EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMLEG00000030248 (Gene tree)
Gene ID: 105538112
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Mandrillus_leucophaeus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9934 bases
Position: chrKN973929.1:2193434-2203367
Accession: 105538112
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMLEP00000012164	SYF2	PF08231.12	2.9e-54	1	1
ENSMLEP00000012159	SYF2	PF08231.12	7.6e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMLET00000035590	SYF2-202	1249	XM_011977883	ENSMLEP00000012164	201 (aa)	XP_011833273	A0A2K5Y9F4
ENSMLET00000035585	SYF2-201	1377	XM_011977882	ENSMLEP00000012159	243 (aa)	XP_011833272	A0A2K5Y9F0

Gene Model

Click here to download ENSMLEG00000030248's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMLEG00000030248's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	97.119	ENSG00000117614	SYF2	100	97.119	Homo_sapiens
ENSMLEG00000030248	SYF2	90	83.562	ENSAPOG00000001174	syf2	99	80.085	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMLEG00000030248	SYF2	98	91.701	ENSAMEG00000010115	-	99	91.701	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMLEG00000030248	SYF2	80	95.897	ENSAMEG00000010134	-	100	95.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMLEG00000030248	SYF2	90	80.822	ENSACIG00000023688	syf2	88	80.822	Amphilophus_citrinellus
ENSMLEG00000030248	SYF2	88	78.995	ENSAOCG00000010912	syf2	68	78.995	Amphiprion_ocellaris
ENSMLEG00000030248	SYF2	98	79.412	ENSAOCG00000022046	syf2	99	79.412	Amphiprion_ocellaris
ENSMLEG00000030248	SYF2	95	80.508	ENSAPEG00000018858	syf2	91	80.508	Amphiprion_percula
ENSMLEG00000030248	SYF2	89	82.488	ENSATEG00000007745	syf2	99	78.814	Anabas_testudineus
ENSMLEG00000030248	SYF2	82	88.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	Anas_platyrhynchos
ENSMLEG00000030248	SYF2	84	85.294	ENSACAG00000013653	-	100	85.294	Anolis_carolinensis
ENSMLEG00000030248	SYF2	79	74.843	ENSACAG00000026777	-	95	74.843	Anolis_carolinensis
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	96.708	ENSANAG00000032473	SYF2	100	96.708	Aotus_nancymaae
ENSMLEG00000030248	SYF2	90	80.365	ENSACLG00000019916	syf2	100	76.050	Astatotilapia_calliptera
ENSMLEG00000030248	SYF2	90	82.569	ENSAMXG00000004051	syf2	92	82.569	Astyanax_mexicanus
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	91.837	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.644	Bos_taurus
ENSMLEG00000030248	SYF2	86	51.905	WBGene00019402	syf-2	99	47.639	Caenorhabditis_elegans
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	97.119	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	97.119	Callithrix_jacchus
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	82.305	ENSCAFG00000030331	-	100	82.305	Canis_familiaris
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	92.213	ENSCAFG00000012895	-	99	92.213	Canis_familiaris
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	92.213	ENSCAFG00020021091	-	99	92.213	Canis_lupus_dingo
ENSMLEG00000030248	SYF2	95	86.316	ENSCAFG00020021094	-	97	86.316	Canis_lupus_dingo
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	90.535	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	92.469	Capra_hircus
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	93.004	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.004	Carlito_syrichta
ENSMLEG00000030248	SYF2	81	97.980	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	Cavia_aperea
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	93.033	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.033	Cavia_porcellus
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	97.119	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	97.119	Cebus_capucinus
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	100.000	ENSCATG00000026917	SYF2	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	93.852	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.852	Chinchilla_lanigera
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	99.177	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	99.177	Chlorocebus_sabaeus
ENSMLEG00000030248	SYF2	72	77.011	ENSCHOG00000005273	-	96	77.011	Choloepus_hoffmanni
ENSMLEG00000030248	SYF2	92	88.839	ENSCPBG00000025073	SYF2	93	87.446	Chrysemys_picta_bellii
ENSMLEG00000030248	SYF2	87	53.991	ENSCING00000003017	-	89	53.521	Ciona_intestinalis
