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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSMAUG00000016820 (Gene tree)
Gene ID: 101825161
Gene Symbol: Msi1
Alias: Msi1|Msi1h|Musahi1|m-Msi-1
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mesocricetus_auratus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16081 bases
Position: chrKB708214.1:3858182-3874262
Accession: 101825161
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMAUP00000018151	RRM_1	PF00076.22	1.3e-34	1	2
ENSMAUP00000018151	RRM_1	PF00076.22	1.3e-34	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMAUT00000022110	-	1377	XM_013119714	ENSMAUP00000018151	243 (aa)	XP_012975168	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMAUG00000016820	Msi1	69	35.227	ENSMAUG00000000115	-	73	35.227
ENSMAUG00000016820	Msi1	70	36.709	ENSMAUG00000015650	-	70	37.500
ENSMAUG00000016820	Msi1	70	42.775	ENSMAUG00000019184	-	75	39.224
ENSMAUG00000016820	Msi1	73	42.500	ENSMAUG00000015003	-	79	42.500
ENSMAUG00000016820	Msi1	78	40.865	ENSMAUG00000012188	Dazap1	98	44.311
ENSMAUG00000016820	Msi1	73	34.932	ENSMAUG00000018057	Tardbp	68	34.932
ENSMAUG00000016820	Msi1	85	37.363	ENSMAUG00000002746	-	68	37.363
ENSMAUG00000016820	Msi1	62	41.667	ENSMAUG00000002162	CIRP	96	41.667
ENSMAUG00000016820	Msi1	70	50.296	ENSMAUG00000011132	Hnrnpdl	75	41.525
ENSMAUG00000016820	Msi1	69	39.437	ENSMAUG00000016488	-	90	39.437
ENSMAUG00000016820	Msi1	51	40.741	ENSMAUG00000008646	-	98	39.437
ENSMAUG00000016820	Msi1	93	80.973	ENSMAUG00000003862	Msi2	64	80.973
ENSMAUG00000016820	Msi1	73	43.017	ENSMAUG00000005706	-	75	41.379
ENSMAUG00000016820	Msi1	74	44.974	ENSMAUG00000008830	Hnrnpd	70	41.525
ENSMAUG00000016820	Msi1	79	51.064	ENSMAUG00000021211	Rbm38	55	38.158
ENSMAUG00000016820	Msi1	69	44.118	ENSMAUG00000018485	Hnrnpa0	60	43.333

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSG00000135097	MSI1	75	100.000	Homo_sapiens
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	88.477	ENSAPOG00000003191	MSI1	70	88.477	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	89.300	ENSAPOG00000023458	-	70	89.300	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAUG00000016820	Msi1	92	100.000	ENSAMEG00000013302	MSI1	58	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMAUG00000016820	Msi1	99	87.336	ENSACIG00000017754	-	64	90.000	Amphilophus_citrinellus
ENSMAUG00000016820	Msi1	58	84.286	ENSACIG00000018210	zgc:110796	76	84.286	Amphilophus_citrinellus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	88.477	ENSAOCG00000003804	MSI1	70	88.477	Amphiprion_ocellaris
ENSMAUG00000016820	Msi1	98	88.186	ENSAOCG00000009031	-	72	88.186	Amphiprion_ocellaris
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	88.477	ENSAPEG00000003245	MSI1	70	88.477	Amphiprion_percula
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	89.300	ENSAPEG00000006857	-	59	89.300	Amphiprion_percula
ENSMAUG00000016820	Msi1	92	87.444	ENSATEG00000023779	-	63	87.444	Anabas_testudineus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	88.696	ENSATEG00000017059	MSI1	69	88.312	Anabas_testudineus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	98.765	ENSACAG00000002762	MSI1	67	98.765	Anolis_carolinensis
ENSMAUG00000016820	Msi1	99	96.281	ENSANAG00000027901	-	81	96.281	Aotus_nancymaae
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSANAG00000027151	MSI1	71	100.000	Aotus_nancymaae
ENSMAUG00000016820	Msi1	99	88.017	ENSACLG00000011230	MSI1	69	88.017	Astatotilapia_calliptera
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	89.300	ENSACLG00000000117	-	74	89.256	Astatotilapia_calliptera
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	87.124	ENSAMXG00000038960	msi1	58	87.124	Astyanax_mexicanus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSBTAG00000009800	MSI1	71	100.000	Bos_taurus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSCJAG00000008578	MSI1	71	100.000	Callithrix_jacchus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	99.588	ENSCAFG00000010283	MSI1	71	99.588	Canis_familiaris
