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Description

Ensembl ID: ENSMICG00000012587 (Gene tree)
Gene ID: 105871537
Gene Symbol: RAB1A
Alias: RAB1|YPT1
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Microcebus_murinus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 32222 bases
Position: chr4:11636128-11668349
Accession: 105871537
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMICP00000032064	MMR_HSR1	PF01926.23	2e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMICT00000034607	RAB1A-202	522	-	ENSMICP00000021762	173 (aa)	-	UPI00005994D2
ENSMICT00000053963	RAB1A-201	1733	XM_012764941	ENSMICP00000032064	205 (aa)	XP_012620395	UPI0000001259
ENSMICT00000042615	RAB1A-203	426	-	ENSMICP00000031503	141 (aa)	-	UPI000002B216
ENSMICT00000032526	RAB1A-205	483	-	ENSMICP00000035861	160 (aa)	-	UPI00085B1C29
ENSMICT00000043614	RAB1A-204	390	-	ENSMICP00000021018	129 (aa)	-	UPI000002B217

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMICG00000012587	RAB1A	84	32.948	ENSMICG00000014037	RAB23	73	32.948
ENSMICG00000012587	RAB1A	83	43.017	ENSMICG00000029915	-	81	43.017
ENSMICG00000012587	RAB1A	76	39.623	ENSMICG00000041433	-	79	39.623
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	45.581	ENSMICG00000034065	-	99	45.581
ENSMICG00000012587	RAB1A	95	34.434	ENSMICG00000015683	RAB36	67	34.434
ENSMICG00000012587	RAB1A	80	38.323	ENSMICG00000038752	-	84	38.323
ENSMICG00000012587	RAB1A	57	31.933	ENSMICG00000044178	ARL4A	59	31.933
ENSMICG00000012587	RAB1A	86	30.601	ENSMICG00000049117	ARL14	92	30.601
ENSMICG00000012587	RAB1A	84	34.463	ENSMICG00000006472	HRAS	93	34.463
ENSMICG00000012587	RAB1A	83	43.429	ENSMICG00000034809	-	76	43.429
ENSMICG00000012587	RAB1A	80	50.909	ENSMICG00000013101	RAB15	78	50.909
ENSMICG00000012587	RAB1A	95	43.814	ENSMICG00000049130	RAB5A	90	43.814
ENSMICG00000012587	RAB1A	57	32.203	ENSMICG00000029477	-	61	32.203
ENSMICG00000012587	RAB1A	80	35.928	ENSMICG00000049226	MRAS	80	35.928
ENSMICG00000012587	RAB1A	88	55.249	ENSMICG00000010340	-	90	55.249
ENSMICG00000012587	RAB1A	57	34.746	ENSMICG00000038748	ARL8A	61	34.746
ENSMICG00000012587	RAB1A	86	43.820	ENSMICG00000044410	RAB39B	84	43.820
ENSMICG00000012587	RAB1A	76	39.623	ENSMICG00000003057	RAB9B	79	39.623
ENSMICG00000012587	RAB1A	85	52.299	ENSMICG00000041504	RAB11A	81	52.299
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	44.554	ENSMICG00000003350	RAB14	93	44.554
ENSMICG00000012587	RAB1A	80	37.805	ENSMICG00000001474	CASC1	86	37.805
ENSMICG00000012587	RAB1A	94	38.384	ENSMICG00000031565	RAB6A	94	38.384
ENSMICG00000012587	RAB1A	57	31.092	ENSMICG00000017503	ARL4C	58	31.092
ENSMICG00000012587	RAB1A	90	48.108	ENSMICG00000034540	RAB2A	99	45.238
ENSMICG00000012587	RAB1A	81	50.602	ENSMICG00000012002	RAB30	82	50.602
ENSMICG00000012587	RAB1A	57	33.058	ENSMICG00000038050	ARL2	61	33.058
ENSMICG00000012587	RAB1A	81	45.783	ENSMICG00000002230	RAB25	78	45.783
ENSMICG00000012587	RAB1A	79	37.423	ENSMICG00000036237	-	89	37.423
ENSMICG00000012587	RAB1A	79	30.233	ENSMICG00000000653	-	74	30.233
ENSMICG00000012587	RAB1A	75	30.380	ENSMICG00000027424	DNAJC27	89	30.380
ENSMICG00000012587	RAB1A	79	42.236	ENSMICG00000002882	RAB31	83	42.236
ENSMICG00000012587	RAB1A	94	36.410	ENSMICG00000049590	RAB6B	94	36.410
ENSMICG00000012587	RAB1A	95	43.590	ENSMICG00000041608	RAB5C	89	43.590
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	53.960	ENSMICG00000047356	RAB35	100	53.960
ENSMICG00000012587	RAB1A	82	49.704	ENSMICG00000030661	RAB12	71	49.704
ENSMICG00000012587	RAB1A	80	47.619	ENSMICG00000034851	RAB33A	71	47.619
ENSMICG00000012587	RAB1A	95	39.086	ENSMICG00000008382	-	97	39.086
ENSMICG00000012587	RAB1A	75	37.419	ENSMICG00000031301	-	65	37.419
ENSMICG00000012587	RAB1A	77	40.373	ENSMICG00000016913	RAB34	62	40.373
ENSMICG00000012587	RAB1A	87	33.514	ENSMICG00000006266	RERG	90	33.514
ENSMICG00000012587	RAB1A	95	43.299	ENSMICG00000011086	RAB5B	90	43.299
ENSMICG00000012587	RAB1A	88	46.703	ENSMICG00000017280	RAB18	93	46.667
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	93.069	ENSMICG00000029171	RAB1B	100	93.069
ENSMICG00000012587	RAB1A	70	35.172	ENSMICG00000033790	RHEB	91	35.172

