EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMAUG00000018974 (Gene tree)
Gene ID: 101836128
Gene Symbol: Syf2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Mesocricetus_auratus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9046 bases
Position: chrKB708219.1:8129447-8138492
Accession: 101836128
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMAUP00000021156	SYF2	PF08231.12	2.1e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMAUT00000025151	-	1336	XM_005079594	ENSMAUP00000021156	242 (aa)	XP_005079651	A0A1U7QUW3

Gene Model

Click here to download ENSMAUG00000018974's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMAUG00000018974's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.123	ENSG00000117614	SYF2	100	90.123	Homo_sapiens
ENSMAUG00000018974	Syf2	92	84.685	ENSAPOG00000001174	syf2	100	80.165	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAUG00000018974	Syf2	97	91.139	ENSAMEG00000010115	-	98	91.139	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMAUG00000018974	Syf2	81	94.359	ENSAMEG00000010134	-	100	94.359	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMAUG00000018974	Syf2	96	80.258	ENSACIG00000023688	syf2	92	80.258	Amphilophus_citrinellus
ENSMAUG00000018974	Syf2	93	79.556	ENSAOCG00000010912	syf2	69	79.556	Amphiprion_ocellaris
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	80.992	ENSAOCG00000022046	syf2	97	83.043	Amphiprion_ocellaris
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	80.992	ENSAPEG00000018858	syf2	92	80.992	Amphiprion_percula
ENSMAUG00000018974	Syf2	90	84.793	ENSATEG00000007745	syf2	100	79.339	Anabas_testudineus
ENSMAUG00000018974	Syf2	83	88.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	Anas_platyrhynchos
ENSMAUG00000018974	Syf2	84	84.804	ENSACAG00000013653	-	100	84.804	Anolis_carolinensis
ENSMAUG00000018974	Syf2	69	75.449	ENSACAG00000026777	-	94	75.796	Anolis_carolinensis
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.947	ENSANAG00000032473	SYF2	100	90.947	Aotus_nancymaae
ENSMAUG00000018974	Syf2	92	81.982	ENSACLG00000019916	syf2	100	78.099	Astatotilapia_calliptera
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	79.339	ENSAMXG00000004051	syf2	100	79.339	Astyanax_mexicanus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	91.020	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	92.797	Bos_taurus
ENSMAUG00000018974	Syf2	86	50.476	WBGene00019402	syf-2	90	50.237	Caenorhabditis_elegans
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.947	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	90.947	Callithrix_jacchus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	80.579	ENSCAFG00000030331	-	100	80.579	Canis_familiaris
ENSMAUG00000018974	Syf2	99	88.934	ENSCAFG00000012895	-	99	88.934	Canis_familiaris
ENSMAUG00000018974	Syf2	99	88.934	ENSCAFG00020021091	-	99	88.934	Canis_lupus_dingo
ENSMAUG00000018974	Syf2	75	84.615	ENSCAFG00020021094	-	83	92.308	Canis_lupus_dingo
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.947	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	90.947	Capra_hircus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.947	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	90.947	Carlito_syrichta
ENSMAUG00000018974	Syf2	82	94.949	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	94.949	Cavia_aperea
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	89.754	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	89.754	Cavia_porcellus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	91.358	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	91.358	Cebus_capucinus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	89.712	ENSCATG00000026917	SYF2	100	89.712	Cercocebus_atys
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	92.623	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	92.623	Chinchilla_lanigera
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.123	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	90.123	Chlorocebus_sabaeus
ENSMAUG00000018974	Syf2	74	72.928	ENSCHOG00000005273	-	100	72.928	Choloepus_hoffmanni
ENSMAUG00000018974	Syf2	93	88.000	ENSCPBG00000025073	SYF2	100	82.731	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAUG00000018974	Syf2	87	53.991	ENSCING00000003017	-	89	53.991	Ciona_intestinalis
ENSMAUG00000018974	Syf2	87	50.235	ENSCSAVG00000006627	-	97	50.235	Ciona_savignyi
