EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000021686 (Gene tree)
Gene ID: 109956103
Gene Symbol: pusl1
Alias: -
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11871 bases
Position: chrKV884706.1:2691160-2703030
Accession: 109956103
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000031412	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.8e-31	1	2
ENSMALP00000031412	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.8e-31	2	2
ENSMALP00000031419	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.8e-31	1	2
ENSMALP00000031419	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.8e-31	2	2
ENSMALP00000031429	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.8e-31	1	2
ENSMALP00000031429	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.8e-31	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000031962	-	3699	XM_020592969	ENSMALP00000031412	303 (aa)	XP_020448625	UPI0009B390BF
ENSMALT00000031969	-	2914	-	ENSMALP00000031419	303 (aa)	-	UPI0009B390BF
ENSMALT00000031979	-	1771	-	ENSMALP00000031429	303 (aa)	-	UPI0009B390BF

Gene Model

Click here to download ENSMALG00000021686's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMALG00000021686's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000021686	pusl1	93	47.931	ENSG00000169972	PUSL1	97	45.528	Homo_sapiens
ENSMALG00000021686	pusl1	99	72.667	ENSAPOG00000016290	pusl1	97	72.667	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000021686	pusl1	91	47.842	ENSAMEG00000013752	PUSL1	90	47.842	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000021686	pusl1	90	76.642	ENSACIG00000015240	pusl1	99	76.642	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000021686	pusl1	99	71.104	ENSAOCG00000019419	pusl1	92	71.104	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000021686	pusl1	99	72.333	ENSAPEG00000005452	pusl1	97	72.333	Amphiprion_percula
ENSMALG00000021686	pusl1	99	78.930	ENSATEG00000024154	pusl1	99	78.930	Anabas_testudineus
ENSMALG00000021686	pusl1	92	53.405	ENSAPLG00000004946	PUSL1	93	53.405	Anas_platyrhynchos
ENSMALG00000021686	pusl1	82	55.422	ENSACAG00000014111	PUSL1	94	55.422	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000021686	pusl1	95	47.635	ENSANAG00000037456	PUSL1	96	47.635	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000021686	pusl1	98	76.846	ENSACLG00000008675	pusl1	99	76.846	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000021686	pusl1	93	59.364	ENSAMXG00000044007	pusl1	95	59.364	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000021686	pusl1	91	49.819	ENSBTAG00000007619	PUSL1	94	49.819	Bos_taurus
ENSMALG00000021686	pusl1	92	48.571	ENSCJAG00000010972	PUSL1	91	48.571	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000021686	pusl1	92	46.786	ENSCAFG00000019291	PUSL1	91	46.786	Canis_familiaris
ENSMALG00000021686	pusl1	92	47.857	ENSCAFG00020011568	PUSL1	90	47.857	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000021686	pusl1	91	49.458	ENSCHIG00000012615	PUSL1	95	49.458	Capra_hircus
ENSMALG00000021686	pusl1	98	47.492	ENSCPOG00000005149	PUSL1	95	47.492	Cavia_porcellus
ENSMALG00000021686	pusl1	95	48.136	ENSCCAG00000027475	PUSL1	96	48.136	Cebus_capucinus
ENSMALG00000021686	pusl1	93	48.276	ENSCATG00000018260	PUSL1	94	48.276	Cercocebus_atys
ENSMALG00000021686	pusl1	91	49.462	ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	49.462	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000021686	pusl1	93	47.586	ENSCSAG00000000680	PUSL1	94	47.586	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000021686	pusl1	92	56.584	ENSCPBG00000022621	PUSL1	96	56.584	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000021686	pusl1	90	48.913	ENSCANG00000034373	PUSL1	90	48.913	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000021686	pusl1	91	47.482	ENSCGRG00001012429	Pusl1	94	47.482	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000021686	pusl1	91	47.482	ENSCGRG00000006466	Pusl1	94	47.482	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMALG00000021686	pusl1	99	74.000	ENSCSEG00000005159	pusl1	99	74.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000021686	pusl1	78	62.185	ENSCVAG00000012923	pusl1	91	62.185	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000021686	pusl1	97	61.433	ENSDARG00000074565	pusl1	99	62.791	Danio_rerio
ENSMALG00000021686	pusl1	92	34.426	FBgn0083976	CG34140	99	34.426	Drosophila_melanogaster
ENSMALG00000021686	pusl1	91	50.542	ENSECAG00000006248	PUSL1	90	50.542	Equus_caballus
ENSMALG00000021686	pusl1	90	46.931	ENSEEUG00000000837	PUSL1	93	46.931	Erinaceus_europaeus
