EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMLUG00000016317 (Gene tree)
Gene ID: 102423716
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Myotis_lucifugus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 46451 bases
Position: chrGL429767:40591136-40637586
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMLUP00000014875	IBN_N	PF03810.19	6e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMLUT00000016325	TNPO1-201	2853	XM_006081559	ENSMLUP00000014875	859 (aa)	-	G1PUC3

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	85.681	ENSMLUG00000012669	TNPO2	99	85.681

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.302	ENSG00000083312	TNPO1	100	99.482	Homo_sapiens
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.481	ENSAPOG00000003453	tnpo1	96	93.481	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.305	ENSAMEG00000007147	TNPO1	95	99.305	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMLUG00000016317	TNPO1	86	92.463	ENSACIG00000003711	tnpo1	95	92.463	Amphilophus_citrinellus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.597	ENSAOCG00000008154	tnpo1	96	93.597	Amphiprion_ocellaris
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.597	ENSAPEG00000001112	tnpo1	96	93.597	Amphiprion_percula
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.248	ENSATEG00000010408	tnpo1	96	93.248	Anabas_testudineus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	94.104	ENSAPLG00000009619	-	96	93.757	Anas_platyrhynchos
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	96.275	ENSACAG00000009599	TNPO1	96	96.275	Anolis_carolinensis
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	90.221	ENSANAG00000025351	-	95	90.221	Aotus_nancymaae
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	64.475	ENSANAG00000027118	-	97	64.409	Aotus_nancymaae
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.836	ENSANAG00000022453	-	95	98.836	Aotus_nancymaae
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	91.153	ENSACLG00000027223	tnpo1	96	91.153	Astatotilapia_calliptera
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.334	ENSAMXG00000009842	tnpo1	96	91.986	Astyanax_mexicanus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.069	ENSBTAG00000007979	TNPO1	95	99.069	Bos_taurus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.952	ENSCJAG00000016409	TNPO1	95	98.952	Callithrix_jacchus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.071	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.071	Canis_familiaris
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	96.042	ENSCAFG00020017397	TNPO1	96	96.042	Canis_lupus_dingo
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.952	ENSCHIG00000023462	TNPO1	95	98.952	Capra_hircus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	97.555	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	97.555	Carlito_syrichta
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.836	ENSCCAG00000026472	TNPO1	96	98.836	Cebus_capucinus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.302	ENSCATG00000043792	TNPO1	96	99.302	Cercocebus_atys
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.836	ENSCLAG00000016191	TNPO1	96	98.836	Chinchilla_lanigera
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.185	ENSCSAG00000015616	TNPO1	95	99.185	Chlorocebus_sabaeus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	94	85.891	ENSCHOG00000001746	TNPO1	95	85.891	Choloepus_hoffmanni
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	97.206	ENSCPBG00000000260	TNPO1	91	97.206	Chrysemys_picta_bellii
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	75.116	ENSCSAVG00000010981	-	96	75.116	Ciona_savignyi
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.302	ENSCANG00000004353	TNPO1	95	99.302	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.952	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	95	98.952	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.952	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	98.952	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.317	ENSCSEG00000012674	tnpo1	96	92.317	Cynoglossus_semilaevis
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.782	ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	92.782	Cyprinodon_variegatus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.442	ENSDARG00000035390	tnpo1	96	92.093	Danio_rerio
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.691	ENSDNOG00000006647	TNPO1	96	92.691	Dasypus_novemcinctus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	97	99.041	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.040	Dipodomys_ordii
ENSMLUG00000016317	TNPO1	97	59.379	FBgn0035693	CG8219	96	58.901	Drosophila_melanogaster
ENSMLUG00000016317	TNPO1	86	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	85	99.625	Echinops_telfairi
ENSMLUG00000016317	TNPO1	98	84.716	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.834	Eptatretus_burgeri
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.302	ENSEASG00005018055	TNPO1	96	99.302	Equus_asinus_asinus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.185	ENSECAG00000024424	TNPO1	95	99.185	Equus_caballus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	86.020	ENSELUG00000002821	tnpo1	96	85.569	Esox_lucius
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.302	ENSFCAG00000013181	TNPO1	96	99.302	Felis_catus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	96.857	ENSFALG00000010292	TNPO1	96	96.857	Ficedula_albicollis
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.952	ENSFDAG00000013345	TNPO1	95	98.952	Fukomys_damarensis
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.140	ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	93.140	Fundulus_heteroclitus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	89.675	ENSGMOG00000000347	tnpo1	96	89.675	Gadus_morhua
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	96.391	ENSGALG00000015014	TNPO1	96	96.391	Gallus_gallus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.102	ENSGAFG00000000943	tnpo1	96	92.102	Gambusia_affinis
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.015	ENSGACG00000015841	tnpo1	96	93.015	Gasterosteus_aculeatus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	96.973	ENSGAGG00000013419	TNPO1	96	96.973	Gopherus_agassizii
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.302	ENSGGOG00000026800	TNPO1	96	99.302	Gorilla_gorilla
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	82.462	ENSGGOG00000022535	-	95	82.462	Gorilla_gorilla
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.782	ENSHBUG00000008068	tnpo1	96	92.782	Haplochromis_burtoni
