EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMLUG00000001885 (Gene tree)
Gene ID: 102434967
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Myotis_lucifugus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6141 bases
Position: chrGL430156:885539-891679
Accession: 102434967
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMLUP00000001715	SYF2	PF08231.12	2.5e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMLUT00000001885	SYF2-201	735	XM_006101982	ENSMLUP00000001715	244 (aa)	XP_006102044	G1NWK3

Gene Model

Click here to download ENSMLUG00000001885's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMLUG00000001885's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.917	ENSG00000117614	SYF2	98	93.697	Homo_sapiens
ENSMLUG00000001885	SYF2	91	82.883	ENSAPOG00000001174	syf2	97	79.915	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMLUG00000001885	SYF2	80	95.897	ENSAMEG00000010134	-	100	95.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMLUG00000001885	SYF2	95	94.850	ENSAMEG00000010115	-	96	94.850	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMLUG00000001885	SYF2	93	78.541	ENSACIG00000023688	syf2	93	78.541	Amphilophus_citrinellus
ENSMLUG00000001885	SYF2	94	82.096	ENSAOCG00000022046	syf2	96	82.096	Amphiprion_ocellaris
ENSMLUG00000001885	SYF2	87	80.660	ENSAOCG00000010912	syf2	65	80.660	Amphiprion_ocellaris
ENSMLUG00000001885	SYF2	94	82.096	ENSAPEG00000018858	syf2	87	82.096	Amphiprion_percula
ENSMLUG00000001885	SYF2	89	82.488	ENSATEG00000007745	syf2	97	78.205	Anabas_testudineus
ENSMLUG00000001885	SYF2	82	88.442	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	Anas_platyrhynchos
ENSMLUG00000001885	SYF2	84	84.804	ENSACAG00000013653	-	100	84.804	Anolis_carolinensis
ENSMLUG00000001885	SYF2	68	75.449	ENSACAG00000026777	-	94	75.796	Anolis_carolinensis
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.500	ENSANAG00000032473	SYF2	98	92.917	Aotus_nancymaae
ENSMLUG00000001885	SYF2	91	80.631	ENSACLG00000019916	syf2	99	76.667	Astatotilapia_calliptera
ENSMLUG00000001885	SYF2	96	76.891	ENSAMXG00000004051	syf2	100	76.891	Astyanax_mexicanus
ENSMLUG00000001885	SYF2	97	93.220	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.220	Bos_taurus
ENSMLUG00000001885	SYF2	85	50.000	WBGene00019402	syf-2	99	47.186	Caenorhabditis_elegans
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	93.333	ENSCJAG00000046570	SYF2	98	93.333	Callithrix_jacchus
ENSMLUG00000001885	SYF2	93	86.344	ENSCAFG00000030331	-	97	86.344	Canis_familiaris
ENSMLUG00000001885	SYF2	95	95.279	ENSCAFG00000012895	-	95	95.279	Canis_familiaris
ENSMLUG00000001885	SYF2	95	95.279	ENSCAFG00020021091	-	95	95.279	Canis_lupus_dingo
ENSMLUG00000001885	SYF2	74	87.363	ENSCAFG00020021094	-	83	95.513	Canis_lupus_dingo
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.500	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	92.437	Capra_hircus
ENSMLUG00000001885	SYF2	94	94.760	ENSTSYG00000005114	SYF2	94	94.760	Carlito_syrichta
ENSMLUG00000001885	SYF2	81	97.980	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	Cavia_aperea
ENSMLUG00000001885	SYF2	94	95.197	ENSCPOG00000005326	SYF2	94	95.197	Cavia_porcellus
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.917	ENSCCAG00000022459	SYF2	98	93.333	Cebus_capucinus
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.437	ENSCATG00000026917	SYF2	98	92.437	Cercocebus_atys
ENSMLUG00000001885	SYF2	94	95.633	ENSCLAG00000008474	SYF2	94	95.633	Chinchilla_lanigera
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.437	ENSCSAG00000000948	SYF2	98	92.437	Chlorocebus_sabaeus
ENSMLUG00000001885	SYF2	74	75.138	ENSCHOG00000005273	-	100	75.138	Choloepus_hoffmanni
ENSMLUG00000001885	SYF2	92	88.839	ENSCPBG00000025073	SYF2	97	85.062	Chrysemys_picta_bellii
ENSMLUG00000001885	SYF2	86	53.521	ENSCING00000003017	-	89	53.052	Ciona_intestinalis
