EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMMOG00000002396 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA-splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Mola_mola
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7124 bases
Position: chrKV751346.1:9737423-9744546
Accession: ZDB-GENE-040801-170
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMMOP00000002976	SYF2	PF08231.12	4.2e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMMOT00000003021	-	720	-	ENSMMOP00000002976	239 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSMMOG00000002396's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMMOG00000002396's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.093	ENSG00000117614	SYF2	90	79.909	Homo_sapiens
ENSMMOG00000002396	syf2	93	91.892	ENSAPOG00000001174	syf2	95	91.189	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMMOG00000002396	syf2	82	79.487	ENSAMEG00000010134	-	100	79.487	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMMOG00000002396	syf2	98	75.210	ENSAMEG00000010115	-	99	74.689	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMMOG00000002396	syf2	99	88.136	ENSACIG00000023688	syf2	94	88.136	Amphilophus_citrinellus
ENSMMOG00000002396	syf2	90	88.785	ENSAOCG00000010912	syf2	67	88.785	Amphiprion_ocellaris
ENSMMOG00000002396	syf2	97	89.610	ENSAOCG00000022046	syf2	98	89.610	Amphiprion_ocellaris
ENSMMOG00000002396	syf2	97	89.610	ENSAPEG00000018858	syf2	89	89.610	Amphiprion_percula
ENSMMOG00000002396	syf2	91	91.705	ENSATEG00000007745	syf2	95	90.308	Anabas_testudineus
ENSMMOG00000002396	syf2	83	81.407	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	81.000	Anas_platyrhynchos
ENSMMOG00000002396	syf2	69	69.461	ENSACAG00000026777	-	100	69.461	Anolis_carolinensis
ENSMMOG00000002396	syf2	85	82.843	ENSACAG00000013653	-	100	82.843	Anolis_carolinensis
ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.556	ENSANAG00000032473	SYF2	90	80.365	Aotus_nancymaae
ENSMMOG00000002396	syf2	93	89.640	ENSACLG00000019916	syf2	97	87.879	Astatotilapia_calliptera
ENSMMOG00000002396	syf2	94	85.268	ENSAMXG00000004051	syf2	94	85.268	Astyanax_mexicanus
ENSMMOG00000002396	syf2	93	79.730	ENSBTAG00000001651	SYF2	94	79.730	Bos_taurus
ENSMMOG00000002396	syf2	87	53.081	WBGene00019402	syf-2	90	53.081	Caenorhabditis_elegans
ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.556	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	80.365	Callithrix_jacchus
ENSMMOG00000002396	syf2	98	70.638	ENSCAFG00000030331	-	97	70.638	Canis_familiaris
ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.093	ENSCAFG00000012895	-	89	79.909	Canis_familiaris
ENSMMOG00000002396	syf2	76	70.330	ENSCAFG00020021094	-	95	70.330	Canis_lupus_dingo
ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.093	ENSCAFG00020021091	-	89	79.909	Canis_lupus_dingo
ENSMMOG00000002396	syf2	93	79.279	ENSCHIG00000020874	SYF2	92	79.279	Capra_hircus
ENSMMOG00000002396	syf2	93	79.279	ENSTSYG00000005114	SYF2	91	79.279	Carlito_syrichta
ENSMMOG00000002396	syf2	83	79.798	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	79.798	Cavia_aperea
