EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMMUG00000002968 (Gene tree)
Gene ID: 719564
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Macaca_mulatta
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10745 bases
Position: chr1:24051662-24062406
Accession: 719564
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMMUP00000003968	SYF2	PF08231.12	3e-54	1	1
ENSMMUP00000003967	SYF2	PF08231.12	8.3e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMMUT00000004206	SYF2-202	606	-	ENSMMUP00000003968	201 (aa)	-	F7GXY5
ENSMMUT00000004205	SYF2-201	2240	XM_015131428	ENSMMUP00000003967	243 (aa)	XP_014986914	F7GXY6

Gene Model

Click here to download ENSMMUG00000002968's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
mcc03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMMUG00000002968's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	97.531	ENSG00000117614	SYF2	100	97.531	Homo_sapiens
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	83.562	ENSAPOG00000001174	syf2	91	83.796	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMMUG00000002968	SYF2	98	92.116	ENSAMEG00000010115	-	99	91.701	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMMUG00000002968	SYF2	80	95.897	ENSAMEG00000010134	-	100	95.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	80.822	ENSACIG00000023688	syf2	86	81.395	Amphilophus_citrinellus
ENSMMUG00000002968	SYF2	98	79.832	ENSAOCG00000022046	syf2	92	84.259	Amphiprion_ocellaris
ENSMMUG00000002968	SYF2	88	78.539	ENSAOCG00000010912	syf2	62	82.915	Amphiprion_ocellaris
ENSMMUG00000002968	SYF2	95	80.085	ENSAPEG00000018858	syf2	83	84.259	Amphiprion_percula
ENSMMUG00000002968	SYF2	89	82.488	ENSATEG00000007745	syf2	91	82.870	Anabas_testudineus
ENSMMUG00000002968	SYF2	82	88.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	Anas_platyrhynchos
ENSMMUG00000002968	SYF2	79	74.843	ENSACAG00000026777	-	95	74.843	Anolis_carolinensis
ENSMMUG00000002968	SYF2	84	85.294	ENSACAG00000013653	-	100	85.294	Anolis_carolinensis
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	97.119	ENSANAG00000032473	SYF2	100	97.119	Aotus_nancymaae
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	80.365	ENSACLG00000019916	syf2	91	81.481	Astatotilapia_calliptera
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	82.569	ENSAMXG00000004051	syf2	91	82.870	Astyanax_mexicanus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	91.837	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	91.429	Bos_taurus
ENSMMUG00000002968	SYF2	86	51.905	WBGene00019402	syf-2	90	50.237	Caenorhabditis_elegans
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	97.531	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	97.531	Callithrix_jacchus
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	92.623	ENSCAFG00000012895	-	99	92.623	Canis_familiaris
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	82.305	ENSCAFG00000030331	-	100	82.305	Canis_familiaris
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	92.623	ENSCAFG00020021091	-	99	92.623	Canis_lupus_dingo
ENSMMUG00000002968	SYF2	95	86.316	ENSCAFG00020021094	-	100	82.843	Canis_lupus_dingo
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	90.947	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	90.947	Capra_hircus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	93.004	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.004	Carlito_syrichta
ENSMMUG00000002968	SYF2	81	97.980	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	Cavia_aperea
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	92.623	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	92.623	Cavia_porcellus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	97.531	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	97.531	Cebus_capucinus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	99.177	ENSCATG00000026917	SYF2	100	99.177	Cercocebus_atys
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	93.852	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.852	Chinchilla_lanigera
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	99.177	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	99.177	Chlorocebus_sabaeus
ENSMMUG00000002968	SYF2	74	76.243	ENSCHOG00000005273	-	100	73.889	Choloepus_hoffmanni
ENSMMUG00000002968	SYF2	92	88.839	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	86.695	Chrysemys_picta_bellii
ENSMMUG00000002968	SYF2	87	53.991	ENSCING00000003017	-	89	53.521	Ciona_intestinalis