ENSMALG00000021686	pusl1	96	65.292	ENSELUG00000015945	pusl1	98	65.292	Esox_lucius
ENSMALG00000021686	pusl1	91	48.736	ENSFCAG00000007617	PUSL1	91	48.736	Felis_catus
ENSMALG00000021686	pusl1	98	72.635	ENSFHEG00000006370	pusl1	99	72.635	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000021686	pusl1	93	70.671	ENSGMOG00000019388	pusl1	100	70.671	Gadus_morhua
ENSMALG00000021686	pusl1	93	52.837	ENSGALG00000001714	PUSL1	96	52.837	Gallus_gallus
ENSMALG00000021686	pusl1	94	72.183	ENSGAFG00000007546	pusl1	96	72.183	Gambusia_affinis
ENSMALG00000021686	pusl1	99	73.422	ENSGACG00000007848	pusl1	99	73.422	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000021686	pusl1	95	54.514	ENSGAGG00000004730	PUSL1	98	54.514	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000021686	pusl1	82	47.451	ENSGGOG00000005364	PUSL1	98	47.451	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000021686	pusl1	98	77.181	ENSHBUG00000001264	pusl1	99	77.181	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000021686	pusl1	96	47.619	ENSHGLG00000017570	PUSL1	94	47.619	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000021686	pusl1	93	47.735	ENSHGLG00100007641	PUSL1	94	47.735	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000021686	pusl1	93	74.113	ENSHCOG00000010077	pusl1	100	74.729	Hippocampus_comes
ENSMALG00000021686	pusl1	94	61.806	ENSIPUG00000023921	pusl1	98	61.806	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000021686	pusl1	90	49.275	ENSSTOG00000001783	PUSL1	85	49.275	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000021686	pusl1	92	48.571	ENSJJAG00000020471	Pusl1	94	48.571	Jaculus_jaculus
ENSMALG00000021686	pusl1	89	68.519	ENSKMAG00000005154	pusl1	91	68.519	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000021686	pusl1	97	76.451	ENSLBEG00000013469	pusl1	100	76.451	Labrus_bergylta
ENSMALG00000021686	pusl1	63	53.886	ENSLACG00000018795	PUSL1	95	53.886	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000021686	pusl1	97	54.730	ENSLOCG00000002210	pusl1	96	55.789	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000021686	pusl1	86	50.570	ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	50.570	Loxodonta_africana
ENSMALG00000021686	pusl1	93	47.931	ENSMFAG00000046288	PUSL1	94	47.931	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000021686	pusl1	93	40.878	ENSMMUG00000016279	PUSL1	94	40.878	Macaca_mulatta
ENSMALG00000021686	pusl1	93	48.789	ENSMNEG00000037989	PUSL1	94	48.789	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000021686	pusl1	99	78.808	ENSMAMG00000016538	pusl1	99	78.808	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000021686	pusl1	98	76.846	ENSMZEG00005026990	pusl1	99	76.846	Maylandia_zebra
ENSMALG00000021686	pusl1	93	51.773	ENSMGAG00000003037	PUSL1	95	51.773	Meleagris_gallopavo
ENSMALG00000021686	pusl1	91	47.122	ENSMAUG00000019924	Pusl1	94	47.122	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000021686	pusl1	90	50.362	ENSMICG00000014171	PUSL1	92	50.362	Microcebus_murinus
ENSMALG00000021686	pusl1	91	48.561	ENSMOCG00000005602	Pusl1	94	48.561	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000021686	pusl1	91	76.344	ENSMMOG00000003269	pusl1	99	76.344	Mola_mola
ENSMALG00000021686	pusl1	91	47.842	MGP_CAROLIEiJ_G0026911	Pusl1	94	47.842	Mus_caroli
ENSMALG00000021686	pusl1	90	48.188	ENSMUSG00000051557	Pusl1	93	48.188	Mus_musculus
ENSMALG00000021686	pusl1	91	48.201	MGP_PahariEiJ_G0029260	Pusl1	94	48.201	Mus_pahari
ENSMALG00000021686	pusl1	90	48.913	MGP_SPRETEiJ_G0027906	Pusl1	93	48.913	Mus_spretus
ENSMALG00000021686	pusl1	92	48.043	ENSMPUG00000014313	PUSL1	91	48.043	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000021686	pusl1	91	49.821	ENSNGAG00000004647	Pusl1	82	49.821	Nannospalax_galili
ENSMALG00000021686	pusl1	81	76.829	ENSNBRG00000014762	pusl1	89	76.829	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000021686	pusl1	85	48.106	ENSNLEG00000000051	PUSL1	95	48.106	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000021686	pusl1	91	40.647	ENSMEUG00000005176	-	99	40.647	Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000021686	pusl1	90	50.725	ENSMEUG00000011649	-	96	50.725	Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000021686	pusl1	91	50.179	ENSODEG00000008247	PUSL1	89	50.179	Octodon_degus
ENSMALG00000021686	pusl1	99	77.333	ENSONIG00000019361	pusl1	99	77.333	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000021686	pusl1	95	70.139	ENSORLG00000016228	pusl1	97	70.139	Oryzias_latipes
