EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMICG00000016191 (Gene tree)
Gene ID: 105863416
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Microcebus_murinus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11779 bases
Position: chr2:44702793-44714571
Accession: 105863416
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMICP00000014764	SYF2	PF08231.12	1.7e-55	1	1
ENSMICP00000041589	SYF2	PF08231.12	2.8e-55	1	1
ENSMICP00000048216	SYF2	PF08231.12	3.1e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMICT00000065635	SYF2-203	624	-	ENSMICP00000041589	207 (aa)	-	UPI000C2ED5EA
ENSMICT00000066654	SYF2-201	2849	XM_012750453	ENSMICP00000048216	199 (aa)	XP_012605907	UPI000C2EA2F1
ENSMICT00000016200	SYF2-202	537	-	ENSMICP00000014764	178 (aa)	-	UPI00085AEADB

Gene Model

Click here to download ENSMICG00000016191's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMICG00000016191's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.990	ENSG00000117614	SYF2	89	97.753	Homo_sapiens
ENSMICG00000016191	SYF2	100	84.925	ENSAPOG00000001174	syf2	84	84.925	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.482	ENSAMEG00000010115	-	82	96.482	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMICG00000016191	SYF2	98	95.385	ENSAMEG00000010134	-	100	95.385	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.412	ENSACIG00000023688	syf2	80	82.412	Amphilophus_citrinellus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	85.427	ENSAOCG00000022046	syf2	85	85.427	Amphiprion_ocellaris
ENSMICG00000016191	SYF2	91	84.066	ENSAOCG00000010912	syf2	57	84.066	Amphiprion_ocellaris
ENSMICG00000016191	SYF2	100	85.427	ENSAPEG00000018858	syf2	77	85.427	Amphiprion_percula
ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.920	ENSATEG00000007745	syf2	84	83.920	Anabas_testudineus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	89.447	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.447	Anas_platyrhynchos
ENSMICG00000016191	SYF2	100	86.432	ENSACAG00000013653	-	98	86.432	Anolis_carolinensis
ENSMICG00000016191	SYF2	89	74.375	ENSACAG00000026777	-	96	74.375	Anolis_carolinensis
ENSMICG00000016191	SYF2	100	98.492	ENSANAG00000032473	SYF2	88	98.305	Aotus_nancymaae
ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.412	ENSACLG00000019916	syf2	84	82.412	Astatotilapia_calliptera
ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.417	ENSAMXG00000004051	syf2	84	83.417	Astyanax_mexicanus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSBTAG00000001651	SYF2	84	97.487	Bos_taurus
ENSMICG00000016191	SYF2	99	51.759	WBGene00019402	syf-2	85	51.759	Caenorhabditis_elegans
ENSMICG00000016191	SYF2	100	98.492	ENSCJAG00000046570	SYF2	89	98.315	Callithrix_jacchus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.985	ENSCAFG00000012895	-	81	96.985	Canis_familiaris
ENSMICG00000016191	SYF2	100	92.462	ENSCAFG00000030331	-	87	92.462	Canis_familiaris
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.985	ENSCAFG00020021091	-	81	96.985	Canis_lupus_dingo
ENSMICG00000016191	SYF2	100	90.449	ENSCAFG00020021094	-	91	90.449	Canis_lupus_dingo
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSCHIG00000020874	SYF2	83	97.487	Capra_hircus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSTSYG00000005114	SYF2	89	96.629	Carlito_syrichta
ENSMICG00000016191	SYF2	99	97.475	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.475	Cavia_aperea
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSCPOG00000005326	SYF2	82	97.487	Cavia_porcellus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	98.492	ENSCCAG00000022459	SYF2	89	98.315	Cebus_capucinus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSCATG00000026917	SYF2	89	96.067	Cercocebus_atys
ENSMICG00000016191	SYF2	100	98.492	ENSCLAG00000008474	SYF2	82	98.492	Chinchilla_lanigera
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSCSAG00000000948	SYF2	82	97.487	Chlorocebus_sabaeus
ENSMICG00000016191	SYF2	65	89.922	ENSCHOG00000005273	-	79	89.922	Choloepus_hoffmanni
ENSMICG00000016191	SYF2	100	88.945	ENSCPBG00000025073	SYF2	80	88.945	Chrysemys_picta_bellii
ENSMICG00000016191	SYF2	100	54.229	ENSCING00000003017	-	84	53.731	Ciona_intestinalis
