EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMEUG00000015620 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Notamacropus_eugenii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 40017 bases
Position: chrGeneScaffold_7502:14237-54253
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMEUP00000014276	GTP_EFTU	PF00009.27	1.7e-45	1	1
ENSMEUP00000014276	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	6.6e-13	1	1
ENSMEUP00000014276	EFG_IV	PF03764.18	1.3e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMEUT00000015679	EFTUD2-201	2919	-	ENSMEUP00000014276	972 (aa)	-	UPI0001B216B4

Gene Model

Click here to download ENSMEUG00000015620's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMEUG00000015620's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	81	38.032	ENSMEUG00000003973	EEF2	95	38.032

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.885	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.580	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	88.374	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.782	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	95.782	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	85.082	ENSACIG00000009096	eftud2	100	84.877	Amphilophus_citrinellus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	87	84.000	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	84.000	Amphiprion_ocellaris
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.683	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	88.477	Amphiprion_percula
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.992	ENSATEG00000000457	eftud2	100	88.786	Anabas_testudineus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	99	90.834	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	90.834	Anas_platyrhynchos
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	94.033	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	94.033	Anolis_carolinensis
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	95.988	Aotus_nancymaae
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.580	ENSACLG00000001296	eftud2	100	88.374	Astatotilapia_calliptera
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.025	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	88.025	Astyanax_mexicanus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.473	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	95.473	Bos_taurus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	99	66.942	WBGene00001166	eftu-2	99	66.736	Caenorhabditis_elegans
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	95.988	Callithrix_jacchus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.782	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	95.782	Canis_familiaris
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.782	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	95.782	Canis_lupus_dingo
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.473	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	95.473	Capra_hircus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.576	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	95.576	Carlito_syrichta
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.165	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	95.165	Cavia_aperea
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.165	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	95.165	Cavia_porcellus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	95.988	Cebus_capucinus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	95.988	Cercocebus_atys
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.062	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	95.062	Chinchilla_lanigera
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	95.988	Chlorocebus_sabaeus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	88	86.033	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	95	86.033	Choloepus_hoffmanni
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.267	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	95.267	Chrysemys_picta_bellii
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	74.256	ENSCING00000009372	-	100	74.256	Ciona_intestinalis
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	99	74.542	ENSCSAVG00000004985	-	99	76.651	Ciona_savignyi
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	95.988	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.473	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	95.473	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.473	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	95.473	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.169	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	87.963	Cynoglossus_semilaevis
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.374	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	88.169	Cyprinodon_variegatus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.359	ENSDARG00000012261	eftud2	100	88.141	Danio_rerio
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.370	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	95.370	Dasypus_novemcinctus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.370	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	95.370	Dipodomys_ordii
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	71.590	FBgn0039566	CG4849	100	71.590	Drosophila_melanogaster
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	92	89.155	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	89.155	Echinops_telfairi
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	69	96.078	ENSEBUG00000004047	-	89	87.332	Eptatretus_burgeri
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.782	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	95.782	Equus_asinus_asinus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.679	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	95.679	Equus_caballus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	83	77.858	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	77.858	Erinaceus_europaeus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.243	ENSELUG00000017169	eftud2	100	87.243	Esox_lucius
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.679	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	95.679	Felis_catus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	94.239	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	94.239	Ficedula_albicollis
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.370	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	95.370	Fukomys_damarensis
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.477	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	88.272	Fundulus_heteroclitus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.551	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	87.963	Gadus_morhua
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	94.342	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	94.342	Gallus_gallus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.374	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	88.272	Gambusia_affinis
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.066	ENSGACG00000009163	eftud2	100	87.860	Gasterosteus_aculeatus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	95.988	Gorilla_gorilla
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.477	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	88.272	Haplochromis_burtoni
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	94.959	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	94.959	Heterocephalus_glaber_female
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	96	100.000	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	94.959	Heterocephalus_glaber_male
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.346	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	87.346	Hippocampus_comes
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.654	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	88.272	Ictalurus_punctatus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	89.918	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	94.020	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	95	95.874	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	95.874	Jaculus_jaculus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.169	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	87.963	Kryptolebias_marmoratus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	93	91.602	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	89.882	Labrus_bergylta
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	90.741	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	91.264	Latimeria_chalumnae
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.477	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	88.477	Lepisosteus_oculatus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.473	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	95.473	Loxodonta_africana
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	95.988	Macaca_fascicularis
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	95.988	Macaca_nemestrina
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	95.988	Mandrillus_leucophaeus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.786	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	88.580	Mastacembelus_armatus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.580	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	88.374	Maylandia_zebra