ENSMMOG00000002396	syf2	92	80.365	ENSCPOG00000005326	SYF2	90	80.365	Cavia_porcellus
ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.556	ENSCCAG00000022459	SYF2	90	80.365	Cebus_capucinus
ENSMMOG00000002396	syf2	92	78.995	ENSCATG00000026917	SYF2	90	78.995	Cercocebus_atys
ENSMMOG00000002396	syf2	93	80.180	ENSCLAG00000008474	SYF2	91	80.180	Chinchilla_lanigera
ENSMMOG00000002396	syf2	92	78.995	ENSCSAG00000000948	SYF2	90	78.995	Chlorocebus_sabaeus
ENSMMOG00000002396	syf2	69	62.651	ENSCHOG00000005273	-	91	62.651	Choloepus_hoffmanni
ENSMMOG00000002396	syf2	93	82.432	ENSCPBG00000025073	SYF2	95	79.237	Chrysemys_picta_bellii
ENSMMOG00000002396	syf2	88	52.582	ENSCING00000003017	-	89	53.052	Ciona_intestinalis
ENSMMOG00000002396	syf2	88	49.765	ENSCSAVG00000006627	-	97	49.765	Ciona_savignyi
ENSMMOG00000002396	syf2	92	69.863	ENSCANG00000037322	SYF2	89	69.863	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMMOG00000002396	syf2	97	77.253	ENSCGRG00001020733	Syf2	96	77.253	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMMOG00000002396	syf2	82	80.612	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	80.402	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMMOG00000002396	syf2	91	88.532	ENSCSEG00000000117	syf2	99	85.714	Cynoglossus_semilaevis
ENSMMOG00000002396	syf2	92	90.045	ENSCVAG00000019543	syf2	96	88.261	Cyprinodon_variegatus
ENSMMOG00000002396	syf2	95	85.463	ENSDARG00000004706	syf2	95	85.463	Danio_rerio
ENSMMOG00000002396	syf2	97	77.872	ENSDNOG00000047605	SYF2	96	77.872	Dasypus_novemcinctus
ENSMMOG00000002396	syf2	93	79.730	ENSDORG00000001274	Syf2	91	79.730	Dipodomys_ordii
ENSMMOG00000002396	syf2	91	55.000	FBgn0033556	CG12343	97	55.000	Drosophila_melanogaster
ENSMMOG00000002396	syf2	90	64.840	ENSETEG00000015729	SYF2	96	64.840	Echinops_telfairi
ENSMMOG00000002396	syf2	82	57.360	ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.360	Eptatretus_burgeri
ENSMMOG00000002396	syf2	97	76.596	ENSEASG00005004224	-	96	76.596	Equus_asinus_asinus
ENSMMOG00000002396	syf2	96	69.528	ENSEASG00005004232	-	92	71.171	Equus_asinus_asinus
ENSMMOG00000002396	syf2	97	76.596	ENSECAG00000010440	-	98	76.596	Equus_caballus
ENSMMOG00000002396	syf2	97	76.596	ENSECAG00000012023	-	96	76.596	Equus_caballus
ENSMMOG00000002396	syf2	72	66.474	ENSEEUG00000015084	SYF2	95	66.474	Erinaceus_europaeus
ENSMMOG00000002396	syf2	93	87.387	ENSELUG00000003465	syf2	93	87.387	Esox_lucius
ENSMMOG00000002396	syf2	97	76.271	ENSFCAG00000010324	-	82	76.271	Felis_catus
ENSMMOG00000002396	syf2	97	76.695	ENSFCAG00000043095	-	96	76.695	Felis_catus
ENSMMOG00000002396	syf2	85	78.922	ENSFALG00000000460	SYF2	96	73.640	Ficedula_albicollis
ENSMMOG00000002396	syf2	92	79.909	ENSFDAG00000008310	SYF2	90	79.909	Fukomys_damarensis
ENSMMOG00000002396	syf2	94	74.336	ENSFHEG00000007238	syf2	100	74.336	Fundulus_heteroclitus
ENSMMOG00000002396	syf2	90	89.302	ENSGMOG00000019138	syf2	96	89.302	Gadus_morhua
ENSMMOG00000002396	syf2	93	79.730	ENSGALG00000013639	SYF2	88	79.730	Gallus_gallus
ENSMMOG00000002396	syf2	99	85.169	ENSGAFG00000019435	syf2	97	86.580	Gambusia_affinis
ENSMMOG00000002396	syf2	93	88.288	ENSGACG00000007305	syf2	98	85.470	Gasterosteus_aculeatus
