EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMAMG00000002927 (Gene tree)
Gene ID: 113126708
Gene Symbol: skiv2l
Alias: fb70b07|wu:fb70b07
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Mastacembelus_armatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14030 bases
Position: chrOOHQ01000103.1:15881144-15895173
Accession: 113126708
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMAMP00000004412	rRNA_proc-arch	PF13234.6	3.2e-28	1	1
ENSMAMP00000004446	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.7e-26	1	1
ENSMAMP00000004446	DEAD	PF00270.29	3.2e-16	1	1
ENSMAMP00000004412	DEAD	PF00270.29	3.4e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMAMT00000004556	-	3537	-	ENSMAMP00000004446	1178 (aa)	-	-
ENSMAMT00000004520	-	4842	-	ENSMAMP00000004412	1246 (aa)	XP_026156576	UPI000E45D3F9

Gene Model

Click here to download ENSMAMG00000002927's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMAMG00000002927's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMAMG00000002927	skiv2l	80	36.061	ENSMAMG00000016753	mtrex	94	35.988

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.981	ENSG00000204351	SKIV2L	99	60.794	Homo_sapiens
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	89.888	ENSAPOG00000008257	skiv2l	100	89.888	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.981	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.873	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	88.493	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	88.412	Amphilophus_citrinellus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	90.449	ENSAOCG00000017352	skiv2l	100	90.449	Amphiprion_ocellaris
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	90.209	ENSAPEG00000001055	skiv2l	100	90.209	Amphiprion_percula
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	92.376	ENSATEG00000007601	skiv2l	100	92.376	Anabas_testudineus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	96	68.345	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	63.544	Anolis_carolinensis
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.464	ENSANAG00000037992	SKIV2L	99	61.270	Aotus_nancymaae
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	90.369	ENSACLG00000006886	skiv2l	100	90.369	Astatotilapia_calliptera
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	82.105	ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	81.855	Astyanax_mexicanus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.353	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	99	60.491	Bos_taurus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	96	40.187	WBGene00008502	skih-2	99	40.559	Caenorhabditis_elegans
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.464	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.270	Callithrix_jacchus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.740	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	99	61.032	Canis_familiaris
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.740	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	99	61.032	Canis_lupus_dingo
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.594	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	99	60.728	Capra_hircus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.754	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	99	60.887	Carlito_syrichta
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.757	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	99	60.428	Cavia_porcellus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.303	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	99	61.111	Cebus_capucinus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.981	ENSCATG00000036901	SKIV2L	99	61.032	Cercocebus_atys
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.223	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	60.952	Chinchilla_lanigera
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.464	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	99	61.270	Chlorocebus_sabaeus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	83	69.984	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	99	60.994	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAMG00000002927	skiv2l	93	51.111	ENSCING00000005576	-	99	51.111	Ciona_intestinalis
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.062	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	60.700	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.124	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	99	60.856	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	86.586	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	86.827	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	89.165	ENSCVAG00000003072	skiv2l	100	89.165	Cyprinodon_variegatus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	83.693	ENSDARG00000062206	skiv2l	100	83.693	Danio_rerio
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	57.510	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	93	65.617	Dasypus_novemcinctus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	93	45.700	FBgn0039117	tst	97	45.661	Drosophila_melanogaster
ENSMAMG00000002927	skiv2l	71	74.684	ENSETEG00000009522	SKIV2L	69	74.684	Echinops_telfairi
ENSMAMG00000002927	skiv2l	91	54.974	ENSEBUG00000013680	-	98	54.445	Eptatretus_burgeri
ENSMAMG00000002927	skiv2l	92	61.986	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	62.393	Equus_asinus_asinus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	93	60.866	ENSECAG00000021823	SKIV2L	95	61.069	Equus_caballus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	53	74.308	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	56	74.308	Erinaceus_europaeus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	84.585	ENSELUG00000000181	skiv2l	100	84.585	Esox_lucius
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.884	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	99	60.935	Felis_catus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	95	65.768	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.905	Fukomys_damarensis
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	88.684	ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	88.684	Fundulus_heteroclitus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	82.462	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	82.462	Gadus_morhua
ENSMAMG00000002927	skiv2l	80	57.544	ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	57.201	Gallus_gallus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	89.727	ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	89.727	Gambusia_affinis
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	88.809	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.809	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.223	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	99	61.032	Gorilla_gorilla
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	90.369	ENSHBUG00000000726	skiv2l	100	90.369	Haplochromis_burtoni
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.720	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	99	60.678	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	59.040	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	99	59.023	Heterocephalus_glaber_male
ENSMAMG00000002927	skiv2l	98	86.022	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	86.022	Hippocampus_comes
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	82.080	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	82.683	Ictalurus_punctatus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.680	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	60.997	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	52	75.974	ENSLACG00000002986	-	60	62.585	Latimeria_chalumnae
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.205	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.283	Loxodonta_africana
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.142	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	99	61.190	Macaca_fascicularis
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.062	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	99	61.190	Macaca_mulatta
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.062	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.111	Macaca_nemestrina
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.981	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	99	61.032	Mandrillus_leucophaeus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	90.289	ENSMZEG00005026415	skiv2l	100	90.289	Maylandia_zebra
ENSMAMG00000002927	skiv2l	54	71.967	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	96	48.729	Meleagris_gallopavo
