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Description

Ensembl ID: ENSMICG00000008468 (Gene tree)
Gene ID: 105881961
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Microcebus_murinus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 64325 bases
Position: chr12:8440363-8504687
Accession: 105881961
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMICP00000007714	IBN_N	PF03810.19	7.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMICT00000048881	TNPO1-203	6412	-	ENSMICP00000036172	219 (aa)	-	UPI00006DDC7D
ENSMICT00000008472	TNPO1-201	2586	XM_020290221	ENSMICP00000007714	861 (aa)	XP_020145810	UPI00085B2EAA
ENSMICT00000038604	TNPO1-202	2415	-	ENSMICP00000024205	804 (aa)	-	UPI000C2ED593

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	82.525	ENSMICG00000016153	TNPO2	99	82.525

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	90.112	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	90.112	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.006	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	95.006	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMICG00000008468	TNPO1	86	88.760	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	88.760	Amphilophus_citrinellus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	90.225	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	90.225	Amphiprion_ocellaris
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	90.225	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	90.225	Amphiprion_percula
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.775	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	89.775	Anabas_testudineus
ENSMICG00000008468	TNPO1	98	88.726	ENSAPLG00000009619	-	97	89.655	Anas_platyrhynchos
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	92.809	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.809	Anolis_carolinensis
ENSMICG00000008468	TNPO1	100	61.641	ENSANAG00000027118	-	100	61.752	Aotus_nancymaae
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	84.658	ENSANAG00000025351	-	99	84.658	Aotus_nancymaae
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.409	ENSANAG00000022453	-	99	95.409	Aotus_nancymaae
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	87.978	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	87.978	Astatotilapia_calliptera
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	88.901	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	88.565	Astyanax_mexicanus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.633	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	95.633	Bos_taurus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.521	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	95.521	Callithrix_jacchus
ENSMICG00000008468	TNPO1	95	95.449	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	95.449	Canis_familiaris
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	92.697	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	92.697	Canis_lupus_dingo
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.521	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	95.521	Capra_hircus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	91.751	ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	91.041	Carlito_syrichta
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.955	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	95.955	Cebus_capucinus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	95.843	Cercocebus_atys
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.521	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	95.506	Chinchilla_lanigera
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.745	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	95.745	Chlorocebus_sabaeus
ENSMICG00000008468	TNPO1	94	82.660	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	82.660	Choloepus_hoffmanni
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	93.715	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.715	Chrysemys_picta_bellii
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	72.503	ENSCSAVG00000010981	-	99	73.660	Ciona_savignyi
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	95.857	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.521	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	95.521	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMICG00000008468	TNPO1	95	95.322	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	95.322	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	88.427	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	88.427	Cynoglossus_semilaevis
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.663	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	89.663	Cyprinodon_variegatus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	88.777	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	88.440	Danio_rerio
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.509	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	89.509	Dasypus_novemcinctus
ENSMICG00000008468	TNPO1	93	95.301	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	95.296	Dipodomys_ordii
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	55.192	FBgn0035693	CG8219	99	54.740	Drosophila_melanogaster
ENSMICG00000008468	TNPO1	76	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	76	99.625	Echinops_telfairi
ENSMICG00000008468	TNPO1	94	80.952	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	81.071	Eptatretus_burgeri
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	95.843	Equus_asinus_asinus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	96.047	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	96.047	Equus_caballus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	82.789	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	82.353	Esox_lucius
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	95.843	Felis_catus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	93.371	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.371	Ficedula_albicollis
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.633	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	95.633	Fukomys_damarensis
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	90.011	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	90.011	Fundulus_heteroclitus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	86.384	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	86.384	Gadus_morhua
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	92.921	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.921	Gallus_gallus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	88.901	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	88.901	Gambusia_affinis
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.250	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	89.250	Gasterosteus_aculeatus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	93.483	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.483	Gopherus_agassizii
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	81.922	ENSGGOG00000022535	-	99	81.922	Gorilla_gorilla
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	95.843	Gorilla_gorilla
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.551	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	89.551	Haplochromis_burtoni
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.297	ENSHGLG00000000970	-	99	95.297	Heterocephalus_glaber_female
ENSMICG00000008468	TNPO1	96	74.070	ENSHGLG00100000963	-	99	73.488	Heterocephalus_glaber_male
ENSMICG00000008468	TNPO1	96	94.977	ENSHGLG00100017090	-	99	94.977	Heterocephalus_glaber_male
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	95.857	Jaculus_jaculus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.888	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	89.888	Kryptolebias_marmoratus
ENSMICG00000008468	TNPO1	90	86.067	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	86.067	Labrus_bergylta
ENSMICG00000008468	TNPO1	96	85.581	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	85.581	Latimeria_chalumnae
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	91.489	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	91.489	Lepisosteus_oculatus
ENSMICG00000008468	TNPO1	97	94.919	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	94.919	Loxodonta_africana
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	95.857	Macaca_fascicularis
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.745	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	95.745	Macaca_mulatta
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	95.857	Macaca_nemestrina
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	95.857	Mandrillus_leucophaeus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.775	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	89.775	Mastacembelus_armatus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.326	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	89.326	Maylandia_zebra
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.521	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.521	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	95.521	Microtus_ochrogaster
ENSMICG00000008468	TNPO1	86	88.273	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	88.273	Mola_mola
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	97.872	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	Monodelphis_domestica
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	88.652	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	88.652	Monopterus_albus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.297	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.521	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.409	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.297	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	95.857	Mustela_putorius_furo
ENSMICG00000008468	TNPO1	95	94.994	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	94.994	Myotis_lucifugus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.521	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	95.521	Nannospalax_galili
ENSMICG00000008468	TNPO1	86	88.630	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	88.630	Neolamprologus_brichardi
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	95.843	Nomascus_leucogenys
ENSMICG00000008468	TNPO1	90	92.025	ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	92.025	Ochotona_princeps
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.297	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	95.297	Octodon_degus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	88.753	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	88.753	Oreochromis_niloticus
ENSMICG00000008468	TNPO1	91	93.659	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.659	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMICG00000008468	TNPO1	95	89.019	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	89.019	Oryctolagus_cuniculus
ENSMICG00000008468	TNPO1	86	88.586	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	88.586	Oryzias_latipes
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.402	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	89.402	Oryzias_latipes_hni
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.515	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	89.515	Oryzias_latipes_hsok
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.402	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	89.402	Oryzias_melastigma
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.745	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	95.745	Otolemur_garnettii
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.633	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	95.633	Ovis_aries
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	95.857	Pan_paniscus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	95.843	Panthera_pardus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	95.843	Panthera_tigris_altaica
ENSMICG00000008468	TNPO1	93	84.594	ENSPTRG00000047731	-	100	84.594	Pan_troglodytes
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	95.857	Pan_troglodytes
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	95.857	Papio_anubis
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	88.431	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	88.431	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	93.490	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.490	Pelodiscus_sinensis
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	87.093	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	87.093	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMICG00000008468	TNPO1	96	95.210	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	95.322	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	94.270	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.270	Phascolarctos_cinereus
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.586	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	89.586	Poecilia_formosa
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.586	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	89.586	Poecilia_latipinna
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.775	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	89.775	Poecilia_mexicana
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.686	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	89.686	Poecilia_reticulata
ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.745	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	95.745	Pongo_abelii
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ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.521	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	95.521	Pteropus_vampyrus
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ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.450	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	89.450	Xiphophorus_maculatus