EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMAUG00000018613 (Gene tree)
Gene ID: 101830400
Gene Symbol: Skiv2l
Alias: -
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Mesocricetus_auratus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10434 bases
Position: chrKB708367.1:424673-435106
Accession: 101830400
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMAUP00000020648	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.4e-41	1	1
ENSMAUP00000020648	DEAD	PF00270.29	1.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMAUT00000024645	-	870	-	ENSMAUP00000020652	289 (aa)	-	-
ENSMAUT00000024641	-	3847	XM_005086839	ENSMAUP00000020648	1245 (aa)	XP_005086896	A0A1U7R3Q6

Gene Model

Click here to download ENSMAUG00000018613's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMAUG00000018613's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	76	37.422	ENSMAUG00000010727	Mtrex	88	37.422

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.184	ENSG00000204351	SKIV2L	98	97.191	Homo_sapiens
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.080	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	61.433	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.189	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	92.943	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	59.522	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.855	Amphilophus_citrinellus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.683	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	61.031	Amphiprion_ocellaris
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.524	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	60.870	Amphiprion_percula
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.575	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	60.709	Anabas_testudineus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	65.364	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	65.317	Anolis_carolinensis
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.504	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	93.424	Aotus_nancymaae
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.094	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.298	Astatotilapia_calliptera
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	98	59.380	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.395	Astyanax_mexicanus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.670	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	93.424	Bos_taurus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	96	39.453	WBGene00008502	skih-2	99	39.593	Caenorhabditis_elegans
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.349	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	93.023	Callithrix_jacchus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.628	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	92.462	Canis_familiaris
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.548	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	92.382	Canis_lupus_dingo
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.590	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	93.344	Capra_hircus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.468	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	92.141	Carlito_syrichta
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	91.968	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	91.968	Cavia_porcellus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.424	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	93.344	Cebus_capucinus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.943	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	92.863	Cercocebus_atys
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.548	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.221	Chinchilla_lanigera
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.189	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	92.943	Chlorocebus_sabaeus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	87	64.912	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	96	65.088	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	94	51.273	ENSCING00000005576	-	99	51.358	Ciona_intestinalis
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	93.098	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	93.018	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	97.189	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	97.189	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.311	ENSCSEG00000011326	skiv2l	98	61.389	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.342	ENSCVAG00000003072	skiv2l	99	61.285	Cyprinodon_variegatus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.379	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	60.543	Danio_rerio
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	94	93.077	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	100	86.950	Dasypus_novemcinctus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	93	43.939	FBgn0039117	tst	97	44.013	Drosophila_melanogaster
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	69	93.068	ENSETEG00000009522	SKIV2L	69	93.068	Echinops_telfairi
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	89	56.190	ENSEBUG00000013680	-	97	55.896	Eptatretus_burgeri
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	93	93.890	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	93.804	Equus_asinus_asinus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	96	92.695	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	92.611	Equus_caballus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	55	98.024	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	98.024	Erinaceus_europaeus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.316	ENSELUG00000000181	skiv2l	94	66.426	Esox_lucius
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.184	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	93.103	Felis_catus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	90.144	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.056	Fukomys_damarensis
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.014	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.044	Fundulus_heteroclitus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	59.392	ENSGMOG00000005926	skiv2l	98	59.593	Gadus_morhua
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	77	61.267	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.066	Gallus_gallus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.173	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.285	Gambusia_affinis
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.301	ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.631	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.943	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	92.863	Gorilla_gorilla
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.014	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	61.218	Haplochromis_burtoni
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	90.720	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	90.552	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	88.080	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	87.910	Heterocephalus_glaber_male
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	98	59.691	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	59.528	Hippocampus_comes
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	59.464	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	59.888	Ictalurus_punctatus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.910	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	93.745	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	71	58.993	ENSLACG00000002986	-	73	59.698	Latimeria_chalumnae
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.468	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	92.221	Loxodonta_africana
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.264	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	93.184	Macaca_fascicularis
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.264	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	93.184	Macaca_mulatta
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.184	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	93.103	Macaca_nemestrina
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.943	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	92.863	Mandrillus_leucophaeus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.921	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.192	Mastacembelus_armatus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.935	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	61.138	Maylandia_zebra
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	70	50.314	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	97	50.123	Meleagris_gallopavo
