EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMAUG00000022167 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Apobec1
Alias: -
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme%2C catalytic polypeptide 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mesocricetus_auratus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3029 bases
Position: chrKB708132.1:1493252-1496280
Accession: 103298
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMAUP00000025731	APOBEC_N	PF08210.11	1.3e-30	1	1
ENSMAUP00000025731	APOBEC_C	PF05240.14	2.6e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMAUT00000029754	-	761	-	ENSMAUP00000025731	222 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMAUG00000022167	Apobec1	51	34.000	ENSMAUG00000011683	Apobec3	53	34.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	71.296	ENSG00000111701	APOBEC1	92	71.296	Homo_sapiens
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	68.837	ENSAMEG00000007098	APOBEC1	91	68.837	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMAUG00000022167	Apobec1	69	44.805	ENSACAG00000028578	-	84	44.805	Anolis_carolinensis
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	69.907	ENSANAG00000027743	APOBEC1	87	69.907	Aotus_nancymaae
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	67.130	ENSBTAG00000014683	APOBEC1	92	67.130	Bos_taurus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	96	70.561	ENSCJAG00000005398	APOBEC1	97	70.561	Callithrix_jacchus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	70.370	ENSCAFG00000013901	APOBEC1	92	70.370	Canis_familiaris
ENSMAUG00000022167	Apobec1	99	69.027	ENSCAFG00020003511	APOBEC1	95	69.027	Canis_lupus_dingo
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	66.204	ENSCHIG00000011898	APOBEC1	90	66.204	Capra_hircus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	60	67.164	ENSTSYG00000029141	APOBEC1	95	67.164	Carlito_syrichta
ENSMAUG00000022167	Apobec1	96	62.617	ENSCAPG00000015882	-	99	62.617	Cavia_aperea
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	61.111	ENSCPOG00000033068	APOBEC1	92	61.111	Cavia_porcellus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	70.833	ENSCCAG00000022258	APOBEC1	92	70.833	Cebus_capucinus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	71.759	ENSCATG00000021613	APOBEC1	87	71.759	Cercocebus_atys
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	61.574	ENSCLAG00000014645	APOBEC1	94	61.574	Chinchilla_lanigera
ENSMAUG00000022167	Apobec1	82	71.823	ENSCSAG00000009817	APOBEC1	95	71.823	Chlorocebus_sabaeus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	89	40.000	ENSCPBG00000014327	-	79	40.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAUG00000022167	Apobec1	94	43.128	ENSCPBG00000014331	-	84	43.128	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAUG00000022167	Apobec1	84	44.211	ENSCPBG00000014328	-	83	44.211	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAUG00000022167	Apobec1	82	48.634	ENSCPBG00000014329	-	50	48.634	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAUG00000022167	Apobec1	77	44.633	ENSCPBG00000017398	-	78	44.633	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAUG00000022167	Apobec1	77	50.289	ENSCPBG00000014335	-	70	50.289	Chrysemys_picta_bellii
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	71.759	ENSCANG00000038359	APOBEC1	94	71.759	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	86.574	ENSCGRG00001011130	Apobec1	94	86.574	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	86.574	ENSCGRG00000008644	Apobec1	94	86.574	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	70.370	ENSDNOG00000010926	APOBEC1	92	70.370	Dasypus_novemcinctus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	96	61.682	ENSDORG00000023717	Apobec1	100	61.682	Dipodomys_ordii
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	68.664	ENSETEG00000004867	APOBEC1	92	68.664	Echinops_telfairi
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	73.611	ENSEASG00005015951	APOBEC1	91	73.611	Equus_asinus_asinus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	82	74.176	ENSECAG00000017163	APOBEC1	95	74.176	Equus_caballus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	92	50.000	ENSEEUG00000007530	-	97	50.000	Erinaceus_europaeus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	93	61.836	ENSEEUG00000009112	-	92	61.836	Erinaceus_europaeus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	70.833	ENSFCAG00000009350	APOBEC1	92	70.833	Felis_catus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	65	51.370	ENSFALG00000007257	-	71	51.370	Ficedula_albicollis
ENSMAUG00000022167	Apobec1	90	54.271	ENSFDAG00000018470	APOBEC1	96	54.271	Fukomys_damarensis
ENSMAUG00000022167	Apobec1	95	47.664	ENSGAGG00000011837	-	87	54.783	Gopherus_agassizii
ENSMAUG00000022167	Apobec1	78	45.810	ENSGAGG00000004947	-	87	48.148	Gopherus_agassizii
ENSMAUG00000022167	Apobec1	76	45.294	ENSGAGG00000006624	-	62	45.294	Gopherus_agassizii
ENSMAUG00000022167	Apobec1	84	43.386	ENSGAGG00000021744	-	74	43.386	Gopherus_agassizii
ENSMAUG00000022167	Apobec1	76	41.618	ENSGAGG00000021745	-	64	41.618	Gopherus_agassizii
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	57.870	ENSHGLG00000001495	APOBEC1	92	57.870	Heterocephalus_glaber_female
