EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMAUG00000017980 (Gene tree)
Gene ID: 101841935
Gene Symbol: Urb2
Alias: -
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Mesocricetus_auratus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 25407 bases
Position: chrKB708128.1:449880-475286
Accession: 101841935
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMAUP00000019786	Urb2	PF10441.9	1.9e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMAUT00000023767	-	4678	XM_005064495	ENSMAUP00000019786	1440 (aa)	XP_005064552	A0A1U7QC51

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	83.688	ENSG00000135763	URB2	100	80.952	Homo_sapiens
ENSMAUG00000017980	Urb2	89	59.574	ENSAPOG00000000608	urb2	90	59.574	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	69.538	ENSAMEG00000009206	URB2	95	80.714	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	59.574	ENSAOCG00000019961	urb2	95	59.574	Amphiprion_ocellaris
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	59.574	ENSAPEG00000005263	urb2	95	59.574	Amphiprion_percula
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	60.284	ENSATEG00000020930	urb2	95	60.284	Anabas_testudineus
ENSMAUG00000017980	Urb2	97	66.901	ENSAPLG00000002998	URB2	95	66.901	Anas_platyrhynchos
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	51.977	ENSACAG00000001285	URB2	95	61.972	Anolis_carolinensis
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	82.979	ENSANAG00000033963	URB2	95	82.979	Aotus_nancymaae
ENSMAUG00000017980	Urb2	89	58.865	ENSACLG00000009254	urb2	90	58.865	Astatotilapia_calliptera
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	53.846	ENSAMXG00000003474	urb2	96	53.846	Astyanax_mexicanus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	79.286	ENSBTAG00000010180	URB2	95	79.286	Bos_taurus
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	82.979	ENSCJAG00000010968	URB2	95	82.979	Callithrix_jacchus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	82.270	ENSCAFG00000012118	URB2	95	82.270	Canis_familiaris
ENSMAUG00000017980	Urb2	93	82.270	ENSCAFG00020027217	URB2	93	82.270	Canis_lupus_dingo
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	77.143	ENSCHIG00000014513	URB2	95	77.143	Capra_hircus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	72.316	ENSTSYG00000006924	URB2	96	76.543	Carlito_syrichta
ENSMAUG00000017980	Urb2	62	83.688	ENSCPOG00000020777	-	92	83.688	Cavia_porcellus
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	83.688	ENSCCAG00000023932	URB2	95	83.688	Cebus_capucinus
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	84.397	ENSCATG00000043366	URB2	95	84.397	Cercocebus_atys
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	68.131	ENSCLAG00000006268	URB2	100	68.131	Chinchilla_lanigera
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	83.688	ENSCSAG00000010599	URB2	95	83.688	Chlorocebus_sabaeus
ENSMAUG00000017980	Urb2	66	72.653	ENSCHOG00000010163	URB2	65	73.529	Choloepus_hoffmanni
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	69.014	ENSCPBG00000006191	URB2	95	69.014	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	84.397	ENSCANG00000023711	URB2	95	84.397	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	94.326	ENSCGRG00001009591	Urb2	95	94.326	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	94.326	ENSCGRG00000011259	Urb2	95	94.326	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	57.343	ENSCSEG00000000299	urb2	96	57.343	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	56.579	ENSCVAG00000011011	urb2	96	56.579	Cyprinodon_variegatus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	56.643	ENSDARG00000003217	urb2	96	56.643	Danio_rerio
ENSMAUG00000017980	Urb2	97	66.667	ENSDNOG00000043064	URB2	94	77.857	Dasypus_novemcinctus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	82.270	ENSDORG00000014975	Urb2	95	82.270	Dipodomys_ordii
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	66.334	ENSETEG00000002869	URB2	95	66.334	Echinops_telfairi
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	82.143	ENSEASG00005012060	URB2	95	82.143	Equus_asinus_asinus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	69.095	ENSECAG00000012338	URB2	95	82.143	Equus_caballus
ENSMAUG00000017980	Urb2	97	77.305	ENSEEUG00000002669	URB2	92	77.305	Erinaceus_europaeus
ENSMAUG00000017980	Urb2	98	62.185	ENSELUG00000014647	urb2	95	60.140	Esox_lucius
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	68.539	ENSFCAG00000007662	URB2	96	72.393	Felis_catus
