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Description

Ensembl ID: ENSMLEG00000042535 (Gene tree)
Gene ID: 105543537
Gene Symbol: RAB1A
Alias: RAB1|YPT1
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Mandrillus_leucophaeus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 53822 bases
Position: chrKN975037.1:1070639-1124460
Accession: 105543537
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMLEP00000036968	MMR_HSR1	PF01926.23	2.1e-05	1	1
ENSMLEP00000036938	MMR_HSR1	PF01926.23	2.1e-05	1	1
ENSMLEP00000036958	MMR_HSR1	PF01926.23	2.1e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMLET00000060545	RAB1A-202	2419	XM_011985505	ENSMLEP00000036939	129 (aa)	XP_011840895	A0A2K6AA33
ENSMLET00000060544	RAB1A-201	2647	XM_011985501	ENSMLEP00000036938	205 (aa)	XP_011840891	A0A2K6AA91
ENSMLET00000060564	RAB1A-205	618	-	ENSMLEP00000036958	205 (aa)	-	A0A2K6AAB0
ENSMLET00000060574	RAB1A-206	615	-	ENSMLEP00000036968	204 (aa)	-	A0A2K6AAC2
ENSMLET00000060575	RAB1A-207	483	-	ENSMLEP00000036969	160 (aa)	-	A0A2K6AA61
ENSMLET00000060561	RAB1A-204	426	-	ENSMLEP00000036955	141 (aa)	-	A0A2K6AA97
ENSMLET00000060560	RAB1A-203	522	-	ENSMLEP00000036954	173 (aa)	-	A0A2K6AA48

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMLEG00000042535	RAB1A	86	43.820	ENSMLEG00000029019	RAB39B	84	43.820
ENSMLEG00000042535	RAB1A	95	38.384	ENSMLEG00000038771	RAB6A	94	38.384
ENSMLEG00000042535	RAB1A	84	33.526	ENSMLEG00000042429	RAB23	73	33.526
ENSMLEG00000042535	RAB1A	61	32.824	ENSMLEG00000038749	ARL8B	68	32.824
ENSMLEG00000042535	RAB1A	82	45.509	ENSMLEG00000025037	RAB25	78	46.386
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	45.581	ENSMLEG00000030601	-	99	45.581
ENSMLEG00000042535	RAB1A	84	35.028	ENSMLEG00000042070	HRAS	93	35.028
ENSMLEG00000042535	RAB1A	57	33.613	ENSMLEG00000044379	ARL2	61	33.613
ENSMLEG00000042535	RAB1A	95	39.086	ENSMLEG00000035868	RAB22A	97	39.086
ENSMLEG00000042535	RAB1A	77	40.373	ENSMLEG00000034269	RAB34	72	40.373
ENSMLEG00000042535	RAB1A	80	37.805	ENSMLEG00000028386	KRAS	95	35.912
ENSMLEG00000042535	RAB1A	75	36.601	ENSMLEG00000032621	-	65	36.601
ENSMLEG00000042535	RAB1A	81	50.602	ENSMLEG00000039496	RAB30	82	50.602
ENSMLEG00000042535	RAB1A	80	47.619	ENSMLEG00000031891	RAB33A	71	47.619
ENSMLEG00000042535	RAB1A	57	31.933	ENSMLEG00000007082	-	59	31.933
ENSMLEG00000042535	RAB1A	85	36.000	ENSMLEG00000038149	RAB41	78	36.000
ENSMLEG00000042535	RAB1A	79	38.182	ENSMLEG00000017215	RAB9A	82	38.182
ENSMLEG00000042535	RAB1A	88	33.514	ENSMLEG00000043731	RERG	90	33.514
ENSMLEG00000042535	RAB1A	83	44.000	ENSMLEG00000033393	RAB33B	76	44.000
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	44.554	ENSMLEG00000031858	RAB14	93	44.554
ENSMLEG00000042535	RAB1A	96	51.269	ENSMLEG00000042247	-	97	51.269
ENSMLEG00000042535	RAB1A	78	39.264	ENSMLEG00000040660	RAB7A	79	39.264
ENSMLEG00000042535	RAB1A	57	31.092	ENSMLEG00000027620	ARL4C	58	31.092
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	93.069	ENSMLEG00000040858	RAB1B	100	93.069
ENSMLEG00000042535	RAB1A	79	38.788	ENSMLEG00000027985	RAB9B	82	38.788
ENSMLEG00000042535	RAB1A	89	46.703	ENSMLEG00000033595	RAB18	93	45.876
ENSMLEG00000042535	RAB1A	57	31.933	ENSMLEG00000026260	-	55	31.933
ENSMLEG00000042535	RAB1A	91	48.108	ENSMLEG00000043065	RAB2B	86	48.649
ENSMLEG00000042535	RAB1A	69	51.773	ENSMLEG00000030130	RAB3C	87	50.000
ENSMLEG00000042535	RAB1A	80	50.000	ENSMLEG00000032505	RAB11A	99	50.000
ENSMLEG00000042535	RAB1A	95	43.367	ENSMLEG00000034462	RAB5B	90	43.367
ENSMLEG00000042535	RAB1A	80	38.415	ENSMLEG00000039333	NRAS	91	38.650
ENSMLEG00000042535	RAB1A	81	35.928	ENSMLEG00000034659	MRAS	83	36.207
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	42.857	ENSMLEG00000028944	RAB5A	94	42.857

