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Description

Ensembl ID: ENSMMUG00000020923 (Gene tree)
Gene ID: 707195
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Macaca_mulatta
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 98927 bases
Position: chr6:69331532-69430458
Accession: 707195
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMMUP00000046988	IBN_N	PF03810.19	7.8e-17	1	1
ENSMMUP00000027531	IBN_N	PF03810.19	1.1e-15	1	1
ENSMMUP00000050391	IBN_N	PF03810.19	1.1e-15	1	1
ENSMMUP00000053718	IBN_N	PF03810.19	1.1e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMMUT00000056570	TNPO1-205	408	-	ENSMMUP00000046988	135 (aa)	-	A0A1D5QG18
ENSMMUT00000064474	TNPO1-201	8579	XM_015140266	ENSMMUP00000050391	898 (aa)	XP_014995752	A0A1D5QQR3
ENSMMUT00000029424	TNPO1-204	2694	-	ENSMMUP00000027531	897 (aa)	-	F7H4P5
ENSMMUT00000053303	TNPO1-202	2547	-	ENSMMUP00000050141	848 (aa)	-	A0A1D5QQ14
ENSMMUT00000074196	TNPO1-203	2670	-	ENSMMUP00000053718	889 (aa)	-	A0A1D5R085

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	85.440	ENSMMUG00000005684	TNPO2	99	85.440

