EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMGAG00000002019 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Meleagris_gallopavo
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1868 bases
Position: chr25:2139965-2141832
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMGAP00000001546	SYF2	PF08231.12	2e-56	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMGAT00000002209	SYF2-201	862	-	ENSMGAP00000001546	199 (aa)	-	G1MT43

Gene Model

Click here to download ENSMGAG00000002019's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMGAG00000002019's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.950	ENSG00000117614	SYF2	82	89.950	Homo_sapiens
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.925	ENSAPOG00000001174	syf2	84	84.925	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.940	ENSAMEG00000010115	-	82	87.940	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMGAG00000002019	SYF2	98	88.205	ENSAMEG00000010134	-	100	88.205	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.915	ENSACIG00000023688	syf2	80	82.915	Amphilophus_citrinellus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.925	ENSAOCG00000022046	syf2	85	84.925	Amphiprion_ocellaris
ENSMGAG00000002019	SYF2	91	83.516	ENSAOCG00000010912	syf2	57	83.516	Amphiprion_ocellaris
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.925	ENSAPEG00000018858	syf2	77	84.925	Amphiprion_percula
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.422	ENSATEG00000007745	syf2	84	84.422	Anabas_testudineus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	99.497	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	99.497	Anas_platyrhynchos
ENSMGAG00000002019	SYF2	83	77.246	ENSACAG00000026777	-	94	76.433	Anolis_carolinensis
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	ENSACAG00000013653	-	98	89.447	Anolis_carolinensis
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	ENSANAG00000032473	SYF2	82	89.447	Aotus_nancymaae
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.915	ENSACLG00000019916	syf2	84	82.915	Astatotilapia_calliptera
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.412	ENSAMXG00000004051	syf2	84	82.412	Astyanax_mexicanus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	ENSBTAG00000001651	SYF2	84	88.945	Bos_taurus
ENSMGAG00000002019	SYF2	99	52.764	WBGene00019402	syf-2	85	52.764	Caenorhabditis_elegans
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	ENSCJAG00000046570	SYF2	82	89.447	Callithrix_jacchus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.422	ENSCAFG00000030331	-	87	84.422	Canis_familiaris
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.940	ENSCAFG00000012895	-	81	87.940	Canis_familiaris
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.940	ENSCAFG00020021091	-	81	87.940	Canis_lupus_dingo
ENSMGAG00000002019	SYF2	91	79.670	ENSCAFG00020021094	-	83	87.179	Canis_lupus_dingo
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	ENSCHIG00000020874	SYF2	83	88.945	Capra_hircus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.940	ENSTSYG00000005114	SYF2	82	87.940	Carlito_syrichta
ENSMGAG00000002019	SYF2	99	88.889	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	88.889	Cavia_aperea
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	ENSCPOG00000005326	SYF2	82	88.945	Cavia_porcellus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	ENSCCAG00000022459	SYF2	82	89.447	Cebus_capucinus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	ENSCATG00000026917	SYF2	82	88.442	Cercocebus_atys
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	ENSCLAG00000008474	SYF2	82	89.447	Chinchilla_lanigera
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	ENSCSAG00000000948	SYF2	82	88.442	Chlorocebus_sabaeus
ENSMGAG00000002019	SYF2	65	78.295	ENSCHOG00000005273	-	79	78.295	Choloepus_hoffmanni
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	91.960	ENSCPBG00000025073	SYF2	80	91.960	Chrysemys_picta_bellii
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	55.224	ENSCING00000003017	-	84	54.726	Ciona_intestinalis
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	53.234	ENSCSAVG00000006627	-	92	53.234	Ciona_savignyi
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	76.884	ENSCANG00000037322	SYF2	79	76.884	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.437	ENSCGRG00001020733	Syf2	82	87.437	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMGAG00000002019	SYF2	98	87.755	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	87.437	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	78.392	ENSCSEG00000000117	syf2	83	78.392	Cynoglossus_semilaevis
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.915	ENSCVAG00000019543	syf2	83	82.915	Cyprinodon_variegatus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	83.920	ENSDARG00000004706	syf2	84	83.920	Danio_rerio
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.940	ENSDNOG00000047605	SYF2	81	87.940	Dasypus_novemcinctus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	ENSDORG00000001274	Syf2	82	89.447	Dipodomys_ordii
ENSMGAG00000002019	SYF2	99	60.000	FBgn0033556	CG12343	88	60.000	Drosophila_melanogaster
ENSMGAG00000002019	SYF2	93	72.973	ENSETEG00000015729	SYF2	81	72.973	Echinops_telfairi
ENSMGAG00000002019	SYF2	99	59.391	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	Eptatretus_burgeri
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.950	ENSEASG00005004224	-	81	89.950	Equus_asinus_asinus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	78.392	ENSEASG00005004232	-	82	78.392	Equus_asinus_asinus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.950	ENSECAG00000010440	-	83	89.950	Equus_caballus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	ENSECAG00000012023	-	81	89.447	Equus_caballus
