EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000020807 (Gene tree)
Gene ID: 109964084
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: RAB13%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5561 bases
Position: chrKV884772.1:263401-268961
Accession: 109964084
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000030094	MMR_HSR1	PF01926.23	7.1e-05	1	1
ENSMALP00000030083	MMR_HSR1	PF01926.23	7.7e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000030616	-	2520	-	ENSMALP00000030083	196 (aa)	-	-
ENSMALT00000030627	-	2482	XM_020607127	ENSMALP00000030094	200 (aa)	XP_020462783	UPI0009B4DF4F

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
malb04530	Tight junction	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000020807	-	88	37.989	ENSMALG00000004053	RAB7A	86	37.989
ENSMALG00000020807	-	84	30.114	ENSMALG00000001189	dnajc27	64	30.114
ENSMALG00000020807	-	96	32.292	ENSMALG00000014149	rhebl1	96	32.292
ENSMALG00000020807	-	84	43.275	ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	77	43.275
ENSMALG00000020807	-	84	47.619	ENSMALG00000004342	rab2a	79	47.619
ENSMALG00000020807	-	85	50.000	ENSMALG00000014727	si:dkey-16l2.16	98	45.894
ENSMALG00000020807	-	93	53.514	ENSMALG00000021129	zgc:171927	88	53.514
ENSMALG00000020807	-	87	46.821	ENSMALG00000003050	rab11a	80	46.821
ENSMALG00000020807	-	82	32.143	ENSMALG00000019233	rasd4	77	32.143
ENSMALG00000020807	-	94	42.347	ENSMALG00000012630	rab33a	89	41.837
ENSMALG00000020807	-	85	46.512	ENSMALG00000012723	RAB39B	81	46.512
ENSMALG00000020807	-	97	38.942	ENSMALG00000003956	-	97	38.942
ENSMALG00000020807	-	86	49.419	ENSMALG00000015762	rab12	71	49.419
ENSMALG00000020807	-	82	37.126	ENSMALG00000015936	RAB9A	77	37.126
ENSMALG00000020807	-	69	30.435	ENSMALG00000005347	arl3	78	30.435
ENSMALG00000020807	-	85	38.462	ENSMALG00000022118	rab14	77	38.462
ENSMALG00000020807	-	98	53.846	ENSMALG00000006985	-	92	53.846
ENSMALG00000020807	-	80	45.000	ENSMALG00000015154	rab25a	78	45.000
ENSMALG00000020807	-	85	40.571	ENSMALG00000003712	zgc:101559	74	40.571
ENSMALG00000020807	-	88	55.429	ENSMALG00000021928	rab15	82	55.429
ENSMALG00000020807	-	81	31.792	ENSMALG00000017553	rasl11a	67	31.792
ENSMALG00000020807	-	98	52.041	ENSMALG00000021144	rab1ba	93	52.041
ENSMALG00000020807	-	79	45.570	ENSMALG00000020364	-	76	45.570
ENSMALG00000020807	-	81	43.373	ENSMALG00000011693	rab22a	83	43.373
ENSMALG00000020807	-	56	36.937	ENSMALG00000007905	RAB17	52	36.937
ENSMALG00000020807	-	95	33.684	ENSMALG00000019758	rras2	94	32.530
ENSMALG00000020807	-	82	47.561	ENSMALG00000005069	rab18b	80	47.561
ENSMALG00000020807	-	84	42.775	ENSMALG00000015854	rab6ba	83	42.775
ENSMALG00000020807	-	79	40.854	ENSMALG00000021944	-	97	44.545
ENSMALG00000020807	-	87	45.665	ENSMALG00000021949	rab11ba	79	45.665
ENSMALG00000020807	-	92	42.487	ENSMALG00000004093	rab11al	89	42.487
ENSMALG00000020807	-	80	33.951	ENSMALG00000005944	rabl2	71	33.951
ENSMALG00000020807	-	84	35.882	ENSMALG00000012930	si:ch73-116o1.2	94	33.673
ENSMALG00000020807	-	86	43.605	ENSMALG00000004112	rab25b	83	43.605
ENSMALG00000020807	-	56	36.607	ENSMALG00000015576	-	87	37.097
ENSMALG00000020807	-	90	37.566	ENSMALG00000002136	rab23	96	37.313
ENSMALG00000020807	-	98	53.535	ENSMALG00000012003	rab1ab	98	53.535
ENSMALG00000020807	-	79	41.250	ENSMALG00000016715	rab34a	61	41.250
ENSMALG00000020807	-	88	52.000	ENSMALG00000016038	RAB15	83	52.000
ENSMALG00000020807	-	82	41.520	ENSMALG00000007664	rab9b	78	41.520
ENSMALG00000020807	-	91	37.313	ENSMALG00000022693	rab33ba	83	37.313
ENSMALG00000020807	-	95	34.975	ENSMALG00000018436	RAB29	81	38.503
ENSMALG00000020807	-	88	37.989	ENSMALG00000016312	RAB7A	86	37.989
ENSMALG00000020807	-	59	58.475	ENSMALG00000003479	rab35b	75	58.475
ENSMALG00000020807	-	95	36.788	ENSMALG00000013806	rab36	74	36.788
ENSMALG00000020807	-	90	38.378	ENSMALG00000013514	rab38b	83	38.378
ENSMALG00000020807	-	86	45.977	ENSMALG00000018973	RAB39B	82	45.977
