EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000022187 (Gene tree)
Gene ID: 109969393
Gene Symbol: rab11bb
Alias: zgc:92772
Full Name: ras-related protein Rab-11B
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5410 bases
Position: chrKV884860.1:1943198-1948607
Accession: 109969393
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000032193	MMR_HSR1	PF01926.23	3.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000032750	-	657	XM_020616242	ENSMALP00000032193	218 (aa)	XP_020471898	UPI0000364045

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
malb04144	Endocytosis	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000022187	rab11bb	66	43.448	ENSMALG00000003479	rab35b	91	43.448
ENSMALG00000022187	rab11bb	97	31.797	ENSMALG00000013514	rab38b	92	31.797
ENSMALG00000022187	rab11bb	70	34.839	ENSMALG00000010781	kras	88	35.928
ENSMALG00000022187	rab11bb	72	38.217	ENSMALG00000010549	rab41	74	38.217
ENSMALG00000022187	rab11bb	68	33.333	ENSMALG00000017903	rheb	84	32.432
ENSMALG00000022187	rab11bb	76	36.145	ENSMALG00000002696	rras	79	36.145
ENSMALG00000022187	rab11bb	77	33.929	ENSMALG00000011273	hrasb	92	35.000
ENSMALG00000022187	rab11bb	78	74.706	ENSMALG00000015154	rab25a	82	74.706
ENSMALG00000022187	rab11bb	72	40.491	ENSMALG00000016312	RAB7A	78	40.491
ENSMALG00000022187	rab11bb	96	40.476	ENSMALG00000010438	rab30	97	40.476
ENSMALG00000022187	rab11bb	72	36.306	ENSMALG00000017417	rab6bb	75	36.306
ENSMALG00000022187	rab11bb	76	43.976	ENSMALG00000021928	rab15	78	43.976
ENSMALG00000022187	rab11bb	94	35.000	ENSMALG00000022693	rab33ba	90	35.000
ENSMALG00000022187	rab11bb	75	47.239	ENSMALG00000022348	-	74	47.239
ENSMALG00000022187	rab11bb	74	42.593	ENSMALG00000016038	RAB15	76	42.593
ENSMALG00000022187	rab11bb	95	36.620	ENSMALG00000015762	rab12	84	36.620
ENSMALG00000022187	rab11bb	89	32.000	ENSMALG00000015854	rab6ba	92	32.000
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	63.761	ENSMALG00000004112	rab25b	100	63.761
ENSMALG00000022187	rab11bb	77	36.905	ENSMALG00000005944	rabl2	72	36.905
ENSMALG00000022187	rab11bb	99	81.106	ENSMALG00000004093	rab11al	99	81.106
ENSMALG00000022187	rab11bb	89	43.005	ENSMALG00000020807	-	92	43.005
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	91.284	ENSMALG00000021949	rab11ba	100	91.284
ENSMALG00000022187	rab11bb	66	40.667	ENSMALG00000021944	-	95	40.741
ENSMALG00000022187	rab11bb	98	44.700	ENSMALG00000012003	rab1ab	99	46.226
ENSMALG00000022187	rab11bb	72	37.580	ENSMALG00000020364	-	75	37.580
ENSMALG00000022187	rab11bb	77	35.714	ENSMALG00000007905	RAB17	67	35.714
ENSMALG00000022187	rab11bb	75	45.181	ENSMALG00000018973	RAB39B	78	45.181
ENSMALG00000022187	rab11bb	78	33.143	ENSMALG00000018436	RAB29	76	33.143
ENSMALG00000022187	rab11bb	84	34.973	ENSMALG00000002136	rab23	84	35.149
ENSMALG00000022187	rab11bb	94	38.725	ENSMALG00000006052	rab5c	88	38.725
ENSMALG00000022187	rab11bb	78	45.029	ENSMALG00000005069	rab18b	83	45.029
ENSMALG00000022187	rab11bb	53	30.252	ENSMALG00000011378	arl4cb	60	30.252
ENSMALG00000022187	rab11bb	81	37.912	ENSMALG00000012506	rab9a	84	37.912
ENSMALG00000022187	rab11bb	74	30.636	ENSMALG00000017553	rasl11a	67	30.636
ENSMALG00000022187	rab11bb	96	46.890	ENSMALG00000006985	-	98	46.890
ENSMALG00000022187	rab11bb	77	30.178	ENSMALG00000019758	rras2	83	30.178
ENSMALG00000022187	rab11bb	96	45.933	ENSMALG00000021144	rab1ba	99	45.933
ENSMALG00000022187	rab11bb	77	52.096	ENSMALG00000003956	-	78	52.096
ENSMALG00000022187	rab11bb	74	38.323	ENSMALG00000015936	RAB9A	77	38.323
ENSMALG00000022187	rab11bb	82	38.043	ENSMALG00000012630	rab33a	82	38.043
ENSMALG00000022187	rab11bb	70	37.037	ENSMALG00000013806	rab36	65	37.037
ENSMALG00000022187	rab11bb	78	39.884	ENSMALG00000003712	zgc:101559	74	39.884
ENSMALG00000022187	rab11bb	72	43.949	ENSMALG00000011693	rab22a	81	43.949
ENSMALG00000022187	rab11bb	95	32.432	ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	97	32.432
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	87.156	ENSMALG00000003050	rab11a	100	87.156
ENSMALG00000022187	rab11bb	80	41.954	ENSMALG00000022118	rab14	79	41.954
ENSMALG00000022187	rab11bb	96	39.234	ENSMALG00000014727	si:dkey-16l2.16	97	39.234
ENSMALG00000022187	rab11bb	79	40.678	ENSMALG00000007664	rab9b	81	40.678
ENSMALG00000022187	rab11bb	78	54.386	ENSMALG00000004342	rab2a	81	54.386
