EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSMLUG00000009489 (Gene tree)
Gene ID: 102425494
Gene Symbol: RAB1A
Alias: RAB1|YPT1
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Myotis_lucifugus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 35249 bases
Position: chrGL429773:299394-334642
Accession: 102425494
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMLUP00000022804	MMR_HSR1	PF01926.23	1.1e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMLUT00000023791	RAB1A-201	1416	XM_006083274	ENSMLUP00000022804	205 (aa)	XP_006083336	G1QGH1
ENSMLUT00000009479	RAB1A-202	1320	-	ENSMLUP00000008638	173 (aa)	-	G1PDS8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMLUG00000009489	RAB1A	78	39.264	ENSMLUG00000008454	RAB7A	79	39.264
ENSMLUG00000009489	RAB1A	80	37.805	ENSMLUG00000015948	KRAS	86	37.805
ENSMLUG00000009489	RAB1A	56	32.203	ENSMLUG00000013429	ARL14	58	32.203
ENSMLUG00000009489	RAB1A	76	39.623	ENSMLUG00000012661	RAB9A	79	39.623
ENSMLUG00000009489	RAB1A	84	32.948	ENSMLUG00000004058	RAB23	73	32.948
ENSMLUG00000009489	RAB1A	81	30.233	ENSMLUG00000014143	DNAJC27	63	30.233
ENSMLUG00000009489	RAB1A	83	44.000	ENSMLUG00000006803	RAB33B	72	44.000
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	44.554	ENSMLUG00000009818	RAB14	93	44.554
ENSMLUG00000009489	RAB1A	95	43.814	ENSMLUG00000011716	RAB5A	90	43.814
ENSMLUG00000009489	RAB1A	68	30.496	ENSMLUG00000012603	ARL3	72	30.496
ENSMLUG00000009489	RAB1A	97	45.794	ENSMLUG00000001902	RAB2B	99	45.794
ENSMLUG00000009489	RAB1A	95	34.272	ENSMLUG00000000298	RAB36	63	34.722
ENSMLUG00000009489	RAB1A	77	40.373	ENSMLUG00000012440	RAB34	77	40.373
ENSMLUG00000009489	RAB1A	57	31.092	ENSMLUG00000006004	ARL4A	59	31.092
ENSMLUG00000009489	RAB1A	78	36.250	ENSMLUG00000016268	-	97	36.250
ENSMLUG00000009489	RAB1A	70	30.323	ENSMLUG00000014197	ARL4D	77	30.323
ENSMLUG00000009489	RAB1A	81	50.602	ENSMLUG00000006552	RAB30	82	50.602
ENSMLUG00000009489	RAB1A	82	32.544	ENSMLUG00000028170	ERAS	71	32.544
ENSMLUG00000009489	RAB1A	76	39.623	ENSMLUG00000028856	RAB9B	79	39.623
ENSMLUG00000009489	RAB1A	77	36.875	ENSMLUG00000010706	-	87	36.875
ENSMLUG00000009489	RAB1A	57	33.058	ENSMLUG00000024082	-	61	33.058
ENSMLUG00000009489	RAB1A	80	47.619	ENSMLUG00000009002	RAB33A	71	47.619
ENSMLUG00000009489	RAB1A	90	48.108	ENSMLUG00000002855	RAB2A	99	45.238
ENSMLUG00000009489	RAB1A	94	42.157	ENSMLUG00000006677	-	99	42.157
ENSMLUG00000009489	RAB1A	80	38.415	ENSMLUG00000022354	NRAS	86	38.415
ENSMLUG00000009489	RAB1A	55	35.652	ENSMLUG00000007927	MRAS	80	35.652
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	43.119	ENSMLUG00000002308	-	99	43.119
ENSMLUG00000009489	RAB1A	82	50.296	ENSMLUG00000002883	RAB12	70	50.296
ENSMLUG00000009489	RAB1A	81	46.988	ENSMLUG00000010153	RAB25	78	46.988
ENSMLUG00000009489	RAB1A	86	43.820	ENSMLUG00000007660	RAB39B	84	43.820
ENSMLUG00000009489	RAB1A	88	40.094	ENSMLUG00000027295	RAB18	94	39.286
ENSMLUG00000009489	RAB1A	85	52.299	ENSMLUG00000008820	RAB11A	67	52.299

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSG00000138069	RAB1A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	95.545	ENSAPOG00000008143	-	100	95.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSAMEG00000001127	RAB1A	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	95.545	ENSAOCG00000020606	-	100	95.545	Amphiprion_ocellaris
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	95.545	ENSAPEG00000022488	-	100	95.545	Amphiprion_percula
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSANAG00000020929	RAB1A	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	96.040	ENSACLG00000003326	-	100	96.040	Astatotilapia_calliptera
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	94.554	ENSAMXG00000034850	-	100	94.554	Astyanax_mexicanus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	Bos_taurus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00000003187	RAB1A	100	100.000	Canis_familiaris
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00020026971	RAB1A	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSMLUG00000009489	RAB1A	96	100.000	ENSCHIG00000014060	RAB1A	96	100.000	Capra_hircus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	98.049	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSCPOG00000015437	RAB1A	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSCATG00000030853	RAB1A	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	99.512	ENSCPBG00000013243	RAB1A	100	99.512	Chrysemys_picta_bellii
