EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMAMG00000010403 (Gene tree)
Gene ID: 113132021
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Mastacembelus_armatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6915 bases
Position: chrOOHQ01000119.1:14555254-14562168
Accession: 113132021
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMAMP00000015326	SYF2	PF08231.12	3.1e-53	1	1
ENSMAMP00000015332	SYF2	PF08231.12	3.2e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMAMT00000015748	-	2951	-	ENSMAMP00000015326	241 (aa)	-	-
ENSMAMT00000015754	-	2637	-	ENSMAMP00000015332	244 (aa)	XP_026165607	UPI000E45F6AB

Gene Model

Click here to download ENSMAMG00000010403's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMAMG00000010403's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMAMG00000010403	syf2	90	81.944	ENSG00000117614	SYF2	89	81.567	Homo_sapiens
ENSMAMG00000010403	syf2	98	92.437	ENSAPOG00000001174	syf2	100	92.437	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAMG00000010403	syf2	81	81.026	ENSAMEG00000010134	-	100	81.026	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMAMG00000010403	syf2	90	81.651	ENSAMEG00000010115	-	89	81.567	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMAMG00000010403	syf2	99	90.833	ENSACIG00000023688	syf2	87	94.931	Amphilophus_citrinellus
ENSMAMG00000010403	syf2	91	91.855	ENSAOCG00000010912	syf2	69	91.855	Amphiprion_ocellaris
ENSMAMG00000010403	syf2	98	92.083	ENSAOCG00000022046	syf2	92	94.931	Amphiprion_ocellaris
ENSMAMG00000010403	syf2	98	92.083	ENSAPEG00000018858	syf2	93	92.083	Amphiprion_percula
ENSMAMG00000010403	syf2	98	93.277	ENSATEG00000007745	syf2	100	93.277	Anabas_testudineus
ENSMAMG00000010403	syf2	83	82.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.000	Anas_platyrhynchos
ENSMAMG00000010403	syf2	85	83.333	ENSACAG00000013653	-	100	83.333	Anolis_carolinensis
ENSMAMG00000010403	syf2	69	69.461	ENSACAG00000026777	-	100	69.461	Anolis_carolinensis
ENSMAMG00000010403	syf2	90	82.407	ENSANAG00000032473	SYF2	89	82.028	Aotus_nancymaae
ENSMAMG00000010403	syf2	98	92.017	ENSACLG00000019916	syf2	100	92.017	Astatotilapia_calliptera
ENSMAMG00000010403	syf2	98	84.454	ENSAMXG00000004051	syf2	100	84.454	Astyanax_mexicanus
ENSMAMG00000010403	syf2	97	76.446	ENSBTAG00000001651	SYF2	92	82.028	Bos_taurus
ENSMAMG00000010403	syf2	86	52.607	WBGene00019402	syf-2	90	51.887	Caenorhabditis_elegans
ENSMAMG00000010403	syf2	90	82.407	ENSCJAG00000046570	SYF2	89	82.028	Callithrix_jacchus
ENSMAMG00000010403	syf2	90	75.926	ENSCAFG00000030331	-	92	75.926	Canis_familiaris
ENSMAMG00000010403	syf2	90	81.944	ENSCAFG00000012895	-	88	81.567	Canis_familiaris
ENSMAMG00000010403	syf2	75	71.978	ENSCAFG00020021094	-	95	71.978	Canis_lupus_dingo
ENSMAMG00000010403	syf2	90	81.944	ENSCAFG00020021091	-	88	81.567	Canis_lupus_dingo
ENSMAMG00000010403	syf2	97	77.083	ENSCHIG00000020874	SYF2	90	81.567	Capra_hircus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	76.132	ENSTSYG00000005114	SYF2	89	81.019	Carlito_syrichta
ENSMAMG00000010403	syf2	82	80.808	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	80.808	Cavia_aperea