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	65.493	ENSFALG00000003385	URB2	95	65.493	Ficedula_albicollis
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	67.626	ENSFDAG00000021079	URB2	100	67.626	Fukomys_damarensis
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	60.284	ENSFHEG00000010357	urb2	95	60.284	Fundulus_heteroclitus
ENSMAUG00000017980	Urb2	90	57.143	ENSGMOG00000012459	urb2	95	57.143	Gadus_morhua
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	64.789	ENSGALG00000011101	URB2	95	66.667	Gallus_gallus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	61.702	ENSGACG00000016179	urb2	95	61.702	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	69.014	ENSGAGG00000021879	URB2	95	69.014	Gopherus_agassizii
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	83.688	ENSGGOG00000025643	URB2	95	83.688	Gorilla_gorilla
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	58.865	ENSHBUG00000018469	urb2	92	58.865	Haplochromis_burtoni
ENSMAUG00000017980	Urb2	97	85.816	ENSHGLG00000016561	URB2	93	85.816	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	85.816	ENSHGLG00100001838	URB2	94	85.816	Heterocephalus_glaber_male
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	55.944	ENSIPUG00000020315	urb2	95	55.944	Ictalurus_punctatus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	86.525	ENSSTOG00000025323	URB2	95	86.525	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	83.688	ENSJJAG00000011998	Urb2	95	83.688	Jaculus_jaculus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	55.944	ENSKMAG00000020129	urb2	95	55.944	Kryptolebias_marmoratus
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	53.933	ENSLACG00000002038	URB2	96	61.111	Latimeria_chalumnae
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	39.015	ENSLOCG00000015462	urb2	95	54.861	Lepisosteus_oculatus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	71.751	ENSLAFG00000012484	URB2	95	85.000	Loxodonta_africana
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	84.397	ENSMFAG00000039905	URB2	95	84.397	Macaca_fascicularis
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	84.397	ENSMMUG00000009509	URB2	95	84.397	Macaca_mulatta
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	85.106	ENSMNEG00000038762	URB2	95	85.106	Macaca_nemestrina
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	83.688	ENSMLEG00000043252	URB2	95	83.688	Mandrillus_leucophaeus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	61.702	ENSMAMG00000020365	urb2	95	61.702	Mastacembelus_armatus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	58.156	ENSMZEG00005011027	urb2	92	58.156	Maylandia_zebra
ENSMAUG00000017980	Urb2	94	64.789	ENSMGAG00000012073	URB2	95	64.789	Meleagris_gallopavo
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	70.430	ENSMICG00000033302	URB2	95	83.571	Microcebus_murinus
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	88.556	ENSMOCG00000020369	Urb2	95	92.908	Microtus_ochrogaster
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	58.741	ENSMALG00000006529	urb2	95	58.741	Monopterus_albus
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	89.362	ENSMUSG00000031976	Urb2	95	89.362	Mus_musculus
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	70.225	ENSMPUG00000012438	URB2	95	82.979	Mustela_putorius_furo
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	84.397	ENSNGAG00000016524	Urb2	95	84.397	Nannospalax_galili
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	84.397	ENSNLEG00000014450	URB2	95	84.397	Nomascus_leucogenys
ENSMAUG00000017980	Urb2	91	57.472	ENSMEUG00000016434	URB2	88	57.558	Notamacropus_eugenii
ENSMAUG00000017980	Urb2	91	81.429	ENSOPRG00000009906	URB2	87	81.429	Ochotona_princeps
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	86.525	ENSODEG00000005593	URB2	95	86.525	Octodon_degus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	58.865	ENSONIG00000017078	urb2	95	58.865	Oreochromis_niloticus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	71.127	ENSOANG00000013732	URB2	94	71.127	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	82.857	ENSOCUG00000010700	URB2	95	82.857	Oryctolagus_cuniculus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	57.343	ENSORLG00000010915	urb2	95	57.343	Oryzias_latipes
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	57.343	ENSORLG00020003361	urb2	95	57.343	Oryzias_latipes_hni
