EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMGAG00000003822 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Meleagris_gallopavo
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14480 bases
Position: chr25:4047285-4061764
Accession: 3262
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMGAP00000003584	PAZ	PF02170.22	5.6e-29	1	1
ENSMGAP00000003584	Piwi	PF02171.17	8e-108	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMGAT00000004288	AGO1-201	2589	-	ENSMGAP00000003584	862 (aa)	-	G1MXK4

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMGAG00000003822	AGO1	98	80.047	ENSMGAG00000003773	AGO3	99	80.047
ENSMGAG00000003822	AGO1	98	78.935	ENSMGAG00000012942	AGO2	99	78.638
ENSMGAG00000003822	AGO1	98	78.862	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	78.862

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSG00000092847	AGO1	100	94.043	Homo_sapiens
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.603	ENSAPOG00000024299	ago1	99	90.603	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSAMEG00000000504	AGO1	99	94.296	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMGAG00000003822	AGO1	81	87.896	ENSACIG00000005298	ago1	96	87.896	Amphilophus_citrinellus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.603	ENSAOCG00000017727	ago1	99	90.603	Amphiprion_ocellaris
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	91.101	ENSAPEG00000004458	ago1	99	91.101	Amphiprion_percula
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.603	ENSATEG00000008523	ago1	99	90.603	Anabas_testudineus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	88.515	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	88.515	Anas_platyrhynchos
ENSMGAG00000003822	AGO1	92	94.170	ENSACAG00000029174	AGO1	100	94.170	Anolis_carolinensis
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSANAG00000037711	AGO1	99	94.393	Aotus_nancymaae
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.371	ENSACLG00000000890	ago1	99	90.371	Astatotilapia_calliptera
ENSMGAG00000003822	AGO1	80	92.641	ENSAMXG00000001917	ago1	98	92.641	Astyanax_mexicanus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.366	ENSBTAG00000012253	AGO1	99	94.179	Bos_taurus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSCJAG00000032023	AGO1	99	94.393	Callithrix_jacchus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSCAFG00000003443	AGO1	99	94.296	Canis_familiaris
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	93.772	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.054	Canis_lupus_dingo
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	93.612	ENSCHIG00000011848	-	99	93.403	Capra_hircus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSTSYG00000009767	-	99	94.399	Carlito_syrichta
ENSMGAG00000003822	AGO1	98	75.296	ENSTSYG00000032426	-	99	75.296	Carlito_syrichta
ENSMGAG00000003822	AGO1	90	85.685	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	84.774	Cavia_aperea
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSCPOG00000011568	AGO1	99	94.296	Cavia_porcellus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSCCAG00000011823	AGO1	99	94.296	Cebus_capucinus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.393	ENSCATG00000031521	AGO1	100	94.043	Cercocebus_atys
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSCLAG00000011507	AGO1	99	94.399	Chinchilla_lanigera
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSCSAG00000001091	AGO1	99	94.296	Chlorocebus_sabaeus
ENSMGAG00000003822	AGO1	86	93.130	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	93.130	Choloepus_hoffmanni
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.296	ENSCPBG00000018594	AGO1	99	94.296	Chrysemys_picta_bellii
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSCANG00000039798	AGO1	99	94.296	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.509	ENSCGRG00001022708	Ago1	99	94.509	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.509	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	94.503	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	89.516	ENSCSEG00000001051	ago1	99	89.516	Cynoglossus_semilaevis
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.405	ENSCVAG00000018173	ago1	100	90.405	Cyprinodon_variegatus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.941	ENSDARG00000092644	ago1	99	90.941	Danio_rerio
ENSMGAG00000003822	AGO1	92	94.043	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	94.043	Dasypus_novemcinctus
ENSMGAG00000003822	AGO1	91	98.095	ENSDORG00000008494	Ago1	99	98.095	Dipodomys_ordii
ENSMGAG00000003822	AGO1	84	86.685	ENSETEG00000007626	AGO1	99	86.685	Echinops_telfairi
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.509	ENSEASG00005012086	AGO1	99	94.296	Equus_asinus_asinus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSECAG00000024353	AGO1	99	94.296	Equus_caballus
ENSMGAG00000003822	AGO1	92	85.768	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	85.768	Erinaceus_europaeus
ENSMGAG00000003822	AGO1	92	91.128	ENSELUG00000016803	ago1	100	91.128	Esox_lucius
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSFCAG00000000746	AGO1	99	94.296	Felis_catus
ENSMGAG00000003822	AGO1	92	86.726	ENSFALG00000000790	AGO1	100	86.726	Ficedula_albicollis
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.393	ENSFDAG00000017210	AGO1	99	94.393	Fukomys_damarensis
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	87.237	ENSFHEG00000017927	ago1	99	87.237	Fundulus_heteroclitus
ENSMGAG00000003822	AGO1	80	96.997	ENSGMOG00000019413	ago1	92	96.997	Gadus_morhua
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.601	ENSGALG00000002249	AGO1	99	94.412	Gallus_gallus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.719	ENSGAFG00000009775	ago1	99	90.719	Gambusia_affinis
ENSMGAG00000003822	AGO1	88	91.029	ENSGACG00000012443	ago1	100	91.029	Gasterosteus_aculeatus
ENSMGAG00000003822	AGO1	92	94.170	ENSGAGG00000012893	-	100	94.170	Gopherus_agassizii
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSGGOG00000003316	AGO1	99	94.393	Gorilla_gorilla
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.371	ENSHBUG00000010459	ago1	99	90.371	Haplochromis_burtoni
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSHGLG00000011540	AGO1	99	94.296	Heterocephalus_glaber_female
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSHGLG00100005568	AGO1	99	94.296	Heterocephalus_glaber_male
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	91.101	ENSHCOG00000005708	ago1	99	91.101	Hippocampus_comes
