EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMMOG00000005551 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mola_mola
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15586 bases
Position: chrKV751320.1:7541539-7557124
Accession: ZDB-GENE-080819-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMMOP00000007159	IBN_N	PF03810.19	3.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMMOT00000007294	-	2343	-	ENSMMOP00000007159	780 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	81.161	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	81.290
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	85.992	ENSMMOG00000021390	TNPO2	98	86.252

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSG00000083312	TNPO1	87	92.526	Homo_sapiens
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	97.680	ENSAPOG00000003453	tnpo1	87	97.680	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	90.306	ENSAMEG00000007147	TNPO1	86	90.944	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.658	ENSACIG00000003711	tnpo1	100	96.658	Amphilophus_citrinellus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	97.809	ENSAOCG00000008154	tnpo1	87	97.809	Amphiprion_ocellaris
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	97.809	ENSAPEG00000001112	tnpo1	87	97.809	Amphiprion_percula
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	97.294	ENSATEG00000010408	tnpo1	87	97.294	Anabas_testudineus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	98	88.672	ENSAPLG00000009619	-	84	89.907	Anas_platyrhynchos
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	93.686	ENSACAG00000009599	TNPO1	87	93.686	Anolis_carolinensis
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	60.459	ENSANAG00000027118	-	86	60.025	Aotus_nancymaae
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	82.732	ENSANAG00000025351	-	86	82.732	Aotus_nancymaae
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.139	ENSANAG00000022453	-	86	92.139	Aotus_nancymaae
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	94.845	ENSACLG00000027223	tnpo1	87	94.845	Astatotilapia_calliptera
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	93.822	ENSAMXG00000009842	tnpo1	87	93.814	Astyanax_mexicanus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.655	ENSBTAG00000007979	TNPO1	86	92.655	Bos_taurus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.268	ENSCJAG00000016409	TNPO1	86	92.268	Callithrix_jacchus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	95	92.194	ENSCAFG00000008081	TNPO1	86	91.925	Canis_familiaris
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	90.039	ENSCAFG00020017397	TNPO1	87	89.820	Canis_lupus_dingo
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSCHIG00000023462	TNPO1	86	92.526	Capra_hircus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	87.938	ENSTSYG00000001871	TNPO1	84	91.363	Carlito_syrichta
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.139	ENSCCAG00000026472	TNPO1	87	92.139	Cebus_capucinus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSCATG00000043792	TNPO1	95	92.588	Cercocebus_atys
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.010	ENSCLAG00000016191	TNPO1	87	92.010	Chinchilla_lanigera
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSCSAG00000015616	TNPO1	86	92.526	Chlorocebus_sabaeus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	83.053	ENSCHOG00000001746	TNPO1	91	82.794	Choloepus_hoffmanni
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.655	ENSCPBG00000000260	TNPO1	82	93.557	Chrysemys_picta_bellii
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	75.161	ENSCSAVG00000010981	-	99	71.324	Ciona_savignyi
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSCANG00000004353	TNPO1	86	92.526	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	86	92.526	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMMOG00000005551	tnpo1	95	92.848	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	86	92.848	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	95.490	ENSCSEG00000012674	tnpo1	87	95.490	Cynoglossus_semilaevis
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.263	ENSCVAG00000001010	tnpo1	87	96.263	Cyprinodon_variegatus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	94.330	ENSDARG00000035390	tnpo1	87	93.814	Danio_rerio
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	86.008	ENSDNOG00000006647	TNPO1	86	85.751	Dasypus_novemcinctus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	92	92.867	ENSDORG00000006476	Tnpo1	86	92.867	Dipodomys_ordii
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	57.827	FBgn0035693	CG8219	86	57.439	Drosophila_melanogaster
ENSMMOG00000005551	tnpo1	88	93.011	ENSETEG00000017805	TNPO1	80	93.011	Echinops_telfairi
ENSMMOG00000005551	tnpo1	93	84.298	ENSEBUG00000001895	tnpo1	86	83.884	Eptatretus_burgeri
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSEASG00005018055	TNPO1	87	92.526	Equus_asinus_asinus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSECAG00000024424	TNPO1	86	92.526	Equus_caballus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	87.282	ENSELUG00000002821	tnpo1	87	86.783	Esox_lucius
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSFCAG00000013181	TNPO1	87	92.526	Felis_catus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	93.428	ENSFALG00000010292	TNPO1	87	93.428	Ficedula_albicollis
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.139	ENSFDAG00000013345	TNPO1	86	92.139	Fukomys_damarensis
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.521	ENSFHEG00000019234	tnpo1	87	96.521	Fundulus_heteroclitus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.535	ENSGMOG00000000347	tnpo1	87	92.535	Gadus_morhua
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSGALG00000015014	TNPO1	89	92.526	Gallus_gallus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.134	ENSGAFG00000000943	tnpo1	87	96.134	Gambusia_affinis
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	95.490	ENSGACG00000015841	tnpo1	86	95.490	Gasterosteus_aculeatus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	93.428	ENSGAGG00000013419	TNPO1	87	93.428	Gopherus_agassizii
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	78.968	ENSGGOG00000022535	-	86	78.968	Gorilla_gorilla
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSGGOG00000026800	TNPO1	87	92.526	Gorilla_gorilla
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.907	ENSHBUG00000008068	tnpo1	87	96.907	Haplochromis_burtoni
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.010	ENSHGLG00000000970	-	86	92.010	Heterocephalus_glaber_female