ENSMALG00000022187	rab11bb	79	45.977	ENSMALG00000012723	RAB39B	82	45.977
ENSMALG00000022187	rab11bb	74	34.756	ENSMALG00000012930	si:ch73-116o1.2	82	36.364
ENSMALG00000022187	rab11bb	94	42.718	ENSMALG00000014929	rab5aa	90	42.718
ENSMALG00000022187	rab11bb	74	45.679	ENSMALG00000009813	rab18a	79	45.679
ENSMALG00000022187	rab11bb	77	52.381	ENSMALG00000021129	zgc:171927	80	52.381
ENSMALG00000022187	rab11bb	72	40.491	ENSMALG00000004053	RAB7A	78	40.491

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSAPOG00000023455	rab11bb	100	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	87.156	ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSACIG00000024376	-	100	97.706	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSAOCG00000018849	-	100	97.706	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSAOCG00000018239	rab11bb	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSAPEG00000016590	rab11bb	100	100.000	Amphiprion_percula
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSATEG00000017696	rab11bb	100	100.000	Anabas_testudineus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	98.165	ENSATEG00000023725	-	100	98.165	Anabas_testudineus
ENSMALG00000022187	rab11bb	94	98.058	ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	Anas_platyrhynchos
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSACLG00000007076	rab11bb	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSACLG00000005446	-	100	97.706	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	98.624	ENSAMXG00000042655	rab11bb	100	98.624	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.789	ENSAMXG00000037623	-	100	96.789	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.330	ENSBTAG00000002475	RAB11B	100	96.330	Bos_taurus
ENSMALG00000022187	rab11bb	96	94.737	ENSCHIG00000022426	-	93	94.737	Capra_hircus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.330	ENSCATG00000029188	-	100	96.330	Cercocebus_atys
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.248	ENSCPBG00000017056	-	100	97.248	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSCSEG00000012149	rab11bb	100	100.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.248	ENSCSEG00000007239	-	100	97.248	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.789	ENSCVAG00000019718	-	100	96.789	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	94.495	ENSCVAG00000019751	-	100	94.495	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSCVAG00000017021	-	100	100.000	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	98.165	ENSDARG00000090086	rab11bb	100	98.165	Danio_rerio
ENSMALG00000022187	rab11bb	99	94.931	ENSETEG00000000905	-	99	94.931	Echinops_telfairi
ENSMALG00000022187	rab11bb	99	94.884	ENSEASG00005003708	-	99	94.884	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000022187	rab11bb	99	94.884	ENSECAG00000000716	RAB11B	99	94.884	Equus_caballus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	98.165	ENSELUG00000021148	rab11bb	100	98.165	Esox_lucius
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	95.413	ENSELUG00000000916	-	100	95.413	Esox_lucius
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.330	ENSELUG00000020948	-	98	100.000	Esox_lucius
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.248	ENSFALG00000011828	-	100	97.248	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSFHEG00000018353	rab11bb	100	100.000	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	98.165	ENSFHEG00000022676	-	100	98.165	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000022187	rab11bb	99	93.519	ENSGMOG00000009668	-	99	93.519	Gadus_morhua
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	99.541	ENSGMOG00000009211	rab11bb	100	99.541	Gadus_morhua
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.248	ENSGALG00000000613	RAB11B	100	97.248	Gallus_gallus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSGAFG00000007102	rab11bb	100	100.000	Gambusia_affinis
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	99.541	ENSGACG00000015479	rab11bb	100	99.541	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	94.495	ENSGACG00000013297	-	99	94.495	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.330	ENSGGOG00000014516	RAB11B	100	96.330	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSHBUG00000009947	-	100	97.706	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSHBUG00000014777	rab11bb	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	99.541	ENSHCOG00000002423	rab11bb	100	99.541	Hippocampus_comes