ENSMLEG00000030248	SYF2	96	46.392	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	86.008	ENSCANG00000037322	SYF2	100	86.008	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	89.300	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	89.300	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMLEG00000030248	SYF2	81	95.408	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.455	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMLEG00000030248	SYF2	90	77.982	ENSCSEG00000000117	syf2	100	71.605	Cynoglossus_semilaevis
ENSMLEG00000030248	SYF2	90	80.822	ENSCVAG00000019543	syf2	99	77.215	Cyprinodon_variegatus
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	77.500	ENSDARG00000004706	syf2	100	77.500	Danio_rerio
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	93.004	ENSDNOG00000047605	SYF2	99	93.004	Dasypus_novemcinctus
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	91.322	ENSDORG00000001274	Syf2	99	91.322	Dipodomys_ordii
ENSMLEG00000030248	SYF2	94	54.783	FBgn0033556	CG12343	99	53.043	Drosophila_melanogaster
ENSMLEG00000030248	SYF2	94	75.983	ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.856	Echinops_telfairi
ENSMLEG00000030248	SYF2	81	59.898	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	Eptatretus_burgeri
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	90.612	ENSEASG00005004224	-	100	90.612	Equus_asinus_asinus
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	80.658	ENSEASG00005004232	-	100	80.658	Equus_asinus_asinus
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	91.020	ENSECAG00000012023	-	100	91.020	Equus_caballus
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	91.736	ENSECAG00000010440	-	96	95.197	Equus_caballus
ENSMLEG00000030248	SYF2	75	79.781	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.781	Erinaceus_europaeus
ENSMLEG00000030248	SYF2	96	79.412	ENSELUG00000003465	syf2	100	79.412	Esox_lucius
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	93.061	ENSFCAG00000010324	-	85	93.061	Felis_catus
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	92.623	ENSFCAG00000043095	-	99	92.623	Felis_catus
ENSMLEG00000030248	SYF2	84	84.314	ENSFALG00000000460	SYF2	93	80.172	Ficedula_albicollis
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	92.593	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.593	Fukomys_damarensis
ENSMLEG00000030248	SYF2	90	66.364	ENSFHEG00000007238	syf2	97	66.364	Fundulus_heteroclitus
ENSMLEG00000030248	SYF2	88	83.721	ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	Gadus_morhua
ENSMLEG00000030248	SYF2	92	86.607	ENSGALG00000013639	SYF2	99	80.800	Gallus_gallus
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	74.689	ENSGAFG00000019435	syf2	99	73.444	Gambusia_affinis
ENSMLEG00000030248	SYF2	88	82.791	ENSGACG00000007305	syf2	90	82.791	Gasterosteus_aculeatus
ENSMLEG00000030248	SYF2	92	88.393	ENSGAGG00000010670	SYF2	93	87.013	Gopherus_agassizii
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	97.531	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	97.531	Gorilla_gorilla
ENSMLEG00000030248	SYF2	90	80.365	ENSHBUG00000020477	syf2	100	76.050	Haplochromis_burtoni
ENSMLEG00000030248	SYF2	93	83.260	ENSHGLG00000004304	-	99	79.583	Heterocephalus_glaber_female
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	93.033	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.033	Heterocephalus_glaber_female
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	93.033	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.033	Heterocephalus_glaber_male
ENSMLEG00000030248	SYF2	98	77.178	ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	Hippocampus_comes
ENSMLEG00000030248	SYF2	91	82.353	ENSIPUG00000019859	syf2	93	82.353	Ictalurus_punctatus
ENSMLEG00000030248	SYF2	60	96.575	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMLEG00000030248	SYF2	82	96.985	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	Jaculus_jaculus
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	76.250	ENSKMAG00000013856	syf2	99	76.250	Kryptolebias_marmoratus
ENSMLEG00000030248	SYF2	90	82.192	ENSLBEG00000014425	syf2	99	78.814	Labrus_bergylta
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	80.417	ENSLACG00000012064	SYF2	99	80.417	Latimeria_chalumnae
ENSMLEG00000030248	SYF2	97	80.000	ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.000	Lepisosteus_oculatus
ENSMLEG00000030248	SYF2	75	65.217	ENSLAFG00000030814	-	100	65.217	Loxodonta_africana
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	91.837	ENSLAFG00000023150	-	100	91.837	Loxodonta_africana
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	99.588	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	99.588	Macaca_fascicularis