ENSMMOG00000002396	syf2	93	82.883	ENSGAGG00000010670	SYF2	95	80.085	Gopherus_agassizii
ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.093	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	79.909	Gorilla_gorilla
ENSMMOG00000002396	syf2	98	88.085	ENSHBUG00000020477	syf2	100	88.085	Haplochromis_burtoni
ENSMMOG00000002396	syf2	97	76.496	ENSHGLG00000014393	SYF2	96	76.923	Heterocephalus_glaber_female
ENSMMOG00000002396	syf2	93	69.058	ENSHGLG00000004304	-	93	69.507	Heterocephalus_glaber_female
ENSMMOG00000002396	syf2	97	76.496	ENSHGLG00100014722	SYF2	96	76.923	Heterocephalus_glaber_male
ENSMMOG00000002396	syf2	97	88.312	ENSHCOG00000012904	syf2	75	88.312	Hippocampus_comes
ENSMMOG00000002396	syf2	95	84.513	ENSIPUG00000019859	syf2	95	84.513	Ictalurus_punctatus
ENSMMOG00000002396	syf2	61	73.973	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	73.973	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMMOG00000002396	syf2	83	80.402	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	80.402	Jaculus_jaculus
ENSMMOG00000002396	syf2	99	86.975	ENSKMAG00000013856	syf2	99	86.975	Kryptolebias_marmoratus
ENSMMOG00000002396	syf2	92	92.237	ENSLBEG00000014425	syf2	95	91.189	Labrus_bergylta
ENSMMOG00000002396	syf2	97	77.586	ENSLACG00000012064	SYF2	97	77.586	Latimeria_chalumnae
ENSMMOG00000002396	syf2	96	84.348	ENSLOCG00000002728	syf2	92	84.348	Lepisosteus_oculatus
ENSMMOG00000002396	syf2	97	77.872	ENSLAFG00000023150	-	96	77.872	Loxodonta_africana
ENSMMOG00000002396	syf2	77	53.804	ENSLAFG00000030814	-	100	53.804	Loxodonta_africana
ENSMMOG00000002396	syf2	92	78.995	ENSMFAG00000041831	SYF2	90	78.995	Macaca_fascicularis
ENSMMOG00000002396	syf2	90	79.167	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	78.995	Macaca_mulatta
ENSMMOG00000002396	syf2	92	78.995	ENSMNEG00000030180	SYF2	90	78.995	Macaca_nemestrina
ENSMMOG00000002396	syf2	92	78.995	ENSMLEG00000030248	SYF2	90	78.995	Mandrillus_leucophaeus
ENSMMOG00000002396	syf2	91	93.548	ENSMAMG00000010403	syf2	98	89.873	Mastacembelus_armatus
ENSMMOG00000002396	syf2	97	87.500	ENSMZEG00005006429	syf2	97	87.500	Maylandia_zebra
ENSMMOG00000002396	syf2	83	80.905	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	80.905	Meleagris_gallopavo
ENSMMOG00000002396	syf2	97	78.541	ENSMAUG00000018974	Syf2	96	78.541	Mesocricetus_auratus
ENSMMOG00000002396	syf2	83	80.402	ENSMICG00000016191	SYF2	100	80.402	Microcebus_murinus
ENSMMOG00000002396	syf2	97	78.541	ENSMOCG00000022938	Syf2	96	78.541	Microtus_ochrogaster
ENSMMOG00000002396	syf2	93	77.232	ENSMODG00000013951	-	98	77.232	Monodelphis_domestica
ENSMMOG00000002396	syf2	99	87.029	ENSMALG00000010706	syf2	99	87.448	Monopterus_albus
ENSMMOG00000002396	syf2	97	78.541	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	96	78.541	Mus_caroli
ENSMMOG00000002396	syf2	97	78.541	ENSMUSG00000028821	Syf2	96	78.541	Mus_musculus
ENSMMOG00000002396	syf2	97	78.541	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	96	78.541	Mus_pahari
ENSMMOG00000002396	syf2	97	78.541	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	96	78.541	Mus_spretus
ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.093	ENSMPUG00000015802	-	89	79.909	Mustela_putorius_furo
ENSMMOG00000002396	syf2	93	78.829	ENSMPUG00000015801	-	90	78.829	Mustela_putorius_furo
ENSMMOG00000002396	syf2	93	78.378	ENSMLUG00000001885	SYF2	91	78.378	Myotis_lucifugus
ENSMMOG00000002396	syf2	97	75.949	ENSNGAG00000007912	Syf2	96	75.949	Nannospalax_galili
ENSMMOG00000002396	syf2	98	77.778	ENSNBRG00000010720	syf2	98	77.778	Neolamprologus_brichardi
ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.093	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	79.909	Nomascus_leucogenys
ENSMMOG00000002396	syf2	96	76.824	ENSOPRG00000012870	SYF2	96	76.824	Ochotona_princeps
ENSMMOG00000002396	syf2	93	70.721	ENSODEG00000014338	-	92	70.721	Octodon_degus
ENSMMOG00000002396	syf2	93	78.378	ENSODEG00000017664	-	93	78.378	Octodon_degus
ENSMMOG00000002396	syf2	93	90.090	ENSONIG00000008213	syf2	97	88.312	Oreochromis_niloticus
ENSMMOG00000002396	syf2	85	81.683	ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.683	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.556	ENSOCUG00000013050	SYF2	91	79.730	Oryctolagus_cuniculus
ENSMMOG00000002396	syf2	97	86.207	ENSORLG00000028820	syf2	99	86.207	Oryzias_latipes
ENSMMOG00000002396	syf2	94	88.444	ENSORLG00020018333	syf2	95	88.444	Oryzias_latipes_hni
ENSMMOG00000002396	syf2	94	88.000	ENSORLG00015014665	syf2	95	88.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSMMOG00000002396	syf2	94	89.778	ENSOMEG00000013911	syf2	95	89.778	Oryzias_melastigma
ENSMMOG00000002396	syf2	93	79.821	ENSOGAG00000009962	SYF2	91	79.821	Otolemur_garnettii
ENSMMOG00000002396	syf2	93	78.571	ENSOARG00000006348	-	91	78.571	Ovis_aries
ENSMMOG00000002396	syf2	82	55.897	ENSOARG00000006269	-	100	55.897	Ovis_aries
ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.093	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	79.909	Pan_paniscus
ENSMMOG00000002396	syf2	92	80.365	ENSPPRG00000001638	-	89	80.365	Panthera_pardus
ENSMMOG00000002396	syf2	97	76.695	ENSPPRG00000001651	-	96	76.695	Panthera_pardus
ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.556	ENSPTIG00000005711	-	80	80.275	Panthera_tigris_altaica
ENSMMOG00000002396	syf2	97	76.695	ENSPTIG00000007036	-	96	76.695	Panthera_tigris_altaica
ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.093	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	79.909	Pan_troglodytes
ENSMMOG00000002396	syf2	92	78.995	ENSPANG00000008139	SYF2	90	78.995	Papio_anubis
ENSMMOG00000002396	syf2	92	85.068	ENSPKIG00000008130	syf2	94	85.068	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMMOG00000002396	syf2	98	77.872	ENSPSIG00000011816	SYF2	89	77.872	Pelodiscus_sinensis
ENSMMOG00000002396	syf2	92	90.045	ENSPMGG00000008755	syf2	86	90.045	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMMOG00000002396	syf2	97	77.682	ENSPEMG00000008283	Syf2	96	77.682	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMMOG00000002396	syf2	93	80.180	ENSPCIG00000014235	SYF2	89	80.180	Phascolarctos_cinereus
ENSMMOG00000002396	syf2	97	87.554	ENSPFOG00000004116	syf2	96	87.554	Poecilia_formosa
