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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSMAMG00000002279 (Gene tree)
Gene ID: 113139350
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mastacembelus_armatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17276 bases
Position: chrOOHQ01000039.1:6185947-6203222
Accession: 113139350
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMAMP00000003309	RRM_1	PF00076.22	4.2e-34	1	2
ENSMAMP00000003309	RRM_1	PF00076.22	4.2e-34	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMAMT00000003385	MSI1-201	2907	XM_026322495	ENSMAMP00000003309	347 (aa)	XP_026178280	UPI000E45E7E7

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMAMG00000002279	MSI1	53	41.176	ENSMAMG00000006307	HNRNPA3	58	41.176
ENSMAMG00000002279	MSI1	54	35.450	ENSMAMG00000017754	HNRNPA0	80	34.562
ENSMAMG00000002279	MSI1	54	46.524	ENSMAMG00000008021	hnrnpaba	79	38.889
ENSMAMG00000002279	MSI1	97	71.795	ENSMAMG00000002488	-	99	78.808
ENSMAMG00000002279	MSI1	55	47.399	ENSMAMG00000004971	hnrnpd	78	40.079
ENSMAMG00000002279	MSI1	54	45.213	ENSMAMG00000020142	-	84	38.235
ENSMAMG00000002279	MSI1	86	30.526	ENSMAMG00000024135	rbm38	81	30.526
ENSMAMG00000002279	MSI1	57	35.176	ENSMAMG00000009233	tardbpl	54	36.527
ENSMAMG00000002279	MSI1	97	72.527	ENSMAMG00000010503	msi2a	100	67.241
ENSMAMG00000002279	MSI1	50	40.230	ENSMAMG00000017728	-	75	39.901
ENSMAMG00000002279	MSI1	57	40.196	ENSMAMG00000007606	-	57	40.513
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	91.977	ENSMAMG00000018426	-	100	91.977

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	ENSG00000135097	MSI1	100	83.425	Homo_sapiens
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	92.264	ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.264	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	97.994	ENSAPOG00000023458	-	100	97.994	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	64.567	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	64.567	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMAMG00000002279	MSI1	87	87.375	ENSACIG00000017754	-	72	92.079	Amphilophus_citrinellus
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	89.297	ENSAOCG00000009031	-	95	89.297	Amphiprion_ocellaris
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	92.264	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	92.264	Amphiprion_ocellaris
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	92.264	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	92.264	Amphiprion_percula
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	97.994	ENSAPEG00000006857	-	84	97.994	Amphiprion_percula
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	94.085	ENSATEG00000017059	MSI1	100	94.085	Anabas_testudineus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	84.136	ENSATEG00000023779	-	100	84.136	Anabas_testudineus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.657	ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.211	Anolis_carolinensis
ENSMAMG00000002279	MSI1	96	75.522	ENSANAG00000027901	-	100	75.522	Aotus_nancymaae
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	ENSANAG00000027151	MSI1	100	83.425	Aotus_nancymaae
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	99.138	ENSACLG00000000117	-	100	99.138	Astatotilapia_calliptera
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	91.738	ENSACLG00000011230	MSI1	100	91.738	Astatotilapia_calliptera
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	92.790	ENSAMXG00000038960	msi1	76	92.790	Astyanax_mexicanus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	84.751	Bos_taurus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	83.425	Callithrix_jacchus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.149	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	83.149	Canis_familiaris
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.887	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	84.887	Canis_lupus_dingo
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	81.199	ENSCHIG00000024304	MSI1	100	81.199	Capra_hircus
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.098	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.098	Carlito_syrichta
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	75.719	ENSCAPG00000003919	MSI1	78	83.883	Cavia_aperea
ENSMAMG00000002279	MSI1	95	84.593	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	84.795	Cavia_porcellus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	83.425	Cebus_capucinus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.425	Cercocebus_atys
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.795	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	84.795	Chinchilla_lanigera