ENSMGAG00000002019	SYF2	69	75.362	ENSEEUG00000015084	SYF2	75	75.362	Erinaceus_europaeus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	85.427	ENSELUG00000003465	syf2	84	85.427	Esox_lucius
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	ENSFCAG00000043095	-	81	88.442	Felis_catus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.950	ENSFCAG00000010324	-	69	89.950	Felis_catus
ENSMGAG00000002019	SYF2	99	94.949	ENSFALG00000000460	SYF2	80	94.949	Ficedula_albicollis
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	ENSFDAG00000008310	SYF2	82	89.447	Fukomys_damarensis
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	67.500	ENSFHEG00000007238	syf2	88	67.500	Fundulus_heteroclitus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.407	ENSGMOG00000019138	syf2	89	81.407	Gadus_morhua
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	100.000	ENSGALG00000013639	SYF2	79	100.000	Gallus_gallus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.407	ENSGAFG00000019435	syf2	84	81.407	Gambusia_affinis
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	83.417	ENSGACG00000007305	syf2	83	83.417	Gasterosteus_aculeatus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	92.462	ENSGAGG00000010670	SYF2	80	92.462	Gopherus_agassizii
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	ENSGGOG00000012796	SYF2	82	89.447	Gorilla_gorilla
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.915	ENSHBUG00000020477	syf2	85	82.915	Haplochromis_burtoni
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	76.884	ENSHGLG00000004304	-	82	74.874	Heterocephalus_glaber_female
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.950	ENSHGLG00000014393	SYF2	82	89.950	Heterocephalus_glaber_female
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.950	ENSHGLG00100014722	SYF2	82	89.950	Heterocephalus_glaber_male
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.412	ENSHCOG00000012904	syf2	65	82.412	Hippocampus_comes
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	83.417	ENSIPUG00000019859	syf2	84	83.417	Ictalurus_punctatus
ENSMGAG00000002019	SYF2	73	84.932	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	84.932	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	88.945	Jaculus_jaculus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	83.417	ENSKMAG00000013856	syf2	84	83.417	Kryptolebias_marmoratus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.925	ENSLBEG00000014425	syf2	84	84.925	Labrus_bergylta
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.925	ENSLACG00000012064	SYF2	84	84.925	Latimeria_chalumnae
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	85.427	ENSLOCG00000002728	syf2	79	85.427	Lepisosteus_oculatus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.940	ENSLAFG00000023150	-	81	87.940	Loxodonta_africana
ENSMGAG00000002019	SYF2	86	62.500	ENSLAFG00000030814	-	94	62.500	Loxodonta_africana
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	ENSMFAG00000041831	SYF2	82	88.442	Macaca_fascicularis
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	ENSMMUG00000002968	SYF2	82	88.442	Macaca_mulatta
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	ENSMNEG00000030180	SYF2	82	88.442	Macaca_nemestrina
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	ENSMLEG00000030248	SYF2	82	88.442	Mandrillus_leucophaeus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.910	ENSMAMG00000010403	syf2	83	81.910	Mastacembelus_armatus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.915	ENSMZEG00005006429	syf2	84	82.915	Maylandia_zebra
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	ENSMAUG00000018974	Syf2	82	88.442	Mesocricetus_auratus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	ENSMICG00000016191	SYF2	100	89.447	Microcebus_murinus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	ENSMOCG00000022938	Syf2	82	88.442	Microtus_ochrogaster
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	80.905	ENSMMOG00000002396	syf2	83	80.905	Mola_mola
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	85.075	ENSMODG00000013951	-	88	85.075	Monodelphis_domestica
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.000	ENSMALG00000010706	syf2	83	81.500	Monopterus_albus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.940	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	82	87.940	Mus_caroli
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.940	ENSMUSG00000028821	Syf2	82	87.940	Mus_musculus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.940	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	82	87.940	Mus_pahari
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.940	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	82	87.940	Mus_spretus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	ENSMPUG00000015801	-	81	88.945	Mustela_putorius_furo
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.940	ENSMPUG00000015802	-	81	87.940	Mustela_putorius_furo
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	ENSMLUG00000001885	SYF2	82	88.442	Myotis_lucifugus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	ENSNGAG00000007912	Syf2	81	88.945	Nannospalax_galili
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	74.874	ENSNBRG00000010720	syf2	84	74.874	Neolamprologus_brichardi
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	ENSNLEG00000035185	SYF2	82	89.447	Nomascus_leucogenys
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.437	ENSOPRG00000012870	SYF2	82	87.437	Ochotona_princeps
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	ENSODEG00000017664	-	84	88.442	Octodon_degus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	78.392	ENSODEG00000014338	-	81	78.392	Octodon_degus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.412	ENSONIG00000008213	syf2	84	82.412	Oreochromis_niloticus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	90.452	ENSOANG00000009552	SYF2	99	90.452	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	ENSOCUG00000013050	SYF2	82	89.447	Oryctolagus_cuniculus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	85.427	ENSORLG00000028820	syf2	85	85.427	Oryzias_latipes