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	94.353	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	94.353	Meleagris_gallopavo
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.473	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	95.473	Mesocricetus_auratus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	95.988	Microcebus_murinus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.576	ENSMOCG00000009039	-	100	95.576	Microtus_ochrogaster
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	92	81.461	ENSMOCG00000017653	-	90	81.461	Microtus_ochrogaster
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	87	89.765	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	89.765	Mola_mola
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	96.193	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	96.193	Monodelphis_domestica
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	87	88.000	ENSMALG00000014501	eftud2	100	88.000	Monopterus_albus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.267	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	95.267	Mus_caroli
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.267	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	95.267	Mus_musculus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.267	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	95.267	Mus_pahari
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.267	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	95.267	Mus_spretus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	93	99.337	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	87	99.337	Mustela_putorius_furo
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.782	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	95.782	Myotis_lucifugus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.473	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	95.473	Nannospalax_galili
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.477	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	88.272	Neolamprologus_brichardi
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	93	97.790	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	92	97.790	Nomascus_leucogenys
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.551	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	87.551	Ochotona_princeps
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	94.753	ENSODEG00000018041	-	100	94.753	Octodon_degus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	93	75.718	ENSODEG00000003385	-	100	75.718	Octodon_degus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.580	ENSONIG00000000912	eftud2	100	88.374	Oreochromis_niloticus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.782	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	95.782	Oryctolagus_cuniculus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.066	ENSORLG00000003109	eftud2	100	88.066	Oryzias_latipes
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.963	ENSORLG00020009865	eftud2	100	87.963	Oryzias_latipes_hni
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.963	ENSORLG00015002611	eftud2	100	89.542	Oryzias_latipes_hsok
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	93.724	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	93.724	Otolemur_garnettii
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.473	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	95.473	Ovis_aries
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.885	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	95.885	Pan_paniscus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.782	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	95.782	Panthera_pardus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.782	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	95.782	Panthera_tigris_altaica
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.885	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	95.885	Pan_troglodytes
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	95.988	Papio_anubis
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	93	97.354	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.354	Pelodiscus_sinensis
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	80.761	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	80.761	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.473	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	95.473	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	96.296	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	96.296	Phascolarctos_cinereus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.374	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	88.272	Poecilia_formosa
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.374	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	88.272	Poecilia_latipinna
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.374	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	88.272	Poecilia_mexicana
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	94.547	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	94.547	Pongo_abelii
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	99.280	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	99.280	Procavia_capensis
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.885	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	95.885	Propithecus_coquereli
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	90.844	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	90.844	Pteropus_vampyrus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.477	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	88.272	Pundamilia_nyererei
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.272	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	88.786	Pygocentrus_nattereri
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.062	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	94.856	Rattus_norvegicus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.885	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	95.885	Rhinopithecus_bieti
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.885	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	95.885	Rhinopithecus_roxellana
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	93	32.991	YKL173W	SNU114	87	33.517	Saccharomyces_cerevisiae
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	95.988	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	97	96.055	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	96.055	Sarcophilus_harrisii
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.757	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	87.988	Scleropages_formosus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.374	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	88.169	Scophthalmus_maximus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.683	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	88.477	Seriola_dumerili
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.786	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	88.580	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.140	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	87.140	Sorex_araneus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	94.033	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	94.033	Sphenodon_punctatus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.786	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	88.580	Stegastes_partitus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.576	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	95.576	Sus_scrofa
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	84	97.324	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	Taeniopygia_guttata
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.757	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	87.551	Takifugu_rubripes
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	83.299	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	82.992	Tetraodon_nigroviridis
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	90.329	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	90.329	Tupaia_belangeri
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	86.934	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	86.934	Tursiops_truncatus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	94.661	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	94.661	Ursus_americanus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.782	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	95.782	Ursus_maritimus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	84	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	84	100.000	Vicugna_pacos
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.782	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	95.782	Vulpes_vulpes
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	97	91.365	ENSXETG00000003394	eftud2	98	92.274	Xenopus_tropicalis
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	81	93.742	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.742	Xiphophorus_couchianus
ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.374	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	88.272	Xiphophorus_maculatus