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSCAFG00020020585	MSI1	68	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSMAUG00000016820	Msi1	99	95.833	ENSCHIG00000024304	MSI1	67	95.833	Capra_hircus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSTSYG00000033949	MSI1	66	100.000	Carlito_syrichta
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSCAPG00000003919	MSI1	50	100.000	Cavia_aperea
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSCPOG00000012361	MSI1	71	100.000	Cavia_porcellus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSCCAG00000035567	MSI1	71	100.000	Cebus_capucinus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSCATG00000030019	MSI1	71	100.000	Cercocebus_atys
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSCLAG00000011329	MSI1	71	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSCSAG00000002265	MSI1	88	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	99.177	ENSCPBG00000011349	MSI1	73	99.177	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSCANG00000040651	MSI1	70	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSCGRG00001018883	Msi1	71	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSCGRG00000002191	Msi1	50	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	88.477	ENSCSEG00000008352	-	68	90.625	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAUG00000016820	Msi1	99	88.017	ENSCSEG00000005834	-	69	88.017	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAUG00000016820	Msi1	92	86.547	ENSCSEG00000011032	MSI1	72	86.547	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	89.712	ENSCVAG00000009100	MSI1	68	91.964	Cyprinodon_variegatus
ENSMAUG00000016820	Msi1	65	63.393	ENSCVAG00000017430	zgc:110796	78	63.393	Cyprinodon_variegatus
ENSMAUG00000016820	Msi1	58	85.714	ENSDARG00000041299	zgc:110796	74	85.714	Danio_rerio
ENSMAUG00000016820	Msi1	79	86.923	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	55	86.923	Danio_rerio
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	90.230	ENSDARG00000010710	msi1	81	90.230	Danio_rerio
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSDNOG00000005713	MSI1	66	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	98.723	ENSDORG00000005610	Msi1	66	98.723	Dipodomys_ordii
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	99.563	ENSETEG00000004756	MSI1	70	99.563	Echinops_telfairi
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSEASG00005004736	MSI1	71	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSECAG00000017526	MSI1	71	100.000	Equus_caballus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	86.364	ENSELUG00000023280	-	75	86.364	Esox_lucius
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	84.375	ENSELUG00000023219	MSI1	67	84.375	Esox_lucius
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSFCAG00000011007	MSI1	71	100.000	Felis_catus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	99.057	ENSFALG00000007574	MSI1	71	99.057	Ficedula_albicollis
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	99.563	ENSFDAG00000019586	MSI1	70	99.563	Fukomys_damarensis
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	89.712	ENSFHEG00000022446	MSI1	70	89.712	Fundulus_heteroclitus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	88.889	ENSFHEG00000003560	-	69	88.889	Fundulus_heteroclitus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	78.189	ENSGMOG00000017838	-	69	78.189	Gadus_morhua
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	88.889	ENSGMOG00000001006	MSI1	70	88.889	Gadus_morhua
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	98.851	ENSGALG00000007227	MSI1	64	98.765	Gallus_gallus
ENSMAUG00000016820	Msi1	88	69.767	ENSGAFG00000005860	-	64	69.767	Gambusia_affinis
ENSMAUG00000016820	Msi1	99	88.843	ENSGAFG00000021522	MSI1	70	91.518	Gambusia_affinis