ENSMAMG00000010403	syf2	98	76.230	ENSCPOG00000005326	SYF2	89	81.567	Cavia_porcellus
ENSMAMG00000010403	syf2	90	82.407	ENSCCAG00000022459	SYF2	89	82.028	Cebus_capucinus
ENSMAMG00000010403	syf2	100	73.770	ENSCATG00000026917	SYF2	89	80.645	Cercocebus_atys
ENSMAMG00000010403	syf2	97	78.059	ENSCLAG00000008474	SYF2	89	82.488	Chinchilla_lanigera
ENSMAMG00000010403	syf2	98	75.000	ENSCSAG00000000948	SYF2	89	80.645	Chlorocebus_sabaeus
ENSMAMG00000010403	syf2	71	61.494	ENSCHOG00000005273	-	88	62.963	Choloepus_hoffmanni
ENSMAMG00000010403	syf2	93	82.222	ENSCPBG00000025073	SYF2	88	83.410	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAMG00000010403	syf2	92	52.018	ENSCING00000003017	-	89	53.521	Ciona_intestinalis
ENSMAMG00000010403	syf2	88	49.765	ENSCSAVG00000006627	-	97	49.765	Ciona_savignyi
ENSMAMG00000010403	syf2	100	65.574	ENSCANG00000037322	SYF2	88	71.429	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	77.273	ENSCGRG00001020733	Syf2	90	82.028	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMAMG00000010403	syf2	81	82.143	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.323	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMAMG00000010403	syf2	90	88.532	ENSCSEG00000000117	syf2	91	88.479	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAMG00000010403	syf2	98	89.958	ENSCVAG00000019543	syf2	100	89.958	Cyprinodon_variegatus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	85.294	ENSDARG00000004706	syf2	100	85.294	Danio_rerio
ENSMAMG00000010403	syf2	98	75.918	ENSDNOG00000047605	SYF2	89	81.567	Dasypus_novemcinctus
ENSMAMG00000010403	syf2	97	78.814	ENSDORG00000001274	Syf2	89	82.028	Dipodomys_ordii
ENSMAMG00000010403	syf2	91	54.299	FBgn0033556	CG12343	94	55.556	Drosophila_melanogaster
ENSMAMG00000010403	syf2	86	68.116	ENSETEG00000015729	SYF2	88	68.473	Echinops_telfairi
ENSMAMG00000010403	syf2	82	57.360	ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.360	Eptatretus_burgeri
ENSMAMG00000010403	syf2	98	76.327	ENSEASG00005004224	-	89	82.028	Equus_asinus_asinus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	69.008	ENSEASG00005004232	-	90	73.272	Equus_asinus_asinus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	75.918	ENSECAG00000012023	-	89	82.028	Equus_caballus
ENSMAMG00000010403	syf2	94	79.476	ENSECAG00000010440	-	91	82.028	Equus_caballus
ENSMAMG00000010403	syf2	72	65.922	ENSEEUG00000015084	SYF2	85	70.513	Erinaceus_europaeus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	83.682	ENSELUG00000003465	syf2	100	82.845	Esox_lucius
ENSMAMG00000010403	syf2	95	79.565	ENSFCAG00000010324	-	75	82.028	Felis_catus
ENSMAMG00000010403	syf2	99	75.918	ENSFCAG00000043095	-	88	82.488	Felis_catus
ENSMAMG00000010403	syf2	85	79.902	ENSFALG00000000460	SYF2	88	79.630	Ficedula_albicollis
ENSMAMG00000010403	syf2	98	75.720	ENSFDAG00000008310	SYF2	89	81.567	Fukomys_damarensis
ENSMAMG00000010403	syf2	93	77.434	ENSFHEG00000007238	syf2	96	77.523	Fundulus_heteroclitus
ENSMAMG00000010403	syf2	91	88.128	ENSGMOG00000019138	syf2	96	89.767	Gadus_morhua
ENSMAMG00000010403	syf2	92	81.081	ENSGALG00000013639	SYF2	86	82.028	Gallus_gallus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	89.076	ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.076	Gambusia_affinis
