EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMAUG00000002959 (Gene tree)
Gene ID: 101841209
Gene Symbol: Tyw1
Alias: Rsafd1
Full Name: S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase
Gene Type: protein_coding
Species: Mesocricetus_auratus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 101499 bases
Position: chrKB708225.1:660656-762154
Accession: 101841209
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMAUP00000003016	Wyosine_form	PF08608.12	1.5e-27	1	1
ENSMAUP00000003002	Wyosine_form	PF08608.12	1.8e-27	1	1
ENSMAUP00000003006	Wyosine_form	PF08608.12	1.8e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMAUT00000003866	-	1386	-	ENSMAUP00000003004	461 (aa)	-	-
ENSMAUT00000003872	-	2175	-	ENSMAUP00000003006	724 (aa)	-	-
ENSMAUT00000003890	-	1926	-	ENSMAUP00000003016	641 (aa)	-	-
ENSMAUT00000003861	-	2175	XM_013120718	ENSMAUP00000003002	724 (aa)	XP_012976172	A0A1U8C9N5

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	80.601	ENSG00000198874	TYW1	100	80.601	Homo_sapiens
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	75.559	ENSG00000277149	TYW1B	99	77.795	Homo_sapiens
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	66.071	ENSAPOG00000014391	tyw1	97	66.392	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	64.722	ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.306	Amphilophus_citrinellus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	64.189	ENSAOCG00000016792	tyw1	97	65.668	Amphiprion_ocellaris
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	64.054	ENSAPEG00000015939	tyw1	97	68.230	Amphiprion_percula
ENSMAUG00000002959	Tyw1	90	66.058	ENSATEG00000006856	tyw1	91	65.906	Anabas_testudineus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	79.098	ENSANAG00000037051	-	100	79.098	Aotus_nancymaae
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	66.805	ENSACLG00000018688	tyw1	96	66.343	Astatotilapia_calliptera
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	67.225	ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.225	Astyanax_mexicanus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	78.659	ENSBTAG00000008446	TYW1	100	78.659	Bos_taurus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	78.825	ENSCJAG00000004295	-	100	78.825	Callithrix_jacchus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	77.657	ENSCAFG00000010867	-	100	77.929	Canis_familiaris
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	75.753	ENSCAFG00020005367	-	99	75.753	Canis_lupus_dingo
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	79.754	ENSCHIG00000019510	-	100	79.754	Capra_hircus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	90	80.945	ENSTSYG00000008236	-	99	80.945	Carlito_syrichta
ENSMAUG00000002959	Tyw1	93	75.733	ENSCAPG00000013569	-	100	76.384	Cavia_aperea
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	77.402	ENSCPOG00000011182	-	100	77.673	Cavia_porcellus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	79.235	ENSCCAG00000026643	-	100	79.372	Cebus_capucinus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	80.464	ENSCATG00000043677	-	100	80.464	Cercocebus_atys
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	78.125	ENSCLAG00000006321	-	100	78.125	Chinchilla_lanigera
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	69.231	ENSCSAG00000018274	-	100	69.231	Chlorocebus_sabaeus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	68	92.308	ENSCHOG00000003801	-	75	92.308	Choloepus_hoffmanni
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	70.867	ENSCPBG00000014896	-	97	75.551	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAUG00000002959	Tyw1	81	58.744	ENSCING00000004125	-	97	58.081	Ciona_intestinalis
ENSMAUG00000002959	Tyw1	90	54.829	ENSCSAVG00000005712	-	100	55.146	Ciona_savignyi
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	80.464	ENSCANG00000033209	-	100	80.464	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	71	96.991	ENSCGRG00001003679	Tyw1	88	96.991	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	67.041	ENSCSEG00000005810	tyw1	94	67.041	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAUG00000002959	Tyw1	88	65.231	ENSCVAG00000001054	tyw1	91	65.586	Cyprinodon_variegatus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	67.715	ENSDARG00000062987	tyw1	96	67.715	Danio_rerio
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	80.438	ENSDNOG00000024165	-	100	80.027	Dasypus_novemcinctus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	74.654	ENSDORG00000014772	Tyw1	98	74.654	Dipodomys_ordii
ENSMAUG00000002959	Tyw1	51	53.261	ENSETEG00000009904	-	83	53.261	Echinops_telfairi
ENSMAUG00000002959	Tyw1	67	70.833	ENSEBUG00000004494	tyw1	92	70.833	Eptatretus_burgeri