ENSMMUG00000002968	SYF2	96	46.392	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	86.008	ENSCANG00000037322	SYF2	100	86.008	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	90.123	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.123	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMMUG00000002968	SYF2	81	95.408	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.975	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	77.982	ENSCSEG00000000117	syf2	90	78.605	Cynoglossus_semilaevis
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	80.822	ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.019	Cyprinodon_variegatus
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	77.500	ENSDARG00000004706	syf2	99	77.500	Danio_rerio
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	93.004	ENSDNOG00000047605	SYF2	99	92.181	Dasypus_novemcinctus
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	91.322	ENSDORG00000001274	Syf2	99	91.322	Dipodomys_ordii
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	55.909	FBgn0033556	CG12343	92	55.556	Drosophila_melanogaster
ENSMMUG00000002968	SYF2	94	76.856	ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.729	Echinops_telfairi
ENSMMUG00000002968	SYF2	89	54.945	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	Eptatretus_burgeri
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	81.070	ENSEASG00005004232	-	100	81.070	Equus_asinus_asinus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	91.020	ENSEASG00005004224	-	100	91.020	Equus_asinus_asinus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	91.429	ENSECAG00000012023	-	100	91.429	Equus_caballus
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	92.149	ENSECAG00000010440	-	99	92.149	Equus_caballus
ENSMMUG00000002968	SYF2	75	79.781	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.781	Erinaceus_europaeus
ENSMMUG00000002968	SYF2	96	79.832	ENSELUG00000003465	syf2	91	85.185	Esox_lucius
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	93.033	ENSFCAG00000043095	-	99	92.623	Felis_catus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	93.469	ENSFCAG00000010324	-	85	93.061	Felis_catus
ENSMMUG00000002968	SYF2	84	84.314	ENSFALG00000000460	SYF2	88	83.796	Ficedula_albicollis
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	93.416	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.416	Fukomys_damarensis
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	66.364	ENSFHEG00000007238	syf2	96	66.359	Fundulus_heteroclitus
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	82.569	ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	Gadus_morhua
ENSMMUG00000002968	SYF2	92	87.500	ENSGALG00000013639	SYF2	99	81.600	Gallus_gallus
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	73.029	ENSGAFG00000019435	syf2	91	79.630	Gambusia_affinis
ENSMMUG00000002968	SYF2	88	82.791	ENSGACG00000007305	syf2	90	82.791	Gasterosteus_aculeatus
ENSMMUG00000002968	SYF2	92	88.393	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	86.266	Gopherus_agassizii
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	97.942	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	97.942	Gorilla_gorilla
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	80.365	ENSHBUG00000020477	syf2	93	81.481	Haplochromis_burtoni
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	93.033	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.033	Heterocephalus_glaber_female
ENSMMUG00000002968	SYF2	93	82.819	ENSHGLG00000004304	-	99	79.167	Heterocephalus_glaber_female
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	93.033	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.033	Heterocephalus_glaber_male
ENSMMUG00000002968	SYF2	98	77.178	ENSHCOG00000012904	syf2	79	76.349	Hippocampus_comes
ENSMMUG00000002968	SYF2	91	82.353	ENSIPUG00000019859	syf2	91	83.796	Ictalurus_punctatus
ENSMMUG00000002968	SYF2	60	96.575	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMMUG00000002968	SYF2	82	96.985	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	Jaculus_jaculus
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	75.833	ENSKMAG00000013856	syf2	91	81.481	Kryptolebias_marmoratus
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	82.192	ENSLBEG00000014425	syf2	91	82.870	Labrus_bergylta
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	80.417	ENSLACG00000012064	SYF2	91	86.111	Latimeria_chalumnae
ENSMMUG00000002968	SYF2	97	80.426	ENSLOCG00000002728	syf2	86	84.259	Lepisosteus_oculatus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	91.837	ENSLAFG00000023150	-	100	91.020	Loxodonta_africana
ENSMMUG00000002968	SYF2	75	65.217	ENSLAFG00000030814	-	100	65.217	Loxodonta_africana