ENSMAMG00000010403	syf2	92	90.541	ENSGACG00000007305	syf2	91	91.705	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAMG00000010403	syf2	93	82.667	ENSGAGG00000010670	SYF2	88	83.871	Gopherus_agassizii
ENSMAMG00000010403	syf2	90	81.944	ENSGGOG00000012796	SYF2	89	81.567	Gorilla_gorilla
ENSMAMG00000010403	syf2	98	91.597	ENSHBUG00000020477	syf2	100	91.597	Haplochromis_burtoni
ENSMAMG00000010403	syf2	92	71.041	ENSHGLG00000004304	-	100	67.227	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAMG00000010403	syf2	97	75.820	ENSHGLG00000014393	SYF2	89	82.028	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAMG00000010403	syf2	97	75.820	ENSHGLG00100014722	SYF2	89	82.028	Heterocephalus_glaber_male
ENSMAMG00000010403	syf2	99	87.552	ENSHCOG00000012904	syf2	79	87.552	Hippocampus_comes
ENSMAMG00000010403	syf2	98	83.682	ENSIPUG00000019859	syf2	100	82.353	Ictalurus_punctatus
ENSMAMG00000010403	syf2	61	75.342	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	75.342	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMAMG00000010403	syf2	83	81.910	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	81.910	Jaculus_jaculus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	91.597	ENSKMAG00000013856	syf2	100	89.076	Kryptolebias_marmoratus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	92.017	ENSLBEG00000014425	syf2	100	92.017	Labrus_bergylta
ENSMAMG00000010403	syf2	96	77.586	ENSLACG00000012064	SYF2	91	82.407	Latimeria_chalumnae
ENSMAMG00000010403	syf2	99	83.471	ENSLOCG00000002728	syf2	96	83.471	Lepisosteus_oculatus
ENSMAMG00000010403	syf2	76	53.804	ENSLAFG00000030814	-	100	53.804	Loxodonta_africana
ENSMAMG00000010403	syf2	98	76.735	ENSLAFG00000023150	-	89	82.028	Loxodonta_africana
ENSMAMG00000010403	syf2	100	73.770	ENSMFAG00000041831	SYF2	89	80.645	Macaca_fascicularis
ENSMAMG00000010403	syf2	90	81.019	ENSMMUG00000002968	SYF2	89	80.645	Macaca_mulatta
ENSMAMG00000010403	syf2	100	73.770	ENSMNEG00000030180	SYF2	89	80.645	Macaca_nemestrina
ENSMAMG00000010403	syf2	100	73.770	ENSMLEG00000030248	SYF2	89	80.645	Mandrillus_leucophaeus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	92.017	ENSMZEG00005006429	syf2	100	92.017	Maylandia_zebra
ENSMAMG00000010403	syf2	83	81.910	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.910	Meleagris_gallopavo
ENSMAMG00000010403	syf2	98	78.512	ENSMAUG00000018974	Syf2	90	83.410	Mesocricetus_auratus
ENSMAMG00000010403	syf2	83	81.910	ENSMICG00000016191	SYF2	100	81.910	Microcebus_murinus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	78.099	ENSMOCG00000022938	Syf2	90	82.949	Microtus_ochrogaster
ENSMAMG00000010403	syf2	98	89.873	ENSMMOG00000002396	syf2	91	93.548	Mola_mola
ENSMAMG00000010403	syf2	92	77.232	ENSMODG00000013951	-	96	78.082	Monodelphis_domestica
ENSMAMG00000010403	syf2	98	90.871	ENSMALG00000010706	syf2	100	90.456	Monopterus_albus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	78.099	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	90	83.410	Mus_caroli
