EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000021084 (Gene tree)
Gene ID: 109962817
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: gastrula zinc finger protein XlCGF26.1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6282 bases
Position: chrKV884756.1:1616679-1622960
Accession: 109962817
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000030503	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-44	1	8
ENSMALP00000030503	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-44	2	8
ENSMALP00000030503	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-44	3	8
ENSMALP00000030503	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-44	4	8
ENSMALP00000030503	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-44	5	8
ENSMALP00000030503	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-44	6	8
ENSMALP00000030503	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-44	7	8
ENSMALP00000030503	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-44	8	8
ENSMALP00000030515	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-25	1	4
ENSMALP00000030515	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-25	2	4
ENSMALP00000030515	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-25	3	4
ENSMALP00000030515	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-25	4	4
ENSMALP00000030503	zf-met	PF12874.7	2.4e-11	1	1
ENSMALP00000030515	zf-met	PF12874.7	4.9e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000031041	-	4773	XM_020604843	ENSMALP00000030503	565 (aa)	XP_020460499	UPI0009B47182
ENSMALT00000031053	-	1209	-	ENSMALP00000030515	402 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000021084	-	68	42.500	ENSMALG00000007314	e4f1	69	38.168
ENSMALG00000021084	-	58	38.298	ENSMALG00000011493	-	78	36.054
ENSMALG00000021084	-	58	46.721	ENSMALG00000005203	-	94	46.721
ENSMALG00000021084	-	60	40.000	ENSMALG00000011756	-	60	42.963
ENSMALG00000021084	-	84	40.426	ENSMALG00000012721	-	93	48.235
ENSMALG00000021084	-	59	40.909	ENSMALG00000014761	-	97	40.909
ENSMALG00000021084	-	59	37.594	ENSMALG00000013656	scrt2	53	37.594
ENSMALG00000021084	-	87	34.840	ENSMALG00000015655	-	96	50.000
ENSMALG00000021084	-	56	42.308	ENSMALG00000001010	-	80	40.260
ENSMALG00000021084	-	67	42.683	ENSMALG00000003588	znf236	56	42.222
ENSMALG00000021084	-	58	34.483	ENSMALG00000004996	-	75	34.677
ENSMALG00000021084	-	54	33.441	ENSMALG00000008638	-	58	36.601
ENSMALG00000021084	-	60	38.314	ENSMALG00000004647	-	91	46.250
ENSMALG00000021084	-	84	43.662	ENSMALG00000007812	-	97	43.662
ENSMALG00000021084	-	79	43.478	ENSMALG00000011992	-	94	42.169
ENSMALG00000021084	-	58	36.082	ENSMALG00000017515	znf131	51	33.333
ENSMALG00000021084	-	90	43.787	ENSMALG00000018074	-	97	49.533
ENSMALG00000021084	-	58	40.237	ENSMALG00000012116	-	95	40.237
ENSMALG00000021084	-	58	46.667	ENSMALG00000020889	-	95	55.556
ENSMALG00000021084	-	67	39.777	ENSMALG00000005239	-	89	46.729
ENSMALG00000021084	-	70	38.235	ENSMALG00000007403	-	79	37.975
ENSMALG00000021084	-	82	49.438	ENSMALG00000008496	-	98	49.438
ENSMALG00000021084	-	99	40.000	ENSMALG00000008493	zbtb17	81	40.000
ENSMALG00000021084	-	59	40.278	ENSMALG00000000494	-	89	41.606
ENSMALG00000021084	-	58	41.732	ENSMALG00000003423	-	96	41.975
ENSMALG00000021084	-	50	59.459	ENSMALG00000019139	-	85	59.459
ENSMALG00000021084	-	84	43.478	ENSMALG00000013323	-	89	47.706
ENSMALG00000021084	-	76	46.512	ENSMALG00000014911	-	96	46.512
ENSMALG00000021084	-	85	45.690	ENSMALG00000019254	-	76	45.690
ENSMALG00000021084	-	64	37.037	ENSMALG00000021318	snai2	73	37.037
ENSMALG00000021084	-	81	36.620	ENSMALG00000012129	-	71	43.925
ENSMALG00000021084	-	60	35.150	ENSMALG00000008786	-	92	36.061