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSG00000138069	RAB1A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	95.545	ENSAPOG00000008143	-	100	95.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSAMEG00000001127	RAB1A	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	95.545	ENSAOCG00000020606	-	100	95.545	Amphiprion_ocellaris
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	95.545	ENSAPEG00000022488	-	100	95.545	Amphiprion_percula
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSANAG00000020929	RAB1A	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	96.040	ENSACLG00000003326	-	100	96.040	Astatotilapia_calliptera
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	94.554	ENSAMXG00000034850	-	100	94.554	Astyanax_mexicanus
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	Bos_taurus
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00000003187	RAB1A	100	100.000	Canis_familiaris
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00020026971	RAB1A	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSMICG00000012587	RAB1A	96	100.000	ENSCHIG00000014060	RAB1A	96	100.000	Capra_hircus
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	98.049	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSCPOG00000015437	RAB1A	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSCATG00000030853	RAB1A	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	99.512	ENSCPBG00000013243	RAB1A	100	99.512	Chrysemys_picta_bellii
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	97.561	ENSCANG00000035916	RAB1A	100	97.561	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00001012691	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00000008456	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSDNOG00000018236	RAB1A	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSDORG00000028628	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	84.466	FBgn0285937	Rab1	100	84.466	Drosophila_melanogaster
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	100.000	ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	Echinops_telfairi
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSEASG00005007298	RAB1A	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSECAG00000009926	RAB1A	100	100.000	Equus_caballus
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	100.000	ENSEEUG00000011721	RAB1A	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	95.588	ENSELUG00000012166	RAB1A	96	95.588	Esox_lucius
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSFCAG00000002536	RAB1A	100	100.000	Felis_catus
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	97.537	ENSFALG00000013624	RAB1A	99	97.537	Ficedula_albicollis
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSFDAG00000019505	-	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	94.554	ENSFHEG00000014414	-	100	94.554	Fundulus_heteroclitus
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	99.512	ENSGALG00000031582	RAB1A	100	99.512	Gallus_gallus
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	94.554	ENSGAFG00000000918	-	100	94.554	Gambusia_affinis
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	99.512	ENSGAGG00000006802	RAB1A	100	99.512	Gopherus_agassizii
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSGGOG00000026603	RAB1A	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSHGLG00000013585	RAB1A	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	97.549	ENSHGLG00100007994	RAB1A	99	97.549	Heterocephalus_glaber_male
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSSTOG00000020693	-	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMICG00000012587	RAB1A	96	100.000	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSMICG00000012587	RAB1A	96	95.431	ENSKMAG00000014038	-	93	95.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	95.050	ENSLBEG00000028426	RAB1A	100	95.050	Labrus_bergylta
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	98.537	ENSLACG00000012869	RAB1A	100	98.537	Latimeria_chalumnae
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	Loxodonta_africana
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSMICG00000012587	RAB1A	96	100.000	ENSMMUG00000021721	RAB1A	91	100.000	Macaca_mulatta
ENSMICG00000012587	RAB1A	95	99.485	ENSMNEG00000028414	-	97	99.485	Macaca_nemestrina
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	96.040	ENSMZEG00005013959	-	100	96.040	Maylandia_zebra
ENSMICG00000012587	RAB1A	96	99.492	ENSMGAG00000004611	RAB1A	98	99.492	Meleagris_gallopavo
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	99.512	ENSMAUG00000012156	Rab1a	100	99.512	Mesocricetus_auratus
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	99.512	ENSMOCG00000017022	Rab1a	100	99.512	Microtus_ochrogaster
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	93.564	ENSMMOG00000018709	RAB1A	100	93.564	Mola_mola
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	99.512	ENSMODG00000003340	RAB1A	100	99.512	Monodelphis_domestica
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	100	100.000	Mus_caroli
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSMUSG00000020149	Rab1a	100	100.000	Mus_musculus
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	100	100.000	Mus_pahari
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	100	100.000	Mus_spretus
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSMPUG00000006139	RAB1A	82	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	Myotis_lucifugus
ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	ENSNGAG00000005838	Rab1a	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSMICG00000012587	RAB1A	99	96.040	ENSNBRG00000020492	-	100	96.040	Neolamprologus_brichardi
ENSMICG00000012587	RAB1A	96	100.000	ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	Ochotona_princeps
ENSMICG00000012587	RAB1A	94	100.000	ENSODEG00000011248	-	96	100.000	Octodon_degus
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ENSMICG00000012587	RAB1A	99	94.554	ENSXMAG00000015776	-	100	94.554	Xiphophorus_maculatus