EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000019642 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: sf3b6
Alias: sf3b14|zgc:86708
Full Name: splicing factor 3b subunit 6
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5737 bases
Position: chrKV885195.1:91353-97089
Accession: 109952871
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000028356	RRM_1	PF00076.22	4.1e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000028873	-	3842	XM_020588175	ENSMALP00000028356	186 (aa)	XP_020443831	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSG00000115128	SF3B6	100	99.200	Homo_sapiens
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSAPOG00000023788	sf3b6	100	99.200	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSAMEG00000002786	SF3B6	100	99.200	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSACIG00000012608	sf3b6	100	99.200	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSAOCG00000013394	sf3b6	100	99.200	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSAPEG00000015311	sf3b6	100	99.200	Amphiprion_percula
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSATEG00000016569	sf3b6	100	99.200	Anabas_testudineus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSACAG00000011677	SF3B6	100	99.200	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSANAG00000027284	SF3B6	95	99.200	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSACLG00000007793	sf3b6	100	99.200	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSAMXG00000034888	sf3b6	100	99.200	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSBTAG00000003407	SF3B6	100	99.200	Bos_taurus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	97.600	ENSBTAG00000049128	-	100	97.600	Bos_taurus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	67.200	WBGene00016808	C50D2.5	91	67.200	Caenorhabditis_elegans
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSCJAG00000007716	SF3B6	100	99.200	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSCAFG00000003957	SF3B6	100	99.200	Canis_familiaris
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSCAFG00020025576	SF3B6	100	99.200	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSCHIG00000009902	SF3B6	100	99.200	Capra_hircus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSTSYG00000013978	SF3B6	100	99.200	Carlito_syrichta
ENSMALG00000019642	sf3b6	65	95.868	ENSCAPG00000016302	SF3B6	99	95.868	Cavia_aperea
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSCPOG00000008016	SF3B6	100	99.200	Cavia_porcellus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSCCAG00000036653	SF3B6	100	99.200	Cebus_capucinus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	93.548	ENSCCAG00000018894	-	96	93.548	Cebus_capucinus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSCATG00000030936	SF3B6	100	99.200	Cercocebus_atys
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSCLAG00000014512	SF3B6	100	99.200	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSCSAG00000008390	SF3B6	100	99.200	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSCHOG00000000689	SF3B6	100	99.200	Choloepus_hoffmanni
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	73.387	ENSCHOG00000013886	-	99	73.387	Choloepus_hoffmanni
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSCPBG00000020042	SF3B6	100	99.200	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000019642	sf3b6	66	80.488	ENSCING00000012689	-	97	80.488	Ciona_intestinalis
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSCANG00000030559	SF3B6	100	99.200	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSCGRG00001014595	Sf3b6	100	99.200	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSCGRG00000005272	Sf3b6	100	99.200	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	98.400	ENSCSEG00000019017	sf3b6	100	98.400	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	100.000	ENSCVAG00000005055	sf3b6	100	100.000	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSDARG00000009753	sf3b6	100	99.200	Danio_rerio
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSDNOG00000007148	SF3B6	100	99.200	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	81.746	ENSDORG00000029761	-	98	81.746	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSDORG00000009772	Sf3b6	100	99.200	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	81.746	ENSDORG00000027390	-	98	81.746	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000019642	sf3b6	62	76.522	FBgn0035692	Sf3b6	95	76.522	Drosophila_melanogaster
ENSMALG00000019642	sf3b6	62	91.304	ENSEBUG00000004424	sf3b6	91	91.304	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	88.000	ENSEASG00005008061	-	100	88.000	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSEASG00005009993	SF3B6	100	99.200	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000019642	sf3b6	54	95.050	ENSECAG00000015618	SF3B6	93	95.050	Equus_caballus
ENSMALG00000019642	sf3b6	52	88.542	ENSECAG00000027755	-	85	85.859	Equus_caballus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSELUG00000010379	sf3b6	100	99.200	Esox_lucius
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSFCAG00000031365	SF3B6	100	99.200	Felis_catus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSFALG00000001651	SF3B6	100	99.200	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSFDAG00000007864	SF3B6	100	99.200	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	100.000	ENSFHEG00000000685	sf3b6	100	100.000	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	98.400	ENSGMOG00000005123	sf3b6	100	98.400	Gadus_morhua
