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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSMAMG00000013260 (Gene tree)
Gene ID: 113135748
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Mastacembelus_armatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7175 bases
Position: chrOOHQ01000019.1:10864161-10871335
Accession: 113135748
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMAMP00000019739	eRF1_2	PF03464.15	1.1e-33	1	1
ENSMAMP00000019757	eRF1_2	PF03464.15	1.1e-33	1	1
ENSMAMP00000019739	eRF1_3	PF03465.15	3.2e-25	1	1
ENSMAMP00000019757	eRF1_3	PF03465.15	4.3e-14	1	1
ENSMAMP00000019757	eRF1_1	PF03463.15	1.6e-51	1	1
ENSMAMP00000019739	eRF1_1	PF03463.15	1.6e-51	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMAMT00000020266	-	2090	-	ENSMAMP00000019739	385 (aa)	XP_026171781	UPI000E461109
ENSMAMT00000020284	-	1152	-	ENSMAMP00000019757	383 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.857	ENSG00000152684	PELO	97	83.110	Homo_sapiens
ENSMAMG00000013260	pelo	64	95.951	ENSAPOG00000023700	-	90	95.951	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAMG00000013260	pelo	64	95.951	ENSAPOG00000000616	pelo	90	95.951	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	95.325	ENSAPOG00000023072	pelo	97	96.247	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.338	ENSAMEG00000007734	PELO	97	82.574	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMAMG00000013260	pelo	97	90.349	ENSACIG00000014386	pelo	97	95.266	Amphilophus_citrinellus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	95.584	ENSAOCG00000023717	pelo	97	96.515	Amphiprion_ocellaris
ENSMAMG00000013260	pelo	100	95.584	ENSAPEG00000011235	pelo	97	96.515	Amphiprion_percula
ENSMAMG00000013260	pelo	100	97.143	ENSATEG00000019550	pelo	100	97.143	Anabas_testudineus
ENSMAMG00000013260	pelo	77	72.819	ENSAPLG00000013265	PELO	96	73.077	Anas_platyrhynchos
ENSMAMG00000013260	pelo	97	81.867	ENSACAG00000004352	PELO	97	82.038	Anolis_carolinensis
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.078	ENSANAG00000014096	PELO	97	82.306	Aotus_nancymaae
ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.247	ENSACLG00000010305	pelo	97	94.102	Astatotilapia_calliptera
ENSMAMG00000013260	pelo	97	93.298	ENSAMXG00000020299	pelo	97	93.298	Astyanax_mexicanus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSBTAG00000003268	PELO	97	82.842	Bos_taurus
ENSMAMG00000013260	pelo	99	60.630	WBGene00011280	pelo-1	98	61.662	Caenorhabditis_elegans
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.338	ENSCJAG00000035190	PELO	97	82.574	Callithrix_jacchus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSCAFG00020023234	PELO	97	82.842	Canis_lupus_dingo
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.338	ENSCHIG00000016410	PELO	97	82.574	Capra_hircus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	83.117	ENSTSYG00000005203	PELO	97	83.378	Carlito_syrichta
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.857	ENSCPOG00000027406	PELO	97	83.110	Cavia_porcellus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.338	ENSCCAG00000035600	PELO	97	82.574	Cebus_capucinus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSCATG00000011829	PELO	97	82.842	Cercocebus_atys
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.338	ENSCLAG00000005043	PELO	97	82.574	Chinchilla_lanigera
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSCSAG00000016692	PELO	97	82.842	Chlorocebus_sabaeus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	83.117	ENSCHOG00000000523	PELO	97	83.378	Choloepus_hoffmanni
ENSMAMG00000013260	pelo	97	81.867	ENSCPBG00000007544	PELO	97	82.038	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAMG00000013260	pelo	97	64.879	ENSCING00000001979	-	97	64.879	Ciona_intestinalis
ENSMAMG00000013260	pelo	100	67.013	ENSCSAVG00000006158	-	97	67.292	Ciona_savignyi
