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Description

Ensembl ID: ENSMFAG00000046246 (Gene tree)
Gene ID: 102118605
Gene Symbol: RAB1A
Alias: -
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Macaca_fascicularis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 45582 bases
Position: chr13:44861119-44906700
Accession: 102118605
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMFAP00000040358	MMR_HSR1	PF01926.23	2.4e-05	1	1
ENSMFAP00000040503	MMR_HSR1	PF01926.23	2.9e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMFAT00000014771	RAB1A-202	654	-	ENSMFAP00000040503	217 (aa)	-	A0A2K5WTZ4
ENSMFAT00000014626	RAB1A-201	2745	XM_005575734	ENSMFAP00000040358	205 (aa)	XP_005575791	A0A2K5WTK2
ENSMFAT00000014775	RAB1A-203	558	-	ENSMFAP00000040507	185 (aa)	-	A0A2K5WTI9
ENSMFAT00000014809	RAB1A-206	417	-	ENSMFAP00000040541	138 (aa)	-	A0A2K5WTL6
ENSMFAT00000014808	RAB1A-205	453	-	ENSMFAP00000040538	150 (aa)	-	A0A2K5WTL9
ENSMFAT00000014780	RAB1A-204	522	-	ENSMFAP00000040512	173 (aa)	-	A0A2K5WTJ4

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
mcf05134	Legionellosis	KEGG

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMFAG00000046246	RAB1A	90	48.108	ENSMFAG00000037805	RAB2A	99	45.238
ENSMFAG00000046246	RAB1A	95	43.814	ENSMFAG00000002326	RAB5A	90	43.814
ENSMFAG00000046246	RAB1A	77	40.373	ENSMFAG00000045768	RAB34	62	40.373
ENSMFAG00000046246	RAB1A	57	33.058	ENSMFAG00000041098	ARL2	61	33.058
ENSMFAG00000046246	RAB1A	85	52.299	ENSMFAG00000000699	-	81	52.299
ENSMFAG00000046246	RAB1A	82	32.544	ENSMFAG00000035424	RHEB	91	32.544
ENSMFAG00000046246	RAB1A	95	43.367	ENSMFAG00000029992	RAB5B	90	43.367
ENSMFAG00000046246	RAB1A	80	50.909	ENSMFAG00000045048	RAB15	90	57.944
ENSMFAG00000046246	RAB1A	94	38.384	ENSMFAG00000041027	RAB6A	94	38.384
ENSMFAG00000046246	RAB1A	75	36.601	ENSMFAG00000044775	-	65	36.601
ENSMFAG00000046246	RAB1A	83	44.000	ENSMFAG00000003290	RAB33B	76	44.000
ENSMFAG00000046246	RAB1A	80	35.928	ENSMFAG00000040143	MRAS	80	35.928
ENSMFAG00000046246	RAB1A	80	38.415	ENSMFAG00000036827	NRAS	91	38.650
ENSMFAG00000046246	RAB1A	81	46.386	ENSMFAG00000000115	RAB25	78	46.386
ENSMFAG00000046246	RAB1A	81	50.602	ENSMFAG00000033119	RAB30	82	50.602
ENSMFAG00000046246	RAB1A	60	34.091	ENSMFAG00000000767	ARL8A	73	33.929
ENSMFAG00000046246	RAB1A	76	38.994	ENSMFAG00000023380	RAB9A	79	38.994
ENSMFAG00000046246	RAB1A	95	43.590	ENSMFAG00000039627	RAB5C	90	43.590
ENSMFAG00000046246	RAB1A	78	39.264	ENSMFAG00000033688	RAB7A	79	39.264
ENSMFAG00000046246	RAB1A	87	33.514	ENSMFAG00000041631	RERG	90	33.514
ENSMFAG00000046246	RAB1A	85	36.000	ENSMFAG00000000762	RAB41	78	36.000
ENSMFAG00000046246	RAB1A	57	31.092	ENSMFAG00000045232	ARL4C	58	31.092
ENSMFAG00000046246	RAB1A	90	48.649	ENSMFAG00000027114	RAB2B	86	48.649
ENSMFAG00000046246	RAB1A	76	39.623	ENSMFAG00000010320	RAB9B	83	37.952
ENSMFAG00000046246	RAB1A	53	34.454	ENSMFAG00000028826	ARL14	59	34.454
ENSMFAG00000046246	RAB1A	96	51.269	ENSMFAG00000041018	RAB13	97	51.269
ENSMFAG00000046246	RAB1A	84	35.028	ENSMFAG00000039003	HRAS	93	35.028
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	45.581	ENSMFAG00000003654	RAB11B	99	45.581
ENSMFAG00000046246	RAB1A	84	33.526	ENSMFAG00000032369	RAB23	73	33.526
ENSMFAG00000046246	RAB1A	86	43.820	ENSMFAG00000036188	RAB39B	84	43.820
ENSMFAG00000046246	RAB1A	94	36.410	ENSMFAG00000032149	RAB6B	94	36.410
ENSMFAG00000046246	RAB1A	81	30.233	ENSMFAG00000043229	DNAJC27	89	30.380
ENSMFAG00000046246	RAB1A	82	50.296	ENSMFAG00000043551	RAB12	69	50.296
ENSMFAG00000046246	RAB1A	95	38.974	ENSMFAG00000044247	RAB22A	97	39.086
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	53.960	ENSMFAG00000038261	RAB35	100	53.960
ENSMFAG00000046246	RAB1A	80	37.805	ENSMFAG00000003804	KRAS	95	35.912
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	44.554	ENSMFAG00000046157	RAB14	93	44.554
ENSMFAG00000046246	RAB1A	88	46.703	ENSMFAG00000006430	RAB18	93	45.876
ENSMFAG00000046246	RAB1A	64	31.655	ENSMFAG00000035233	ARL8B	72	31.655
ENSMFAG00000046246	RAB1A	80	47.619	ENSMFAG00000002604	RAB33A	71	47.619
ENSMFAG00000046246	RAB1A	59	32.061	ENSMFAG00000008326	-	65	32.061
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	93.069	ENSMFAG00000040560	RAB1B	100	93.069
ENSMFAG00000046246	RAB1A	95	33.333	ENSMFAG00000003128	RAB36	63	33.796