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	78.189	ENSCANG00000037322	SYF2	100	78.189	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	96.281	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	96.281	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMAUG00000018974	Syf2	82	97.990	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	97.990	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMAUG00000018974	Syf2	90	79.817	ENSCSEG00000000117	syf2	93	78.829	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAUG00000018974	Syf2	91	83.258	ENSCVAG00000019543	syf2	100	78.926	Cyprinodon_variegatus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	78.512	ENSDARG00000004706	syf2	100	78.512	Danio_rerio
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	89.796	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	89.796	Dasypus_novemcinctus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	91.393	ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.393	Dipodomys_ordii
ENSMAUG00000018974	Syf2	90	57.273	FBgn0033556	CG12343	97	57.273	Drosophila_melanogaster
ENSMAUG00000018974	Syf2	94	76.419	ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.419	Echinops_telfairi
ENSMAUG00000018974	Syf2	81	59.898	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	Eptatretus_burgeri
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.612	ENSEASG00005004224	-	100	90.612	Equus_asinus_asinus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	81.070	ENSEASG00005004232	-	100	81.070	Equus_asinus_asinus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	91.429	ENSECAG00000012023	-	100	91.429	Equus_caballus
ENSMAUG00000018974	Syf2	98	92.017	ENSECAG00000010440	-	99	92.017	Equus_caballus
ENSMAUG00000018974	Syf2	75	78.689	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	78.689	Erinaceus_europaeus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	80.247	ENSELUG00000003465	syf2	99	80.247	Esox_lucius
ENSMAUG00000018974	Syf2	99	90.574	ENSFCAG00000043095	-	99	90.574	Felis_catus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	91.429	ENSFCAG00000010324	-	85	91.429	Felis_catus
ENSMAUG00000018974	Syf2	84	84.804	ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.116	Ficedula_albicollis
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	92.181	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.181	Fukomys_damarensis
ENSMAUG00000018974	Syf2	92	68.304	ENSFHEG00000007238	syf2	99	68.304	Fundulus_heteroclitus
ENSMAUG00000018974	Syf2	90	84.404	ENSGMOG00000019138	syf2	97	84.404	Gadus_morhua
ENSMAUG00000018974	Syf2	93	88.444	ENSGALG00000013639	SYF2	99	82.400	Gallus_gallus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	76.446	ENSGAFG00000019435	syf2	100	76.446	Gambusia_affinis
ENSMAUG00000018974	Syf2	89	85.116	ENSGACG00000007305	syf2	100	78.512	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAUG00000018974	Syf2	93	88.444	ENSGAGG00000010670	SYF2	92	87.719	Gopherus_agassizii
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.535	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	90.535	Gorilla_gorilla
ENSMAUG00000018974	Syf2	96	80.258	ENSHBUG00000020477	syf2	99	80.258	Haplochromis_burtoni
ENSMAUG00000018974	Syf2	93	83.036	ENSHGLG00000004304	-	100	76.860	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.984	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	90.984	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.984	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	90.984	Heterocephalus_glaber_male
ENSMAUG00000018974	Syf2	99	78.423	ENSHCOG00000012904	syf2	77	78.423	Hippocampus_comes
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	80.247	ENSIPUG00000019859	syf2	100	80.247	Ictalurus_punctatus
ENSMAUG00000018974	Syf2	60	93.151	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	93.151	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMAUG00000018974	Syf2	82	96.482	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.482	Jaculus_jaculus
ENSMAUG00000018974	Syf2	96	79.237	ENSKMAG00000013856	syf2	99	79.237	Kryptolebias_marmoratus
ENSMAUG00000018974	Syf2	90	84.932	ENSLBEG00000014425	syf2	100	79.339	Labrus_bergylta
ENSMAUG00000018974	Syf2	94	82.379	ENSLACG00000012064	SYF2	95	82.379	Latimeria_chalumnae
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	81.818	ENSLOCG00000002728	syf2	95	81.818	Lepisosteus_oculatus
ENSMAUG00000018974	Syf2	76	63.043	ENSLAFG00000030814	-	100	63.043	Loxodonta_africana
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.612	ENSLAFG00000023150	-	100	90.612	Loxodonta_africana