ENSMICG00000016191	SYF2	100	52.736	ENSCSAVG00000006627	-	92	52.736	Ciona_savignyi
ENSMICG00000016191	SYF2	100	81.407	ENSCANG00000037322	SYF2	86	78.652	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	95.980	ENSCGRG00001020733	Syf2	82	95.980	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMICG00000016191	SYF2	100	95.980	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMICG00000016191	SYF2	100	78.392	ENSCSEG00000000117	syf2	83	78.392	Cynoglossus_semilaevis
ENSMICG00000016191	SYF2	100	81.910	ENSCVAG00000019543	syf2	83	81.910	Cyprinodon_variegatus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.417	ENSDARG00000004706	syf2	84	83.417	Danio_rerio
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.482	ENSDNOG00000047605	SYF2	81	96.482	Dasypus_novemcinctus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	98.492	ENSDORG00000001274	Syf2	82	98.492	Dipodomys_ordii
ENSMICG00000016191	SYF2	99	59.500	FBgn0033556	CG12343	88	59.500	Drosophila_melanogaster
ENSMICG00000016191	SYF2	93	79.459	ENSETEG00000015729	SYF2	81	79.459	Echinops_telfairi
ENSMICG00000016191	SYF2	99	60.406	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.920	ENSEASG00005004232	-	82	83.920	Equus_asinus_asinus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.985	ENSEASG00005004224	-	81	96.985	Equus_asinus_asinus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.985	ENSECAG00000010440	-	83	96.985	Equus_caballus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.990	ENSECAG00000012023	-	81	97.990	Equus_caballus
ENSMICG00000016191	SYF2	69	84.058	ENSEEUG00000015084	SYF2	75	84.058	Erinaceus_europaeus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	86.432	ENSELUG00000003465	syf2	84	86.432	Esox_lucius
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.990	ENSFCAG00000010324	-	69	97.990	Felis_catus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.191	ENSFCAG00000043095	-	87	97.191	Felis_catus
ENSMICG00000016191	SYF2	99	86.364	ENSFALG00000000460	SYF2	80	86.364	Ficedula_albicollis
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.985	ENSFDAG00000008310	SYF2	82	96.985	Fukomys_damarensis
ENSMICG00000016191	SYF2	100	68.900	ENSFHEG00000007238	syf2	96	65.741	Fundulus_heteroclitus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	84.422	ENSGMOG00000019138	syf2	89	84.422	Gadus_morhua
ENSMICG00000016191	SYF2	100	89.447	ENSGALG00000013639	SYF2	79	89.447	Gallus_gallus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	80.402	ENSGAFG00000019435	syf2	84	80.402	Gambusia_affinis
ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.417	ENSGACG00000007305	syf2	83	83.417	Gasterosteus_aculeatus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	89.447	ENSGAGG00000010670	SYF2	80	89.447	Gopherus_agassizii
ENSMICG00000016191	SYF2	100	98.492	ENSGGOG00000012796	SYF2	89	97.753	Gorilla_gorilla
ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.412	ENSHBUG00000020477	syf2	85	82.412	Haplochromis_burtoni
ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.417	ENSHGLG00000004304	-	91	79.412	Heterocephalus_glaber_female
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSHGLG00000014393	SYF2	82	97.487	Heterocephalus_glaber_female
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSHGLG00100014722	SYF2	82	97.487	Heterocephalus_glaber_male
ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.920	ENSHCOG00000012904	syf2	65	83.920	Hippocampus_comes
ENSMICG00000016191	SYF2	100	84.422	ENSIPUG00000019859	syf2	84	84.422	Ictalurus_punctatus
ENSMICG00000016191	SYF2	73	95.890	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	Jaculus_jaculus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	81.910	ENSKMAG00000013856	syf2	84	81.910	Kryptolebias_marmoratus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.920	ENSLBEG00000014425	syf2	84	83.920	Labrus_bergylta
ENSMICG00000016191	SYF2	100	85.930	ENSLACG00000012064	SYF2	84	85.930	Latimeria_chalumnae
ENSMICG00000016191	SYF2	100	85.427	ENSLOCG00000002728	syf2	79	85.427	Lepisosteus_oculatus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.985	ENSLAFG00000023150	-	81	96.985	Loxodonta_africana
ENSMICG00000016191	SYF2	86	64.205	ENSLAFG00000030814	-	94	64.205	Loxodonta_africana