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	99.588	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	99.588	Macaca_fascicularis
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	99.588	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	99.588	Macaca_nemestrina
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	99.177	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	99.177	Mandrillus_leucophaeus
ENSMMUG00000002968	SYF2	89	80.645	ENSMAMG00000010403	syf2	90	81.019	Mastacembelus_armatus
ENSMMUG00000002968	SYF2	95	77.119	ENSMZEG00005006429	syf2	91	81.481	Maylandia_zebra
ENSMMUG00000002968	SYF2	82	88.442	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	Meleagris_gallopavo
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	90.535	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.535	Mesocricetus_auratus
ENSMMUG00000002968	SYF2	89	96.629	ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	Microcebus_murinus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	91.358	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.358	Microtus_ochrogaster
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	78.995	ENSMMOG00000002396	syf2	90	79.167	Mola_mola
ENSMMUG00000002968	SYF2	93	87.665	ENSMODG00000013951	-	95	88.532	Monodelphis_domestica
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	75.000	ENSMALG00000010706	syf2	90	81.106	Monopterus_albus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	90.947	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	90.535	Mus_caroli
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	90.947	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	90.535	Mus_musculus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	90.947	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	90.535	Mus_pahari
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	90.947	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	90.535	Mus_spretus
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	93.033	ENSMPUG00000015802	-	99	92.623	Mustela_putorius_furo
ENSMMUG00000002968	SYF2	98	93.333	ENSMPUG00000015801	-	98	92.917	Mustela_putorius_furo
ENSMMUG00000002968	SYF2	98	92.857	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.857	Myotis_lucifugus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	91.870	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.870	Nannospalax_galili
ENSMMUG00000002968	SYF2	97	70.833	ENSNBRG00000010720	syf2	89	74.537	Neolamprologus_brichardi
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	98.354	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	98.354	Nomascus_leucogenys
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	90.535	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.535	Ochotona_princeps
ENSMMUG00000002968	SYF2	96	94.421	ENSODEG00000017664	-	98	94.421	Octodon_degus
ENSMMUG00000002968	SYF2	96	84.549	ENSODEG00000014338	-	98	84.549	Octodon_degus
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	80.365	ENSONIG00000008213	syf2	91	81.019	Oreochromis_niloticus
ENSMMUG00000002968	SYF2	83	89.604	ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	94.262	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.262	Oryctolagus_cuniculus
ENSMMUG00000002968	SYF2	95	78.696	ENSORLG00000028820	syf2	93	82.407	Oryzias_latipes
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	81.735	ENSORLG00020018333	syf2	91	82.407	Oryzias_latipes_hni
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	81.651	ENSORLG00015014665	syf2	91	82.407	Oryzias_latipes_hsok
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	82.648	ENSOMEG00000013911	syf2	91	82.870	Oryzias_melastigma
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	93.388	ENSOGAG00000009962	SYF2	99	93.388	Otolemur_garnettii
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	91.903	ENSOARG00000006348	-	100	91.498	Ovis_aries
ENSMMUG00000002968	SYF2	80	67.179	ENSOARG00000006269	-	100	66.154	Ovis_aries
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	97.942	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	97.942	Pan_paniscus
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	93.033	ENSPPRG00000001651	-	99	92.623	Panthera_pardus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	93.089	ENSPPRG00000001638	-	100	92.683	Panthera_pardus
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	92.623	ENSPTIG00000007036	-	99	92.213	Panthera_tigris_altaica
ENSMMUG00000002968	SYF2	93	96.018	ENSPTIG00000005711	-	82	96.018	Panthera_tigris_altaica
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	97.942	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	97.942	Pan_troglodytes