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	58.333	ENSHGLG00100002187	APOBEC1	92	58.333	Heterocephalus_glaber_male
ENSMAUG00000022167	Apobec1	96	56.542	ENSSTOG00000021971	APOBEC1	99	71.134	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	71.296	ENSJJAG00000022108	Apobec1	94	71.296	Jaculus_jaculus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	69.907	ENSLAFG00000030837	APOBEC1	97	69.907	Loxodonta_africana
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	71.759	ENSMFAG00000000277	APOBEC1	95	72.376	Macaca_fascicularis
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	71.296	ENSMNEG00000029670	APOBEC1	92	71.296	Macaca_nemestrina
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	71.759	ENSMLEG00000036301	APOBEC1	92	71.759	Mandrillus_leucophaeus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	99	70.136	ENSMICG00000043645	APOBEC1	96	70.136	Microcebus_murinus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	65.278	ENSMODG00000018004	APOBEC1	91	65.278	Monodelphis_domestica
ENSMAUG00000022167	Apobec1	99	80.995	ENSMUSG00000040613	Apobec1	97	80.995	Mus_musculus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	99	78.281	MGP_PahariEiJ_G0022580	-	97	78.281	Mus_pahari
ENSMAUG00000022167	Apobec1	99	80.995	MGP_SPRETEiJ_G0029857	Apobec1	97	80.995	Mus_spretus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	68.981	ENSMPUG00000017532	APOBEC1	92	68.981	Mustela_putorius_furo
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	75.926	ENSNGAG00000022607	Apobec1	94	75.926	Nannospalax_galili
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	70.833	ENSNLEG00000005342	APOBEC1	92	70.833	Nomascus_leucogenys
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	62.500	ENSMEUG00000013406	APOBEC1	92	62.500	Notamacropus_eugenii
ENSMAUG00000022167	Apobec1	75	59.281	ENSOPRG00000009508	-	92	59.281	Ochotona_princeps
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	66.667	ENSOCUG00000025736	APOBEC1	81	66.667	Oryctolagus_cuniculus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	70.370	ENSOGAG00000026415	APOBEC1	92	70.370	Otolemur_garnettii
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	66.204	ENSOARG00000002072	APOBEC1	90	66.204	Ovis_aries
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	65.741	ENSPPAG00000027657	APOBEC1	91	65.741	Pan_paniscus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	71.296	ENSPPRG00000012182	APOBEC1	92	71.296	Panthera_pardus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	71.296	ENSPTIG00000020280	APOBEC1	92	71.296	Panthera_tigris_altaica
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	70.833	ENSPTRG00000004614	APOBEC1	92	70.833	Pan_troglodytes
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	72.222	ENSPANG00000021027	APOBEC1	92	72.222	Papio_anubis
ENSMAUG00000022167	Apobec1	56	50.926	ENSPSIG00000012791	-	71	50.926	Pelodiscus_sinensis
ENSMAUG00000022167	Apobec1	79	45.455	ENSPSIG00000012568	-	76	45.455	Pelodiscus_sinensis
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	82.870	ENSPEMG00000023841	Apobec1	94	82.870	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	66.667	ENSPCIG00000023973	APOBEC1	92	66.667	Phascolarctos_cinereus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	70.833	ENSPPYG00000004228	APOBEC1	87	70.833	Pongo_abelii
ENSMAUG00000022167	Apobec1	78	68.391	ENSPCAG00000008733	APOBEC1	93	68.391	Procavia_capensis
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	71.628	ENSPCOG00000013957	APOBEC1	95	71.628	Propithecus_coquereli
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	54.167	ENSPVAG00000010709	APOBEC1	91	54.167	Pteropus_vampyrus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	99	78.733	ENSRNOG00000015411	Apobec1	97	78.733	Rattus_norvegicus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	71.296	ENSRBIG00000031161	APOBEC1	92	71.296	Rhinopithecus_bieti
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	71.296	ENSRROG00000033576	APOBEC1	95	71.823	Rhinopithecus_roxellana
ENSMAUG00000022167	Apobec1	78	69.364	ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	69.364	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	64.352	ENSSHAG00000008925	APOBEC1	95	64.352	Sarcophilus_harrisii
ENSMAUG00000022167	Apobec1	77	61.628	ENSSARG00000000032	-	100	61.628	Sorex_araneus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	58	65.116	ENSSARG00000011972	-	98	65.116	Sorex_araneus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	90	42.857	ENSSPUG00000009044	-	78	42.857	Sphenodon_punctatus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	71.163	ENSSSCG00000000668	APOBEC1	91	71.163	Sus_scrofa
ENSMAUG00000022167	Apobec1	65	52.055	ENSTGUG00000013118	-	100	52.055	Taeniopygia_guttata
ENSMAUG00000022167	Apobec1	96	67.757	ENSTBEG00000010043	APOBEC1	91	67.757	Tupaia_belangeri
ENSMAUG00000022167	Apobec1	78	66.667	ENSTTRG00000014015	APOBEC1	93	66.667	Tursiops_truncatus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	68.837	ENSUAMG00000011636	APOBEC1	88	68.837	Ursus_americanus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	68.837	ENSUMAG00000016552	APOBEC1	88	68.837	Ursus_maritimus
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	68.519	ENSVPAG00000001343	APOBEC1	92	68.519	Vicugna_pacos
ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	70.833	ENSVVUG00000010522	APOBEC1	92	70.833	Vulpes_vulpes