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSMFAG00000041831	SYF2	89	96.629	Macaca_fascicularis
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSMMUG00000002968	SYF2	89	96.629	Macaca_mulatta
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSMNEG00000030180	SYF2	89	96.629	Macaca_nemestrina
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSMLEG00000030248	SYF2	89	96.067	Mandrillus_leucophaeus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	81.910	ENSMAMG00000010403	syf2	83	81.910	Mastacembelus_armatus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.412	ENSMZEG00005006429	syf2	84	82.412	Maylandia_zebra
ENSMICG00000016191	SYF2	100	89.447	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	Meleagris_gallopavo
ENSMICG00000016191	SYF2	100	95.980	ENSMAUG00000018974	Syf2	82	95.980	Mesocricetus_auratus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.985	ENSMOCG00000022938	Syf2	82	96.985	Microtus_ochrogaster
ENSMICG00000016191	SYF2	100	80.402	ENSMMOG00000002396	syf2	83	80.402	Mola_mola
ENSMICG00000016191	SYF2	100	89.552	ENSMODG00000013951	-	88	89.552	Monodelphis_domestica
ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.000	ENSMALG00000010706	syf2	83	82.500	Monopterus_albus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.482	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	82	96.482	Mus_caroli
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.482	ENSMUSG00000028821	Syf2	82	96.482	Mus_musculus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.482	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	82	96.482	Mus_pahari
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.482	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	82	96.482	Mus_spretus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.482	ENSMPUG00000015802	-	81	96.482	Mustela_putorius_furo
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.985	ENSMPUG00000015801	-	81	96.985	Mustela_putorius_furo
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.482	ENSMLUG00000001885	SYF2	82	96.482	Myotis_lucifugus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSNGAG00000007912	Syf2	81	97.487	Nannospalax_galili
ENSMICG00000016191	SYF2	100	73.869	ENSNBRG00000010720	syf2	84	73.869	Neolamprologus_brichardi
ENSMICG00000016191	SYF2	100	98.492	ENSNLEG00000035185	SYF2	89	97.753	Nomascus_leucogenys
ENSMICG00000016191	SYF2	100	95.477	ENSOPRG00000012870	SYF2	82	95.477	Ochotona_princeps
ENSMICG00000016191	SYF2	100	84.422	ENSODEG00000014338	-	91	79.208	Octodon_degus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.985	ENSODEG00000017664	-	84	96.985	Octodon_degus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	81.910	ENSONIG00000008213	syf2	84	81.910	Oreochromis_niloticus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	91.960	ENSOANG00000009552	SYF2	99	91.960	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSOCUG00000013050	SYF2	82	97.487	Oryctolagus_cuniculus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.412	ENSORLG00000028820	syf2	85	82.412	Oryzias_latipes
ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.412	ENSORLG00020018333	syf2	84	82.412	Oryzias_latipes_hni
ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.412	ENSORLG00015014665	syf2	84	82.412	Oryzias_latipes_hsok
ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.915	ENSOMEG00000013911	syf2	84	82.915	Oryzias_melastigma
ENSMICG00000016191	SYF2	100	99.497	ENSOGAG00000009962	SYF2	82	99.497	Otolemur_garnettii
ENSMICG00000016191	SYF2	98	66.667	ENSOARG00000006269	-	100	66.667	Ovis_aries
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.517	ENSOARG00000006348	-	81	96.517	Ovis_aries
ENSMICG00000016191	SYF2	100	98.492	ENSPPAG00000036579	SYF2	89	97.753	Pan_paniscus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.191	ENSPPRG00000001651	-	87	97.191	Panthera_pardus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.990	ENSPPRG00000001638	-	81	97.990	Panthera_pardus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.990	ENSPTIG00000005711	-	73	97.990	Panthera_tigris_altaica
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.191	ENSPTIG00000007036	-	87	97.191	Panthera_tigris_altaica
ENSMICG00000016191	SYF2	100	98.492	ENSPTRG00000000352	SYF2	89	97.753	Pan_troglodytes