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	93.578	ENSHCOG00000000985	-	100	93.578	Hippocampus_comes
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	95.413	ENSHCOG00000000954	-	100	95.413	Hippocampus_comes
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.248	ENSIPUG00000025100	rab11b	100	97.248	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	99.083	ENSIPUG00000019927	rab11bb	100	99.083	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSKMAG00000006170	-	100	97.706	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSKMAG00000009033	rab11bb	100	100.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	89.450	ENSLBEG00000005981	-	100	89.450	Labrus_bergylta
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	99.541	ENSLBEG00000015248	rab11bb	100	99.541	Labrus_bergylta
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.789	ENSLBEG00000004172	-	100	96.789	Labrus_bergylta
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.248	ENSLACG00000016857	-	100	97.248	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.330	ENSMFAG00000003654	RAB11B	100	96.330	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.330	ENSMLEG00000030601	-	100	96.330	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.789	ENSMAMG00000018533	-	100	96.789	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	99.541	ENSMAMG00000006378	rab11bb	100	99.541	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSMZEG00005010975	-	100	97.706	Maylandia_zebra
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSMZEG00005003352	rab11bb	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.330	ENSMICG00000034065	-	100	96.330	Microcebus_murinus
ENSMALG00000022187	rab11bb	99	95.853	ENSMMOG00000001238	-	99	95.853	Mola_mola
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSMMOG00000001250	-	100	97.706	Mola_mola
ENSMALG00000022187	rab11bb	94	100.000	ENSMMOG00000007917	rab11bb	100	100.000	Mola_mola
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.248	ENSMODG00000003841	-	100	97.248	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000022187	rab11bb	94	87.923	ENSMLUG00000006677	-	100	87.923	Myotis_lucifugus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSNBRG00000023885	-	100	97.706	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSNBRG00000000372	rab11bb	100	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.248	ENSMEUG00000003686	-	100	97.248	Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSONIG00000010435	rab11bb	100	100.000	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSONIG00000002544	-	100	97.706	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000022187	rab11bb	52	94.737	ENSOANG00000031567	-	82	94.737	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMALG00000022187	rab11bb	99	95.853	ENSORLG00000015284	-	72	95.853	Oryzias_latipes
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	99.541	ENSORLG00000013938	rab11bb	100	99.541	Oryzias_latipes
ENSMALG00000022187	rab11bb	99	95.853	ENSORLG00020020844	RAB11B	99	95.853	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	99.541	ENSORLG00020019393	rab11bb	100	99.541	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	99.541	ENSORLG00015020173	rab11bb	100	99.541	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000022187	rab11bb	99	95.853	ENSORLG00015016999	RAB11B	99	95.853	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.789	ENSOMEG00000002562	-	100	96.789	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSOMEG00000017806	-	100	100.000	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.330	ENSPPAG00000028589	-	100	96.330	Pan_paniscus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.330	ENSPTRG00000010422	RAB11B	100	96.330	Pan_troglodytes
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.330	ENSPANG00000007765	-	100	96.330	Papio_anubis
