EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMAMG00000021976 (Gene tree)
Gene ID: 113121830
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Mastacembelus_armatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16303 bases
Position: chrOOHQ01000089.1:3232008-3248310
Accession: 113121830
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMAMP00000032659	RIX1	PF08167.12	2.1e-11	1	1
ENSMAMP00000032663	IBN_N	PF03810.19	8.1e-15	1	1
ENSMAMP00000032659	IBN_N	PF03810.19	8.9e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMAMT00000033508	-	6269	-	ENSMAMP00000032659	1085 (aa)	XP_026148439	UPI000E464B1A
ENSMAMT00000033512	-	3219	-	ENSMAMP00000032663	1072 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.972	ENSG00000196497	IPO4	99	45.018	Homo_sapiens
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	80.922	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	80.922	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.270	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	44.177	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	79.706	ENSACIG00000004246	ipo4	100	79.706	Amphilophus_citrinellus
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	82.661	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	82.661	Amphiprion_ocellaris
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	82.661	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	82.661	Amphiprion_percula
ENSMAMG00000021976	ipo4	92	87.238	ENSATEG00000017082	ipo4	99	87.238	Anabas_testudineus
ENSMAMG00000021976	ipo4	84	46.312	ENSACAG00000003973	-	97	46.262	Anolis_carolinensis
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.507	ENSANAG00000037973	IPO4	99	44.742	Aotus_nancymaae
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	80.018	ENSACLG00000019742	ipo4	100	80.018	Astatotilapia_calliptera
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	69.862	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	69.493	Astyanax_mexicanus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.824	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.547	Bos_taurus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.972	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	45.203	Callithrix_jacchus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.616	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	45.471	Canis_familiaris
ENSMAMG00000021976	ipo4	98	45.209	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.372	Canis_lupus_dingo
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.776	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	44.547	Capra_hircus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.590	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	44.270	Carlito_syrichta
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.194	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	44.824	Cavia_porcellus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.786	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	44.834	Cebus_capucinus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.345	ENSCATG00000040395	IPO4	99	45.295	Cercocebus_atys
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.656	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	45.471	Chinchilla_lanigera
ENSMAMG00000021976	ipo4	90	45.418	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	42.673	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAMG00000021976	ipo4	92	36.302	ENSCING00000008639	-	99	36.293	Ciona_intestinalis
ENSMAMG00000021976	ipo4	92	36.686	ENSCSAVG00000011482	-	98	36.884	Ciona_savignyi
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.065	ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.018	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	43.860	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	43.952	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	43.767	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	43.952	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	76.584	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	76.125	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	73.869	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	73.838	Cyprinodon_variegatus
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	74.425	ENSDARG00000041493	ipo4	100	74.333	Danio_rerio
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.379	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	45.287	Dasypus_novemcinctus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.429	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	45.471	Dipodomys_ordii
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.751	ENSETEG00000018381	IPO4	99	44.342	Echinops_telfairi
ENSMAMG00000021976	ipo4	90	46.545	ENSEASG00005011954	IPO4	96	46.545	Equus_asinus_asinus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.194	ENSECAG00000009909	IPO4	99	45.102	Equus_caballus
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	74.037	ENSELUG00000020628	ipo4	100	74.220	Esox_lucius
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.749	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	45.656	Felis_catus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	41.636	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	41.636	Fukomys_damarensis
ENSMAMG00000021976	ipo4	89	79.292	ENSFHEG00000009351	ipo4	97	79.564	Fundulus_heteroclitus
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	77.624	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	77.624	Gadus_morhua
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	78.827	ENSGAFG00000005601	ipo4	100	78.827	Gambusia_affinis
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	81.400	ENSGACG00000002276	ipo4	99	81.492	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.879	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	44.926	Gorilla_gorilla
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	80.681	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	80.681	Haplochromis_burtoni
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.640	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	44.640	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.362	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	44.362	Heterocephalus_glaber_male
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	76.833	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	76.833	Hippocampus_comes
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	72.284	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	72.099	Ictalurus_punctatus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.656	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	45.379	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.200	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	44.968	Jaculus_jaculus
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	79.706	ENSKMAG00000004627	ipo4	100	79.614	Kryptolebias_marmoratus
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	82.613	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	82.521	Labrus_bergylta
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	50.540	ENSLACG00000001428	IPO4	100	50.314	Latimeria_chalumnae
ENSMAMG00000021976	ipo4	78	67.857	ENSLOCG00000001149	ipo4	85	66.582	Lepisosteus_oculatus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.346	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	45.429	Loxodonta_africana
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.345	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	45.295	Macaca_fascicularis
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.345	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	45.295	Macaca_mulatta
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.251	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	45.203	Macaca_nemestrina
