EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMAMG00000014528 (Gene tree)
Gene ID: 113139505
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC113139505
Gene Type: protein_coding
Species: Mastacembelus_armatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10143 bases
Position: chrOOHQ01000039.1:12461648-12471790
Accession: 113139505
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMAMP00000021616	MMR_HSR1	PF01926.23	5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMAMT00000022163	-	2939	XM_026322803	ENSMAMP00000021616	448 (aa)	XP_026178588	UPI000E46579F

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	96	60.508	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	60.369

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	58.758	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.758	Amphilophus_citrinellus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Amphilophus_citrinellus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	92.857	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	92.857	Amphiprion_ocellaris
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Amphiprion_ocellaris
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Amphiprion_percula
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Amphiprion_percula
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Anabas_testudineus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Anabas_testudineus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	99	57.812	ENSACAG00000028632	-	99	57.906	Anolis_carolinensis
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	59.513	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Astatotilapia_calliptera
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Astatotilapia_calliptera
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	60.089	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Astyanax_mexicanus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	81.292	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.292	Astyanax_mexicanus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	77	61.449	ENSCING00000020807	-	91	61.449	Ciona_intestinalis
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	98	54.773	ENSCSAVG00000009987	-	98	55.227	Ciona_savignyi
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	88.616	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	86.321	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	89.509	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	89.509	Cyprinodon_variegatus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	60.089	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Cyprinodon_variegatus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	73.980	Danio_rerio
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	98	83.864	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.864	Danio_rerio
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	80	56.077	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	97	56.077	Eptatretus_burgeri
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	99	81.166	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.166	Esox_lucius
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Fundulus_heteroclitus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	59.956	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.956	Fundulus_heteroclitus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	89	55.611	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	55.611	Gadus_morhua
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	89.955	Gambusia_affinis
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Gambusia_affinis
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	58	93.798	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	93.798	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	85	64.136	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	62.095	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	59.735	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.735	Haplochromis_burtoni
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Haplochromis_burtoni
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Hippocampus_comes
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	99	85.135	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	85.135	Hippocampus_comes
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	84	58.730	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	83	58.730	Ictalurus_punctatus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	96	59.815	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	60.046	Ictalurus_punctatus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	77.283	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.283	Ictalurus_punctatus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Kryptolebias_marmoratus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Kryptolebias_marmoratus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	89.509	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	89.509	Labrus_bergylta
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	62.361	ENSLACG00000004899	-	99	62.361	Latimeria_chalumnae
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	99	60.762	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	60.987	Latimeria_chalumnae
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	99	68.919	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	68.919	Latimeria_chalumnae
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	99	74.273	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	74.273	Lepisosteus_oculatus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	92.411	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	92.411	Maylandia_zebra
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	59.292	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	59.292	Maylandia_zebra
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	57.871	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	57.871	Mola_mola
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Monopterus_albus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	98	90.205	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	90.205	Monopterus_albus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Neolamprologus_brichardi
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	96	60.277	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	60.277	Neolamprologus_brichardi
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Oreochromis_niloticus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	59.513	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Oreochromis_niloticus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	85.491	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	85.491	Oryzias_latipes
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Oryzias_latipes
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	88.170	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	88.170	Oryzias_latipes_hni
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Oryzias_latipes_hni
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	88.616	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	88.616	Oryzias_latipes_hsok
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	60.089	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Oryzias_latipes_hsok
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	89.732	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	89.732	Oryzias_melastigma
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	60.310	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	60.310	Oryzias_melastigma
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	77.283	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.283	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	58.259	ENSPKIG00000023918	-	98	58.259	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	58.980	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	59.867	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	60.177	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	60.177	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	85.268	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	85.268	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	89.800	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	89.800	Poecilia_formosa
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ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	90.179	ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	90.179	Poecilia_mexicana
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSPMEG00000024198	si:ch211-11k18.4	99	61.663	Poecilia_mexicana
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ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	98	58.087	ENSPREG00000015319	si:ch211-11k18.4	98	58.087	Poecilia_reticulata
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	59.735	ENSPNYG00000017099	si:ch211-11k18.4	99	59.735	Pundamilia_nyererei
ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSPNYG00000017266	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Pundamilia_nyererei
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