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.192	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.921	Mesocricetus_auratus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.384	ENSMICG00000046331	SKIV2L	99	61.746	Microcebus_murinus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	59.984	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.048	Microtus_ochrogaster
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	87.679	ENSMMOG00000014547	skiv2l	99	87.679	Mola_mola
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.270	ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.965	Monodelphis_domestica
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	86.013	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	86.013	Monopterus_albus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.160	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	99	60.890	Mus_caroli
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.919	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	99	60.970	Mus_musculus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.241	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	99	61.288	Mus_pahari
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.919	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	99	60.970	Mus_spretus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.289	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	99	60.697	Mustela_putorius_furo
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.981	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	99	60.794	Myotis_lucifugus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	86.726	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	86.726	Neolamprologus_brichardi
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.452	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.304	Nomascus_leucogenys
ENSMAMG00000002927	skiv2l	73	68.827	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	61.947	Notamacropus_eugenii
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.285	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	61.094	Ochotona_princeps
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.223	ENSODEG00000017516	SKIV2L	99	61.190	Octodon_degus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	90.449	ENSONIG00000013500	skiv2l	100	90.449	Oreochromis_niloticus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.545	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	99	61.667	Oryctolagus_cuniculus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	87.821	ENSORLG00000002021	skiv2l	100	87.821	Oryzias_latipes
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	87.660	ENSORLG00020009462	skiv2l	100	87.660	Oryzias_latipes_hni
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	87.660	ENSORLG00015016750	skiv2l	100	87.660	Oryzias_latipes_hsok
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	88.372	ENSOMEG00000008531	skiv2l	100	88.372	Oryzias_melastigma
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.174	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	99	60.983	Otolemur_garnettii
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	57.266	ENSOARG00000002411	-	99	57.442	Ovis_aries
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.560	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	60.491	Pan_paniscus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.124	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	99	61.173	Panthera_pardus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.723	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	60.777	Panthera_tigris_altaica
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.142	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	99	60.952	Pan_troglodytes
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.048	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	60.222	Papio_anubis
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	79.077	ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	79.077	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	86.393	ENSPMGG00000019707	skiv2l	99	86.473	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.821	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	99	60.873	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.203	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	99	61.758	Phascolarctos_cinereus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	89.888	ENSPFOG00000002424	skiv2l	100	89.888	Poecilia_formosa
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	89.807	ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	89.807	Poecilia_latipinna
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	89.727	ENSPMEG00000006997	skiv2l	100	89.727	Poecilia_mexicana
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	86.337	ENSPREG00000002277	skiv2l	99	86.337	Poecilia_reticulata
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.821	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.635	Pongo_abelii
ENSMAMG00000002927	skiv2l	79	66.019	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	76	66.019	Procavia_capensis
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.334	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	99	61.618	Propithecus_coquereli
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.576	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	99	61.270	Pteropus_vampyrus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	86.778	ENSPNYG00000017853	skiv2l	99	90.041	Pundamilia_nyererei
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	83.974	ENSPNAG00000011823	skiv2l	100	84.118	Pygocentrus_nattereri
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.644	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	99	61.367	Rattus_norvegicus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	59.952	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	60.127	Rhinopithecus_bieti
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.142	ENSRROG00000036429	SKIV2L	99	61.190	Rhinopithecus_roxellana
ENSMAMG00000002927	skiv2l	90	40.149	YLR398C	-	90	40.232	Saccharomyces_cerevisiae
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.464	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.270	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMAMG00000002927	skiv2l	96	67.598	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.539	Sarcophilus_harrisii
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	81.165	ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.165	Scleropages_formosus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	91.011	ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	91.011	Scophthalmus_maximus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	93.018	ENSSDUG00000019977	skiv2l	100	93.018	Seriola_dumerili
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	87.468	ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	87.468	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMAMG00000002927	skiv2l	98	65.443	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	60.648	Sphenodon_punctatus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	95	91.441	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	91.441	Stegastes_partitus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.142	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.538	Sus_scrofa
ENSMAMG00000002927	skiv2l	69	92.045	ENSTRUG00000000966	skiv2l	83	92.045	Takifugu_rubripes
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	84.732	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	84.812	Tetraodon_nigroviridis
ENSMAMG00000002927	skiv2l	93	62.699	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.699	Tupaia_belangeri
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	57.315	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.256	Tursiops_truncatus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.142	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.032	Ursus_americanus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	92	62.296	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	62.382	Ursus_maritimus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.660	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	61.067	Vulpes_vulpes
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	58.280	ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.758	Xenopus_tropicalis
ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	88.084	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	88.084	Xiphophorus_couchianus
ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	89.005	ENSXMAG00000014079	skiv2l	100	89.005	Xiphophorus_maculatus