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSGAFG00000009334	sf3b6	100	99.200	Gambusia_affinis
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	98.400	ENSGACG00000004803	sf3b6	100	98.400	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSGAGG00000012240	SF3B6	100	99.200	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSGGOG00000040806	SF3B6	100	99.200	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSHBUG00000012556	sf3b6	100	99.200	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSHGLG00000014895	SF3B14	100	99.200	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSHGLG00100008639	SF3B14	100	99.200	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	100.000	ENSHCOG00000019962	sf3b6	100	100.000	Hippocampus_comes
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ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSJJAG00000021819	Sf3b6	100	99.200	Jaculus_jaculus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSKMAG00000004000	sf3b6	100	99.200	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSLBEG00000022937	sf3b6	100	99.200	Labrus_bergylta
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSLACG00000014326	SF3B6	100	99.200	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSLOCG00000016481	sf3b6	100	99.200	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSLAFG00000029423	SF3B6	100	99.200	Loxodonta_africana
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSMFAG00000038178	SF3B6	100	99.200	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSMMUG00000001282	SF3B6	100	99.200	Macaca_mulatta
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSMNEG00000029050	SF3B6	100	99.200	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSMLEG00000019896	SF3B6	100	99.200	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000019642	sf3b6	52	97.938	ENSMAMG00000007713	sf3b6	88	97.938	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSMZEG00005003557	sf3b6	100	99.200	Maylandia_zebra
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSMGAG00000014057	SF3B6	100	99.200	Meleagris_gallopavo
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSMAUG00000000586	-	100	99.200	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSMICG00000032874	SF3B6	100	99.200	Microcebus_murinus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSMOCG00000014338	Sf3b6	100	99.200	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	100.000	ENSMMOG00000015653	sf3b6	100	100.000	Mola_mola
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	92.000	ENSMODG00000002144	SF3B6	100	92.000	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	MGP_CAROLIEiJ_G0017590	Sf3b6	100	99.200	Mus_caroli
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSMUSG00000037361	Sf3b6	100	99.200	Mus_musculus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	MGP_PahariEiJ_G0029348	Sf3b6	100	99.200	Mus_pahari
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	MGP_SPRETEiJ_G0018434	Sf3b6	100	99.200	Mus_spretus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSMPUG00000013957	SF3B6	100	99.200	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	97.600	ENSMLUG00000002473	SF3B6	100	97.600	Myotis_lucifugus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSNGAG00000020256	Sf3b6	100	99.200	Nannospalax_galili
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSNBRG00000018244	sf3b6	100	99.200	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSNLEG00000000815	-	100	99.200	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000019642	sf3b6	59	99.083	ENSODEG00000009547	SF3B6	92	99.083	Octodon_degus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSONIG00000001219	sf3b6	100	99.200	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSOANG00000007627	SF3B6	100	99.200	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSOCUG00000022008	SF3B6	100	99.200	Oryctolagus_cuniculus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSORLG00000015955	sf3b6	100	99.200	Oryzias_latipes
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSORLG00020005875	sf3b6	100	99.200	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSORLG00015001347	sf3b6	100	99.200	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSOMEG00000014506	sf3b6	100	99.200	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSOGAG00000004468	SF3B6	100	99.200	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSOARG00000017819	SF3B6	100	99.200	Ovis_aries
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSPPAG00000027816	SF3B6	100	99.200	Pan_paniscus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSPPRG00000023257	SF3B6	100	99.200	Panthera_pardus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSPTIG00000013322	SF3B6	100	99.200	Panthera_tigris_altaica
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSPTRG00000011709	SF3B6	100	99.200	Pan_troglodytes
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSPANG00000021963	SF3B6	100	99.200	Papio_anubis
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSPKIG00000012311	sf3b6	100	99.200	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000019642	sf3b6	62	99.130	ENSPSIG00000017115	SF3B6	100	99.130	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000019642	sf3b6	52	97.938	ENSPMGG00000014621	sf3b6	81	97.938	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSPEMG00000010308	Sf3b6	100	99.200	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000019642	sf3b6	63	87.288	ENSPMAG00000006008	sf3b6	94	87.288	Petromyzon_marinus
ENSMALG00000019642	sf3b6	67	99.200	ENSPCIG00000022128	-	100	99.200	Phascolarctos_cinereus
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