ENSMALG00000021084	-	59	31.025	ENSMALG00000013934	prdm5	74	36.810
ENSMALG00000021084	-	57	44.275	ENSMALG00000014554	znf652	54	36.000
ENSMALG00000021084	-	59	39.432	ENSMALG00000001085	-	91	46.729
ENSMALG00000021084	-	58	41.007	ENSMALG00000006454	zbtb47b	85	41.860
ENSMALG00000021084	-	93	42.236	ENSMALG00000000650	-	99	42.236
ENSMALG00000021084	-	65	47.170	ENSMALG00000012856	-	76	40.580
ENSMALG00000021084	-	100	44.954	ENSMALG00000007422	-	94	44.954
ENSMALG00000021084	-	59	37.143	ENSMALG00000016121	-	67	37.143
ENSMALG00000021084	-	61	43.750	ENSMALG00000000252	-	84	41.935
ENSMALG00000021084	-	60	44.037	ENSMALG00000004279	-	77	47.273
ENSMALG00000021084	-	60	39.080	ENSMALG00000006887	-	92	43.902
ENSMALG00000021084	-	62	40.602	ENSMALG00000004984	-	91	48.193
ENSMALG00000021084	-	59	31.707	ENSMALG00000021172	patz1	52	30.131
ENSMALG00000021084	-	100	47.778	ENSMALG00000004200	-	94	47.778
ENSMALG00000021084	-	58	35.172	ENSMALG00000019842	ZNF319	87	35.172
ENSMALG00000021084	-	83	43.511	ENSMALG00000007051	-	99	46.729
ENSMALG00000021084	-	60	37.857	ENSMALG00000003294	-	98	42.647
ENSMALG00000021084	-	79	34.925	ENSMALG00000011969	-	92	39.881
ENSMALG00000021084	-	81	42.574	ENSMALG00000003906	-	89	47.273
ENSMALG00000021084	-	59	41.033	ENSMALG00000005554	-	87	45.736
ENSMALG00000021084	-	58	49.533	ENSMALG00000013592	-	70	49.533
ENSMALG00000021084	-	75	30.990	ENSMALG00000011720	-	96	36.042
ENSMALG00000021084	-	67	48.837	ENSMALG00000012155	-	97	38.750
ENSMALG00000021084	-	99	43.182	ENSMALG00000005696	-	99	43.182
ENSMALG00000021084	-	61	52.174	ENSMALG00000012056	-	99	38.144
ENSMALG00000021084	-	58	33.117	ENSMALG00000005901	znf319b	72	33.117
ENSMALG00000021084	-	100	43.363	ENSMALG00000003975	-	91	45.455
ENSMALG00000021084	-	58	36.893	ENSMALG00000004413	-	93	45.679
ENSMALG00000021084	-	83	42.308	ENSMALG00000001487	-	87	45.833
ENSMALG00000021084	-	99	43.077	ENSMALG00000005562	-	99	43.902
ENSMALG00000021084	-	58	38.406	ENSMALG00000021985	-	76	38.406
ENSMALG00000021084	-	62	40.437	ENSMALG00000010700	-	91	40.437
ENSMALG00000021084	-	67	32.886	ENSMALG00000009834	-	71	44.000
ENSMALG00000021084	-	60	39.259	ENSMALG00000010959	-	97	39.103
ENSMALG00000021084	-	94	47.967	ENSMALG00000008930	-	100	47.967
ENSMALG00000021084	-	72	36.311	ENSMALG00000010693	-	62	44.275
ENSMALG00000021084	-	99	35.772	ENSMALG00000000710	-	98	35.772
ENSMALG00000021084	-	58	39.752	ENSMALG00000004034	gfi1b	54	39.752
ENSMALG00000021084	-	100	45.985	ENSMALG00000008942	-	91	45.985
ENSMALG00000021084	-	87	38.835	ENSMALG00000004216	-	96	43.678
ENSMALG00000021084	-	52	42.029	ENSMALG00000002956	-	77	45.070
ENSMALG00000021084	-	100	41.176	ENSMALG00000012043	-	98	41.176
ENSMALG00000021084	-	59	36.842	ENSMALG00000012704	scrt1b	58	36.842
ENSMALG00000021084	-	84	41.732	ENSMALG00000018062	-	89	41.772
ENSMALG00000021084	-	62	38.506	ENSMALG00000012008	-	80	45.349
ENSMALG00000021084	-	82	42.754	ENSMALG00000010369	-	90	42.754
ENSMALG00000021084	-	67	37.500	ENSMALG00000011860	-	63	38.037
ENSMALG00000021084	-	58	31.803	ENSMALG00000002274	-	98	35.252
ENSMALG00000021084	-	58	36.190	ENSMALG00000022544	znf526	59	36.190
ENSMALG00000021084	-	76	44.340	ENSMALG00000012757	-	92	44.340
ENSMALG00000021084	-	58	45.255	ENSMALG00000003448	-	99	45.255
ENSMALG00000021084	-	59	37.989	ENSMALG00000004579	-	91	48.571
ENSMALG00000021084	-	100	40.230	ENSMALG00000012840	-	98	40.230
ENSMALG00000021084	-	59	36.111	ENSMALG00000019991	-	95	34.694