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.603	ENSIPUG00000023216	ago1	99	90.603	Ictalurus_punctatus
ENSMGAG00000003822	AGO1	100	93.968	ENSSTOG00000010857	AGO1	99	94.296	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.282	ENSJJAG00000019449	Ago1	99	94.282	Jaculus_jaculus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.603	ENSKMAG00000019464	ago1	99	90.603	Kryptolebias_marmoratus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.719	ENSLBEG00000007694	ago1	99	90.719	Labrus_bergylta
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	88.837	ENSLACG00000017009	AGO1	99	88.837	Latimeria_chalumnae
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	88.889	ENSLOCG00000000504	AGO1	99	88.889	Lepisosteus_oculatus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.509	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	94.509	Loxodonta_africana
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSMFAG00000002846	AGO1	99	94.296	Macaca_fascicularis
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	89.836	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	89.765	Macaca_mulatta
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	91.005	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	94.043	Macaca_nemestrina
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSMLEG00000038388	AGO1	99	94.296	Mandrillus_leucophaeus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.603	ENSMAMG00000008381	ago1	99	90.603	Mastacembelus_armatus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.371	ENSMZEG00005007996	ago1	99	90.371	Maylandia_zebra
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSMAUG00000015189	Ago1	99	94.296	Mesocricetus_auratus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSMICG00000016147	AGO1	99	94.393	Microcebus_murinus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.366	ENSMOCG00000000537	Ago1	99	94.179	Microtus_ochrogaster
ENSMGAG00000003822	AGO1	79	91.533	ENSMMOG00000018459	ago1	94	91.533	Mola_mola
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.179	ENSMODG00000023335	AGO1	99	94.179	Monodelphis_domestica
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.984	ENSMALG00000011057	ago1	99	91.006	Monopterus_albus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	99	94.296	Mus_caroli
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSMUSG00000041530	Ago1	99	94.296	Mus_musculus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	99	94.296	Mus_pahari
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	99	94.296	Mus_spretus
ENSMGAG00000003822	AGO1	84	93.655	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	93.655	Mustela_putorius_furo
ENSMGAG00000003822	AGO1	57	96.945	ENSMLUG00000009628	AGO1	93	96.945	Myotis_lucifugus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.379	ENSNGAG00000017448	Ago1	99	94.379	Nannospalax_galili
ENSMGAG00000003822	AGO1	92	91.128	ENSNBRG00000010867	ago1	100	91.128	Neolamprologus_brichardi
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.179	ENSNLEG00000011181	AGO1	99	94.179	Nomascus_leucogenys
ENSMGAG00000003822	AGO1	84	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSMGAG00000003822	AGO1	92	99.396	ENSOPRG00000012325	AGO1	92	99.396	Ochotona_princeps
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSODEG00000005321	AGO1	99	94.296	Octodon_degus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.867	ENSONIG00000016345	ago1	99	90.867	Oreochromis_niloticus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	85.616	ENSOANG00000002080	AGO1	99	86.543	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.366	ENSOCUG00000023116	AGO1	99	94.179	Oryctolagus_cuniculus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.603	ENSORLG00000014965	ago1	99	90.603	Oryzias_latipes
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.603	ENSORLG00020018253	ago1	99	90.603	Oryzias_latipes_hni
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.603	ENSORLG00015003287	ago1	99	90.603	Oryzias_latipes_hsok
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.603	ENSOMEG00000020528	ago1	99	90.603	Oryzias_melastigma
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.509	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	94.509	Otolemur_garnettii
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.366	ENSOARG00000019591	AGO1	99	94.179	Ovis_aries
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSPPAG00000034838	AGO1	99	94.393	Pan_paniscus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSPPRG00000006475	AGO1	99	94.296	Panthera_pardus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.249	ENSPTIG00000020991	AGO1	99	94.063	Panthera_tigris_altaica
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSPTRG00000000528	AGO1	99	94.393	Pan_troglodytes
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSPANG00000009060	AGO1	99	94.296	Papio_anubis
ENSMGAG00000003822	AGO1	98	94.215	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	94.215	Pelodiscus_sinensis
ENSMGAG00000003822	AGO1	81	91.026	ENSPMGG00000024099	ago1	99	91.026	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSPEMG00000023313	Ago1	99	94.406	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.179	ENSPCIG00000000172	AGO1	99	94.179	Phascolarctos_cinereus
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.719	ENSPFOG00000005867	ago1	99	90.719	Poecilia_formosa
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.719	ENSPLAG00000002824	ago1	99	92.785	Poecilia_latipinna
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.719	ENSPMEG00000001787	ago1	99	92.785	Poecilia_mexicana
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.719	ENSPREG00000006534	ago1	99	90.719	Poecilia_reticulata
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSPPYG00000001551	AGO1	99	94.296	Pongo_abelii
ENSMGAG00000003822	AGO1	55	100.000	ENSPCAG00000005604	AGO1	62	100.000	Procavia_capensis
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSPCOG00000022061	AGO1	100	94.043	Propithecus_coquereli
ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	ENSPVAG00000005082	AGO1	99	94.296	Pteropus_vampyrus
ENSMGAG00000003822	AGO1	92	86.346	ENSPNYG00000012586	ago1	100	86.346	Pundamilia_nyererei
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ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.366	ENSRNOG00000055915	Ago1	99	94.179	Rattus_norvegicus
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