EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMGAG00000017190 (Gene tree)
Gene ID: 100540333
Gene Symbol: APOBEC4
Alias: C1orf169|FLJ25691|MGC26594|RP1-127C7.4
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide like 4
Gene Type: protein_coding
Species: Meleagris_gallopavo
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1005 bases
Position: chr10:2876057-2877061
Accession: 32152
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMGAP00000019732	APOBEC_N	PF08210.11	2.6e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMGAT00000020476	APOBEC4-201	1005	-	ENSMGAP00000019732	334 (aa)	-	G3UV61

Gene Model

Click here to download ENSMGAG00000017190's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMGAG00000017190's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	49.074	ENSG00000173627	APOBEC4	93	47.661	Homo_sapiens
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	99	47.674	ENSAMEG00000002503	APOBEC4	90	48.127	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	99	48.657	ENSACAG00000015192	APOBEC4	95	48.657	Anolis_carolinensis
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	99	46.802	ENSBTAG00000047395	APOBEC4	93	46.802	Bos_taurus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	48.780	ENSCJAG00000040026	APOBEC4	88	48.780	Callithrix_jacchus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	75	54.800	ENSCAFG00000013349	APOBEC4	88	48.318	Canis_familiaris
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	75	54.800	ENSCAFG00020015526	APOBEC4	88	48.318	Canis_lupus_dingo
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	99	47.522	ENSCHIG00000011987	APOBEC4	89	48.105	Capra_hircus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	100	47.059	ENSCSAG00000000243	APOBEC4	92	47.059	Chlorocebus_sabaeus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	48.457	ENSCHOG00000012387	APOBEC4	88	48.457	Choloepus_hoffmanni
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	99	58.859	ENSCPBG00000015714	APOBEC4	90	58.859	Chrysemys_picta_bellii
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	47.335	ENSCGRG00001004553	Apobec4	90	47.335	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	48.171	ENSDNOG00000044664	APOBEC4	88	48.171	Dasypus_novemcinctus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	94	45.625	ENSDORG00000007335	Apobec4	89	45.625	Dipodomys_ordii
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	99	48.837	ENSEASG00005006513	APOBEC4	93	48.837	Equus_asinus_asinus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	50.617	ENSECAG00000019734	APOBEC4	87	50.617	Equus_caballus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	99	48.138	ENSFCAG00000010909	APOBEC4	93	48.711	Felis_catus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	84	52.281	ENSFDAG00000018185	APOBEC4	88	52.281	Fukomys_damarensis
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	100	87.425	ENSGALG00000053078	APOBEC4	98	87.425	Gallus_gallus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	49.383	ENSGGOG00000042217	APOBEC4	88	49.383	Gorilla_gorilla
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	46.729	ENSLACG00000014504	APOBEC4	87	46.729	Latimeria_chalumnae
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	64	36.620	ENSLOCG00000010326	-	79	36.620	Lepisosteus_oculatus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	100	46.471	ENSMMUG00000031303	APOBEC4	92	46.471	Macaca_mulatta
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	94	47.516	MGP_CAROLIEiJ_G0014701	Apobec4	84	47.516	Mus_caroli
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	94	46.417	ENSMUSG00000055547	Apobec4	84	46.417	Mus_musculus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	94	48.125	MGP_PahariEiJ_G0027937	Apobec4	84	48.125	Mus_pahari
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	94	45.171	MGP_SPRETEiJ_G0015508	Apobec4	83	45.171	Mus_spretus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	98	49.701	ENSMPUG00000011756	APOBEC4	88	49.398	Mustela_putorius_furo
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	99	45.821	ENSMLUG00000002458	APOBEC4	92	46.765	Myotis_lucifugus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	39.937	ENSNGAG00000017599	Apobec4	86	39.937	Nannospalax_galili
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	48.457	ENSNLEG00000035610	APOBEC4	88	48.624	Nomascus_leucogenys
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	96	46.933	ENSODEG00000009778	APOBEC4	92	47.059	Octodon_degus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	98	48.503	ENSOANG00000001000	APOBEC4	90	48.503	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	50.309	ENSOGAG00000003118	APOBEC4	87	50.769	Otolemur_garnettii
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	99	46.647	ENSOARG00000005287	APOBEC4	93	46.647	Ovis_aries
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	48.607	ENSPPAG00000038272	APOBEC4	88	48.607	Pan_paniscus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	99	47.564	ENSPPRG00000014706	APOBEC4	93	48.138	Panthera_pardus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	99	47.278	ENSPTIG00000005518	APOBEC4	93	47.851	Panthera_tigris_altaica
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	48.624	ENSPTRG00000047181	APOBEC4	88	48.624	Pan_troglodytes
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	47.484	ENSPEMG00000019164	Apobec4	87	47.484	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	63	33.906	ENSPMAG00000006156	APOBEC4	63	33.906	Petromyzon_marinus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	99	49.412	ENSPCIG00000003817	APOBEC4	90	49.704	Phascolarctos_cinereus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	48.765	ENSPPYG00000000424	APOBEC4	88	48.930	Pongo_abelii
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	96	38.415	ENSPCAG00000015174	APOBEC4	88	38.415	Procavia_capensis
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	50.456	ENSPVAG00000001100	APOBEC4	88	51.064	Pteropus_vampyrus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	94	47.205	ENSRNOG00000028089	Apobec4	80	47.205	Rattus_norvegicus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	98	48.810	ENSSHAG00000013804	APOBEC4	90	48.810	Sarcophilus_harrisii
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	96	55.000	ENSSPUG00000010884	APOBEC4	86	55.000	Sphenodon_punctatus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	50.309	ENSSSCG00000015561	APOBEC4	88	50.309	Sus_scrofa
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	97	48.955	ENSTBEG00000006476	APOBEC4	90	48.955	Tupaia_belangeri
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	48.923	ENSTTRG00000014784	APOBEC4	88	48.923	Tursiops_truncatus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	99	47.384	ENSUAMG00000005088	APOBEC4	93	47.839	Ursus_americanus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	99	47.093	ENSUMAG00000016285	APOBEC4	93	47.093	Ursus_maritimus
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	75	54.800	ENSVVUG00000009054	APOBEC4	88	48.318	Vulpes_vulpes
ENSMGAG00000017190	APOBEC4	96	45.171	ENSXETG00000017441	apobec4	85	45.171	Xenopus_tropicalis