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000021084	-	62	35.185	ENSAPOG00000013499	-	66	43.939	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000021084	-	98	37.714	ENSAPOG00000013493	-	80	44.275	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000021084	-	72	39.247	ENSAPOG00000020116	-	94	36.860	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000021084	-	97	45.631	ENSAPOG00000018492	-	94	44.037	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000021084	-	84	42.754	ENSAPOG00000005187	-	67	42.754	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000021084	-	79	39.045	ENSAPOG00000018586	-	88	39.045	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000021084	-	84	49.074	ENSAPOG00000001054	-	97	49.383	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000021084	-	58	39.612	ENSACIG00000022293	-	94	40.000	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000021084	-	81	42.857	ENSACIG00000010647	-	99	46.809	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000021084	-	52	41.176	ENSACIG00000007034	-	98	41.176	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000021084	-	68	37.770	ENSACIG00000023794	-	76	50.000	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000021084	-	81	43.307	ENSACIG00000004041	-	98	50.467	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000021084	-	79	36.129	ENSAOCG00000012903	-	79	41.714	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000021084	-	56	55.072	ENSAOCG00000019475	-	71	55.072	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000021084	-	92	38.095	ENSAOCG00000020624	-	95	35.938	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000021084	-	85	33.945	ENSAOCG00000013578	-	97	43.750	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000021084	-	84	41.606	ENSAOCG00000013951	-	85	43.421	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000021084	-	87	43.966	ENSAOCG00000015369	-	99	50.943	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000021084	-	87	47.273	ENSAOCG00000013934	-	92	47.273	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000021084	-	100	66.102	ENSAOCG00000010954	-	100	66.949	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000021084	-	88	39.456	ENSAOCG00000022459	-	99	43.443	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000021084	-	78	50.000	ENSAOCG00000018484	-	94	47.500	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000021084	-	84	41.606	ENSAPEG00000012229	-	87	41.606	Amphiprion_percula
ENSMALG00000021084	-	100	65.825	ENSAPEG00000005678	-	100	66.667	Amphiprion_percula
ENSMALG00000021084	-	98	43.925	ENSAPEG00000018460	-	74	43.925	Amphiprion_percula
ENSMALG00000021084	-	84	43.151	ENSAPEG00000011020	-	99	48.092	Amphiprion_percula
ENSMALG00000021084	-	87	47.273	ENSAPEG00000012236	-	92	47.273	Amphiprion_percula
ENSMALG00000021084	-	63	37.778	ENSAPEG00000009515	-	88	45.775	Amphiprion_percula
ENSMALG00000021084	-	68	38.320	ENSAPEG00000018471	-	88	39.286	Amphiprion_percula
ENSMALG00000021084	-	83	47.561	ENSAPEG00000008020	-	99	47.561	Amphiprion_percula
ENSMALG00000021084	-	86	45.455	ENSAPEG00000013031	-	98	45.455	Amphiprion_percula
ENSMALG00000021084	-	62	34.921	ENSAPEG00000016462	-	66	43.939	Amphiprion_percula
ENSMALG00000021084	-	68	46.951	ENSATEG00000007325	-	96	46.951	Anabas_testudineus
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ENSMALG00000021084	-	71	40.606	ENSATEG00000005519	-	93	51.852	Anabas_testudineus
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ENSMALG00000021084	-	58	40.876	ENSPNYG00000022104	-	96	42.331	Pundamilia_nyererei
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ENSMALG00000021084	-	99	66.585	ENSPNYG00000009700	-	100	66.993	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000021084	-	61	39.560	ENSPNAG00000010752	-	84	39.560	Pygocentrus_nattereri
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