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	57.343	ENSORLG00015001534	urb2	95	57.343	Oryzias_latipes_hsok
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	58.865	ENSOMEG00000010076	urb2	95	58.865	Oryzias_melastigma
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	73.446	ENSOGAG00000003021	URB2	95	87.143	Otolemur_garnettii
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	78.571	ENSOARG00000003102	URB2	95	78.571	Ovis_aries
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	83.688	ENSPPAG00000040629	URB2	95	83.688	Pan_paniscus
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	67.978	ENSPPRG00000012767	URB2	95	79.433	Panthera_pardus
ENSMAUG00000017980	Urb2	96	90.909	ENSPTIG00000012577	URB2	94	90.909	Panthera_tigris_altaica
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	83.688	ENSPTRG00000002092	URB2	95	83.688	Pan_troglodytes
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	84.397	ENSPANG00000002245	URB2	95	84.397	Papio_anubis
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	59.441	ENSPKIG00000005787	urb2	95	60.839	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	68.310	ENSPSIG00000002690	URB2	95	68.310	Pelodiscus_sinensis
ENSMAUG00000017980	Urb2	95	92.105	ENSPEMG00000019551	Urb2	95	92.105	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	76.596	ENSPCIG00000030071	URB2	95	76.596	Phascolarctos_cinereus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	53.691	ENSPFOG00000014330	urb2	95	53.691	Poecilia_formosa
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	53.691	ENSPLAG00000014654	urb2	95	53.691	Poecilia_latipinna
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	52.349	ENSPMEG00000012356	urb2	95	53.691	Poecilia_mexicana
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	53.691	ENSPREG00000010268	urb2	95	53.691	Poecilia_reticulata
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	82.857	ENSPPYG00000000123	URB2	95	82.857	Pongo_abelii
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	82.857	ENSPCOG00000023537	URB2	95	82.857	Propithecus_coquereli
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	59.509	ENSPVAG00000002108	URB2	95	62.411	Pteropus_vampyrus
ENSMAUG00000017980	Urb2	89	58.865	ENSPNYG00000016840	urb2	90	58.865	Pundamilia_nyererei
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	54.225	ENSPNAG00000013684	urb2	95	54.225	Pygocentrus_nattereri
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	88.650	ENSRNOG00000026853	Urb2	92	92.199	Rattus_norvegicus
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	84.397	ENSRBIG00000037937	URB2	95	84.397	Rhinopithecus_bieti
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	84.397	ENSRROG00000039854	URB2	95	84.397	Rhinopithecus_roxellana
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	84.397	ENSSBOG00000023055	URB2	95	84.397	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	76.596	ENSSHAG00000014735	URB2	95	76.596	Sarcophilus_harrisii
ENSMAUG00000017980	Urb2	98	58.042	ENSSFOG00015015432	urb2	93	58.042	Scleropages_formosus
ENSMAUG00000017980	Urb2	89	58.451	ENSSMAG00000004984	urb2	90	58.451	Scophthalmus_maximus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	60.839	ENSSDUG00000000902	urb2	95	60.839	Seriola_dumerili
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	69.014	ENSSPUG00000018549	URB2	95	69.014	Sphenodon_punctatus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	60.284	ENSSPAG00000013632	urb2	95	60.284	Stegastes_partitus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	70.056	ENSSSCG00000010186	URB2	94	82.857	Sus_scrofa
ENSMAUG00000017980	Urb2	100	64.085	ENSTGUG00000009990	URB2	95	64.085	Taeniopygia_guttata
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	61.702	ENSTRUG00000008173	urb2	95	61.702	Takifugu_rubripes
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	60.993	ENSTNIG00000017689	urb2	95	60.993	Tetraodon_nigroviridis
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	69.492	ENSTTRG00000014864	URB2	95	83.571	Tursiops_truncatus
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	80.714	ENSUAMG00000015022	URB2	95	80.714	Ursus_americanus
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ENSMAUG00000017980	Urb2	67	82.143	ENSVPAG00000001750	-	63	82.143	Vicugna_pacos
ENSMAUG00000017980	Urb2	99	82.979	ENSVVUG00000006747	URB2	95	82.979	Vulpes_vulpes
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ENSMAUG00000017980	Urb2	99	53.691	ENSXMAG00000015059	urb2	95	53.691	Xiphophorus_maculatus