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.345	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	45.295	Mandrillus_leucophaeus
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	80.755	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	80.755	Maylandia_zebra
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.917	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	44.640	Mesocricetus_auratus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.802	ENSMICG00000001719	IPO4	99	45.749	Microcebus_murinus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.216	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	44.229	Microtus_ochrogaster
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	80.695	ENSMMOG00000005264	ipo4	100	80.878	Mola_mola
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	43.900	ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.623	Monodelphis_domestica
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	83.088	ENSMALG00000001587	ipo4	100	83.272	Monopterus_albus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.598	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	46.173	Mus_caroli
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.229	ENSMUSG00000002319	Ipo4	99	45.679	Mus_musculus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.362	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	46.020	Mus_pahari
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.506	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	99	45.926	Mus_spretus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	46.303	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	46.211	Mustela_putorius_furo
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.824	ENSMLUG00000025277	IPO4	86	44.824	Myotis_lucifugus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.194	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	44.824	Nannospalax_galili
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	83.871	ENSNBRG00000005870	ipo4	100	83.871	Neolamprologus_brichardi
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.756	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	45.664	Ochotona_princeps
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.379	ENSODEG00000002609	IPO4	99	45.194	Octodon_degus
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	83.978	ENSONIG00000014574	ipo4	100	83.978	Oreochromis_niloticus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.885	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	44.608	Oryctolagus_cuniculus
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	76.271	ENSORLG00000006457	ipo4	99	78.927	Oryzias_latipes
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	78.749	ENSORLG00020004286	ipo4	100	78.381	Oryzias_latipes_hni
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	78.565	ENSORLG00015021856	ipo4	100	78.197	Oryzias_latipes_hsok
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	76.115	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	75.919	Oryzias_melastigma
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.310	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	44.270	Otolemur_garnettii
ENSMAMG00000021976	ipo4	98	44.382	ENSOARG00000019188	IPO4	99	44.101	Ovis_aries
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.693	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	44.557	Pan_paniscus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.933	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	45.841	Panthera_pardus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.841	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	45.749	Panthera_tigris_altaica
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.879	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	44.649	Pan_troglodytes
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.438	ENSPANG00000026278	IPO4	99	45.387	Papio_anubis
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	66.942	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	67.309	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	68.883	ENSPKIG00000007683	-	99	68.421	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	72.294	ENSPMGG00000020871	ipo4	100	71.927	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	43.675	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	43.583	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMAMG00000021976	ipo4	94	46.267	ENSPCIG00000010718	IPO4	97	46.131	Phascolarctos_cinereus
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	79.174	ENSPFOG00000009255	ipo4	100	79.174	Poecilia_formosa
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	79.266	ENSPLAG00000020556	ipo4	100	79.266	Poecilia_latipinna
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	79.174	ENSPMEG00000013102	ipo4	100	79.174	Poecilia_mexicana
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	78.991	ENSPREG00000017605	ipo4	100	78.991	Poecilia_reticulata
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.972	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	45.111	Pongo_abelii
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	46.692	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	46.630	Procavia_capensis
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.776	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	44.732	Propithecus_coquereli
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.963	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	45.102	Pteropus_vampyrus
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	82.228	ENSPNYG00000021414	ipo4	100	82.228	Pundamilia_nyererei
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	74.101	ENSPNAG00000027964	ipo4	100	74.194	Pygocentrus_nattereri
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.547	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	44.691	Rattus_norvegicus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.158	ENSRBIG00000027704	IPO4	99	45.018	Rhinopithecus_bieti
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.158	ENSRROG00000011492	IPO4	99	45.018	Rhinopithecus_roxellana
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	43.762	ENSSBOG00000020162	IPO4	99	43.911	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.906	ENSSHAG00000002619	IPO4	96	46.090	Sarcophilus_harrisii
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	64.945	ENSSFOG00015014437	IPO4	99	64.852	Scleropages_formosus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	67.706	ENSSFOG00015012267	ipo4	99	67.779	Scleropages_formosus
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	83.747	ENSSMAG00000019912	ipo4	100	83.501	Scophthalmus_maximus
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	81.066	ENSSDUG00000017513	ipo4	100	81.066	Seriola_dumerili
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ENSMAMG00000021976	ipo4	82	46.040	ENSSARG00000010701	IPO4	81	45.916	Sorex_araneus
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	83.088	ENSSPAG00000008486	ipo4	100	83.088	Stegastes_partitus
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ENSMAMG00000021976	ipo4	100	77.022	ENSTRUG00000012832	ipo4	100	77.114	Takifugu_rubripes
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ENSMAMG00000021976	ipo4	94	47.383	ENSTBEG00000009781	IPO4	99	42.949	Tupaia_belangeri
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ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.834	ENSUAMG00000024037	IPO4	99	44.649	Ursus_americanus
ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.304	ENSXETG00000014621	ipo4	99	44.843	Xenopus_tropicalis
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	77.482	ENSXCOG00000005208	ipo4	100	76.965	Xiphophorus_couchianus
ENSMAMG00000021976	ipo4	100	78.807	ENSXMAG00000006041	ipo4	100	78.807	Xiphophorus_maculatus