EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMGAG00000010083 (Gene tree)
Gene ID: 100549751
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Meleagris_gallopavo
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14812 bases
Position: chr29:329319-344130
Accession: 100549751
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMGAP00000010466	GTP_EFTU	PF00009.27	5.9e-46	1	1
ENSMGAP00000010466	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	9.2e-13	1	1
ENSMGAP00000010466	EFG_IV	PF03764.18	9.4e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMGAT00000011324	EFTUD2-201	3368	XM_003212998	ENSMGAP00000010466	975 (aa)	XP_003213046	G1NCI7

Gene Model

Click here to download ENSMGAG00000010083's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
mgp03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMGAG00000010083's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	86	38.593	ENSMGAG00000011170	EEF2	99	38.593

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.786	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.581	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.152	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	98.152	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	88.193	ENSACIG00000009096	eftud2	100	87.988	Amphilophus_citrinellus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	87	87.793	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	87.793	Amphiprion_ocellaris
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.786	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	91.581	Amphiprion_percula
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	92.094	ENSATEG00000000457	eftud2	100	91.889	Anabas_testudineus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	95.683	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	95.683	Anas_platyrhynchos
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.255	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	98.255	Anolis_carolinensis
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.049	Aotus_nancymaae
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.684	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.478	Astatotilapia_calliptera
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	90.909	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	90.705	Astyanax_mexicanus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	100	97.846	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	97.947	Bos_taurus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	70.000	WBGene00001166	eftu-2	99	70.206	Caenorhabditis_elegans
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.049	Callithrix_jacchus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.152	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	98.152	Canis_familiaris
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.152	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	98.152	Canis_lupus_dingo
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.947	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	97.947	Capra_hircus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.639	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	97.639	Carlito_syrichta
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.331	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	97.331	Cavia_aperea
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.331	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	97.331	Cavia_porcellus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	98.049	Cebus_capucinus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.049	Cercocebus_atys
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.228	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	97.228	Chinchilla_lanigera
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.049	Chlorocebus_sabaeus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	91	85.618	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	85.618	Choloepus_hoffmanni
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.665	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.665	Chrysemys_picta_bellii
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	77.380	ENSCING00000009372	-	100	77.380	Ciona_intestinalis
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	78.557	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.647	Ciona_savignyi
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	98.049	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.639	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	97.639	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.639	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	97.639	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.273	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.068	Cynoglossus_semilaevis
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	92.094	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.786	Cyprinodon_variegatus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	90.462	ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.462	Danio_rerio
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.536	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	97.536	Dasypus_novemcinctus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.741	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	97.741	Dipodomys_ordii
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	75.230	FBgn0039566	CG4849	100	75.026	Drosophila_melanogaster
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	92	98.913	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	Echinops_telfairi
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	74	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	86.824	Eptatretus_burgeri
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.152	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	98.152	Equus_asinus_asinus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	98.049	Equus_caballus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	90.760	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.657	Esox_lucius
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	98.049	Felis_catus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	99.281	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	99.281	Ficedula_albicollis
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.741	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	97.741	Fukomys_damarensis
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.992	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	91.684	Fundulus_heteroclitus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	90.657	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.068	Gadus_morhua
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	99.589	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	99.677	Gallus_gallus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.889	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.684	Gambusia_affinis
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.376	ENSGACG00000009163	eftud2	100	90.965	Gasterosteus_aculeatus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	98.049	Gorilla_gorilla
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.581	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.376	Haplochromis_burtoni
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.433	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	97.433	Heterocephalus_glaber_female
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.433	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	97.433	Heterocephalus_glaber_male
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	90.760	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.760	Hippocampus_comes
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	90.760	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.376	Ictalurus_punctatus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	92.402	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	95.856	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	96	97.974	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	97.974	Jaculus_jaculus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.684	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.273	Kryptolebias_marmoratus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	95	91.389	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.371	Labrus_bergylta
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	94.045	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.564	Latimeria_chalumnae
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	100	91.709	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	91.889	Lepisosteus_oculatus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.536	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	97.536	Loxodonta_africana
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	98.049	Macaca_fascicularis
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	98.049	Macaca_nemestrina