ENSMLUG00000001885	SYF2	86	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	79.583	ENSCANG00000037322	SYF2	98	79.583	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMLUG00000001885	SYF2	94	94.323	ENSCGRG00001020733	Syf2	94	94.323	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMLUG00000001885	SYF2	82	95.980	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMLUG00000001885	SYF2	89	77.064	ENSCSEG00000000117	syf2	100	72.803	Cynoglossus_semilaevis
ENSMLUG00000001885	SYF2	91	80.543	ENSCVAG00000019543	syf2	99	76.667	Cyprinodon_variegatus
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	78.333	ENSDARG00000004706	syf2	99	78.333	Danio_rerio
ENSMLUG00000001885	SYF2	97	93.249	ENSDNOG00000047605	SYF2	97	93.249	Dasypus_novemcinctus
ENSMLUG00000001885	SYF2	97	92.827	ENSDORG00000001274	Syf2	97	92.827	Dipodomys_ordii
ENSMLUG00000001885	SYF2	89	57.727	FBgn0033556	CG12343	97	57.727	Drosophila_melanogaster
ENSMLUG00000001885	SYF2	91	76.923	ENSETEG00000015729	SYF2	94	79.630	Echinops_telfairi
ENSMLUG00000001885	SYF2	81	60.406	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSMLUG00000001885	SYF2	96	94.444	ENSEASG00005004224	-	95	94.444	Equus_asinus_asinus
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	82.917	ENSEASG00005004232	-	98	82.917	Equus_asinus_asinus
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	93.697	ENSECAG00000010440	-	98	94.444	Equus_caballus
ENSMLUG00000001885	SYF2	96	95.726	ENSECAG00000012023	-	96	95.726	Equus_caballus
ENSMLUG00000001885	SYF2	73	81.006	ENSEEUG00000015084	SYF2	98	81.006	Erinaceus_europaeus
ENSMLUG00000001885	SYF2	97	79.412	ENSELUG00000003465	syf2	100	79.412	Esox_lucius
ENSMLUG00000001885	SYF2	95	95.708	ENSFCAG00000043095	-	95	95.708	Felis_catus
ENSMLUG00000001885	SYF2	95	94.421	ENSFCAG00000010324	-	81	94.421	Felis_catus
ENSMLUG00000001885	SYF2	84	85.294	ENSFALG00000000460	SYF2	92	82.251	Ficedula_albicollis
ENSMLUG00000001885	SYF2	94	94.323	ENSFDAG00000008310	SYF2	94	94.323	Fukomys_damarensis
ENSMLUG00000001885	SYF2	91	66.518	ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.518	Fundulus_heteroclitus
ENSMLUG00000001885	SYF2	89	82.569	ENSGMOG00000019138	syf2	97	82.569	Gadus_morhua
ENSMLUG00000001885	SYF2	93	87.225	ENSGALG00000013639	SYF2	92	85.897	Gallus_gallus
ENSMLUG00000001885	SYF2	99	75.104	ENSGAFG00000019435	syf2	95	77.293	Gambusia_affinis
ENSMLUG00000001885	SYF2	88	83.256	ENSGACG00000007305	syf2	97	79.060	Gasterosteus_aculeatus
ENSMLUG00000001885	SYF2	92	89.286	ENSGAGG00000010670	SYF2	97	85.477	Gopherus_agassizii
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	93.333	ENSGGOG00000012796	SYF2	98	94.118	Gorilla_gorilla
ENSMLUG00000001885	SYF2	93	78.541	ENSHBUG00000020477	syf2	100	78.541	Haplochromis_burtoni
ENSMLUG00000001885	SYF2	97	89.754	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	89.754	Heterocephalus_glaber_female
ENSMLUG00000001885	SYF2	92	83.036	ENSHGLG00000004304	-	98	81.624	Heterocephalus_glaber_female
ENSMLUG00000001885	SYF2	97	89.754	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	89.754	Heterocephalus_glaber_male
ENSMLUG00000001885	SYF2	99	77.049	ENSHCOG00000012904	syf2	80	77.049	Hippocampus_comes
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	77.917	ENSIPUG00000019859	syf2	99	77.917	Ictalurus_punctatus
ENSMLUG00000001885	SYF2	60	95.890	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMLUG00000001885	SYF2	82	96.482	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.482	Jaculus_jaculus
ENSMLUG00000001885	SYF2	96	77.215	ENSKMAG00000013856	syf2	99	76.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSMLUG00000001885	SYF2	90	82.648	ENSLBEG00000014425	syf2	99	77.917	Labrus_bergylta
ENSMLUG00000001885	SYF2	89	86.111	ENSLACG00000012064	SYF2	91	86.111	Latimeria_chalumnae
ENSMLUG00000001885	SYF2	91	82.960	ENSLOCG00000002728	syf2	89	82.960	Lepisosteus_oculatus
ENSMLUG00000001885	SYF2	75	64.674	ENSLAFG00000030814	-	100	64.674	Loxodonta_africana
ENSMLUG00000001885	SYF2	94	94.783	ENSLAFG00000023150	-	94	94.783	Loxodonta_africana
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.857	ENSMFAG00000041831	SYF2	98	92.857	Macaca_fascicularis
