EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMAMG00000016989 (Gene tree)
Gene ID: 113129467
Gene Symbol: si:dkey-86e18.1
Alias: im:6912651
Full Name: uncharacterized LOC113129467
Gene Type: protein_coding
Species: Mastacembelus_armatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6631 bases
Position: chrOOHQ01000036.1:7820621-7827251
Accession: 113129467
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMAMP00000025295	Isy1	PF06246.12	1.3e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMAMT00000025946	-	5673	-	ENSMAMP00000025295	315 (aa)	XP_026161258	UPI000E4605B9

Gene Model

Click here to download ENSMAMG00000016989's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMAMG00000016989's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	99	69.010	ENSAPOG00000002792	si:dkey-86e18.1	99	69.010	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	60.317	ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	60.317	Amphilophus_citrinellus
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	99	58.654	ENSAOCG00000014440	si:dkey-86e18.1	99	58.654	Amphiprion_ocellaris
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	99	66.026	ENSAPEG00000011831	si:dkey-86e18.1	99	66.026	Amphiprion_percula
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	99	66.134	ENSATEG00000018061	si:dkey-86e18.1	100	66.134	Anabas_testudineus
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	97	64.495	ENSACLG00000012308	si:dkey-86e18.1	100	64.873	Astatotilapia_calliptera
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	99	47.826	ENSAMXG00000038638	si:dkey-86e18.1	100	47.826	Astyanax_mexicanus
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	99	56.869	ENSCSEG00000007482	-	99	56.869	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	60.759	ENSCVAG00000020099	si:dkey-86e18.1	99	60.759	Cyprinodon_variegatus
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	99	43.770	ENSDARG00000043536	si:dkey-86e18.1	99	43.770	Danio_rerio
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	50.313	ENSELUG00000007229	si:dkey-86e18.1	100	50.313	Esox_lucius
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	60.000	ENSFHEG00000023250	si:dkey-86e18.1	100	60.000	Fundulus_heteroclitus
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	86	60.806	ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	91	60.806	Gambusia_affinis
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	97	64.821	ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	65.190	Haplochromis_burtoni
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	99	46.984	ENSIPUG00000012213	si:dkey-86e18.1	99	46.984	Ictalurus_punctatus
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	99	66.667	ENSKMAG00000008387	si:dkey-86e18.1	99	66.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	97	51.623	ENSLBEG00000008055	si:dkey-86e18.1	98	51.911	Labrus_bergylta
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	99	39.748	ENSLACG00000003926	si:dkey-86e18.1	100	39.748	Latimeria_chalumnae
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	99	43.131	ENSLOCG00000008902	si:dkey-86e18.1	100	43.131	Lepisosteus_oculatus
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	97	64.495	ENSMZEG00005019446	si:dkey-86e18.1	100	64.873	Maylandia_zebra
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	57.460	ENSMMOG00000002257	si:dkey-86e18.1	100	57.460	Mola_mola
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	66.456	ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	91	66.456	Monopterus_albus
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	97	57.190	ENSNBRG00000023611	si:dkey-86e18.1	100	57.778	Neolamprologus_brichardi
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	97	64.706	ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	65.079	Oreochromis_niloticus
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	55.828	ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	55.828	Oryzias_latipes
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	56.508	ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	56.508	Oryzias_latipes_hni
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	55.215	ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	55.215	Oryzias_latipes_hsok
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	99	58.333	ENSOMEG00000001778	si:dkey-86e18.1	100	58.333	Oryzias_melastigma
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	99	40.566	ENSPKIG00000009550	si:dkey-86e18.1	100	40.566	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	50.158	ENSPMGG00000008481	si:dkey-86e18.1	99	50.158	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	61.709	ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	61.709	Poecilia_formosa
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	61.392	ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	61.392	Poecilia_latipinna
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	62.025	ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	62.025	Poecilia_mexicana
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	53.016	ENSPREG00000002081	si:dkey-86e18.1	100	53.016	Poecilia_reticulata
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	97	64.495	ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	64.873	Pundamilia_nyererei
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	99	47.771	ENSPNAG00000008048	si:dkey-86e18.1	100	47.771	Pygocentrus_nattereri
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	99	43.558	ENSSFOG00015002284	si:dkey-86e18.1	100	43.558	Scleropages_formosus
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	96	66.776	ENSSMAG00000017672	si:dkey-86e18.1	98	67.093	Scophthalmus_maximus
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	70.755	ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	70.755	Seriola_dumerili
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	70.219	ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	70.219	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	69.841	ENSSPAG00000014712	si:dkey-86e18.1	100	69.841	Stegastes_partitus
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	55.873	ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	57.143	Takifugu_rubripes
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	52.381	ENSXCOG00000008851	si:dkey-86e18.1	100	52.381	Xiphophorus_couchianus
ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	60.443	ENSXMAG00000011403	si:dkey-86e18.1	100	60.443	Xiphophorus_maculatus