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	99.588	ENSPANG00000008139	SYF2	100	99.588	Papio_anubis
ENSMMUG00000002968	SYF2	95	80.687	ENSPKIG00000008130	syf2	92	83.796	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMMUG00000002968	SYF2	96	84.979	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	84.979	Pelodiscus_sinensis
ENSMMUG00000002968	SYF2	97	77.119	ENSPMGG00000008755	syf2	84	81.481	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	90.947	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	90.947	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMMUG00000002968	SYF2	93	92.889	ENSPCIG00000014235	SYF2	86	94.444	Phascolarctos_cinereus
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	79.358	ENSPFOG00000004116	syf2	89	80.000	Poecilia_formosa
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	79.358	ENSPLAG00000006691	syf2	92	80.000	Poecilia_latipinna
ENSMMUG00000002968	SYF2	96	72.650	ENSPMEG00000011684	syf2	97	72.222	Poecilia_mexicana
ENSMMUG00000002968	SYF2	89	80.093	ENSPREG00000003009	syf2	91	80.093	Poecilia_reticulata
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	98.354	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	98.354	Pongo_abelii
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	76.119	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	76.119	Propithecus_coquereli
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	81.070	ENSPVAG00000005841	SYF2	99	80.579	Pteropus_vampyrus
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	80.365	ENSPNYG00000004979	syf2	91	81.481	Pundamilia_nyererei
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	79.012	ENSPNAG00000015570	syf2	100	78.601	Pygocentrus_nattereri
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	90.947	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	90.535	Rattus_norvegicus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	96.708	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	96.708	Rhinopithecus_bieti
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	99.588	ENSRROG00000001347	SYF2	100	99.588	Rhinopithecus_roxellana
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	96.296	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	96.296	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMMUG00000002968	SYF2	82	94.472	ENSSHAG00000007152	-	97	94.472	Sarcophilus_harrisii
ENSMMUG00000002968	SYF2	93	91.111	ENSSHAG00000015630	-	87	92.130	Sarcophilus_harrisii
ENSMMUG00000002968	SYF2	93	81.057	ENSSFOG00015023647	syf2	91	83.796	Scleropages_formosus
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	80.734	ENSSMAG00000009867	syf2	91	81.019	Scophthalmus_maximus
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	82.569	ENSSDUG00000013072	syf2	91	82.870	Seriola_dumerili
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	82.569	ENSSLDG00000012677	syf2	91	82.870	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	73.770	ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.361	Sorex_araneus
ENSMMUG00000002968	SYF2	95	85.714	ENSSPUG00000005251	SYF2	85	87.963	Sphenodon_punctatus
ENSMMUG00000002968	SYF2	95	78.814	ENSSPAG00000009626	syf2	91	82.870	Stegastes_partitus
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	90.947	ENSSSCG00000037481	SYF2	88	97.685	Sus_scrofa
ENSMMUG00000002968	SYF2	58	71.795	ENSTGUG00000001126	SYF2	80	59.627	Taeniopygia_guttata
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	74.486	ENSTRUG00000001499	syf2	86	80.930	Takifugu_rubripes
ENSMMUG00000002968	SYF2	90	79.358	ENSTNIG00000016912	syf2	97	79.630	Tetraodon_nigroviridis
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	70.782	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.547	Tupaia_belangeri
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	91.803	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.213	Tursiops_truncatus
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	91.803	ENSUAMG00000002897	SYF2	99	91.393	Ursus_americanus
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	92.213	ENSUMAG00000013108	SYF2	99	91.803	Ursus_maritimus
ENSMMUG00000002968	SYF2	100	91.803	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.803	Vicugna_pacos
ENSMMUG00000002968	SYF2	99	92.623	ENSVVUG00000027175	-	99	92.623	Vulpes_vulpes
ENSMMUG00000002968	SYF2	84	96.098	ENSVVUG00000027181	-	100	89.113	Vulpes_vulpes
ENSMMUG00000002968	SYF2	96	81.545	ENSXETG00000022797	syf2	94	81.545	Xenopus_tropicalis
ENSMMUG00000002968	SYF2	88	80.465	ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.093	Xiphophorus_maculatus