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.857	ENSMMUG00000002968	SYF2	98	92.857	Macaca_mulatta
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.857	ENSMNEG00000030180	SYF2	98	92.857	Macaca_nemestrina
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.437	ENSMLEG00000030248	SYF2	98	92.437	Mandrillus_leucophaeus
ENSMLUG00000001885	SYF2	89	81.106	ENSMAMG00000010403	syf2	99	74.694	Mastacembelus_armatus
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	76.667	ENSMZEG00005006429	syf2	99	76.667	Maylandia_zebra
ENSMLUG00000001885	SYF2	82	88.442	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	Meleagris_gallopavo
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	89.167	ENSMAUG00000018974	Syf2	99	89.167	Mesocricetus_auratus
ENSMLUG00000001885	SYF2	82	96.482	ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.482	Microcebus_murinus
ENSMLUG00000001885	SYF2	94	94.323	ENSMOCG00000022938	Syf2	94	94.323	Microtus_ochrogaster
ENSMLUG00000001885	SYF2	91	78.378	ENSMMOG00000002396	syf2	93	78.378	Mola_mola
ENSMLUG00000001885	SYF2	93	87.281	ENSMODG00000013951	-	99	87.281	Monodelphis_domestica
ENSMLUG00000001885	SYF2	96	76.349	ENSMALG00000010706	syf2	100	76.763	Monopterus_albus
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	89.583	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	99	89.583	Mus_caroli
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	89.583	ENSMUSG00000028821	Syf2	99	89.583	Mus_musculus
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	89.583	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	99	89.583	Mus_pahari
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	89.583	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	99	89.583	Mus_spretus
ENSMLUG00000001885	SYF2	95	95.708	ENSMPUG00000015802	-	95	95.708	Mustela_putorius_furo
ENSMLUG00000001885	SYF2	96	92.340	ENSMPUG00000015801	-	96	92.340	Mustela_putorius_furo
ENSMLUG00000001885	SYF2	97	93.220	ENSNGAG00000007912	Syf2	96	93.220	Nannospalax_galili
ENSMLUG00000001885	SYF2	96	71.368	ENSNBRG00000010720	syf2	96	71.368	Neolamprologus_brichardi
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	93.333	ENSNLEG00000035185	SYF2	98	94.118	Nomascus_leucogenys
ENSMLUG00000001885	SYF2	97	92.405	ENSOPRG00000012870	SYF2	97	92.405	Ochotona_princeps
ENSMLUG00000001885	SYF2	94	93.886	ENSODEG00000017664	-	96	93.886	Octodon_degus
ENSMLUG00000001885	SYF2	94	83.406	ENSODEG00000014338	-	96	83.406	Octodon_degus
ENSMLUG00000001885	SYF2	91	80.180	ENSONIG00000008213	syf2	97	77.350	Oreochromis_niloticus
ENSMLUG00000001885	SYF2	83	90.099	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMLUG00000001885	SYF2	94	97.380	ENSOCUG00000013050	SYF2	94	97.380	Oryctolagus_cuniculus
ENSMLUG00000001885	SYF2	91	81.532	ENSORLG00000028820	syf2	95	81.532	Oryzias_latipes
ENSMLUG00000001885	SYF2	96	78.571	ENSORLG00020018333	syf2	100	78.571	Oryzias_latipes_hni
ENSMLUG00000001885	SYF2	96	78.151	ENSORLG00015014665	syf2	100	78.151	Oryzias_latipes_hsok
ENSMLUG00000001885	SYF2	96	78.571	ENSOMEG00000013911	syf2	100	78.571	Oryzias_melastigma
ENSMLUG00000001885	SYF2	94	95.197	ENSOGAG00000009962	SYF2	94	95.197	Otolemur_garnettii
ENSMLUG00000001885	SYF2	97	92.469	ENSOARG00000006348	-	97	92.469	Ovis_aries
ENSMLUG00000001885	SYF2	80	65.641	ENSOARG00000006269	-	100	65.641	Ovis_aries
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	93.333	ENSPPAG00000036579	SYF2	98	94.118	Pan_paniscus
ENSMLUG00000001885	SYF2	95	95.708	ENSPPRG00000001651	-	95	95.708	Panthera_pardus
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.500	ENSPPRG00000001638	-	98	92.500	Panthera_pardus
ENSMLUG00000001885	SYF2	95	95.708	ENSPTIG00000007036	-	95	95.708	Panthera_tigris_altaica
ENSMLUG00000001885	SYF2	89	97.685	ENSPTIG00000005711	-	81	95.964	Panthera_tigris_altaica
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	93.333	ENSPTRG00000000352	SYF2	98	94.118	Pan_troglodytes
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.857	ENSPANG00000008139	SYF2	98	92.857	Papio_anubis
