EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMMUG00000013118 (Gene tree)
Gene ID: 715512
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Macaca_mulatta
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 43384 bases
Position: chr16:50740759-50784142
Accession: 715512
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMMUP00000017238	GTP_EFTU	PF00009.27	4.8e-45	1	1
ENSMMUP00000017238	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.8e-12	1	1
ENSMMUP00000056120	EFG_IV	PF03764.18	1.5e-23	1	1
ENSMMUP00000017238	EFG_IV	PF03764.18	3.7e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMMUT00000075390	EFTUD2-202	672	-	ENSMMUP00000056120	223 (aa)	-	A0A1D5R732
ENSMMUT00000018410	EFTUD2-201	3686	XM_001114964	ENSMMUP00000017238	972 (aa)	XP_001114964	G7NIZ0

Gene Model

Click here to download ENSMMUG00000013118's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
mcc03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMMUG00000013118's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	81	30.220	ENSMMUG00000023353	EFL1	83	30.220
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	60	44.853	ENSMMUG00000042545	-	96	46.262
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	56	34.074	ENSMMUG00000019998	GFM2	66	34.815
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	87	39.061	ENSMMUG00000022767	EEF2	93	46.693

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	92.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.794	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.580	Amphilophus_citrinellus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.181	Amphiprion_percula
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.490	Anabas_testudineus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.336	Anas_platyrhynchos
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	Anolis_carolinensis
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	Astatotilapia_calliptera
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	Astyanax_mexicanus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.486	Bos_taurus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	96	86.441	WBGene00001166	eftu-2	99	69.938	Caenorhabditis_elegans
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.794	Canis_familiaris
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	Canis_lupus_dingo
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	Capra_hircus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	Carlito_syrichta
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.971	Cavia_aperea
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	Cavia_porcellus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	Chinchilla_lanigera
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	90	100.000	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	Choloepus_hoffmanni
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	Chrysemys_picta_bellii
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	89.552	ENSCING00000009372	-	100	77.538	Ciona_intestinalis
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	99	90.769	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	Cyprinodon_variegatus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	98.507	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	Danio_rerio
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	99.383	Dasypus_novemcinctus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	Dipodomys_ordii
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	88.060	FBgn0039566	CG4849	100	75.077	Drosophila_melanogaster
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	91.045	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.794	Equus_asinus_asinus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	99.691	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.691	Equus_caballus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	Esox_lucius
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	Felis_catus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	Ficedula_albicollis
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	Fukomys_damarensis
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.181	Fundulus_heteroclitus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.667	Gadus_morhua
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	Gallus_gallus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.975	Gambusia_affinis
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	Gasterosteus_aculeatus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	Haplochromis_burtoni
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.765	Heterocephalus_glaber_female
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	Heterocephalus_glaber_male
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	Hippocampus_comes
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	Ictalurus_punctatus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	Jaculus_jaculus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	94.030	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.564	Kryptolebias_marmoratus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	90	100.000	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	97.015	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	Latimeria_chalumnae
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.181	Lepisosteus_oculatus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	Loxodonta_africana
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.490	Mastacembelus_armatus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	92.078	Maylandia_zebra
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	Meleagris_gallopavo
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.486	Mesocricetus_auratus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	92	81.798	ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	Microtus_ochrogaster
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSMOCG00000009039	-	100	99.588	Microtus_ochrogaster
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	Monodelphis_domestica
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.280	Mus_caroli
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.280	Mus_musculus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	Mus_pahari
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.280	Mus_spretus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	97	99.576	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.576	Mustela_putorius_furo
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.794	Myotis_lucifugus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	Nannospalax_galili
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	Neolamprologus_brichardi
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	97	98.193	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	Nomascus_leucogenys
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	Notamacropus_eugenii
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	93	100.000	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	Ochotona_princeps
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	85.443	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSODEG00000018041	-	100	98.560	Octodon_degus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSONIG00000000912	eftud2	100	92.078	Oreochromis_niloticus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	Oryctolagus_cuniculus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	Oryzias_latipes
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	Oryzias_latipes_hni
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.737	Otolemur_garnettii
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.486	Ovis_aries
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.897	Pan_paniscus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.794	Panthera_pardus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.794	Panthera_tigris_altaica
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	Pan_troglodytes
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	100.000	Papio_anubis
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	93	97.133	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	Pelodiscus_sinensis
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.486	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.691	Phascolarctos_cinereus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.975	Poecilia_formosa
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.975	Poecilia_latipinna
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.975	Poecilia_mexicana
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.560	Pongo_abelii
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	Procavia_capensis
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	Propithecus_coquereli
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	Pteropus_vampyrus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.975	Pundamilia_nyererei
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	Pygocentrus_nattereri
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	Rattus_norvegicus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.897	Rhinopithecus_bieti
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	Rhinopithecus_roxellana
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	79	57.895	YKL173W	SNU114	97	33.893	Saccharomyces_cerevisiae
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	Sarcophilus_harrisii
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	Scleropages_formosus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.872	Scophthalmus_maximus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	Seriola_dumerili
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.284	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	93	100.000	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	Sorex_araneus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	Sphenodon_punctatus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.284	Stegastes_partitus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	Sus_scrofa
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	84	97.324	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	Taeniopygia_guttata
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	Takifugu_rubripes
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	Tetraodon_nigroviridis
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	94.342	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	Tupaia_belangeri
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	Tursiops_truncatus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	Ursus_americanus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.794	Ursus_maritimus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.794	Vulpes_vulpes
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	98.507	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	Xiphophorus_maculatus