EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMAUG00000007235 (Gene tree)
Gene ID: 101834230
Gene Symbol: Htatsf1
Alias: 1600023H17Rik|2600017A12Rik|2700077B20Rik|TAT-SF1
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mesocricetus_auratus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12491 bases
Position: chrKB708298.1:890906-903396
Accession: 101834230
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMAUP00000005296	RRM_1	PF00076.22	5.4e-17	1	2
ENSMAUP00000005296	RRM_1	PF00076.22	5.4e-17	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMAUT00000008800	-	2241	XM_013123999	ENSMAUP00000005296	746 (aa)	XP_012979453	-
ENSMAUT00000008756	-	798	-	ENSMAUP00000005270	190 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	73.850	ENSG00000102241	HTATSF1	100	88.525	Homo_sapiens
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	55	60.422	ENSAPOG00000009823	htatsf1	92	60.284	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	72.983	ENSAMEG00000002921	HTATSF1	99	72.634	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	53	61.737	ENSACIG00000020459	htatsf1	82	63.325	Amphilophus_citrinellus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	62.850	ENSAOCG00000020994	htatsf1	80	62.735	Amphiprion_ocellaris
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	62.850	ENSAPEG00000016432	htatsf1	89	60.964	Amphiprion_percula
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	51	60.051	ENSACAG00000009346	HTATSF1	93	60.051	Anolis_carolinensis
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	95	64.110	ENSANAG00000027986	-	97	62.055	Aotus_nancymaae
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	94	71.008	ENSANAG00000025458	-	99	70.588	Aotus_nancymaae
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	52	61.614	ENSACLG00000008096	htatsf1	89	61.408	Astatotilapia_calliptera
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	64.411	ENSAMXG00000008387	htatsf1	79	63.947	Astyanax_mexicanus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	70.988	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	99	72.286	Bos_taurus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	66.142	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	99	67.454	Bos_taurus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	70.988	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	99	72.286	Bos_taurus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	73.263	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	99	72.346	Callithrix_jacchus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	74.836	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	99	74.346	Canis_familiaris
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	73.496	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	99	73.018	Canis_lupus_dingo
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	71.691	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	99	72.881	Capra_hircus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	74.474	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	99	75.817	Carlito_syrichta
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	74.147	ENSCCAG00000022701	-	99	73.228	Cebus_capucinus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	70.395	ENSCCAG00000025329	-	99	69.474	Cebus_capucinus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	73.913	ENSCATG00000029963	HTATSF1	100	74.185	Cercocebus_atys
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	71.186	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	71.056	Chinchilla_lanigera
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	74.045	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	100	74.316	Chlorocebus_sabaeus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	51	70.026	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	88	67.322	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	74.045	ENSCANG00000028495	HTATSF1	100	74.316	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	100	86.538	ENSCGRG00001021602	Htatsf1	100	87.821	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	92	80.893	ENSCGRG00000002085	Htatsf1	100	82.148	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	65.985	ENSCVAG00000014070	htatsf1	81	65.147	Cyprinodon_variegatus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	62.629	ENSDARG00000056649	htatsf1	84	62.629	Danio_rerio
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	71.261	ENSDNOG00000002254	HTATSF1	99	72.962	Dasypus_novemcinctus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	66	47.904	ENSETEG00000006377	-	69	48.008	Echinops_telfairi
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	49.502	ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	48.958	Eptatretus_burgeri
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	81	74.568	ENSEASG00005003440	HTATSF1	99	71.684	Equus_asinus_asinus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	81	74.882	ENSECAG00000009156	HTATSF1	99	71.939	Equus_caballus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	61.410	ENSEEUG00000010668	HTATSF1	99	61.656	Erinaceus_europaeus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	74.707	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	99	74.215	Felis_catus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	51	68.193	ENSFALG00000003728	HTATSF1	87	67.662	Ficedula_albicollis
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	70.735	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	71.317	Fukomys_damarensis
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	65.903	ENSFHEG00000020286	htatsf1	83	64.644	Fundulus_heteroclitus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	51	68.653	ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	65.860	Gallus_gallus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	64.557	ENSGAFG00000003041	htatsf1	82	63.660	Gambusia_affinis
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	63.049	ENSGACG00000020459	htatsf1	82	62.432	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	73.850	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	99	74.248	Gorilla_gorilla
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	52	62.347	ENSHBUG00000004392	htatsf1	89	62.136	Haplochromis_burtoni
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	98	70.346	ENSHGLG00000005328	HTATSF1	99	70.735	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	51	61.480	ENSHCOG00000009056	htatsf1	90	60.859	Hippocampus_comes
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	64.136	ENSIPUG00000017828	htatsf1	80	64.829	Ictalurus_punctatus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	74.766	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	74.805	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	64.557	ENSKMAG00000007622	htatsf1	81	64.706	Kryptolebias_marmoratus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	67.368	ENSLACG00000015989	HTATSF1	80	66.851	Latimeria_chalumnae
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	53	43.990	ENSLOCG00000015118	htatsf1	86	43.552	Lepisosteus_oculatus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	65.572	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	65.359	Loxodonta_africana
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	74.045	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	100	74.316	Macaca_fascicularis
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	73.781	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	100	74.055	Macaca_mulatta
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	69.272	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	100	69.594	Macaca_nemestrina