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSCANG00000023382	PELO	97	82.842	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMAMG00000013260	pelo	97	82.842	ENSCGRG00001024665	Pelo	97	82.842	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMAMG00000013260	pelo	97	83.646	ENSCGRG00000004570	Pelo	97	83.646	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMAMG00000013260	pelo	100	94.026	ENSCSEG00000008807	pelo	97	94.638	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAMG00000013260	pelo	100	94.286	ENSCVAG00000016082	pelo	97	94.906	Cyprinodon_variegatus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	90.649	ENSDARG00000055477	pelo	97	91.153	Danio_rerio
ENSMAMG00000013260	pelo	100	79.534	ENSDNOG00000036721	PELO	97	79.679	Dasypus_novemcinctus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	83.636	ENSDORG00000016689	Pelo	97	83.914	Dipodomys_ordii
ENSMAMG00000013260	pelo	96	68.649	FBgn0011207	pelo	94	68.365	Drosophila_melanogaster
ENSMAMG00000013260	pelo	71	80.117	ENSEBUG00000004955	pelo	95	80.117	Eptatretus_burgeri
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.338	ENSEASG00005013348	PELO	97	82.574	Equus_asinus_asinus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	92.208	ENSELUG00000023229	pelo	98	92.676	Esox_lucius
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSFCAG00000032341	PELO	97	82.842	Felis_catus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.338	ENSFALG00000004559	PELO	97	82.842	Ficedula_albicollis
ENSMAMG00000013260	pelo	74	83.451	ENSFDAG00000002076	PELO	88	83.451	Fukomys_damarensis
ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.247	ENSFHEG00000009769	pelo	97	94.102	Fundulus_heteroclitus
ENSMAMG00000013260	pelo	98	92.042	ENSGMOG00000005849	pelo	97	92.225	Gadus_morhua
ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.247	ENSGAFG00000019350	pelo	97	94.102	Gambusia_affinis
ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.766	ENSGACG00000007245	pelo	97	94.505	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAMG00000013260	pelo	97	81.867	ENSGAGG00000004018	PELO	97	82.038	Gopherus_agassizii
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSGGOG00000012635	PELO	97	82.842	Gorilla_gorilla
ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.247	ENSHBUG00000005866	pelo	97	94.102	Haplochromis_burtoni
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.857	ENSHGLG00000005932	PELO	97	83.110	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAMG00000013260	pelo	100	80.779	ENSHGLG00100017627	PELO	97	80.965	Heterocephalus_glaber_male
ENSMAMG00000013260	pelo	100	92.727	ENSHCOG00000016782	pelo	97	93.298	Hippocampus_comes
ENSMAMG00000013260	pelo	100	90.390	ENSIPUG00000020627	pelo	97	90.885	Ictalurus_punctatus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.857	ENSSTOG00000027378	PELO	97	83.110	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	80.260	ENSJJAG00000015032	Pelo	97	80.429	Jaculus_jaculus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	94.026	ENSKMAG00000021305	pelo	97	94.638	Kryptolebias_marmoratus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.766	ENSLBEG00000022399	pelo	97	94.370	Labrus_bergylta
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSLAFG00000020551	PELO	97	82.842	Loxodonta_africana
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSMFAG00000000651	PELO	97	82.842	Macaca_fascicularis
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSMMUG00000039101	PELO	97	82.842	Macaca_mulatta
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSMNEG00000035538	PELO	97	82.842	Macaca_nemestrina
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSMLEG00000039113	PELO	97	82.842	Mandrillus_leucophaeus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.247	ENSMZEG00005014258	pelo	97	94.102	Maylandia_zebra
ENSMAMG00000013260	pelo	100	83.117	ENSMAUG00000009770	Pelo	97	83.378	Mesocricetus_auratus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.857	ENSMICG00000044040	PELO	97	83.110	Microcebus_murinus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	83.117	ENSMOCG00000017554	Pelo	97	83.378	Microtus_ochrogaster
ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.766	ENSMMOG00000001324	pelo	97	94.906	Mola_mola
ENSMAMG00000013260	pelo	100	95.065	ENSMALG00000008194	pelo	97	95.710	Monopterus_albus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.857	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	97	83.110	Mus_caroli
