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Description

Ensembl ID: ENSMAMG00000001357 (Gene tree)
Gene ID: 113124251
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mastacembelus_armatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 20478 bases
Position: chrOOHQ01000096.1:17526807-17547284
Accession: 113124251
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMAMP00000001974	IBN_N	PF03810.19	8.5e-15	1	1
ENSMAMP00000002035	IBN_N	PF03810.19	9.6e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMAMT00000002015	-	6108	XM_026296814	ENSMAMP00000001974	890 (aa)	XP_026152599	UPI000E45B447
ENSMAMT00000002080	-	2703	-	ENSMAMP00000002035	900 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMAMG00000001357	tnpo1	99	84.667	ENSMAMG00000023658	tnpo2	99	84.667
ENSMAMG00000001357	tnpo1	99	87.050	ENSMAMG00000011862	-	99	87.050

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSG00000083312	TNPO1	100	94.301	Homo_sapiens
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	99.101	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	99.101	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	92.539	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.650	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMAMG00000001357	tnpo1	87	98.062	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	98.062	Amphilophus_citrinellus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	99.101	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	99.101	Amphiprion_ocellaris
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	99.101	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	99.101	Amphiprion_percula
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	99.101	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	99.101	Anabas_testudineus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	99	89.515	ENSAPLG00000009619	-	97	90.482	Anas_platyrhynchos
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	94.157	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	94.157	Anolis_carolinensis
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.034	ENSANAG00000022453	-	99	93.034	Aotus_nancymaae
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	60.310	ENSANAG00000027118	-	99	60.643	Aotus_nancymaae
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	83.483	ENSANAG00000025351	-	99	83.483	Aotus_nancymaae
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	96.854	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	96.854	Astatotilapia_calliptera
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	95.067	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.843	Astyanax_mexicanus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.596	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	93.596	Bos_taurus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.146	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.146	Callithrix_jacchus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	96	93.582	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.582	Canis_familiaris
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	91.124	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	91.124	Canis_lupus_dingo
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.483	Capra_hircus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	99	90.056	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.398	Carlito_syrichta
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.034	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	93.034	Cebus_capucinus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	93.483	Cercocebus_atys
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.034	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.034	Chinchilla_lanigera
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	93.483	Chlorocebus_sabaeus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	94	81.883	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	82.002	Choloepus_hoffmanni
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	94.157	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	94.157	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAMG00000001357	tnpo1	99	76.431	ENSCSAVG00000010981	-	99	76.094	Ciona_savignyi
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	93.483	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.371	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.371	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMAMG00000001357	tnpo1	96	93.684	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	93.684	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	96.517	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.517	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.753	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	97.753	Cyprinodon_variegatus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	95.286	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.613	Danio_rerio
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	87.794	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.794	Dasypus_novemcinctus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	93	93.855	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.848	Dipodomys_ordii
ENSMAMG00000001357	tnpo1	99	58.625	FBgn0035693	CG8219	99	58.286	Drosophila_melanogaster
ENSMAMG00000001357	tnpo1	86	95.506	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.506	Echinops_telfairi
ENSMAMG00000001357	tnpo1	94	85.595	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.595	Eptatretus_burgeri
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	93.483	Equus_asinus_asinus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	93.483	Equus_caballus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	89.107	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.671	Esox_lucius
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	93.483	Felis_catus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	94.045	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.045	Ficedula_albicollis
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.146	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.146	Fukomys_damarensis
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.755	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	97.755	Fundulus_heteroclitus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.169	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	93.169	Gadus_morhua
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.146	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.146	Gallus_gallus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.422	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	97.422	Gambusia_affinis
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	96.629	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.629	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	94.045	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.045	Gopherus_agassizii
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	78.251	ENSGGOG00000022535	-	98	78.251	Gorilla_gorilla
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	93.483	Gorilla_gorilla
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	98.652	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	98.652	Haplochromis_burtoni
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.034	ENSHGLG00000000970	-	99	93.034	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAMG00000001357	tnpo1	96	93.224	ENSHGLG00100017090	-	99	93.224	Heterocephalus_glaber_male
ENSMAMG00000001357	tnpo1	97	73.140	ENSHGLG00100000963	-	99	72.442	Heterocephalus_glaber_male
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.596	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.596	Jaculus_jaculus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.640	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	97.640	Kryptolebias_marmoratus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	91	94.575	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	94.575	Labrus_bergylta
ENSMAMG00000001357	tnpo1	96	87.093	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.093	Latimeria_chalumnae
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	94.831	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.831	Lepisosteus_oculatus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	97	92.956	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.956	Loxodonta_africana
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	93.483	Macaca_fascicularis
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.371	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.567	Macaca_mulatta
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	93.483	Macaca_nemestrina
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	93.483	Mandrillus_leucophaeus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	98.202	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	98.202	Maylandia_zebra
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.371	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	92.697	Mesocricetus_auratus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	89.775	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.775	Microcebus_murinus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.371	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.371	Microtus_ochrogaster
ENSMAMG00000001357	tnpo1	87	97.680	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	97.680	Mola_mola
ENSMAMG00000001357	tnpo1	99	94.468	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.468	Monodelphis_domestica
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.753	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	97.753	Monopterus_albus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.371	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.680	Mus_caroli
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.371	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.680	Mus_musculus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.804	Mus_pahari
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.146	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.432	Mus_spretus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	93.483	Mustela_putorius_furo
ENSMAMG00000001357	tnpo1	96	93.248	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.248	Myotis_lucifugus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.483	Nannospalax_galili
ENSMAMG00000001357	tnpo1	87	98.062	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	98.062	Neolamprologus_brichardi
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	93.483	Nomascus_leucogenys
ENSMAMG00000001357	tnpo1	90	88.548	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.525	Ochotona_princeps
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	92.809	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.809	Octodon_degus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.879	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	97.879	Oreochromis_niloticus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	92	94.634	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.634	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	96	87.617	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.617	Oryctolagus_cuniculus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	87	97.406	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.406	Oryzias_latipes
ENSMAMG00000001357	tnpo1	99	97.745	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	97.745	Oryzias_latipes_hni
ENSMAMG00000001357	tnpo1	99	98.083	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	98.083	Oryzias_latipes_hsok
ENSMAMG00000001357	tnpo1	99	97.632	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.632	Oryzias_melastigma
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	93.483	Otolemur_garnettii
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.596	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.596	Ovis_aries
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	93.483	Pan_paniscus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	93.483	Panthera_pardus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	93.483	Panthera_tigris_altaica
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	93.483	Pan_troglodytes
ENSMAMG00000001357	tnpo1	94	82.182	ENSPTRG00000047731	-	100	82.044	Pan_troglodytes
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	93.483	Papio_anubis
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	91.573	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.573	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	94.045	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	94.045	Pelodiscus_sinensis
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	94.388	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.164	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	96	93.684	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.684	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	94.494	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.494	Phascolarctos_cinereus
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.648	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	97.648	Poecilia_formosa
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.648	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	97.648	Poecilia_latipinna
ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	98.090	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	98.090	Poecilia_mexicana
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ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.371	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.371	Pongo_abelii
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ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.755	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	97.755	Xiphophorus_maculatus