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	99.083	ENSPKIG00000011640	rab11bb	100	99.083	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	98.624	ENSPKIG00000011703	-	100	98.624	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000022187	rab11bb	98	97.196	ENSPKIG00000001389	-	69	97.196	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000022187	rab11bb	98	93.151	ENSPSIG00000010242	-	85	93.151	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSPMGG00000009435	rab11bb	100	100.000	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000022187	rab11bb	99	93.088	ENSPMGG00000014336	-	99	93.088	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.789	ENSPMGG00000014333	-	100	96.789	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000022187	rab11bb	97	95.755	ENSPCIG00000020371	-	99	95.755	Phascolarctos_cinereus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSPFOG00000024114	-	100	100.000	Poecilia_formosa
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSPFOG00000006224	-	100	97.706	Poecilia_formosa
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSPLAG00000014207	-	100	97.706	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSPLAG00000001598	rab11bb	100	100.000	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSPMEG00000012389	rab11bb	100	100.000	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSPMEG00000007842	-	100	97.706	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.248	ENSPREG00000006336	-	100	97.248	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSPREG00000014269	rab11bb	100	100.000	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSPNYG00000004098	rab11bb	100	100.000	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSPNYG00000019611	-	100	97.706	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.330	ENSRROG00000037812	-	100	96.330	Rhinopithecus_roxellana
ENSMALG00000022187	rab11bb	97	96.226	ENSSHAG00000006816	-	97	96.226	Sarcophilus_harrisii
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	75.229	ENSSFOG00015006245	-	100	75.229	Scleropages_formosus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSSFOG00015009042	rab11bb	100	97.706	Scleropages_formosus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	99.541	ENSSMAG00000004922	rab11bb	100	99.541	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	94.954	ENSSMAG00000018613	-	100	94.954	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSSDUG00000013558	rab11bb	100	100.000	Seriola_dumerili
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSSDUG00000002934	-	100	97.706	Seriola_dumerili
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSSLDG00000020676	rab11bb	100	100.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSSLDG00000005275	-	100	97.706	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	96.789	ENSSPUG00000002243	-	100	96.789	Sphenodon_punctatus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSSPAG00000011419	rab11bb	100	100.000	Stegastes_partitus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSSPAG00000014559	-	100	97.706	Stegastes_partitus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.248	ENSTGUG00000000084	-	100	97.248	Taeniopygia_guttata
ENSMALG00000022187	rab11bb	99	97.685	ENSTRUG00000021619	-	100	97.685	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000022187	rab11bb	99	94.931	ENSTRUG00000021614	-	99	94.931	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSTRUG00000022029	rab11bb	100	100.000	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000022187	rab11bb	93	96.552	ENSTNIG00000002003	-	100	96.552	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	98.624	ENSTNIG00000011081	rab11bb	100	98.624	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000022187	rab11bb	99	94.470	ENSTNIG00000013184	-	99	94.470	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000022187	rab11bb	99	97.685	ENSTNIG00000013182	-	100	97.685	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000022187	rab11bb	94	97.073	ENSUAMG00000006639	-	99	97.073	Ursus_americanus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.260	ENSXETG00000025484	rab11b.1	99	97.260	Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.706	ENSXCOG00000009190	-	100	97.706	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSXCOG00000008042	-	100	100.000	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	100.000	ENSXMAG00000011926	rab11bb	100	100.000	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.248	ENSXMAG00000024840	-	100	97.248	Xiphophorus_maculatus