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.603	ENSHGLG00000000970	-	95	98.603	Heterocephalus_glaber_female
ENSMLUG00000016317	TNPO1	99	77.273	ENSHGLG00100000963	-	98	76.690	Heterocephalus_glaber_male
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.603	ENSHGLG00100017090	-	99	98.603	Heterocephalus_glaber_male
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.069	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	93	99.069	Jaculus_jaculus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.132	ENSKMAG00000018195	tnpo1	96	93.132	Kryptolebias_marmoratus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	90	89.615	ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	89.615	Labrus_bergylta
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	88.644	ENSLACG00000012199	TNPO1	99	88.644	Latimeria_chalumnae
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	94.761	ENSLOCG00000011092	tnpo1	93	94.761	Lepisosteus_oculatus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.069	ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	99.069	Loxodonta_africana
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.302	ENSMFAG00000003636	TNPO1	95	99.302	Macaca_fascicularis
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.185	ENSMMUG00000020923	TNPO1	96	99.185	Macaca_mulatta
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.302	ENSMNEG00000044581	TNPO1	95	99.302	Macaca_nemestrina
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.302	ENSMLEG00000030740	TNPO1	95	99.302	Mandrillus_leucophaeus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.248	ENSMAMG00000001357	tnpo1	96	93.248	Mastacembelus_armatus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.549	ENSMZEG00005004913	tnpo1	96	92.549	Maylandia_zebra
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.952	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	95	98.952	Mesocricetus_auratus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	94.994	ENSMICG00000008468	TNPO1	95	94.994	Microcebus_murinus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.952	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	95	98.952	Microtus_ochrogaster
ENSMLUG00000016317	TNPO1	86	92.215	ENSMMOG00000005551	tnpo1	95	92.215	Mola_mola
ENSMLUG00000016317	TNPO1	99	97.660	ENSMODG00000001721	TNPO1	77	97.660	Monodelphis_domestica
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.084	ENSMALG00000009782	tnpo1	96	92.084	Monopterus_albus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.719	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	96	98.719	Mus_caroli
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.952	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	96	98.969	Mus_musculus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.836	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	96	98.840	Mus_pahari
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.719	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	96	98.711	Mus_spretus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.185	ENSMPUG00000014387	TNPO1	95	99.185	Mustela_putorius_furo
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.069	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	96	99.069	Nannospalax_galili
ENSMLUG00000016317	TNPO1	86	92.328	ENSNBRG00000009998	tnpo1	95	92.328	Neolamprologus_brichardi
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.302	ENSNLEG00000004572	TNPO1	96	99.302	Nomascus_leucogenys
ENSMLUG00000016317	TNPO1	90	93.662	ENSOPRG00000012390	TNPO1	86	93.662	Ochotona_princeps
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.603	ENSODEG00000001771	TNPO1	95	98.603	Octodon_degus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.023	ENSONIG00000011151	tnpo1	95	92.023	Oreochromis_niloticus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	96	97.330	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.330	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.558	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.558	Oryctolagus_cuniculus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	86	92.194	ENSORLG00000003182	tnpo1	95	92.194	Oryzias_latipes
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.549	ENSORLG00020011559	tnpo1	96	92.549	Oryzias_latipes_hni
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.666	ENSORLG00015019113	tnpo1	96	92.666	Oryzias_latipes_hsok
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.549	ENSOMEG00000014567	tnpo1	96	92.549	Oryzias_melastigma
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.185	ENSOGAG00000000808	TNPO1	95	99.185	Otolemur_garnettii
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.069	ENSOARG00000005038	TNPO1	80	99.069	Ovis_aries
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.302	ENSPPAG00000042518	TNPO1	95	99.302	Pan_paniscus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.302	ENSPPRG00000022336	TNPO1	96	99.302	Panthera_pardus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.302	ENSPTIG00000018839	TNPO1	96	99.302	Panthera_tigris_altaica
ENSMLUG00000016317	TNPO1	94	86.311	ENSPTRG00000047731	-	96	86.311	Pan_troglodytes
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.302	ENSPTRG00000016972	TNPO1	95	99.302	Pan_troglodytes
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.302	ENSPANG00000006074	TNPO1	95	99.302	Papio_anubis
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	90.105	ENSPKIG00000019795	tnpo1	96	90.105	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	96.857	ENSPSIG00000014366	TNPO1	95	96.857	Pelodiscus_sinensis
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	90.233	ENSPMGG00000017014	tnpo1	96	90.349	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.952	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	98.952	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	97.788	ENSPCIG00000026080	TNPO1	96	97.788	Phascolarctos_cinereus
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.923	ENSPFOG00000011447	tnpo1	96	92.923	Poecilia_formosa
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.923	ENSPLAG00000018696	tnpo1	96	92.923	Poecilia_latipinna
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.132	ENSPMEG00000024121	tnpo1	96	93.132	Poecilia_mexicana
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.031	ENSPREG00000020705	tnpo1	96	93.031	Poecilia_reticulata
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.185	ENSPPYG00000015545	TNPO1	95	99.185	Pongo_abelii
ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.185	ENSPCOG00000004254	TNPO1	95	99.185	Propithecus_coquereli
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