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	73.650	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	100	74.055	Mandrillus_leucophaeus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	63.728	ENSMAMG00000021225	htatsf1	83	63.395	Mastacembelus_armatus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	52	61.614	ENSMZEG00005000485	htatsf1	89	61.408	Maylandia_zebra
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	72.680	ENSMICG00000009348	HTATSF1	99	73.856	Microcebus_murinus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	100	80.570	ENSMOCG00000023007	-	100	80.699	Microtus_ochrogaster
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	78.220	ENSMOCG00000022370	-	95	77.675	Microtus_ochrogaster
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	53	62.410	ENSMMOG00000011013	htatsf1	90	62.410	Mola_mola
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	52	71.066	ENSMODG00000014087	-	86	71.066	Monodelphis_domestica
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	55	59.674	ENSMALG00000019977	htatsf1	93	59.674	Monopterus_albus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	79.342	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	80.263	Mus_caroli
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	98	79.813	ENSMUSG00000067873	Htatsf1	99	81.447	Mus_musculus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	98	79.947	MGP_SPRETEiJ_G0034249	Htatsf1	99	81.579	Mus_spretus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	71.120	ENSMPUG00000001901	HTATSF1	99	71.995	Mustela_putorius_furo
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	67.143	ENSMLUG00000028418	-	99	67.529	Myotis_lucifugus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	65.782	ENSMLUG00000009234	-	100	63.368	Myotis_lucifugus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	98	77.718	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	78.836	Nannospalax_galili
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	52	61.985	ENSNBRG00000003818	htatsf1	82	62.205	Neolamprologus_brichardi
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	72.881	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	99	73.987	Nomascus_leucogenys
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	71.123	ENSMEUG00000004133	-	90	71.658	Notamacropus_eugenii
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	52	62.712	ENSONIG00000008638	htatsf1	87	62.745	Oreochromis_niloticus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	100	72.599	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	100	74.008	Oryctolagus_cuniculus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	98	71.598	ENSOGAG00000005565	HTATSF1	99	72.952	Otolemur_garnettii
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	70.732	ENSOARG00000011215	-	99	71.903	Ovis_aries
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	68.031	ENSOARG00000000481	-	99	68.286	Ovis_aries
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	73.850	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	99	74.248	Pan_paniscus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	73.924	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	99	73.429	Panthera_pardus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	92	72.893	ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	72.355	Panthera_tigris_altaica
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	73.850	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	99	74.248	Pan_troglodytes
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	62.978	ENSPANG00000010946	HTATSF1	100	63.364	Papio_anubis
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	66.316	ENSPKIG00000024852	htatsf1	79	65.746	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	64.810	ENSPMGG00000006172	htatsf1	86	64.411	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	98	82.377	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	83.311	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	59	61.298	ENSPCIG00000018896	-	100	61.298	Phascolarctos_cinereus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	57	63.616	ENSPCIG00000030173	-	99	63.741	Phascolarctos_cinereus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	64.070	ENSPFOG00000007871	htatsf1	81	63.492	Poecilia_formosa
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ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	64.467	ENSPREG00000007811	htatsf1	82	63.904	Poecilia_reticulata
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	81	77.060	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	83	76.960	Pongo_abelii
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	93	63.329	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	99	61.457	Procavia_capensis
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	74.674	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	99	75.979	Propithecus_coquereli
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	66.799	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	66.402	Pteropus_vampyrus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	52	61.743	ENSPNYG00000016693	htatsf1	89	61.538	Pundamilia_nyererei
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	64.286	ENSPNAG00000006166	htatsf1	81	62.371	Pygocentrus_nattereri
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	81.701	ENSRNOG00000027761	Htatsf1	99	82.216	Rattus_norvegicus
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ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	73.650	ENSRROG00000021939	HTATSF1	100	73.924	Rhinopithecus_roxellana
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	70.550	ENSSBOG00000017914	-	99	69.634	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	73.413	ENSSBOG00000027186	-	100	73.168	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	51	69.737	ENSSHAG00000006440	-	99	68.734	Sarcophilus_harrisii
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	51	63.446	ENSSFOG00015012002	htatsf1	77	63.510	Scleropages_formosus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	54	59.629	ENSSLDG00000016880	htatsf1	93	59.629	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	98	59.157	ENSSARG00000005193	HTATSF1	81	65.635	Sorex_araneus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	67.969	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	84	67.969	Sphenodon_punctatus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	51	62.963	ENSSPAG00000000732	htatsf1	92	60.140	Stegastes_partitus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	66.230	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	99	67.658	Sus_scrofa
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	69.211	ENSTGUG00000002099	HTATSF1	86	67.939	Taeniopygia_guttata
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	64.051	ENSTRUG00000013383	htatsf1	83	63.395	Takifugu_rubripes
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	51	63.457	ENSTNIG00000016140	htatsf1	88	63.457	Tetraodon_nigroviridis
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	84	65.116	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	96	64.984	Tursiops_truncatus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	74.674	ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	74.118	Ursus_americanus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	73.436	ENSUMAG00000010393	HTATSF1	99	72.890	Ursus_maritimus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	91	66.667	ENSVPAG00000004569	HTATSF1	99	67.705	Vicugna_pacos
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	73.239	ENSVVUG00000024802	HTATSF1	99	72.762	Vulpes_vulpes
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	65.375	ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	66.295	Xiphophorus_couchianus
ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	66.580	ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	66.116	Xiphophorus_maculatus