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	79.207	ENSEASG00005008818	-	100	79.207	Equus_asinus_asinus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	71.272	ENSECAG00000023164	-	100	71.056	Equus_caballus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	61	89.583	ENSEEUG00000005950	-	61	89.583	Erinaceus_europaeus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	65.170	ENSELUG00000008449	tyw1	98	66.112	Esox_lucius
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	78.187	ENSFCAG00000014262	-	100	77.248	Felis_catus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	66.895	ENSFALG00000013810	-	100	66.895	Ficedula_albicollis
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	78.112	ENSFDAG00000013270	-	99	78.112	Fukomys_damarensis
ENSMAUG00000002959	Tyw1	84	67.695	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	67.695	Fundulus_heteroclitus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	65.395	ENSGALG00000001110	-	99	69.346	Gallus_gallus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	64.876	ENSGACG00000012692	tyw1	98	66.203	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	70.149	ENSGAGG00000022393	-	100	70.149	Gopherus_agassizii
ENSMAUG00000002959	Tyw1	90	71.927	ENSGGOG00000001473	TYW1	100	71.927	Gorilla_gorilla
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	66.667	ENSHBUG00000002640	tyw1	96	66.205	Haplochromis_burtoni
ENSMAUG00000002959	Tyw1	94	70.801	ENSHGLG00000012093	-	100	76.019	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	78.933	ENSHGLG00100011743	TYW1	100	78.933	Heterocephalus_glaber_male
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	62.325	ENSHCOG00000019949	tyw1	96	62.185	Hippocampus_comes
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	65.937	ENSIPUG00000016330	tyw1	97	66.667	Ictalurus_punctatus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	79.127	ENSSTOG00000004067	-	92	79.127	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	82.393	ENSJJAG00000022959	Tyw1	100	83.219	Jaculus_jaculus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	64.529	ENSKMAG00000018599	tyw1	96	65.517	Kryptolebias_marmoratus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	66.074	ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.800	Latimeria_chalumnae
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	68.320	ENSLOCG00000004035	tyw1	96	68.182	Lepisosteus_oculatus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	80.464	ENSMFAG00000035457	-	100	80.464	Macaca_fascicularis
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	80.464	ENSMMUG00000030374	-	100	80.464	Macaca_mulatta
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	80.738	ENSMNEG00000041992	-	100	80.738	Macaca_nemestrina
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	80.464	ENSMLEG00000039741	-	100	80.464	Mandrillus_leucophaeus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	67.452	ENSMAMG00000016089	tyw1	94	67.452	Mastacembelus_armatus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	91	70.120	ENSMZEG00005024386	tyw1	97	69.474	Maylandia_zebra
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	69.619	ENSMGAG00000002176	-	99	69.619	Meleagris_gallopavo
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	79.448	ENSMICG00000014374	-	100	79.890	Microcebus_murinus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	92.552	ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	92.414	Microtus_ochrogaster
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	62.588	ENSMMOG00000005064	tyw1	97	62.588	Mola_mola
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	71.719	ENSMODG00000025697	-	100	71.719	Monodelphis_domestica
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	67.268	ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.268	Monopterus_albus
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ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	90.569	ENSMUSG00000056310	Tyw1	99	90.569	Mus_musculus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	88.627	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	99	89.320	Mus_pahari
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	90.707	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	99	90.707	Mus_spretus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	95	77.246	ENSMPUG00000016191	-	100	76.957	Mustela_putorius_furo
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	76.223	ENSMLUG00000013582	-	100	76.223	Myotis_lucifugus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	82.964	ENSNGAG00000002742	Tyw1	99	82.964	Nannospalax_galili
ENSMAUG00000002959	Tyw1	96	66.714	ENSNBRG00000016996	tyw1	99	66.714	Neolamprologus_brichardi