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	99.177	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	99.177	Macaca_mulatta
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	99.588	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	99.588	Macaca_nemestrina
ENSMLEG00000030248	SYF2	89	80.645	ENSMAMG00000010403	syf2	100	73.770	Mastacembelus_armatus
ENSMLEG00000030248	SYF2	95	77.119	ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.119	Maylandia_zebra
ENSMLEG00000030248	SYF2	82	88.442	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	Meleagris_gallopavo
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	89.712	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	89.712	Mesocricetus_auratus
ENSMLEG00000030248	SYF2	89	96.067	ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	Microcebus_murinus
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	90.535	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.535	Microtus_ochrogaster
ENSMLEG00000030248	SYF2	90	78.995	ENSMMOG00000002396	syf2	92	78.995	Mola_mola
ENSMLEG00000030248	SYF2	93	87.665	ENSMODG00000013951	-	99	87.665	Monodelphis_domestica
ENSMLEG00000030248	SYF2	95	77.637	ENSMALG00000010706	syf2	98	77.215	Monopterus_albus
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	90.535	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	90.535	Mus_caroli
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	90.535	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	90.535	Mus_musculus
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	90.535	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	90.535	Mus_pahari
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	90.535	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	90.535	Mus_spretus
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	92.623	ENSMPUG00000015802	-	99	92.623	Mustela_putorius_furo
ENSMLEG00000030248	SYF2	98	92.917	ENSMPUG00000015801	-	98	92.917	Mustela_putorius_furo
ENSMLEG00000030248	SYF2	98	92.437	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.437	Myotis_lucifugus
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	91.463	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.463	Nannospalax_galili
ENSMLEG00000030248	SYF2	97	70.833	ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.833	Neolamprologus_brichardi
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	97.942	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	97.942	Nomascus_leucogenys
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	90.535	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.535	Ochotona_princeps
ENSMLEG00000030248	SYF2	96	94.421	ENSODEG00000017664	-	98	94.421	Octodon_degus
ENSMLEG00000030248	SYF2	96	84.549	ENSODEG00000014338	-	98	84.549	Octodon_degus
ENSMLEG00000030248	SYF2	90	80.365	ENSONIG00000008213	syf2	100	76.050	Oreochromis_niloticus
ENSMLEG00000030248	SYF2	83	89.604	ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	94.262	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.262	Oryctolagus_cuniculus
ENSMLEG00000030248	SYF2	90	81.735	ENSORLG00000028820	syf2	94	81.735	Oryzias_latipes
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	76.667	ENSORLG00020018333	syf2	100	76.667	Oryzias_latipes_hni
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	76.250	ENSORLG00015014665	syf2	100	76.250	Oryzias_latipes_hsok
ENSMLEG00000030248	SYF2	96	78.151	ENSOMEG00000013911	syf2	100	78.151	Oryzias_melastigma
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	93.388	ENSOGAG00000009962	SYF2	99	93.388	Otolemur_garnettii
ENSMLEG00000030248	SYF2	80	67.179	ENSOARG00000006269	-	100	66.154	Ovis_aries
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	91.498	ENSOARG00000006348	-	100	91.498	Ovis_aries
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	97.531	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	97.531	Pan_paniscus
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	92.683	ENSPPRG00000001638	-	100	92.683	Panthera_pardus
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	92.623	ENSPPRG00000001651	-	99	92.623	Panthera_pardus
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	92.213	ENSPTIG00000007036	-	99	92.213	Panthera_tigris_altaica
ENSMLEG00000030248	SYF2	89	98.148	ENSPTIG00000005711	-	82	95.575	Panthera_tigris_altaica
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	97.531	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	97.531	Pan_troglodytes