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	85.427	ENSORLG00020018333	syf2	84	85.427	Oryzias_latipes_hni
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	85.427	ENSORLG00015014665	syf2	84	85.427	Oryzias_latipes_hsok
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.925	ENSOMEG00000013911	syf2	84	84.925	Oryzias_melastigma
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	ENSOGAG00000009962	SYF2	82	88.945	Otolemur_garnettii
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.060	ENSOARG00000006348	-	81	88.060	Ovis_aries
ENSMGAG00000002019	SYF2	98	62.051	ENSOARG00000006269	-	100	62.051	Ovis_aries
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	ENSPPAG00000036579	SYF2	82	89.447	Pan_paniscus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.950	ENSPPRG00000001638	-	81	89.950	Panthera_pardus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	ENSPPRG00000001651	-	81	88.442	Panthera_pardus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	ENSPTIG00000007036	-	81	88.442	Panthera_tigris_altaica
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.950	ENSPTIG00000005711	-	73	89.950	Panthera_tigris_altaica
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	ENSPTRG00000000352	SYF2	82	89.447	Pan_troglodytes
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	ENSPANG00000008139	SYF2	82	88.442	Papio_anubis
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.422	ENSPKIG00000008130	syf2	85	84.422	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	91.457	ENSPSIG00000011816	SYF2	77	91.457	Pelodiscus_sinensis
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.910	ENSPMGG00000008755	syf2	78	81.910	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.940	ENSPEMG00000008283	Syf2	82	87.940	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	91.457	ENSPCIG00000014235	SYF2	80	91.457	Phascolarctos_cinereus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.910	ENSPFOG00000004116	syf2	82	81.910	Poecilia_formosa
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.910	ENSPLAG00000006691	syf2	85	81.910	Poecilia_latipinna
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	78.392	ENSPMEG00000011684	syf2	85	78.392	Poecilia_mexicana
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.910	ENSPREG00000003009	syf2	84	81.910	Poecilia_reticulata
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	ENSPPYG00000001713	SYF2	82	89.447	Pongo_abelii
ENSMGAG00000002019	SYF2	80	72.956	ENSPCOG00000027011	SYF2	73	73.077	Propithecus_coquereli
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	77.889	ENSPVAG00000005841	SYF2	81	77.889	Pteropus_vampyrus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.915	ENSPNYG00000004979	syf2	84	82.915	Pundamilia_nyererei
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.422	ENSPNAG00000015570	syf2	84	84.422	Pygocentrus_nattereri
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.940	ENSRNOG00000060597	Syf2	82	87.940	Rattus_norvegicus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	85.427	ENSRBIG00000042970	SYF2	82	85.427	Rhinopithecus_bieti
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	ENSRROG00000001347	SYF2	82	88.442	Rhinopithecus_roxellana
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	ENSSBOG00000020184	SYF2	82	88.945	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	90.452	ENSSHAG00000015630	-	80	90.452	Sarcophilus_harrisii
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	91.457	ENSSHAG00000007152	-	97	91.457	Sarcophilus_harrisii
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.412	ENSSFOG00015023647	syf2	84	82.412	Scleropages_formosus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.407	ENSSMAG00000009867	syf2	84	81.407	Scophthalmus_maximus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	83.920	ENSSDUG00000013072	syf2	84	83.920	Seriola_dumerili
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	83.920	ENSSLDG00000012677	syf2	84	83.920	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMGAG00000002019	SYF2	79	86.624	ENSSARG00000012889	SYF2	64	86.538	Sorex_araneus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	ENSSPUG00000005251	SYF2	79	89.447	Sphenodon_punctatus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.915	ENSSPAG00000009626	syf2	84	82.915	Stegastes_partitus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	ENSSSCG00000037481	SYF2	81	88.945	Sus_scrofa
ENSMGAG00000002019	SYF2	55	82.727	ENSTGUG00000001126	SYF2	51	89.109	Taeniopygia_guttata
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.407	ENSTRUG00000001499	syf2	80	81.407	Takifugu_rubripes
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	80.402	ENSTNIG00000016912	syf2	89	80.402	Tetraodon_nigroviridis
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	63.317	ENSTBEG00000017370	SYF2	78	62.814	Tupaia_belangeri
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	ENSTTRG00000003550	SYF2	82	88.945	Tursiops_truncatus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.437	ENSUAMG00000002897	SYF2	81	87.437	Ursus_americanus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.437	ENSUMAG00000013108	SYF2	81	87.437	Ursus_maritimus
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	ENSVPAG00000005705	SYF2	82	88.442	Vicugna_pacos
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.940	ENSVVUG00000027175	-	81	87.940	Vulpes_vulpes
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.940	ENSVVUG00000027181	-	80	87.940	Vulpes_vulpes
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	86.935	ENSXETG00000022797	syf2	80	86.935	Xenopus_tropicalis
ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.910	ENSXMAG00000022698	syf2	84	81.910	Xiphophorus_maculatus