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.109	ENSMICG00000046331	SKIV2L	100	92.702	Microcebus_murinus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.976	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	94.137	Microtus_ochrogaster
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.821	ENSMMOG00000014547	skiv2l	98	60.650	Mola_mola
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	86.880	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	86.720	Monodelphis_domestica
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	59.839	ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.902	Monopterus_albus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	94.699	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	94.458	Mus_caroli
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	94.699	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	94.458	Mus_musculus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	94.217	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	93.976	Mus_pahari
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	94.378	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	94.137	Mus_spretus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.869	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	92.702	Mustela_putorius_furo
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	91.500	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	91.419	Myotis_lucifugus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.558	ENSNBRG00000018650	skiv2l	98	60.467	Neolamprologus_brichardi
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	98	89.538	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	89.457	Nomascus_leucogenys
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	78	92.035	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	92.035	Notamacropus_eugenii
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.702	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	92.622	Ochotona_princeps
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	91.426	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	91.179	Octodon_degus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.791	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.994	Oreochromis_niloticus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	94.071	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	93.825	Oryctolagus_cuniculus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.821	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	60.849	Oryzias_latipes
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.742	ENSORLG00020009462	skiv2l	97	64.213	Oryzias_latipes_hni
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.745	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	60.772	Oryzias_latipes_hsok
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.935	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	62.138	Oryzias_melastigma
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.109	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	92.783	Otolemur_garnettii
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	88.272	ENSOARG00000002411	-	100	88.028	Ovis_aries
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	98	92.146	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	99	92.065	Pan_paniscus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.269	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	93.023	Panthera_pardus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.949	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	92.702	Panthera_tigris_altaica
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.103	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	93.023	Pan_troglodytes
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	98	91.815	ENSPANG00000011501	SKIV2L	99	91.734	Papio_anubis
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.016	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.286	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	59.823	ENSPMGG00000019707	skiv2l	98	60.212	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	95.904	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	95.582	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	86.731	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	86.491	Phascolarctos_cinereus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.094	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	61.353	Poecilia_formosa
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.301	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.483	Poecilia_latipinna
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.094	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	61.205	Poecilia_mexicana
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	59.342	ENSPREG00000002277	skiv2l	98	59.431	Poecilia_reticulata
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.382	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	92.302	Pongo_abelii
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	77	93.325	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	93.325	Procavia_capensis
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	94.231	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	93.825	Propithecus_coquereli
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	91.339	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	91.259	Pteropus_vampyrus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.129	ENSPNYG00000017853	skiv2l	98	59.058	Pundamilia_nyererei
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	98	60.995	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	61.334	Pygocentrus_nattereri
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	95.502	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	95.261	Rattus_norvegicus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	98	90.372	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	90.291	Rhinopithecus_bieti
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.863	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	92.783	Rhinopithecus_roxellana
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	92	38.018	YLR398C	-	93	37.672	Saccharomyces_cerevisiae
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.504	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	93.424	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	86.480	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	85.280	Sarcophilus_harrisii
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.849	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.280	Scleropages_formosus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.929	ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.111	Scophthalmus_maximus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.459	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	61.736	Seriola_dumerili
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	59.581	ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.611	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	62.219	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	98	62.205	Sphenodon_punctatus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	94	60.837	ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.054	Stegastes_partitus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	94.071	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	93.750	Sus_scrofa
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	85	55.217	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.825	Takifugu_rubripes
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	59.522	ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.774	Tetraodon_nigroviridis
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	94	93.015	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.015	Tupaia_belangeri
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	87.901	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	87.650	Tursiops_truncatus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.670	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	93.424	Ursus_americanus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	93	93.895	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	93.632	Ursus_maritimus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	98	92.840	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	91.694	Vulpes_vulpes
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	58.366	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.446	Xenopus_tropicalis
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.058	ENSXCOG00000019517	skiv2l	96	61.021	Xiphophorus_couchianus
ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.506	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	60.800	Xiphophorus_maculatus