ENSMAMG00000002279	MSI1	78	84.116	ENSCSAG00000002265	MSI1	96	84.116	Chlorocebus_sabaeus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	87.179	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	87.179	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.146	ENSCANG00000040651	MSI1	100	84.146	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.425	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.195	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.195	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	97.701	ENSCSEG00000008352	-	100	97.701	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	89.264	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	89.264	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	90.857	ENSCSEG00000005834	-	100	90.857	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAMG00000002279	MSI1	62	74.537	ENSCVAG00000017463	-	89	74.537	Cyprinodon_variegatus
ENSMAMG00000002279	MSI1	51	65.672	ENSCVAG00000017430	zgc:110796	94	65.672	Cyprinodon_variegatus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	97.989	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	97.989	Cyprinodon_variegatus
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	88.254	ENSDARG00000010710	msi1	100	94.393	Danio_rerio
ENSMAMG00000002279	MSI1	79	91.628	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	91.628	Danio_rerio
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	81.646	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	81.646	Dasypus_novemcinctus
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	83.533	ENSDORG00000005610	Msi1	94	83.533	Dipodomys_ordii
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	81.402	ENSETEG00000004756	MSI1	100	81.402	Echinops_telfairi
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	ENSEASG00005004736	MSI1	100	83.425	Equus_asinus_asinus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	ENSECAG00000017526	MSI1	100	83.425	Equus_caballus
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	89.685	ENSELUG00000023219	MSI1	92	89.685	Esox_lucius
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	86.810	ENSELUG00000023280	-	100	86.810	Esox_lucius
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.425	Felis_catus
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	88.667	ENSFALG00000007574	MSI1	100	88.667	Ficedula_albicollis
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	83.841	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	83.841	Fukomys_damarensis
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	91.714	ENSFHEG00000003560	-	100	91.714	Fundulus_heteroclitus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	97.421	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	97.421	Fundulus_heteroclitus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	95.677	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	95.389	Gadus_morhua
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	82.720	ENSGMOG00000017838	-	100	82.720	Gadus_morhua
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	88.168	ENSGALG00000007227	MSI1	98	75.703	Gallus_gallus
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	92.049	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	92.049	Gambusia_affinis
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	74.644	ENSGAFG00000005860	-	100	74.644	Gambusia_affinis
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.934	ENSGACG00000008674	-	100	83.934	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	96.848	ENSGACG00000012679	MSI1	100	96.848	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	87.179	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	87.179	Gopherus_agassizii
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.713	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	84.713	Gorilla_gorilla
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	99.138	ENSHBUG00000011841	-	100	99.138	Haplochromis_burtoni
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	91.738	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	91.738	Haplochromis_burtoni
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.149	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	83.149	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	83.841	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	83.841	Heterocephalus_glaber_male
ENSMAMG00000002279	MSI1	90	90.735	ENSHCOG00000012019	MSI1	95	90.735	Hippocampus_comes
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	91.761	ENSHCOG00000012067	-	100	91.761	Hippocampus_comes
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	91.117	ENSIPUG00000001976	msi1	100	91.117	Ictalurus_punctatus
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.887	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	84.887	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	73.056	ENSJJAG00000010643	-	100	72.346	Jaculus_jaculus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	83.425	Jaculus_jaculus
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	87.117	ENSKMAG00000019877	-	100	87.117	Kryptolebias_marmoratus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	97.983	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	97.983	Kryptolebias_marmoratus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	97.708	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	97.708	Labrus_bergylta
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	91.714	ENSLBEG00000001375	-	100	91.714	Labrus_bergylta
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	83.626	ENSLACG00000018287	MSI1	100	83.721	Latimeria_chalumnae