ENSMAUG00000016820	Msi1	99	82.231	ENSGACG00000008674	-	67	82.231	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	89.300	ENSGACG00000012679	MSI1	69	91.518	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	99.177	ENSGAGG00000016037	MSI1	69	99.177	Gopherus_agassizii
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSGGOG00000010328	MSI1	68	100.000	Gorilla_gorilla
ENSMAUG00000016820	Msi1	99	88.017	ENSHBUG00000021921	MSI1	69	88.017	Haplochromis_burtoni
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	89.300	ENSHBUG00000011841	-	70	89.300	Haplochromis_burtoni
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	99.588	ENSHGLG00000012782	MSI1	71	99.588	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	99.563	ENSHGLG00100016848	MSI1	70	99.563	Heterocephalus_glaber_male
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	87.603	ENSHCOG00000012019	MSI1	73	90.135	Hippocampus_comes
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	88.261	ENSHCOG00000012067	-	77	90.678	Hippocampus_comes
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	87.243	ENSIPUG00000001976	msi1	71	87.850	Ictalurus_punctatus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSSTOG00000009799	MSI1	68	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMAUG00000016820	Msi1	97	96.610	ENSJJAG00000010643	-	76	96.610	Jaculus_jaculus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSJJAG00000010463	Msi1	71	100.000	Jaculus_jaculus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	88.889	ENSKMAG00000011251	MSI1	70	88.889	Kryptolebias_marmoratus
ENSMAUG00000016820	Msi1	92	92.377	ENSKMAG00000019877	-	73	92.377	Kryptolebias_marmoratus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	89.300	ENSLBEG00000008789	MSI1	68	91.518	Labrus_bergylta
ENSMAUG00000016820	Msi1	99	87.603	ENSLBEG00000001375	-	69	87.603	Labrus_bergylta
ENSMAUG00000016820	Msi1	96	91.026	ENSLACG00000018287	MSI1	69	91.026	Latimeria_chalumnae
ENSMAUG00000016820	Msi1	66	72.222	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	58	72.222	Lepisosteus_oculatus
ENSMAUG00000016820	Msi1	95	84.914	ENSLAFG00000009412	MSI1	71	85.253	Loxodonta_africana
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSMFAG00000001798	MSI1	71	100.000	Macaca_fascicularis
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSMMUG00000031527	MSI1	70	100.000	Macaca_mulatta
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSMNEG00000040034	MSI1	71	100.000	Macaca_nemestrina
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSMLEG00000003921	MSI1	70	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	89.300	ENSMAMG00000002279	MSI1	70	89.300	Mastacembelus_armatus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	88.889	ENSMAMG00000018426	-	69	91.518	Mastacembelus_armatus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	89.300	ENSMZEG00005000340	-	68	91.518	Maylandia_zebra
ENSMAUG00000016820	Msi1	99	88.017	ENSMZEG00005026892	MSI1	69	88.017	Maylandia_zebra
ENSMAUG00000016820	Msi1	91	98.817	ENSMGAG00000016518	-	100	98.817	Meleagris_gallopavo
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	ENSMICG00000033181	MSI1	74	100.000	Microcebus_murinus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	99.588	ENSMOCG00000002286	Msi1	71	99.588	Microtus_ochrogaster
ENSMAUG00000016820	Msi1	92	92.411	ENSMMOG00000010492	MSI1	72	92.411	Mola_mola
ENSMAUG00000016820	Msi1	92	87.215	ENSMMOG00000012265	-	71	87.215	Mola_mola
ENSMAUG00000016820	Msi1	92	64.159	ENSMODG00000003189	-	68	64.159	Monodelphis_domestica
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	88.430	ENSMALG00000001426	-	78	86.192	Monopterus_albus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	89.300	ENSMALG00000017889	MSI1	70	89.300	Monopterus_albus
ENSMAUG00000016820	Msi1	100	99.177	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	79	99.526	Mus_caroli
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ENSMAUG00000016820	Msi1	100	99.177	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	79	99.526	Mus_pahari
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