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	97.561	ENSCANG00000035916	RAB1A	100	97.561	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00001012691	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00000008456	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSDNOG00000018236	RAB1A	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSDORG00000028628	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	84.466	FBgn0285937	Rab1	100	84.466	Drosophila_melanogaster
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	100.000	ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	Echinops_telfairi
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSEASG00005007298	RAB1A	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSECAG00000009926	RAB1A	100	100.000	Equus_caballus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	100.000	ENSEEUG00000011721	RAB1A	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	95.588	ENSELUG00000012166	RAB1A	96	95.588	Esox_lucius
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSFCAG00000002536	RAB1A	100	100.000	Felis_catus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	97.537	ENSFALG00000013624	RAB1A	99	97.537	Ficedula_albicollis
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSFDAG00000019505	-	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	94.554	ENSFHEG00000014414	-	100	94.554	Fundulus_heteroclitus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	99.512	ENSGALG00000031582	RAB1A	100	99.512	Gallus_gallus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	94.554	ENSGAFG00000000918	-	100	94.554	Gambusia_affinis
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	99.512	ENSGAGG00000006802	RAB1A	100	99.512	Gopherus_agassizii
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSGGOG00000026603	RAB1A	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSHGLG00000013585	RAB1A	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	97.549	ENSHGLG00100007994	RAB1A	99	97.549	Heterocephalus_glaber_male
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSSTOG00000020693	-	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSMLUG00000009489	RAB1A	96	95.431	ENSKMAG00000014038	-	93	95.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	95.050	ENSLBEG00000028426	RAB1A	100	95.050	Labrus_bergylta
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	98.537	ENSLACG00000012869	RAB1A	100	98.537	Latimeria_chalumnae
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	Loxodonta_africana
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ENSMLUG00000009489	RAB1A	96	100.000	ENSMMUG00000021721	RAB1A	91	100.000	Macaca_mulatta
ENSMLUG00000009489	RAB1A	95	99.485	ENSMNEG00000028414	-	97	99.485	Macaca_nemestrina
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
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ENSMLUG00000009489	RAB1A	96	99.492	ENSMGAG00000004611	RAB1A	98	99.492	Meleagris_gallopavo
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	99.512	ENSMAUG00000012156	Rab1a	100	99.512	Mesocricetus_auratus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	99.512	ENSMOCG00000017022	Rab1a	100	99.512	Microtus_ochrogaster
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	93.564	ENSMMOG00000018709	RAB1A	100	93.564	Mola_mola
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	99.512	ENSMODG00000003340	RAB1A	100	99.512	Monodelphis_domestica
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	100	100.000	Mus_caroli
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ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	100	100.000	Mus_pahari
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	100	100.000	Mus_spretus
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ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSOCUG00000017003	RAB1A	100	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	Otolemur_garnettii
ENSMLUG00000009489	RAB1A	96	100.000	ENSOARG00000019997	RAB1A	97	100.000	Ovis_aries
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ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	Panthera_pardus
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ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSPTRG00000011989	RAB1A	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	ENSPANG00000010485	RAB1A	100	100.000	Papio_anubis
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	96.552	ENSPSIG00000008028	RAB1A	99	96.552	Pelodiscus_sinensis
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	95.588	ENSPMGG00000021015	-	99	95.588	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	99.512	ENSPCIG00000023212	RAB1A	100	99.512	Phascolarctos_cinereus
ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	93.137	ENSPFOG00000000498	-	99	93.137	Poecilia_formosa
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