ENSMAMG00000010403	syf2	98	78.099	ENSMUSG00000028821	Syf2	90	83.410	Mus_musculus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	78.099	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	90	83.410	Mus_pahari
ENSMAMG00000010403	syf2	98	78.099	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	90	83.410	Mus_spretus
ENSMAMG00000010403	syf2	99	74.694	ENSMPUG00000015802	-	88	81.567	Mustela_putorius_furo
ENSMAMG00000010403	syf2	91	80.455	ENSMPUG00000015801	-	88	81.106	Mustela_putorius_furo
ENSMAMG00000010403	syf2	99	74.694	ENSMLUG00000001885	SYF2	89	81.106	Myotis_lucifugus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	75.610	ENSNGAG00000007912	Syf2	88	81.567	Nannospalax_galili
ENSMAMG00000010403	syf2	98	81.893	ENSNBRG00000010720	syf2	100	81.893	Neolamprologus_brichardi
ENSMAMG00000010403	syf2	90	81.944	ENSNLEG00000035185	SYF2	89	81.567	Nomascus_leucogenys
ENSMAMG00000010403	syf2	98	75.720	ENSOPRG00000012870	SYF2	89	80.645	Ochotona_princeps
ENSMAMG00000010403	syf2	97	68.354	ENSODEG00000014338	-	90	71.889	Octodon_degus
ENSMAMG00000010403	syf2	97	76.371	ENSODEG00000017664	-	91	80.645	Octodon_degus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	92.857	ENSONIG00000008213	syf2	100	92.857	Oreochromis_niloticus
ENSMAMG00000010403	syf2	84	81.188	ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.188	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMAMG00000010403	syf2	96	75.309	ENSOCUG00000013050	SYF2	89	82.028	Oryctolagus_cuniculus
ENSMAMG00000010403	syf2	97	87.983	ENSORLG00000028820	syf2	93	92.627	Oryzias_latipes
ENSMAMG00000010403	syf2	98	86.975	ENSORLG00020018333	syf2	92	92.627	Oryzias_latipes_hni
ENSMAMG00000010403	syf2	98	87.395	ENSORLG00015014665	syf2	91	92.627	Oryzias_latipes_hsok
ENSMAMG00000010403	syf2	98	88.655	ENSOMEG00000013911	syf2	100	88.655	Oryzias_melastigma
ENSMAMG00000010403	syf2	98	77.824	ENSOGAG00000009962	SYF2	89	82.488	Otolemur_garnettii
ENSMAMG00000010403	syf2	96	75.203	ENSOARG00000006348	-	89	80.822	Ovis_aries
ENSMAMG00000010403	syf2	81	55.897	ENSOARG00000006269	-	100	55.897	Ovis_aries
ENSMAMG00000010403	syf2	90	81.944	ENSPPAG00000036579	SYF2	89	81.567	Pan_paniscus
ENSMAMG00000010403	syf2	95	79.565	ENSPPRG00000001638	-	88	82.028	Panthera_pardus
ENSMAMG00000010403	syf2	99	75.918	ENSPPRG00000001651	-	88	82.488	Panthera_pardus
ENSMAMG00000010403	syf2	99	75.918	ENSPTIG00000007036	-	88	82.488	Panthera_tigris_altaica
ENSMAMG00000010403	syf2	90	82.407	ENSPTIG00000005711	-	79	82.028	Panthera_tigris_altaica
ENSMAMG00000010403	syf2	90	81.944	ENSPTRG00000000352	SYF2	89	81.567	Pan_troglodytes
ENSMAMG00000010403	syf2	100	73.770	ENSPANG00000008139	SYF2	89	80.645	Papio_anubis
ENSMAMG00000010403	syf2	98	83.613	ENSPKIG00000008130	syf2	100	83.613	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMAMG00000010403	syf2	99	77.273	ENSPSIG00000011816	SYF2	84	82.488	Pelodiscus_sinensis
ENSMAMG00000010403	syf2	98	86.555	ENSPMGG00000008755	syf2	85	91.705	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	77.686	ENSPEMG00000008283	Syf2	90	82.488	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMAMG00000010403	syf2	92	81.081	ENSPCIG00000014235	SYF2	87	82.028	Phascolarctos_cinereus
ENSMAMG00000010403	syf2	100	86.939	ENSPFOG00000004116	syf2	90	91.705	Poecilia_formosa