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.857	ENSMUSG00000042275	Pelo	97	83.110	Mus_musculus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	83.117	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	97	83.378	Mus_pahari
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.857	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	97	83.110	Mus_spretus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.338	ENSMLUG00000024132	PELO	97	82.574	Myotis_lucifugus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	84.156	ENSNGAG00000019331	Pelo	97	84.182	Nannospalax_galili
ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.247	ENSNBRG00000011799	pelo	97	94.102	Neolamprologus_brichardi
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSNLEG00000035970	PELO	97	82.842	Nomascus_leucogenys
ENSMAMG00000013260	pelo	100	81.558	ENSMEUG00000005468	PELO	97	82.038	Notamacropus_eugenii
ENSMAMG00000013260	pelo	98	81.794	ENSOPRG00000018793	PELO	98	82.480	Ochotona_princeps
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.857	ENSODEG00000017579	PELO	97	83.110	Octodon_degus
ENSMAMG00000013260	pelo	96	94.609	ENSONIG00000011511	pelo	97	94.638	Oreochromis_niloticus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.857	ENSOCUG00000023902	PELO	97	83.378	Oryctolagus_cuniculus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.766	ENSORLG00000005827	pelo	97	94.370	Oryzias_latipes
ENSMAMG00000013260	pelo	100	94.026	ENSORLG00020016456	pelo	97	94.638	Oryzias_latipes_hni
ENSMAMG00000013260	pelo	100	94.026	ENSORLG00015014447	pelo	97	94.638	Oryzias_latipes_hsok
ENSMAMG00000013260	pelo	100	94.805	ENSOMEG00000021567	pelo	97	95.710	Oryzias_melastigma
ENSMAMG00000013260	pelo	100	83.117	ENSOGAG00000027940	PELO	97	83.378	Otolemur_garnettii
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSOARG00000008324	PELO	97	82.842	Ovis_aries
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSPPAG00000038951	PELO	97	82.842	Pan_paniscus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSPPRG00000018800	PELO	97	82.842	Panthera_pardus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSPTIG00000019988	PELO	97	82.842	Panthera_tigris_altaica
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSPTRG00000034409	PELO	97	82.842	Pan_troglodytes
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSPANG00000010902	PELO	97	82.842	Papio_anubis
ENSMAMG00000013260	pelo	100	91.169	ENSPKIG00000015190	pelo	97	91.957	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMAMG00000013260	pelo	97	81.600	ENSPSIG00000004971	PELO	97	81.769	Pelodiscus_sinensis
ENSMAMG00000013260	pelo	67	93.023	ENSPMGG00000014561	pelo	95	93.023	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	83.377	ENSPEMG00000015584	Pelo	97	83.646	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSPCIG00000004880	PELO	97	83.378	Phascolarctos_cinereus
ENSMAMG00000013260	pelo	100	94.286	ENSPFOG00000007277	pelo	97	94.906	Poecilia_formosa
ENSMAMG00000013260	pelo	100	94.545	ENSPLAG00000020787	pelo	97	95.174	Poecilia_latipinna
ENSMAMG00000013260	pelo	100	94.286	ENSPMEG00000016964	pelo	97	94.906	Poecilia_mexicana
ENSMAMG00000013260	pelo	100	94.545	ENSPREG00000023071	pelo	97	95.174	Poecilia_reticulata
ENSMAMG00000013260	pelo	97	82.842	ENSPPYG00000015451	PELO	93	82.842	Pongo_abelii
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.857	ENSPCOG00000021178	PELO	97	83.110	Propithecus_coquereli
ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.247	ENSPNYG00000017325	pelo	97	94.102	Pundamilia_nyererei
ENSMAMG00000013260	pelo	97	93.566	ENSPNAG00000012458	pelo	97	93.566	Pygocentrus_nattereri
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ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSRBIG00000007299	PELO	97	82.842	Rhinopithecus_bieti
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	ENSRROG00000035507	PELO	97	82.842	Rhinopithecus_roxellana
ENSMAMG00000013260	pelo	97	33.421	YNL001W	-	97	33.333	Saccharomyces_cerevisiae
ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.078	ENSSBOG00000036140	PELO	97	82.306	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMAMG00000013260	pelo	63	79.508	ENSSHAG00000010770	PELO	95	80.172	Sarcophilus_harrisii
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