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSG00000138069	RAB1A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	95.545	ENSAPOG00000008143	-	100	95.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSAMEG00000001127	RAB1A	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	95.545	ENSAOCG00000020606	-	100	95.545	Amphiprion_ocellaris
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	95.545	ENSAPEG00000022488	-	100	95.545	Amphiprion_percula
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSANAG00000020929	RAB1A	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	96.040	ENSACLG00000003326	-	100	96.040	Astatotilapia_calliptera
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	94.554	ENSAMXG00000034850	-	100	94.554	Astyanax_mexicanus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	Bos_taurus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00000003187	RAB1A	100	100.000	Canis_familiaris
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00020026971	RAB1A	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSMFAG00000046246	RAB1A	96	100.000	ENSCHIG00000014060	RAB1A	99	99.512	Capra_hircus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	98.049	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSCPOG00000015437	RAB1A	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSCATG00000030853	RAB1A	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	99.512	ENSCPBG00000013243	RAB1A	100	99.512	Chrysemys_picta_bellii
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	97.561	ENSCANG00000035916	RAB1A	100	97.664	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00001012691	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00000008456	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSDNOG00000018236	RAB1A	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSDORG00000028628	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	84.466	FBgn0285937	Rab1	100	84.466	Drosophila_melanogaster
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	100.000	ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	Echinops_telfairi
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSEASG00005007298	RAB1A	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSECAG00000009926	RAB1A	100	100.000	Equus_caballus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	100.000	ENSEEUG00000011721	RAB1A	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	95.588	ENSELUG00000012166	RAB1A	96	95.588	Esox_lucius
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSFCAG00000002536	RAB1A	100	100.000	Felis_catus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	97.537	ENSFALG00000013624	RAB1A	99	97.537	Ficedula_albicollis
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSFDAG00000019505	-	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	94.554	ENSFHEG00000014414	-	100	94.554	Fundulus_heteroclitus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	99.512	ENSGALG00000031582	RAB1A	100	99.512	Gallus_gallus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	94.554	ENSGAFG00000000918	-	100	94.554	Gambusia_affinis
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	99.512	ENSGAGG00000006802	RAB1A	100	99.512	Gopherus_agassizii
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSGGOG00000026603	RAB1A	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSHGLG00000013585	RAB1A	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	97.549	ENSHGLG00100007994	RAB1A	97	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSSTOG00000020693	-	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	96	100.000	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	96	95.431	ENSKMAG00000014038	-	93	95.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	95.050	ENSLBEG00000028426	RAB1A	100	95.050	Labrus_bergylta
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	98.537	ENSLACG00000012869	RAB1A	100	98.537	Latimeria_chalumnae
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	Loxodonta_africana
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	97.674	ENSMMUG00000021721	RAB1A	99	97.674	Macaca_mulatta
ENSMFAG00000046246	RAB1A	95	99.485	ENSMNEG00000028414	-	97	99.485	Macaca_nemestrina
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	96.040	ENSMZEG00005013959	-	100	96.040	Maylandia_zebra
ENSMFAG00000046246	RAB1A	96	99.492	ENSMGAG00000004611	RAB1A	100	99.010	Meleagris_gallopavo
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	99.512	ENSMAUG00000012156	Rab1a	100	99.512	Mesocricetus_auratus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	99.512	ENSMOCG00000017022	Rab1a	100	99.512	Microtus_ochrogaster
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	93.564	ENSMMOG00000018709	RAB1A	100	93.564	Mola_mola
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	99.512	ENSMODG00000003340	RAB1A	100	99.512	Monodelphis_domestica
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	100	100.000	Mus_caroli
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSMUSG00000020149	Rab1a	100	100.000	Mus_musculus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	100	100.000	Mus_pahari
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	100	100.000	Mus_spretus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSMPUG00000006139	RAB1A	82	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	Myotis_lucifugus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSNGAG00000005838	Rab1a	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	96.040	ENSNBRG00000020492	-	100	96.040	Neolamprologus_brichardi
ENSMFAG00000046246	RAB1A	96	100.000	ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	Ochotona_princeps
ENSMFAG00000046246	RAB1A	94	100.000	ENSODEG00000011248	-	96	100.000	Octodon_degus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	93.627	ENSONIG00000006819	-	100	93.627	Oreochromis_niloticus
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	99.512	ENSOANG00000012438	RAB1A	100	99.512	Ornithorhynchus_anatinus
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ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSPTRG00000011989	RAB1A	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSPANG00000010485	RAB1A	100	100.000	Papio_anubis
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	96.552	ENSPSIG00000008028	RAB1A	97	99.495	Pelodiscus_sinensis
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	95.588	ENSPMGG00000021015	-	99	95.588	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSMFAG00000046246	RAB1A	97	99.495	ENSVPAG00000005640	RAB1A	99	99.495	Vicugna_pacos
ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	ENSVVUG00000027588	RAB1A	100	100.000	Vulpes_vulpes
ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	94.554	ENSXMAG00000015776	-	100	94.554	Xiphophorus_maculatus