ENSMMOG00000002396	syf2	98	86.809	ENSPLAG00000006691	syf2	99	87.826	Poecilia_latipinna
ENSMMOG00000002396	syf2	97	83.550	ENSPMEG00000011684	syf2	99	83.550	Poecilia_mexicana
ENSMMOG00000002396	syf2	90	89.815	ENSPREG00000003009	syf2	97	87.826	Poecilia_reticulata
ENSMMOG00000002396	syf2	92	79.909	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	79.909	Pongo_abelii
ENSMMOG00000002396	syf2	93	54.505	ENSPCOG00000027011	SYF2	88	54.505	Propithecus_coquereli
ENSMMOG00000002396	syf2	93	70.270	ENSPVAG00000005841	SYF2	91	70.270	Pteropus_vampyrus
ENSMMOG00000002396	syf2	93	89.640	ENSPNYG00000004979	syf2	99	86.555	Pundamilia_nyererei
ENSMMOG00000002396	syf2	94	84.889	ENSPNAG00000015570	syf2	95	84.889	Pygocentrus_nattereri
ENSMMOG00000002396	syf2	97	78.541	ENSRNOG00000060597	Syf2	96	78.541	Rattus_norvegicus
ENSMMOG00000002396	syf2	92	76.712	ENSRBIG00000042970	SYF2	90	76.712	Rhinopithecus_bieti
ENSMMOG00000002396	syf2	92	78.995	ENSRROG00000001347	SYF2	90	78.995	Rhinopithecus_roxellana
ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.556	ENSSBOG00000020184	SYF2	90	80.365	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMMOG00000002396	syf2	86	80.583	ENSSHAG00000007152	-	100	80.583	Sarcophilus_harrisii
ENSMMOG00000002396	syf2	93	79.730	ENSSHAG00000015630	-	89	79.730	Sarcophilus_harrisii
ENSMMOG00000002396	syf2	92	87.330	ENSSFOG00015023647	syf2	93	87.330	Scleropages_formosus
ENSMMOG00000002396	syf2	95	89.381	ENSSMAG00000009867	syf2	95	89.381	Scophthalmus_maximus
ENSMMOG00000002396	syf2	91	92.661	ENSSDUG00000013072	syf2	95	90.749	Seriola_dumerili
ENSMMOG00000002396	syf2	91	92.661	ENSSLDG00000012677	syf2	95	90.749	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMMOG00000002396	syf2	93	60.811	ENSSARG00000012889	SYF2	91	60.811	Sorex_araneus
ENSMMOG00000002396	syf2	99	76.250	ENSSPUG00000005251	SYF2	95	76.250	Sphenodon_punctatus
ENSMMOG00000002396	syf2	94	91.556	ENSSPAG00000009626	syf2	95	91.556	Stegastes_partitus
ENSMMOG00000002396	syf2	97	76.170	ENSSSCG00000037481	SYF2	96	76.170	Sus_scrofa
ENSMMOG00000002396	syf2	62	50.993	ENSTGUG00000001126	SYF2	81	52.121	Taeniopygia_guttata
ENSMMOG00000002396	syf2	97	87.500	ENSTRUG00000001499	syf2	93	87.500	Takifugu_rubripes
ENSMMOG00000002396	syf2	93	87.838	ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.838	Tetraodon_nigroviridis
ENSMMOG00000002396	syf2	93	59.009	ENSTBEG00000017370	SYF2	89	59.009	Tupaia_belangeri
ENSMMOG00000002396	syf2	90	79.630	ENSTTRG00000003550	SYF2	91	78.829	Tursiops_truncatus
ENSMMOG00000002396	syf2	92	79.909	ENSUAMG00000002897	SYF2	89	79.909	Ursus_americanus
ENSMMOG00000002396	syf2	90	79.630	ENSUMAG00000013108	SYF2	89	79.452	Ursus_maritimus
ENSMMOG00000002396	syf2	96	76.496	ENSVPAG00000005705	SYF2	96	76.496	Vicugna_pacos
ENSMMOG00000002396	syf2	86	79.024	ENSVVUG00000027181	-	95	75.000	Vulpes_vulpes
ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.093	ENSVVUG00000027175	-	89	79.909	Vulpes_vulpes
ENSMMOG00000002396	syf2	93	78.378	ENSXETG00000022797	syf2	89	78.378	Xenopus_tropicalis
ENSMMOG00000002396	syf2	90	90.698	ENSXMAG00000022698	syf2	97	87.879	Xiphophorus_maculatus