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.123	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	90.123	Macaca_fascicularis
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.535	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	90.535	Macaca_mulatta
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.123	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	90.123	Macaca_nemestrina
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	89.712	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	89.712	Mandrillus_leucophaeus
ENSMAUG00000018974	Syf2	90	83.410	ENSMAMG00000010403	syf2	98	78.512	Mastacembelus_armatus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	78.099	ENSMZEG00005006429	syf2	100	78.099	Maylandia_zebra
ENSMAUG00000018974	Syf2	82	88.442	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	Meleagris_gallopavo
ENSMAUG00000018974	Syf2	82	95.980	ENSMICG00000016191	SYF2	100	95.980	Microcebus_murinus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	97.934	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	97.934	Microtus_ochrogaster
ENSMAUG00000018974	Syf2	96	78.541	ENSMMOG00000002396	syf2	97	78.541	Mola_mola
ENSMAUG00000018974	Syf2	93	87.336	ENSMODG00000013951	-	100	87.336	Monodelphis_domestica
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	78.189	ENSMALG00000010706	syf2	100	78.189	Monopterus_albus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	97.521	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	97.521	Mus_caroli
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	97.521	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	97.521	Mus_musculus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	97.521	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	97.521	Mus_pahari
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	97.521	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	97.521	Mus_spretus
ENSMAUG00000018974	Syf2	99	89.754	ENSMPUG00000015802	-	99	89.754	Mustela_putorius_furo
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	89.024	ENSMPUG00000015801	-	100	89.024	Mustela_putorius_furo
ENSMAUG00000018974	Syf2	99	89.167	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	89.167	Myotis_lucifugus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	92.683	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.683	Nannospalax_galili
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	70.661	ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.661	Neolamprologus_brichardi
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.947	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	90.947	Nomascus_leucogenys
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	91.770	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.770	Ochotona_princeps
ENSMAUG00000018974	Syf2	98	90.678	ENSODEG00000017664	-	98	90.678	Octodon_degus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	79.508	ENSODEG00000014338	-	99	80.591	Octodon_degus
ENSMAUG00000018974	Syf2	92	81.982	ENSONIG00000008213	syf2	100	78.099	Oreochromis_niloticus
ENSMAUG00000018974	Syf2	83	89.604	ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	92.213	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	92.213	Oryctolagus_cuniculus
ENSMAUG00000018974	Syf2	92	82.432	ENSORLG00000028820	syf2	95	82.432	Oryzias_latipes
ENSMAUG00000018974	Syf2	92	82.432	ENSORLG00020018333	syf2	99	77.824	Oryzias_latipes_hni
ENSMAUG00000018974	Syf2	99	78.750	ENSORLG00015014665	syf2	99	78.750	Oryzias_latipes_hsok
ENSMAUG00000018974	Syf2	92	83.333	ENSOMEG00000013911	syf2	93	83.333	Oryzias_melastigma
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	92.213	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.213	Otolemur_garnettii
ENSMAUG00000018974	Syf2	99	91.429	ENSOARG00000006348	-	99	91.429	Ovis_aries
ENSMAUG00000018974	Syf2	81	66.154	ENSOARG00000006269	-	100	66.154	Ovis_aries
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.535	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	90.535	Pan_paniscus
ENSMAUG00000018974	Syf2	99	90.574	ENSPPRG00000001651	-	99	90.574	Panthera_pardus
ENSMAUG00000018974	Syf2	99	90.164	ENSPPRG00000001638	-	99	90.164	Panthera_pardus
ENSMAUG00000018974	Syf2	99	90.574	ENSPTIG00000007036	-	99	90.574	Panthera_tigris_altaica
ENSMAUG00000018974	Syf2	89	95.833	ENSPTIG00000005711	-	81	94.619	Panthera_tigris_altaica
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.535	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	90.535	Pan_troglodytes