ENSMALG00000020807	-	79	45.570	ENSMALG00000017417	rab6bb	76	45.570
ENSMALG00000020807	-	86	48.538	ENSMALG00000010438	rab30	84	48.538
ENSMALG00000020807	-	96	34.896	ENSMALG00000011273	hrasb	98	34.896
ENSMALG00000020807	-	78	35.032	ENSMALG00000017903	rheb	80	35.211
ENSMALG00000020807	-	89	39.548	ENSMALG00000006052	rab5c	82	38.418
ENSMALG00000020807	-	79	44.304	ENSMALG00000010549	rab41	75	44.304
ENSMALG00000020807	-	81	37.654	ENSMALG00000002696	rras	79	37.654
ENSMALG00000020807	-	92	43.005	ENSMALG00000022187	rab11bb	89	43.005
ENSMALG00000020807	-	79	39.130	ENSMALG00000018499	rab34b	60	39.130
ENSMALG00000020807	-	85	36.158	ENSMALG00000010781	kras	98	34.197
ENSMALG00000020807	-	58	36.207	ENSMALG00000010254	RAP2B	98	36.719
ENSMALG00000020807	-	85	39.429	ENSMALG00000012506	rab9a	84	39.429
ENSMALG00000020807	-	91	40.331	ENSMALG00000022348	-	81	40.331
ENSMALG00000020807	-	90	44.865	ENSMALG00000009813	rab18a	88	44.865
ENSMALG00000020807	-	95	40.933	ENSMALG00000014929	rab5aa	90	40.933

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000020807	-	100	96.000	ENSAPOG00000001040	-	100	96.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000020807	-	100	66.667	ENSACIG00000003157	-	100	66.667	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000020807	-	100	96.000	ENSAOCG00000015908	-	100	96.000	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000020807	-	100	96.000	ENSAPEG00000004121	-	100	96.000	Amphiprion_percula
ENSMALG00000020807	-	100	91.000	ENSATEG00000023662	-	100	91.000	Anabas_testudineus
ENSMALG00000020807	-	100	94.000	ENSACLG00000019643	-	100	94.000	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000020807	-	100	93.500	ENSCVAG00000022649	-	100	93.500	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000020807	-	86	73.256	ENSDARG00000103934	megf8	99	73.256	Danio_rerio
ENSMALG00000020807	-	100	92.000	ENSGAFG00000014787	-	100	92.000	Gambusia_affinis
ENSMALG00000020807	-	100	94.000	ENSHBUG00000003728	-	100	94.000	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000020807	-	100	94.000	ENSMZEG00005015817	-	100	94.000	Maylandia_zebra
ENSMALG00000020807	-	100	94.000	ENSMMOG00000003924	-	100	94.000	Mola_mola
ENSMALG00000020807	-	55	89.815	ENSOPRG00000014416	-	100	89.815	Ochotona_princeps
ENSMALG00000020807	-	100	90.500	ENSORLG00000025395	-	100	90.500	Oryzias_latipes
ENSMALG00000020807	-	100	90.500	ENSORLG00020009535	-	100	90.500	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000020807	-	100	90.500	ENSORLG00015015518	-	100	90.500	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000020807	-	100	89.552	ENSPKIG00000014528	-	100	89.552	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000020807	-	100	93.500	ENSPFOG00000014418	-	100	93.500	Poecilia_formosa
ENSMALG00000020807	-	100	93.500	ENSPLAG00000003181	-	100	93.500	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000020807	-	100	93.500	ENSPMEG00000008020	-	100	93.500	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000020807	-	100	93.500	ENSPMEG00000022988	-	100	93.500	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000020807	-	100	93.500	ENSPNYG00000004681	-	100	93.500	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000020807	-	100	90.500	ENSSFOG00015021754	rab13	100	90.500	Scleropages_formosus
ENSMALG00000020807	-	100	67.150	ENSSMAG00000002569	-	100	67.150	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000020807	-	100	94.500	ENSSMAG00000016376	-	100	94.500	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000020807	-	100	96.000	ENSSDUG00000006307	-	100	96.000	Seriola_dumerili
ENSMALG00000020807	-	100	96.000	ENSSLDG00000015823	-	100	96.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000020807	-	100	96.000	ENSSPAG00000022440	-	100	96.000	Stegastes_partitus
ENSMALG00000020807	-	100	93.500	ENSTNIG00000018319	-	100	93.500	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000020807	-	100	92.500	ENSXMAG00000016094	-	100	92.500	Xiphophorus_maculatus