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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMAUG00000020550 (Gene tree)
Gene ID: 101839788
Gene Symbol: Tnpo1
Alias: D13Ertd688e|Kpnb2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mesocricetus_auratus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 52442 bases
Position: chrKB708130.1:14527337-14579778
Accession: 101839788
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMAUP00000023408	IBN_N	PF03810.19	4.1e-17	1	1
ENSMAUP00000023430	IBN_N	PF03810.19	5.2e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMAUT00000027439	-	2697	XM_005065616	ENSMAUP00000023430	898 (aa)	XP_005065673	-
ENSMAUT00000027417	-	8386	-	ENSMAUP00000023408	178 (aa)	-	UPI000268B4EB

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	76	80.882	ENSMAUG00000007313	-	99	80.882

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.708	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSAMEG00000007147	TNPO1	100	98.344	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.023	Amphilophus_citrinellus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.820	Amphiprion_ocellaris
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.820	Amphiprion_percula
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	92.697	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.371	Anabas_testudineus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	98	92.446	ENSAPLG00000009619	-	97	93.448	Anas_platyrhynchos
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	96.629	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.629	Anolis_carolinensis
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSANAG00000022453	-	99	99.107	Aotus_nancymaae
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	88.479	ENSANAG00000025351	-	99	88.479	Aotus_nancymaae
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	67.978	ENSANAG00000027118	-	99	63.978	Aotus_nancymaae
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	Astatotilapia_calliptera
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.258	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.265	Astyanax_mexicanus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	99.330	Bos_taurus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	99.219	Callithrix_jacchus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	95	99.417	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.417	Canis_familiaris
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.517	Canis_lupus_dingo
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	99.219	Capra_hircus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	95.367	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	97.895	Carlito_syrichta
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	63	93.750	ENSCCAG00000020805	-	75	92.373	Cebus_capucinus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.213	Cebus_capucinus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.663	Cercocebus_atys
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.213	Chinchilla_lanigera
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	99.442	Chlorocebus_sabaeus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	94	86.627	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	86.627	Choloepus_hoffmanni
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	97.753	ENSCPBG00000000260	TNPO1	95	97.324	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	80	78.169	ENSCING00000021247	-	99	78.169	Ciona_intestinalis
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	75.758	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.421	Ciona_savignyi
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	99.554	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	99.888	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	95	100.000	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	91.573	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	Cynoglossus_semilaevis
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.258	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.146	Cyprinodon_variegatus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	92.705	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.368	Danio_rerio
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	99.438	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.415	Dasypus_novemcinctus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	92	99.398	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.397	Dipodomys_ordii
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	57.675	FBgn0035693	CG8219	99	57.336	Drosophila_melanogaster
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	86	99.251	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.251	Echinops_telfairi
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	94	85.119	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	Eptatretus_burgeri
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.663	Equus_asinus_asinus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	99.438	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	99.330	Equus_caballus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	89.888	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.275	Esox_lucius
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.663	Felis_catus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	97.753	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	Ficedula_albicollis
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	99.219	Fukomys_damarensis
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.490	Fundulus_heteroclitus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	92.135	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.067	Gadus_morhua
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	97.753	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	Gallus_gallus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.258	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.265	Gambusia_affinis
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.833	Gasterosteus_aculeatus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	97.191	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	Gopherus_agassizii
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	83.146	ENSGGOG00000022535	-	99	82.905	Gorilla_gorilla
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.663	Gorilla_gorilla
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.258	Haplochromis_burtoni
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	68	85.950	ENSHGLG00000001198	-	93	84.821	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSHGLG00000000970	-	99	98.992	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	75.223	ENSHGLG00100000963	-	99	74.665	Heterocephalus_glaber_male
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	95	98.832	ENSHGLG00100017090	-	99	98.832	Heterocephalus_glaber_male
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	98.876	ENSSTOG00000021784	-	100	98.876	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.664	Jaculus_jaculus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.258	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.483	Kryptolebias_marmoratus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.258	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	Labrus_bergylta
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	95	89.419	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.419	Latimeria_chalumnae
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	94.944	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	95.297	Lepisosteus_oculatus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	96	98.845	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.845	Loxodonta_africana
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	99.554	Macaca_fascicularis
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	99.438	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	99.549	Macaca_mulatta
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	99.554	Macaca_nemestrina
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	99.554	Mandrillus_leucophaeus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	92.697	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.371	Mastacembelus_armatus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.034	Maylandia_zebra
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.521	Microcebus_murinus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.555	Microtus_ochrogaster
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	92.697	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	Mola_mola
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	97.660	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.660	Monodelphis_domestica
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	92.247	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.247	Monopterus_albus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	99.442	Mustela_putorius_furo
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	95	98.952	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.952	Myotis_lucifugus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	99.438	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	99.776	Nannospalax_galili
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.894	Neolamprologus_brichardi
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.663	Nomascus_leucogenys
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	97	99.419	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.615	Ochotona_princeps
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	99.438	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	98.884	Octodon_degus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	69	87.805	ENSODEG00000009802	-	95	87.302	Octodon_degus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.428	Oreochromis_niloticus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	91	97.805	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	95	92.874	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.874	Oryctolagus_cuniculus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	98	92.571	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.607	Oryzias_latipes
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	92.897	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	Oryzias_latipes_hni
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	93.010	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	Oryzias_latipes_hsok
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	92.897	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.897	Oryzias_melastigma
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	99.442	Otolemur_garnettii
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.330	Ovis_aries
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	99.554	Pan_paniscus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.663	Panthera_pardus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.663	Panthera_tigris_altaica
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	99.554	Pan_troglodytes
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	90.395	ENSPTRG00000047731	-	100	86.602	Pan_troglodytes
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	99.554	Papio_anubis
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	90.562	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	97.753	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	97.092	Pelodiscus_sinensis
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	91.011	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.348	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	95	100.000	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.258	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.057	Poecilia_formosa
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ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	ENSVVUG00000007338	TNPO1	100	99.663	Vulpes_vulpes
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.270	Xenopus_tropicalis
ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	92.697	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.929	Xiphophorus_maculatus