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.889	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.792	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.708	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	99.001	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.001	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMMUG00000020923	TNPO1	87	92.857	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.857	Amphilophus_citrinellus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.905	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.820	Amphiprion_ocellaris
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.905	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.820	Amphiprion_percula
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.567	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.371	Anabas_testudineus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.559	ENSAPLG00000009619	-	97	93.563	Anas_platyrhynchos
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	96.629	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.629	Anolis_carolinensis
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	64.420	ENSANAG00000027118	-	99	64.199	Aotus_nancymaae
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	88.307	ENSANAG00000025351	-	100	88.307	Aotus_nancymaae
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.443	ENSANAG00000022453	-	100	99.443	Aotus_nancymaae
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	91.535	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.461	Astatotilapia_calliptera
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.793	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.265	Astyanax_mexicanus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.666	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	99.666	Bos_taurus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.555	ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.555	Callithrix_jacchus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	96	99.650	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.650	Canis_familiaris
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	96.742	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.742	Canis_lupus_dingo
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.555	ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.555	Capra_hircus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	95.276	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	98.129	Carlito_syrichta
ENSMMUG00000020923	TNPO1	90	89.344	ENSCCAG00000020805	-	78	89.344	Cebus_capucinus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.443	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.443	Cebus_capucinus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.889	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.889	Cercocebus_atys
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.443	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.443	Chinchilla_lanigera
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.777	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	99.777	Chlorocebus_sabaeus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	86	97.436	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.013	Choloepus_hoffmanni
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	96.656	ENSCPBG00000000260	TNPO1	95	97.318	Chrysemys_picta_bellii
ENSMMUG00000020923	TNPO1	84	73.684	ENSCING00000021247	-	99	78.169	Ciona_intestinalis
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	75.421	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.421	Ciona_savignyi
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.889	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	99.889	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.555	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.555	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMMUG00000020923	TNPO1	96	99.532	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	99.532	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.212	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.135	Cynoglossus_semilaevis
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.228	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.146	Cyprinodon_variegatus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.672	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.144	Danio_rerio
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.527	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.527	Dasypus_novemcinctus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	93	99.639	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.638	Dipodomys_ordii
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	57.788	FBgn0035693	CG8219	99	57.336	Drosophila_melanogaster
ENSMMUG00000020923	TNPO1	86	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	Echinops_telfairi
ENSMMUG00000020923	TNPO1	94	85.119	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	Eptatretus_burgeri
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.889	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.889	Equus_asinus_asinus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.666	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	99.666	Equus_caballus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	86.652	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	Esox_lucius
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.889	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.889	Felis_catus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	97.303	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	Ficedula_albicollis
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.555	ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.555	Fukomys_damarensis
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.574	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.490	Fundulus_heteroclitus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	89.989	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.989	Gadus_morhua
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	96.214	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	Gallus_gallus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.342	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.265	Gambusia_affinis
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.115	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.115	Gasterosteus_aculeatus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	97.416	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	Gopherus_agassizii
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	83.128	ENSGGOG00000022535	-	99	83.128	Gorilla_gorilla
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.889	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.889	Gorilla_gorilla
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.115	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.034	Haplochromis_burtoni
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.220	ENSHGLG00000000970	-	100	99.220	Heterocephalus_glaber_female
ENSMMUG00000020923	TNPO1	87	79.167	ENSHGLG00000001198	-	93	83.929	Heterocephalus_glaber_female
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	75.390	ENSHGLG00100000963	-	99	77.093	Heterocephalus_glaber_male
ENSMMUG00000020923	TNPO1	96	99.065	ENSHGLG00100017090	-	99	99.065	Heterocephalus_glaber_male
ENSMMUG00000020923	TNPO1	87	91.525	ENSSTOG00000021784	-	100	98.315	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	99.664	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.664	Jaculus_jaculus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.567	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.483	Kryptolebias_marmoratus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	90	90.087	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.087	Labrus_bergylta
ENSMMUG00000020923	TNPO1	96	89.070	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.070	Latimeria_chalumnae
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	95.297	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	95.190	Lepisosteus_oculatus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	97	99.076	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.076	Loxodonta_africana
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.889	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	99.889	Macaca_fascicularis
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.889	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	99.889	Macaca_nemestrina
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.889	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	99.889	Mandrillus_leucophaeus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.567	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.371	Mastacembelus_armatus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.889	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.809	Maylandia_zebra
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	99.549	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	99.438	Mesocricetus_auratus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	95.745	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.745	Microcebus_murinus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	99.552	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.552	Microtus_ochrogaster
ENSMMUG00000020923	TNPO1	87	92.487	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.487	Mola_mola
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	97.872	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	Monodelphis_domestica
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.438	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.247	Monopterus_albus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.332	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	99.438	Mus_caroli
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.555	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	99.555	Mus_musculus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.443	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	99.443	Mus_pahari
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.332	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	99.438	Mus_spretus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.777	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	99.777	Mustela_putorius_furo
ENSMMUG00000020923	TNPO1	96	99.185	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.185	Myotis_lucifugus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.555	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.555	Nannospalax_galili
ENSMMUG00000020923	TNPO1	87	92.727	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.727	Neolamprologus_brichardi
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.889	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.889	Nomascus_leucogenys
ENSMMUG00000020923	TNPO1	91	92.966	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	Ochotona_princeps
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.220	ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.220	Octodon_degus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	90	80.992	ENSODEG00000009802	-	96	85.827	Octodon_degus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.377	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.377	Oreochromis_niloticus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	92	97.805	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	96	93.107	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.107	Oryctolagus_cuniculus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	87	92.597	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.607	Oryzias_latipes
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.897	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	Oryzias_latipes_hni
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.010	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	Oryzias_latipes_hsok
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.897	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.897	Oryzias_melastigma
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.777	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	99.777	Otolemur_garnettii
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.666	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.666	Ovis_aries
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.889	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	99.889	Pan_paniscus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.889	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.889	Panthera_pardus
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.889	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.889	Panthera_tigris_altaica
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.889	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	99.889	Pan_troglodytes
ENSMMUG00000020923	TNPO1	94	86.824	ENSPTRG00000047731	-	100	86.878	Pan_troglodytes
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.889	ENSPANG00000006074	TNPO1	100	99.889	Papio_anubis
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	90.519	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.449	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	96.882	ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.882	Pelodiscus_sinensis
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ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	99.888	ENSVVUG00000007338	TNPO1	100	99.888	Vulpes_vulpes
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	94.270	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.270	Xenopus_tropicalis
ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.010	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.929	Xiphophorus_maculatus