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	77.917	ENSPKIG00000008130	syf2	99	77.917	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMLUG00000001885	SYF2	96	86.325	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	86.325	Pelodiscus_sinensis
ENSMLUG00000001885	SYF2	92	79.911	ENSPMGG00000008755	syf2	88	79.911	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	89.583	ENSPEMG00000008283	Syf2	99	89.583	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMLUG00000001885	SYF2	92	92.444	ENSPCIG00000014235	SYF2	92	91.775	Phascolarctos_cinereus
ENSMLUG00000001885	SYF2	93	77.489	ENSPFOG00000004116	syf2	95	77.489	Poecilia_formosa
ENSMLUG00000001885	SYF2	100	72.332	ENSPLAG00000006691	syf2	100	77.253	Poecilia_latipinna
ENSMLUG00000001885	SYF2	94	75.109	ENSPMEG00000011684	syf2	97	75.109	Poecilia_mexicana
ENSMLUG00000001885	SYF2	89	81.019	ENSPREG00000003009	syf2	97	78.355	Poecilia_reticulata
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.917	ENSPPYG00000001713	SYF2	98	93.697	Pongo_abelii
ENSMLUG00000001885	SYF2	94	64.629	ENSPCOG00000027011	SYF2	92	64.192	Propithecus_coquereli
ENSMLUG00000001885	SYF2	97	82.700	ENSPVAG00000005841	SYF2	97	82.700	Pteropus_vampyrus
ENSMLUG00000001885	SYF2	91	80.631	ENSPNYG00000004979	syf2	99	76.667	Pundamilia_nyererei
ENSMLUG00000001885	SYF2	96	78.992	ENSPNAG00000015570	syf2	100	78.992	Pygocentrus_nattereri
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	89.583	ENSRNOG00000060597	Syf2	99	89.583	Rattus_norvegicus
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	90.336	ENSRBIG00000042970	SYF2	98	90.336	Rhinopithecus_bieti
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.857	ENSRROG00000001347	SYF2	98	92.857	Rhinopithecus_roxellana
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.500	ENSSBOG00000020184	SYF2	98	93.697	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMLUG00000001885	SYF2	93	91.150	ENSSHAG00000015630	-	93	90.043	Sarcophilus_harrisii
ENSMLUG00000001885	SYF2	84	92.233	ENSSHAG00000007152	-	100	92.233	Sarcophilus_harrisii
ENSMLUG00000001885	SYF2	92	81.778	ENSSFOG00015023647	syf2	95	81.778	Scleropages_formosus
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	75.833	ENSSMAG00000009867	syf2	99	75.833	Scophthalmus_maximus
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	76.151	ENSSDUG00000013072	syf2	99	77.500	Seriola_dumerili
ENSMLUG00000001885	SYF2	89	82.110	ENSSLDG00000012677	syf2	99	77.500	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	73.333	ENSSARG00000012889	SYF2	98	73.333	Sorex_araneus
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	83.750	ENSSPUG00000005251	SYF2	95	83.750	Sphenodon_punctatus
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	77.917	ENSSPAG00000009626	syf2	99	77.917	Stegastes_partitus
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	91.632	ENSSSCG00000037481	SYF2	98	91.632	Sus_scrofa
ENSMLUG00000001885	SYF2	61	59.603	ENSTGUG00000001126	SYF2	85	59.195	Taeniopygia_guttata
ENSMLUG00000001885	SYF2	99	75.720	ENSTRUG00000001499	syf2	96	75.720	Takifugu_rubripes
ENSMLUG00000001885	SYF2	91	78.475	ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.475	Tetraodon_nigroviridis
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	69.748	ENSTBEG00000017370	SYF2	97	69.328	Tupaia_belangeri
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	91.667	ENSTTRG00000003550	SYF2	98	91.667	Tursiops_truncatus
ENSMLUG00000001885	SYF2	95	94.421	ENSUAMG00000002897	SYF2	95	94.421	Ursus_americanus
ENSMLUG00000001885	SYF2	95	94.850	ENSUMAG00000013108	SYF2	95	94.850	Ursus_maritimus
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	90.833	ENSVPAG00000005705	SYF2	98	90.833	Vicugna_pacos
ENSMLUG00000001885	SYF2	95	95.279	ENSVVUG00000027175	-	95	95.279	Vulpes_vulpes
ENSMLUG00000001885	SYF2	95	92.275	ENSVVUG00000027181	-	94	92.275	Vulpes_vulpes
ENSMLUG00000001885	SYF2	98	82.353	ENSXETG00000022797	syf2	96	82.353	Xenopus_tropicalis
ENSMLUG00000001885	SYF2	88	80.465	ENSXMAG00000022698	syf2	93	78.378	Xiphophorus_maculatus