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.123	ENSPANG00000008139	SYF2	100	90.123	Papio_anubis
ENSMAUG00000018974	Syf2	91	84.163	ENSPKIG00000008130	syf2	94	84.163	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMAUG00000018974	Syf2	99	82.988	ENSPSIG00000011816	SYF2	94	82.988	Pelodiscus_sinensis
ENSMAUG00000018974	Syf2	99	77.500	ENSPMGG00000008755	syf2	93	77.500	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	97.934	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	97.934	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMAUG00000018974	Syf2	93	91.071	ENSPCIG00000014235	SYF2	92	90.393	Phascolarctos_cinereus
ENSMAUG00000018974	Syf2	96	78.541	ENSPFOG00000004116	syf2	95	78.541	Poecilia_formosa
ENSMAUG00000018974	Syf2	96	78.541	ENSPLAG00000006691	syf2	99	78.541	Poecilia_latipinna
ENSMAUG00000018974	Syf2	99	74.689	ENSPMEG00000011684	syf2	98	76.522	Poecilia_mexicana
ENSMAUG00000018974	Syf2	89	82.870	ENSPREG00000003009	syf2	100	76.446	Poecilia_reticulata
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.947	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	90.947	Pongo_abelii
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	62.963	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.551	Propithecus_coquereli
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	77.778	ENSPVAG00000005841	SYF2	99	77.778	Pteropus_vampyrus
ENSMAUG00000018974	Syf2	92	81.982	ENSPNYG00000004979	syf2	100	78.099	Pundamilia_nyererei
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	81.818	ENSPNAG00000015570	syf2	100	81.818	Pygocentrus_nattereri
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	97.521	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	97.521	Rattus_norvegicus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	88.066	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	88.066	Rhinopithecus_bieti
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.123	ENSRROG00000001347	SYF2	100	90.123	Rhinopithecus_roxellana
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.947	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	90.947	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMAUG00000018974	Syf2	85	91.748	ENSSHAG00000007152	-	100	91.748	Sarcophilus_harrisii
ENSMAUG00000018974	Syf2	93	90.749	ENSSHAG00000015630	-	92	90.351	Sarcophilus_harrisii
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	80.165	ENSSFOG00015023647	syf2	100	80.165	Scleropages_formosus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	76.860	ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.860	Scophthalmus_maximus
ENSMAUG00000018974	Syf2	90	84.404	ENSSDUG00000013072	syf2	100	78.279	Seriola_dumerili
ENSMAUG00000018974	Syf2	90	84.404	ENSSLDG00000012677	syf2	100	78.279	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	72.541	ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.541	Sorex_araneus
ENSMAUG00000018974	Syf2	93	88.393	ENSSPUG00000005251	SYF2	95	82.573	Sphenodon_punctatus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	78.926	ENSSPAG00000009626	syf2	100	78.926	Stegastes_partitus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	91.020	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	91.020	Sus_scrofa
ENSMAUG00000018974	Syf2	62	57.616	ENSTGUG00000001126	SYF2	98	52.041	Taeniopygia_guttata
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	76.033	ENSTRUG00000001499	syf2	95	76.569	Takifugu_rubripes
ENSMAUG00000018974	Syf2	92	79.372	ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.372	Tetraodon_nigroviridis
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	69.547	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.136	Tupaia_belangeri
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	91.393	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	91.393	Tursiops_truncatus
ENSMAUG00000018974	Syf2	99	88.934	ENSUAMG00000002897	SYF2	99	88.934	Ursus_americanus
ENSMAUG00000018974	Syf2	99	88.525	ENSUMAG00000013108	SYF2	99	89.344	Ursus_maritimus
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.164	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	90.164	Vicugna_pacos
ENSMAUG00000018974	Syf2	99	88.934	ENSVVUG00000027175	-	99	88.934	Vulpes_vulpes
ENSMAUG00000018974	Syf2	100	87.097	ENSVVUG00000027181	-	100	87.097	Vulpes_vulpes
ENSMAUG00000018974	Syf2	98	81.513	ENSXETG00000022797	syf2	96	81.513	Xenopus_tropicalis
ENSMAUG00000018974	Syf2	89	82.791	ENSXMAG00000022698	syf2	100	76.033	Xiphophorus_maculatus