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Description

Ensembl ID: ENSMAMG00000003056 (Gene tree)
Gene ID: 113138368
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: wu:fa56c07|wu:fi27f11|zgc:66238
Full Name: probable global transcription activator SNF2L2
Gene Type: protein_coding
Species: Mastacembelus_armatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 45465 bases
Position: chrOOHQ01000039.1:18043848-18089312
Accession: 113138368
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMAMP00000004490	BRK	PF07533.16	2.1e-17	1	1
ENSMAMP00000004529	BRK	PF07533.16	2.1e-17	1	1
ENSMAMP00000004581	BRK	PF07533.16	8.8e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMAMT00000004696	SMARCA2-203	4137	-	ENSMAMP00000004581	1378 (aa)	-	-
ENSMAMT00000004644	SMARCA2-202	7384	XM_026320721	ENSMAMP00000004529	1600 (aa)	XP_026176506	UPI000E465DDB
ENSMAMT00000004605	SMARCA2-201	7196	XM_026320721	ENSMAMP00000004490	1600 (aa)	XP_026176506	UPI000E465DDB

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	95	70.453	ENSMAMG00000002841	-	98	72.909
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	95	72.262	ENSMAMG00000009256	smarca4a	99	70.785

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	82.117	ENSG00000080503	SMARCA2	99	98.000	Homo_sapiens
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	92.701	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	92.951	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	77.331	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	86.317	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	90.037	ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	90.099	Amphilophus_citrinellus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	93.200	ENSAOCG00000009647	-	100	93.075	Amphiprion_ocellaris
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	92.764	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	100	92.888	Amphiprion_percula
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	99	95.466	ENSATEG00000006916	SMARCA2	99	95.466	Anabas_testudineus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	78.107	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	79.075	Anas_platyrhynchos
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	80.127	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	79.752	Anolis_carolinensis
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	82.297	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	81.103	Aotus_nancymaae
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	91.013	ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	90.835	Astatotilapia_calliptera
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	99	85.705	ENSAMXG00000012404	smarca2	100	84.867	Astyanax_mexicanus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	80.473	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	79.616	Bos_taurus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	82.276	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.928	Callithrix_jacchus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.952	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	80.224	Canis_familiaris
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	76	87.488	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	87.382	Canis_lupus_dingo
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	80.062	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	79.678	Capra_hircus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.600	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	82.093	Carlito_syrichta
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	80.428	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	79.104	Cavia_aperea
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.752	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	80.846	Cavia_porcellus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	82.383	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	81.091	Cebus_capucinus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.805	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	80.497	Cercocebus_atys
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.428	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	81.219	Chinchilla_lanigera
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	82.064	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	81.474	Chlorocebus_sabaeus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	88	83.210	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	82.481	Choloepus_hoffmanni
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	80.649	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	100	83.959	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	82.418	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	80.970	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	75.585	ENSCGRG00001002323	Smarca2	89	75.338	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	87.563	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	98	87.160	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	95	90.286	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	98	90.060	Cyprinodon_variegatus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	84.677	ENSDARG00000008904	smarca2	100	83.933	Danio_rerio
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	80.740	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	80.982	Dasypus_novemcinctus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.885	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	80.721	Dipodomys_ordii
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	80	62.719	FBgn0000212	brm	68	61.821	Drosophila_melanogaster
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	88	59.239	ENSEBUG00000002449	-	95	62.195	Eptatretus_burgeri
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	99	70.893	ENSEBUG00000011442	-	97	68.462	Eptatretus_burgeri
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.598	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	80.435	Equus_asinus_asinus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	60	94.118	ENSEEUG00000015540	-	69	79.730	Erinaceus_europaeus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	82.120	ENSELUG00000010318	smarca2	99	81.788	Esox_lucius
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.878	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	80.174	Felis_catus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	80.190	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	82.219	Ficedula_albicollis
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	82.085	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	100	80.296	Fukomys_damarensis
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	92.657	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	92.657	Fundulus_heteroclitus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	81.953	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	81.881	Gadus_morhua
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	80.458	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	80.509	Gallus_gallus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	95	89.674	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	95	82.430	Gambusia_affinis
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	99	89.070	ENSGACG00000014488	SMARCA2	99	88.505	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	80.586	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	80.571	Gopherus_agassizii
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	92	87.031	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	100	85.782	Gorilla_gorilla
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	91.848	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	92.159	Haplochromis_burtoni
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	82.031	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	98	81.577	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.705	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	98	80.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	82.101	ENSHCOG00000015348	-	95	88.826	Hippocampus_comes
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	85.156	ENSIPUG00000011060	smarca2	100	82.047	Ictalurus_punctatus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	82.143	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	81.281	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.812	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	80.521	Jaculus_jaculus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	92.600	ENSKMAG00000015844	-	100	92.475	Kryptolebias_marmoratus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	52	64.968	ENSLACG00000000270	SMARCA2	99	68.545	Latimeria_chalumnae