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	79.508	ENSNLEG00000013210	-	99	79.508	Nomascus_leucogenys
ENSMAUG00000002959	Tyw1	92	63.118	ENSOPRG00000008734	-	88	63.118	Ochotona_princeps
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	77.217	ENSODEG00000014729	-	99	76.712	Octodon_degus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	67.270	ENSONIG00000005872	tyw1	96	66.946	Oreochromis_niloticus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	78.386	ENSOCUG00000003173	-	100	78.386	Oryctolagus_cuniculus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	66.852	ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.812	Oryzias_latipes
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	67.129	ENSORLG00020019361	tyw1	96	67.129	Oryzias_latipes_hni
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	66.898	ENSORLG00015008095	tyw1	95	67.038	Oryzias_latipes_hsok
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	78.918	ENSOGAG00000016555	-	98	78.918	Otolemur_garnettii
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	79.348	ENSOARG00000010673	-	100	79.348	Ovis_aries
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	78.052	ENSPPRG00000004945	-	100	77.778	Panthera_pardus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	78.189	ENSPTIG00000019545	-	100	77.915	Panthera_tigris_altaica
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	72.564	ENSPTRG00000023076	TYW1B	99	74.763	Pan_troglodytes
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	80.464	ENSPANG00000019053	-	100	80.464	Papio_anubis
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	65.793	ENSPKIG00000006545	tyw1	96	66.207	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMAUG00000002959	Tyw1	96	64.689	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	64.831	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	92.798	ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	92.798	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	66.398	ENSPFOG00000015855	tyw1	99	66.398	Poecilia_formosa
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	66.040	ENSPLAG00000000838	tyw1	93	81.675	Poecilia_latipinna
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ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	64.295	ENSPREG00000018773	tyw1	98	64.617	Poecilia_reticulata
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	80.874	ENSPPYG00000017514	TYW1	100	80.874	Pongo_abelii
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	63.165	ENSPCOG00000015294	-	97	72.000	Propithecus_coquereli
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	66.805	ENSPNYG00000022381	tyw1	96	66.343	Pundamilia_nyererei
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	68.985	ENSPNAG00000009001	tyw1	98	68.985	Pygocentrus_nattereri
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ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	80.464	ENSRBIG00000039619	-	100	80.464	Rhinopithecus_bieti
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ENSMAUG00000002959	Tyw1	94	40.863	YPL207W	-	70	54.034	Saccharomyces_cerevisiae
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	78.962	ENSSBOG00000025873	-	100	78.962	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	72.011	ENSSHAG00000010346	-	100	73.269	Sarcophilus_harrisii
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	68.560	ENSSFOG00015001054	tyw1	97	69.848	Scleropages_formosus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	66.158	ENSSMAG00000020514	tyw1	96	66.207	Scophthalmus_maximus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	66.529	ENSSDUG00000001552	tyw1	93	70.651	Seriola_dumerili
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	66.667	ENSSLDG00000003554	tyw1	96	66.667	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	68.514	ENSSPUG00000002715	-	100	69.850	Sphenodon_punctatus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	79.670	ENSSSCG00000007733	-	99	79.670	Sus_scrofa
ENSMAUG00000002959	Tyw1	91	68.018	ENSTGUG00000003428	-	100	68.018	Taeniopygia_guttata
ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	66.667	ENSTRUG00000016107	tyw1	93	66.667	Takifugu_rubripes
ENSMAUG00000002959	Tyw1	90	69.970	ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.670	Tetraodon_nigroviridis
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	77.929	ENSUMAG00000015343	-	100	77.657	Ursus_maritimus
ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	76.975	ENSVVUG00000016457	-	100	77.248	Vulpes_vulpes
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	69.919	ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.158	Xenopus_tropicalis
ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	66.214	ENSXMAG00000013125	tyw1	98	67.683	Xiphophorus_maculatus