ENSMAMG00000002279	MSI1	52	80.000	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	71	80.000	Lepisosteus_oculatus
ENSMAMG00000002279	MSI1	90	74.924	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	74.924	Loxodonta_africana
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.795	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	84.795	Macaca_fascicularis
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.795	ENSMMUG00000031527	MSI1	97	83.908	Macaca_mulatta
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	ENSMNEG00000040034	MSI1	100	83.425	Macaca_nemestrina
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.146	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	84.146	Mandrillus_leucophaeus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	91.738	ENSMZEG00005026892	MSI1	100	91.738	Maylandia_zebra
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	99.138	ENSMZEG00005000340	-	100	99.138	Maylandia_zebra
ENSMAMG00000002279	MSI1	63	94.083	ENSMGAG00000016518	-	100	94.083	Meleagris_gallopavo
ENSMAMG00000002279	MSI1	70	89.300	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	89.300	Mesocricetus_auratus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	ENSMICG00000033181	MSI1	100	83.425	Microcebus_murinus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.149	ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.149	Microtus_ochrogaster
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	82.133	ENSMMOG00000012265	-	100	82.133	Mola_mola
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	86.239	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	86.239	Mola_mola
ENSMAMG00000002279	MSI1	90	57.831	ENSMODG00000003189	-	100	57.229	Monodelphis_domestica
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	98.851	ENSMALG00000017889	MSI1	100	98.851	Monopterus_albus
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	92.331	ENSMALG00000001426	-	100	92.331	Monopterus_albus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	82.873	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	100	82.873	Mus_caroli
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	82.873	ENSMUSG00000054256	Msi1	99	86.728	Mus_musculus
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	85.714	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	100	85.714	Mus_pahari
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	82.873	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	100	82.873	Mus_spretus
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.887	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	84.887	Mustela_putorius_furo
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	75.595	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	75.595	Myotis_lucifugus
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.195	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.195	Nannospalax_galili
ENSMAMG00000002279	MSI1	89	84.016	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	84.016	Neolamprologus_brichardi
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	99.138	ENSNBRG00000000841	-	100	99.138	Neolamprologus_brichardi
ENSMAMG00000002279	MSI1	90	74.695	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	74.695	Nomascus_leucogenys
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ENSMAMG00000002279	MSI1	90	77.143	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.143	Ochotona_princeps
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.146	ENSODEG00000006328	MSI1	100	84.146	Octodon_degus
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ENSMAMG00000002279	MSI1	100	98.281	ENSORLG00015013672	-	71	98.281	Oryzias_latipes_hsok
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ENSMAMG00000002279	MSI1	94	86.239	ENSPSIG00000011608	-	93	86.239	Pelodiscus_sinensis
ENSMAMG00000002279	MSI1	79	80.263	ENSPSIG00000009621	-	100	80.702	Pelodiscus_sinensis
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ENSMAMG00000002279	MSI1	94	82.789	ENSPEMG00000010491	Msi1	95	82.789	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSMAMG00000002279	MSI1	100	91.143	ENSPLAG00000012431	-	97	91.143	Poecilia_latipinna
ENSMAMG00000002279	MSI1	100	91.117	ENSPMEG00000007025	-	86	91.117	Poecilia_mexicana
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ENSMAMG00000002279	MSI1	76	89.340	ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.340	Procavia_capensis
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ENSMAMG00000002279	MSI1	94	83.939	ENSRROG00000041076	MSI1	93	83.939	Rhinopithecus_roxellana
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.795	ENSSBOG00000030259	MSI1	99	84.795	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMAMG00000002279	MSI1	94	74.837	ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.837	Sarcophilus_harrisii
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ENSMAMG00000002279	MSI1	54	84.375	ENSSPAG00000015573	zgc:110796	82	84.375	Stegastes_partitus
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ENSMAMG00000002279	MSI1	94	74.924	ENSXCOG00000017605	MSI1	89	74.924	Xiphophorus_couchianus
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ENSMAMG00000002279	MSI1	100	91.404	ENSXMAG00000018237	-	100	91.404	Xiphophorus_maculatus