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	99.588	ENSPANG00000008139	SYF2	100	99.588	Papio_anubis
ENSMLEG00000030248	SYF2	95	79.828	ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.828	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMLEG00000030248	SYF2	96	84.979	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	84.979	Pelodiscus_sinensis
ENSMLEG00000030248	SYF2	97	77.119	ENSPMGG00000008755	syf2	92	77.119	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	90.123	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	90.123	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMLEG00000030248	SYF2	93	92.889	ENSPCIG00000014235	SYF2	92	92.140	Phascolarctos_cinereus
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	75.417	ENSPFOG00000004116	syf2	95	75.417	Poecilia_formosa
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	75.417	ENSPLAG00000006691	syf2	99	75.417	Poecilia_latipinna
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	72.917	ENSPMEG00000011684	syf2	100	71.605	Poecilia_mexicana
ENSMLEG00000030248	SYF2	89	80.093	ENSPREG00000003009	syf2	100	74.074	Poecilia_reticulata
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	97.942	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	97.942	Pongo_abelii
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	76.617	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	76.617	Propithecus_coquereli
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	81.070	ENSPVAG00000005841	SYF2	99	81.070	Pteropus_vampyrus
ENSMLEG00000030248	SYF2	90	80.365	ENSPNYG00000004979	syf2	100	76.050	Pundamilia_nyererei
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	79.012	ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.012	Pygocentrus_nattereri
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	90.535	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	90.535	Rattus_norvegicus
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	96.708	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	96.708	Rhinopithecus_bieti
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	99.588	ENSRROG00000001347	SYF2	100	99.588	Rhinopithecus_roxellana
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	95.885	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	95.885	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMLEG00000030248	SYF2	82	94.472	ENSSHAG00000007152	-	97	94.472	Sarcophilus_harrisii
ENSMLEG00000030248	SYF2	93	91.111	ENSSHAG00000015630	-	92	90.351	Sarcophilus_harrisii
ENSMLEG00000030248	SYF2	93	80.087	ENSSFOG00015023647	syf2	97	80.087	Scleropages_formosus
ENSMLEG00000030248	SYF2	95	77.119	ENSSMAG00000009867	syf2	99	77.119	Scophthalmus_maximus
ENSMLEG00000030248	SYF2	90	82.569	ENSSDUG00000013072	syf2	98	78.059	Seriola_dumerili
ENSMLEG00000030248	SYF2	90	82.569	ENSSLDG00000012677	syf2	98	78.059	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	73.361	ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.361	Sorex_araneus
ENSMLEG00000030248	SYF2	95	85.714	ENSSPUG00000005251	SYF2	91	85.714	Sphenodon_punctatus
ENSMLEG00000030248	SYF2	95	79.237	ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.237	Stegastes_partitus
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	90.535	ENSSSCG00000037481	SYF2	99	90.535	Sus_scrofa
ENSMLEG00000030248	SYF2	58	71.795	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	59.429	Taeniopygia_guttata
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	73.663	ENSTRUG00000001499	syf2	92	77.253	Takifugu_rubripes
ENSMLEG00000030248	SYF2	90	79.358	ENSTNIG00000016912	syf2	98	79.358	Tetraodon_nigroviridis
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	70.782	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.547	Tupaia_belangeri
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	91.393	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.213	Tursiops_truncatus
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	91.803	ENSUAMG00000002897	SYF2	99	91.803	Ursus_americanus
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	91.803	ENSUMAG00000013108	SYF2	99	91.803	Ursus_maritimus
ENSMLEG00000030248	SYF2	100	91.393	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.393	Vicugna_pacos
ENSMLEG00000030248	SYF2	84	96.098	ENSVVUG00000027181	-	100	88.710	Vulpes_vulpes
ENSMLEG00000030248	SYF2	99	92.213	ENSVVUG00000027175	-	99	92.213	Vulpes_vulpes
ENSMLEG00000030248	SYF2	96	81.116	ENSXETG00000022797	syf2	94	81.116	Xenopus_tropicalis
ENSMLEG00000030248	SYF2	88	80.465	ENSXMAG00000022698	syf2	100	74.074	Xiphophorus_maculatus