ENSMMOG00000005551	tnpo1	95	92.183	ENSHGLG00100017090	-	86	92.183	Heterocephalus_glaber_male
ENSMMOG00000005551	tnpo1	96	71.007	ENSHGLG00100000963	-	84	70.107	Heterocephalus_glaber_male
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.655	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	84	92.655	Jaculus_jaculus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	95.876	ENSKMAG00000018195	tnpo1	87	95.876	Kryptolebias_marmoratus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	97.304	ENSLBEG00000009521	tnpo1	93	97.304	Labrus_bergylta
ENSMMOG00000005551	tnpo1	95	90.604	ENSLACG00000012199	TNPO1	86	90.604	Latimeria_chalumnae
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	93.943	ENSLOCG00000011092	tnpo1	84	93.943	Lepisosteus_oculatus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	96	92.021	ENSLAFG00000011796	TNPO1	87	92.021	Loxodonta_africana
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSMFAG00000003636	TNPO1	86	92.526	Macaca_fascicularis
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.487	ENSMMUG00000020923	TNPO1	87	92.487	Macaca_mulatta
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSMNEG00000044581	TNPO1	86	92.526	Macaca_nemestrina
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSMLEG00000030740	TNPO1	86	92.526	Mandrillus_leucophaeus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	97.680	ENSMAMG00000001357	tnpo1	87	97.680	Mastacembelus_armatus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.392	ENSMZEG00005004913	tnpo1	87	96.392	Maylandia_zebra
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	92.697	Mesocricetus_auratus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	88.273	ENSMICG00000008468	TNPO1	86	88.273	Microcebus_murinus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	86	92.526	Microtus_ochrogaster
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	95.115	ENSMODG00000001721	TNPO1	69	95.115	Monodelphis_domestica
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	95.876	ENSMALG00000009782	tnpo1	87	95.876	Monopterus_albus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	92.697	Mus_caroli
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	92.697	Mus_musculus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.655	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	92.697	Mus_pahari
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.268	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	92.697	Mus_spretus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSMPUG00000014387	TNPO1	86	92.526	Mustela_putorius_furo
ENSMMOG00000005551	tnpo1	95	92.215	ENSMLUG00000016317	TNPO1	86	92.215	Myotis_lucifugus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	87	92.526	Nannospalax_galili
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.915	ENSNBRG00000009998	tnpo1	100	96.915	Neolamprologus_brichardi
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSNLEG00000004572	TNPO1	87	92.526	Nomascus_leucogenys
ENSMMOG00000005551	tnpo1	88	86.581	ENSOPRG00000012390	TNPO1	76	86.581	Ochotona_princeps
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	91.753	ENSODEG00000001771	TNPO1	86	91.753	Octodon_degus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.282	ENSONIG00000011151	tnpo1	86	96.282	Oreochromis_niloticus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	95	93.927	ENSOANG00000015785	TNPO1	90	93.927	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	95	85.714	ENSOCUG00000013318	TNPO1	86	85.175	Oryctolagus_cuniculus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.654	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.654	Oryzias_latipes
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.378	ENSORLG00020011559	tnpo1	87	96.378	Oryzias_latipes_hni
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.766	ENSORLG00015019113	tnpo1	87	96.766	Oryzias_latipes_hsok
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.248	ENSOMEG00000014567	tnpo1	87	96.248	Oryzias_melastigma
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSOGAG00000000808	TNPO1	86	92.526	Otolemur_garnettii
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	91.881	ENSOARG00000005038	TNPO1	73	92.655	Ovis_aries
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSPPAG00000042518	TNPO1	86	92.526	Pan_paniscus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSPPRG00000022336	TNPO1	87	92.526	Panthera_pardus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSPTIG00000018839	TNPO1	87	92.526	Panthera_tigris_altaica
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSPTRG00000016972	TNPO1	86	92.526	Pan_troglodytes
ENSMMOG00000005551	tnpo1	93	81.906	ENSPTRG00000047731	-	90	81.906	Pan_troglodytes
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSPANG00000006074	TNPO1	86	92.526	Papio_anubis
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	89.691	ENSPKIG00000019795	tnpo1	87	90.206	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	93.686	ENSPSIG00000014366	TNPO1	86	93.686	Pelodiscus_sinensis
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.793	ENSPMGG00000017014	tnpo1	87	91.892	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	95	92.848	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	86	92.848	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	93.943	ENSPCIG00000026080	TNPO1	89	93.943	Phascolarctos_cinereus
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.911	ENSPFOG00000011447	tnpo1	87	96.911	Poecilia_formosa
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.911	ENSPLAG00000018696	tnpo1	87	96.911	Poecilia_latipinna
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.907	ENSPMEG00000024121	tnpo1	87	96.907	Poecilia_mexicana
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ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.397	ENSPPYG00000015545	TNPO1	86	92.397	Pongo_abelii
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	ENSPCOG00000004254	TNPO1	86	92.526	Propithecus_coquereli
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.655	ENSPVAG00000013051	TNPO1	86	92.655	Pteropus_vampyrus
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ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	93.814	ENSPNAG00000021484	tnpo1	87	93.814	Pygocentrus_nattereri
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ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	91.237	ENSXETG00000016812	tnpo1	86	91.237	Xenopus_tropicalis
ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.263	ENSXMAG00000005440	tnpo1	87	96.263	Xiphophorus_maculatus