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSG00000138069	RAB1A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	95.545	ENSAPOG00000008143	-	100	95.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSAMEG00000001127	RAB1A	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	95.545	ENSAOCG00000020606	-	100	95.545	Amphiprion_ocellaris
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	95.545	ENSAPEG00000022488	-	100	95.545	Amphiprion_percula
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSANAG00000020929	RAB1A	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	96.040	ENSACLG00000003326	-	100	96.040	Astatotilapia_calliptera
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	94.554	ENSAMXG00000034850	-	100	94.554	Astyanax_mexicanus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	Bos_taurus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00000003187	RAB1A	100	100.000	Canis_familiaris
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00020026971	RAB1A	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	98.039	ENSCHIG00000014060	RAB1A	99	98.039	Capra_hircus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	98.049	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSCPOG00000015437	RAB1A	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSCATG00000030853	RAB1A	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	99.512	ENSCPBG00000013243	RAB1A	100	99.512	Chrysemys_picta_bellii
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	97.561	ENSCANG00000035916	RAB1A	100	97.561	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00001012691	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00000008456	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSDNOG00000018236	RAB1A	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSDORG00000028628	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	84.466	FBgn0285937	Rab1	100	84.466	Drosophila_melanogaster
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	100.000	ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	Echinops_telfairi
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSEASG00005007298	RAB1A	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSECAG00000009926	RAB1A	100	100.000	Equus_caballus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	100.000	ENSEEUG00000011721	RAB1A	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	95.588	ENSELUG00000012166	RAB1A	96	95.588	Esox_lucius
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSFCAG00000002536	RAB1A	100	100.000	Felis_catus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	96.602	ENSFALG00000013624	RAB1A	99	97.537	Ficedula_albicollis
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSFDAG00000019505	-	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	94.554	ENSFHEG00000014414	-	100	94.554	Fundulus_heteroclitus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	99.512	ENSGALG00000031582	RAB1A	100	99.512	Gallus_gallus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	94.554	ENSGAFG00000000918	-	100	94.554	Gambusia_affinis
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	99.512	ENSGAGG00000006802	RAB1A	100	99.512	Gopherus_agassizii
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSGGOG00000026603	RAB1A	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSHGLG00000013585	RAB1A	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	99.005	ENSHGLG00100007994	RAB1A	99	99.005	Heterocephalus_glaber_male
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSSTOG00000020693	-	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	97	100.000	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	97	95.431	ENSKMAG00000014038	-	93	95.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	95.050	ENSLBEG00000028426	RAB1A	100	95.050	Labrus_bergylta
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	98.537	ENSLACG00000012869	RAB1A	100	98.537	Latimeria_chalumnae
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	Loxodonta_africana
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSMLEG00000042535	RAB1A	97	100.000	ENSMMUG00000021721	RAB1A	91	100.000	Macaca_mulatta
ENSMLEG00000042535	RAB1A	95	99.485	ENSMNEG00000028414	-	97	99.485	Macaca_nemestrina
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	96.040	ENSMZEG00005013959	-	100	96.040	Maylandia_zebra
ENSMLEG00000042535	RAB1A	97	99.492	ENSMGAG00000004611	RAB1A	98	99.492	Meleagris_gallopavo
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	99.512	ENSMAUG00000012156	Rab1a	100	99.512	Mesocricetus_auratus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	99.512	ENSMOCG00000017022	Rab1a	100	99.512	Microtus_ochrogaster
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	93.564	ENSMMOG00000018709	RAB1A	100	93.564	Mola_mola
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	99.512	ENSMODG00000003340	RAB1A	100	99.512	Monodelphis_domestica
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	100	100.000	Mus_caroli
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSMUSG00000020149	Rab1a	100	100.000	Mus_musculus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	100	100.000	Mus_pahari
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	100	100.000	Mus_spretus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSMPUG00000006139	RAB1A	82	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	Myotis_lucifugus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSNGAG00000005838	Rab1a	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	96.040	ENSNBRG00000020492	-	100	96.040	Neolamprologus_brichardi
ENSMLEG00000042535	RAB1A	97	100.000	ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	Ochotona_princeps
ENSMLEG00000042535	RAB1A	94	100.000	ENSODEG00000011248	-	96	100.000	Octodon_degus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	93.627	ENSONIG00000006819	-	100	93.627	Oreochromis_niloticus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	99.512	ENSOANG00000012438	RAB1A	100	99.512	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSOCUG00000017003	RAB1A	100	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	Otolemur_garnettii
ENSMLEG00000042535	RAB1A	97	100.000	ENSOARG00000019997	RAB1A	97	100.000	Ovis_aries
ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	100.000	ENSPPAG00000030253	RAB1A	100	100.000	Pan_paniscus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	Panthera_pardus
ENSMLEG00000042535	RAB1A	97	100.000	ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	Panthera_tigris_altaica
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