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	83.427	ENSLOCG00000011499	smarca2	100	82.794	Lepisosteus_oculatus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	80.510	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	80.497	Loxodonta_africana
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.698	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	79.975	Macaca_fascicularis
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	82.430	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	80.970	Macaca_mulatta
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.685	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	99	81.637	Macaca_nemestrina
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.117	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	95	88.858	Mandrillus_leucophaeus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	92.269	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	100	92.581	Maylandia_zebra
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	82	66.182	ENSMGAG00000005160	-	100	68.956	Meleagris_gallopavo
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	82.172	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	80.659	Microcebus_murinus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	81.067	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	80.917	Microtus_ochrogaster
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	91.721	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	99	88.586	Mola_mola
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	96	80.851	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	80.870	Monodelphis_domestica
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	96.235	ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	92.947	Monopterus_albus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.114	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	100	81.032	Mus_caroli
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.318	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.000	Mus_musculus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.481	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	100	81.017	Mus_pahari
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.187	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	90.909	Mus_spretus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	79	86.037	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	86.037	Mustela_putorius_furo
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	77.065	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	77.264	Myotis_lucifugus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.858	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	80.436	Nannospalax_galili
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	94	80.942	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	86.637	Neolamprologus_brichardi
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	80.984	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	78.696	Nomascus_leucogenys
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	75.715	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	73.313	Notamacropus_eugenii
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	79	81.969	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	76.861	Ochotona_princeps
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.146	ENSODEG00000005452	SMARCA2	98	80.263	Octodon_degus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	99	92.163	ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	92.100	Oreochromis_niloticus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	52	86.388	ENSOANG00000008299	-	95	89.353	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	80.931	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	79.457	Oryctolagus_cuniculus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	91.068	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	91.204	Oryzias_latipes
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	91.068	ENSORLG00015006289	SMARCA2	100	91.142	Oryzias_latipes_hsok
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	90.069	ENSOMEG00000009736	-	100	90.006	Oryzias_melastigma
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	79	86.651	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	80.740	Otolemur_garnettii
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	78.558	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	78.925	Ovis_aries
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	92	87.030	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	100	86.499	Pan_paniscus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.952	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	80.236	Panthera_pardus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	82.098	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	80.807	Pan_troglodytes
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	76.928	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	76.785	Papio_anubis
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	84.030	ENSPKIG00000018469	-	100	83.468	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	79.333	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	80.112	Pelodiscus_sinensis
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	84.752	ENSPMGG00000013696	-	98	82.683	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.122	ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	80.025	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	99	69.069	ENSPMAG00000005337	-	97	69.467	Petromyzon_marinus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	80.764	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	80.994	Phascolarctos_cinereus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	91.910	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	91.973	Poecilia_formosa
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	99	92.235	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	96	92.235	Poecilia_latipinna
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	99	92.045	ENSPMEG00000001815	-	99	91.848	Poecilia_mexicana
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	91.848	ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	91.848	Poecilia_reticulata
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	82.211	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	100	80.547	Pongo_abelii
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	77	74.648	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	74.648	Procavia_capensis
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	80.470	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	100	78.856	Propithecus_coquereli
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	89	82.706	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	94	81.606	Pteropus_vampyrus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	88.682	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	100	88.682	Pundamilia_nyererei
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	99	86.646	ENSPNAG00000014635	smarca2	98	86.270	Pygocentrus_nattereri
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.409	ENSRNOG00000011931	Smarca2	100	80.000	Rattus_norvegicus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.658	ENSRBIG00000038618	SMARCA2	95	87.089	Rhinopithecus_bieti
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.598	ENSRROG00000019271	SMARCA2	99	81.935	Rhinopithecus_roxellana
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ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	85.541	ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.185	Scleropages_formosus
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ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	94.107	ENSSDUG00000008852	-	100	94.291	Seriola_dumerili
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	91.208	ENSSLDG00000025449	SMARCA2	98	90.013	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	77.572	ENSXETG00000015299	smarca2	100	77.298	Xenopus_tropicalis
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	90.647	ENSXCOG00000011073	SMARCA2	99	90.576	Xiphophorus_couchianus
ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	91.677	ENSXMAG00000015611	SMARCA2	100	91.925	Xiphophorus_maculatus