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	98.049	Mandrillus_leucophaeus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	92.300	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.094	Mastacembelus_armatus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.684	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.478	Maylandia_zebra
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.639	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	97.639	Mesocricetus_auratus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	98.049	Microcebus_murinus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.741	ENSMOCG00000009039	-	100	97.741	Microtus_ochrogaster
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	91	80.269	ENSMOCG00000017653	-	90	80.269	Microtus_ochrogaster
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	87	93.545	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.545	Mola_mola
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.152	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.152	Monodelphis_domestica
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	87	91.901	ENSMALG00000014501	eftud2	100	91.901	Monopterus_albus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.433	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	97.433	Mus_caroli
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.433	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	97.433	Mus_musculus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.433	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	97.433	Mus_pahari
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.433	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	97.433	Mus_spretus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	97	97.886	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	97.886	Mustela_putorius_furo
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.152	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	98.152	Myotis_lucifugus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.844	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	97.844	Nannospalax_galili
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.581	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.376	Neolamprologus_brichardi
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	97	96.182	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	96.182	Nomascus_leucogenys
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	94.353	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	94.353	Notamacropus_eugenii
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	89.733	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	89.733	Ochotona_princeps
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	93	78.797	ENSODEG00000003385	-	100	78.797	Octodon_degus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	96.920	ENSODEG00000018041	-	100	96.920	Octodon_degus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.684	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.478	Oreochromis_niloticus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.947	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	97.947	Oryctolagus_cuniculus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.273	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.273	Oryzias_latipes
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.170	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.170	Oryzias_latipes_hni
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.170	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.152	Oryzias_latipes_hsok
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	95.791	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	95.791	Otolemur_garnettii
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	100	97.846	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	97.846	Ovis_aries
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	98.049	Pan_paniscus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.152	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	98.152	Panthera_pardus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.152	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	98.152	Panthera_tigris_altaica
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	98.049	Pan_troglodytes
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	98.049	Papio_anubis
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	93	97.580	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.580	Pelodiscus_sinensis
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	84.292	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.086	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.639	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	97.639	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	98.049	Phascolarctos_cinereus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.889	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.684	Poecilia_formosa
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.889	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.684	Poecilia_latipinna
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.889	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.684	Poecilia_mexicana
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	96.612	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	96.612	Pongo_abelii
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	93.840	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	93.840	Procavia_capensis
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.049	Propithecus_coquereli
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	93.634	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	93.634	Pteropus_vampyrus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.581	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.376	Pundamilia_nyererei
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.170	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	91.889	Pygocentrus_nattereri
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.536	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	97.536	Rattus_norvegicus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.947	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	97.947	Rhinopithecus_bieti
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.947	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	97.947	Rhinopithecus_roxellana
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	97	34.024	YKL173W	SNU114	97	33.728	Saccharomyces_cerevisiae
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.049	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	96	98.191	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.191	Sarcophilus_harrisii
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.273	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.170	Scleropages_formosus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.478	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.273	Scophthalmus_maximus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.786	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.581	Seriola_dumerili
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.889	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	91.684	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	89.425	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	89.425	Sorex_araneus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.844	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.844	Sphenodon_punctatus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.889	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	91.684	Stegastes_partitus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.947	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	97.947	Sus_scrofa
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	84	99.270	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	99.270	Taeniopygia_guttata
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	90.965	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.760	Takifugu_rubripes
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	86.503	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.299	Tetraodon_nigroviridis
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	92.505	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	92.505	Tupaia_belangeri
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	89.425	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	89.425	Tursiops_truncatus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.029	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	97.029	Ursus_americanus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.152	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	98.152	Ursus_maritimus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.152	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	98.152	Vulpes_vulpes
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	96	95.000	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.983	Xenopus_tropicalis
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	81	93.384	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.384	Xiphophorus_couchianus
ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.889	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.684	Xiphophorus_maculatus