ENSMAMG00000010403	syf2	97	89.700	ENSPLAG00000006691	syf2	93	91.244	Poecilia_latipinna
ENSMAMG00000010403	syf2	98	86.555	ENSPMEG00000011684	syf2	100	86.555	Poecilia_mexicana
ENSMAMG00000010403	syf2	98	89.076	ENSPREG00000003009	syf2	100	89.076	Poecilia_reticulata
ENSMAMG00000010403	syf2	98	75.833	ENSPPYG00000001713	SYF2	89	81.567	Pongo_abelii
ENSMAMG00000010403	syf2	98	53.498	ENSPCOG00000027011	SYF2	85	55.760	Propithecus_coquereli
ENSMAMG00000010403	syf2	92	72.072	ENSPVAG00000005841	SYF2	89	73.272	Pteropus_vampyrus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	91.597	ENSPNYG00000004979	syf2	100	91.597	Pundamilia_nyererei
ENSMAMG00000010403	syf2	98	84.034	ENSPNAG00000015570	syf2	100	84.034	Pygocentrus_nattereri
ENSMAMG00000010403	syf2	98	78.099	ENSRNOG00000060597	Syf2	90	83.410	Rattus_norvegicus
ENSMAMG00000010403	syf2	100	71.721	ENSRBIG00000042970	SYF2	89	78.341	Rhinopithecus_bieti
ENSMAMG00000010403	syf2	100	73.770	ENSRROG00000001347	SYF2	89	80.645	Rhinopithecus_roxellana
ENSMAMG00000010403	syf2	98	76.250	ENSSBOG00000020184	SYF2	89	81.567	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMAMG00000010403	syf2	92	79.730	ENSSHAG00000015630	-	87	80.645	Sarcophilus_harrisii
ENSMAMG00000010403	syf2	85	81.068	ENSSHAG00000007152	-	100	81.068	Sarcophilus_harrisii
ENSMAMG00000010403	syf2	92	87.783	ENSSFOG00015023647	syf2	92	88.018	Scleropages_formosus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	91.597	ENSSMAG00000009867	syf2	100	91.597	Scophthalmus_maximus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	91.597	ENSSDUG00000013072	syf2	100	91.597	Seriola_dumerili
ENSMAMG00000010403	syf2	98	91.597	ENSSLDG00000012677	syf2	100	91.597	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMAMG00000010403	syf2	97	58.506	ENSSARG00000012889	SYF2	100	57.377	Sorex_araneus
ENSMAMG00000010403	syf2	99	77.273	ENSSPUG00000005251	SYF2	95	76.033	Sphenodon_punctatus
ENSMAMG00000010403	syf2	98	92.857	ENSSPAG00000009626	syf2	100	92.857	Stegastes_partitus
ENSMAMG00000010403	syf2	100	74.390	ENSSSCG00000037481	SYF2	89	81.567	Sus_scrofa
ENSMAMG00000010403	syf2	62	52.318	ENSTGUG00000001126	SYF2	78	55.063	Taeniopygia_guttata
ENSMAMG00000010403	syf2	99	86.420	ENSTRUG00000001499	syf2	97	84.836	Takifugu_rubripes
ENSMAMG00000010403	syf2	92	88.288	ENSTNIG00000016912	syf2	97	88.940	Tetraodon_nigroviridis
ENSMAMG00000010403	syf2	98	57.613	ENSTBEG00000017370	SYF2	87	59.908	Tupaia_belangeri
ENSMAMG00000010403	syf2	100	73.770	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	73.770	Tursiops_truncatus
ENSMAMG00000010403	syf2	93	80.717	ENSUAMG00000002897	SYF2	88	81.567	Ursus_americanus
ENSMAMG00000010403	syf2	90	81.481	ENSUMAG00000013108	SYF2	88	81.106	Ursus_maritimus
ENSMAMG00000010403	syf2	92	80.180	ENSVPAG00000005705	SYF2	89	81.106	Vicugna_pacos
ENSMAMG00000010403	syf2	85	80.488	ENSVVUG00000027181	-	88	80.184	Vulpes_vulpes
ENSMAMG00000010403	syf2	90	81.944	ENSVVUG00000027175	-	88	81.567	Vulpes_vulpes
ENSMAMG00000010403	syf2	96	75.862	ENSXETG00000022797	syf2	87	78.802	Xenopus_tropicalis
ENSMAMG00000010403	syf2	98	89.916	ENSXMAG00000022698	syf2	100	89.916	Xiphophorus_maculatus