG00000019536RBMS310078.231ENSSBOG00000020232RBMS310078.005Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMALG00000019536RBMS38677.236ENSSHAG00000002411RBMS39478.049Sarcophilus_harrisii
ENSMALG00000019536RBMS39981.043ENSSFOG00015008578rbms39982.979Scleropages_formosus
ENSMALG00000019536RBMS310093.443ENSSMAG00000004997rbms310095.109Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000019536RBMS39085.195ENSSMAG00000020065-9384.935Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000019536RBMS310097.887ENSSDUG00000013656RBMS310097.887Seriola_dumerili
ENSMALG00000019536RBMS39980.896ENSSDUG00000019287-9982.824Seriola_dumerili
ENSMALG00000019536RBMS39980.896ENSSLDG00000013224-9982.824Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000019536RBMS310097.436ENSSLDG00000020276RBMS310097.436Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000019536RBMS38268.805ENSSARG00000000695RBMS39268.824Sorex_araneus
ENSMALG00000019536RBMS36977.741ENSSPUG00000017197RBMS39877.592Sphenodon_punctatus
ENSMALG00000019536RBMS310097.658ENSSPAG00000020693rbms310097.658Stegastes_partitus
ENSMALG00000019536RBMS39973.815ENSSPAG00000003983-9975.450Stegastes_partitus
ENSMALG00000019536RBMS310080.374ENSSSCG00000036381RBMS39980.140Sus_scrofa
ENSMALG00000019536RBMS37578.338ENSTGUG00000003572RBMS310078.209Taeniopygia_guttata
ENSMALG00000019536RBMS310094.836ENSTRUG00000021719RBMS310094.836Takifugu_rubripes
ENSMALG00000019536RBMS39971.789ENSTRUG00000007482-9973.474Takifugu_rubripes
ENSMALG00000019536RBMS38277.551ENSTBEG00000005362RBMS39282.059Tupaia_belangeri
ENSMALG00000019536RBMS39977.201ENSTTRG00000006202RBMS310077.098Tursiops_truncatus
ENSMALG00000019536RBMS310077.703ENSUMAG00000000263RBMS39977.602Ursus_maritimus
ENSMALG00000019536RBMS38670.573ENSVPAG00000003842RBMS39270.419Vicugna_pacos
ENSMALG00000019536RBMS38680.260ENSVVUG00000004660RBMS39091.866Vulpes_vulpes
ENSMALG00000019536RBMS36974.598ENSXETG00000032055RBMS39974.434Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000019536RBMS39268.262ENSXCOG00000019600-9569.624Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000019536RBMS310093.192ENSXMAG00000021783rbms310093.662Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000019536RBMS39980.660ENSXMAG00000014382-9982.353Xiphophorus_maculatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us