ENSMALG00000021686	pusl1	95	71.181	ENSORLG00020013710	pusl1	97	71.181	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000021686	pusl1	93	71.277	ENSORLG00015008715	pusl1	99	71.277	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000021686	pusl1	96	70.103	ENSOMEG00000018897	pusl1	100	70.103	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000021686	pusl1	91	48.375	ENSOGAG00000031692	PUSL1	95	48.375	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000021686	pusl1	86	49.810	ENSOARG00000004905	PUSL1	97	49.810	Ovis_aries
ENSMALG00000021686	pusl1	93	48.276	ENSPPAG00000029283	PUSL1	94	48.276	Pan_paniscus
ENSMALG00000021686	pusl1	91	49.097	ENSPPRG00000023329	PUSL1	91	49.097	Panthera_pardus
ENSMALG00000021686	pusl1	83	49.603	ENSPTIG00000018532	PUSL1	93	49.603	Panthera_tigris_altaica
ENSMALG00000021686	pusl1	93	48.276	ENSPTRG00000000021	PUSL1	94	48.276	Pan_troglodytes
ENSMALG00000021686	pusl1	90	48.913	ENSPANG00000000591	PUSL1	90	48.913	Papio_anubis
ENSMALG00000021686	pusl1	93	63.732	ENSPKIG00000002447	pusl1	97	63.732	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000021686	pusl1	83	57.708	ENSPSIG00000002781	PUSL1	94	57.708	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000021686	pusl1	91	67.391	ENSPMGG00000011051	pusl1	99	67.391	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000021686	pusl1	91	48.921	ENSPEMG00000013541	Pusl1	94	48.921	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000021686	pusl1	92	50.000	ENSPCIG00000007816	-	63	50.000	Phascolarctos_cinereus
ENSMALG00000021686	pusl1	100	66.997	ENSPFOG00000015448	pusl1	100	66.997	Poecilia_formosa
ENSMALG00000021686	pusl1	98	68.792	ENSPLAG00000004348	pusl1	100	68.792	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000021686	pusl1	98	68.792	ENSPMEG00000000931	pusl1	100	68.792	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000021686	pusl1	98	68.792	ENSPREG00000002324	pusl1	100	68.792	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000021686	pusl1	83	46.304	ENSPPYG00000002014	PUSL1	91	46.304	Pongo_abelii
ENSMALG00000021686	pusl1	62	48.677	ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	48.677	Procavia_capensis
ENSMALG00000021686	pusl1	66	55.556	ENSPVAG00000001016	PUSL1	66	55.556	Pteropus_vampyrus
ENSMALG00000021686	pusl1	80	77.593	ENSPNYG00000006588	pusl1	100	77.593	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000021686	pusl1	93	61.837	ENSPNAG00000024441	pusl1	97	61.837	Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000021686	pusl1	90	49.275	ENSRNOG00000022354	Pusl1	93	49.275	Rattus_norvegicus
ENSMALG00000021686	pusl1	94	47.423	ENSRBIG00000036842	PUSL1	95	47.423	Rhinopithecus_bieti
ENSMALG00000021686	pusl1	94	47.423	ENSRROG00000030704	PUSL1	95	47.423	Rhinopithecus_roxellana
ENSMALG00000021686	pusl1	87	47.232	ENSSBOG00000032249	PUSL1	97	47.232	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMALG00000021686	pusl1	91	63.669	ENSSFOG00015008281	pusl1	91	63.669	Scleropages_formosus
ENSMALG00000021686	pusl1	99	75.000	ENSSMAG00000007187	pusl1	99	75.000	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000021686	pusl1	99	75.251	ENSSDUG00000000287	pusl1	92	75.251	Seriola_dumerili
ENSMALG00000021686	pusl1	99	75.585	ENSSLDG00000009605	pusl1	95	75.585	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000021686	pusl1	57	47.977	ENSSARG00000005323	-	91	47.977	Sorex_araneus
ENSMALG00000021686	pusl1	90	68.978	ENSSPAG00000002528	pusl1	99	68.978	Stegastes_partitus
ENSMALG00000021686	pusl1	91	48.921	ENSSSCG00000003338	PUSL1	90	48.921	Sus_scrofa
ENSMALG00000021686	pusl1	90	52.364	ENSTGUG00000003214	PUSL1	96	52.174	Taeniopygia_guttata
ENSMALG00000021686	pusl1	96	71.724	ENSTRUG00000010102	pusl1	97	71.724	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000021686	pusl1	60	67.956	ENSTNIG00000005789	pusl1	82	67.956	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000021686	pusl1	56	47.977	ENSTBEG00000005001	PUSL1	71	47.977	Tupaia_belangeri
ENSMALG00000021686	pusl1	91	42.806	ENSTTRG00000017030	PUSL1	90	42.806	Tursiops_truncatus
ENSMALG00000021686	pusl1	79	49.174	ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	49.174	Ursus_americanus
ENSMALG00000021686	pusl1	79	49.587	ENSUMAG00000002084	PUSL1	79	49.587	Ursus_maritimus
ENSMALG00000021686	pusl1	95	47.079	ENSVVUG00000004320	PUSL1	91	42.320	Vulpes_vulpes
ENSMALG00000021686	pusl1	74	55.556	ENSXETG00000011145	pusl1	97	55.556	Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000021686	pusl1	93	68.440	ENSXCOG00000017748	pusl1	99	68.440	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000021686	pusl1	98	70.470	ENSXMAG00000018846	pusl1	100	70.470	Xiphophorus_maculatus