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSPANG00000008139	SYF2	89	96.629	Papio_anubis
ENSMICG00000016191	SYF2	100	84.925	ENSPKIG00000008130	syf2	85	84.925	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMICG00000016191	SYF2	100	88.442	ENSPSIG00000011816	SYF2	77	88.442	Pelodiscus_sinensis
ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.417	ENSPMGG00000008755	syf2	78	83.417	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.482	ENSPEMG00000008283	Syf2	82	96.482	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMICG00000016191	SYF2	100	94.975	ENSPCIG00000014235	SYF2	80	94.975	Phascolarctos_cinereus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	80.905	ENSPFOG00000004116	syf2	82	80.905	Poecilia_formosa
ENSMICG00000016191	SYF2	100	80.905	ENSPLAG00000006691	syf2	85	80.905	Poecilia_latipinna
ENSMICG00000016191	SYF2	100	77.387	ENSPMEG00000011684	syf2	85	77.387	Poecilia_mexicana
ENSMICG00000016191	SYF2	100	80.905	ENSPREG00000003009	syf2	84	80.905	Poecilia_reticulata
ENSMICG00000016191	SYF2	100	98.492	ENSPPYG00000001713	SYF2	82	98.492	Pongo_abelii
ENSMICG00000016191	SYF2	100	80.899	ENSPCOG00000027011	SYF2	86	80.899	Propithecus_coquereli
ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.920	ENSPVAG00000005841	SYF2	81	83.920	Pteropus_vampyrus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.412	ENSPNYG00000004979	syf2	84	82.412	Pundamilia_nyererei
ENSMICG00000016191	SYF2	100	85.427	ENSPNAG00000015570	syf2	84	85.427	Pygocentrus_nattereri
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.482	ENSRNOG00000060597	Syf2	82	96.482	Rattus_norvegicus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	94.472	ENSRBIG00000042970	SYF2	89	93.258	Rhinopithecus_bieti
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSRROG00000001347	SYF2	89	96.629	Rhinopithecus_roxellana
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.990	ENSSBOG00000020184	SYF2	89	97.753	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMICG00000016191	SYF2	100	93.467	ENSSHAG00000015630	-	80	93.467	Sarcophilus_harrisii
ENSMICG00000016191	SYF2	100	94.975	ENSSHAG00000007152	-	97	94.975	Sarcophilus_harrisii
ENSMICG00000016191	SYF2	100	84.925	ENSSFOG00015023647	syf2	84	84.925	Scleropages_formosus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	81.910	ENSSMAG00000009867	syf2	84	81.910	Scophthalmus_maximus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.920	ENSSDUG00000013072	syf2	84	83.920	Seriola_dumerili
ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.920	ENSSLDG00000012677	syf2	84	83.920	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMICG00000016191	SYF2	100	77.273	ENSSARG00000012889	SYF2	90	77.273	Sorex_araneus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	88.442	ENSSPUG00000005251	SYF2	79	88.442	Sphenodon_punctatus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.417	ENSSPAG00000009626	syf2	84	83.417	Stegastes_partitus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	ENSSSCG00000037481	SYF2	81	97.487	Sus_scrofa
ENSMICG00000016191	SYF2	65	73.504	ENSTGUG00000001126	SYF2	80	61.635	Taeniopygia_guttata
ENSMICG00000016191	SYF2	100	81.407	ENSTRUG00000001499	syf2	80	81.407	Takifugu_rubripes
ENSMICG00000016191	SYF2	100	79.899	ENSTNIG00000016912	syf2	89	79.899	Tetraodon_nigroviridis
ENSMICG00000016191	SYF2	100	68.342	ENSTBEG00000017370	SYF2	78	67.839	Tupaia_belangeri
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.482	ENSTTRG00000003550	SYF2	82	96.482	Tursiops_truncatus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	95.980	ENSUAMG00000002897	SYF2	81	95.980	Ursus_americanus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	95.980	ENSUMAG00000013108	SYF2	81	95.980	Ursus_maritimus
ENSMICG00000016191	SYF2	100	95.980	ENSVPAG00000005705	SYF2	82	95.980	Vicugna_pacos
ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.985	ENSVVUG00000027175	-	81	96.985	Vulpes_vulpes
ENSMICG00000016191	SYF2	100	95.980	ENSVVUG00000027181	-	80	95.980	Vulpes_vulpes
ENSMICG00000016191	SYF2	100	86.432	ENSXETG00000022797	syf2	80	86.432	Xenopus_tropicalis
ENSMICG00000016191	SYF2	100	80.905	ENSXMAG00000022698	syf2	84	80.905	Xiphophorus_maculatus