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Description

Ensembl ID: ENSMNEG00000029670 (Gene tree)
Gene ID: 105484237
Gene Symbol: APOBEC1
Alias: APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1
Gene Type: protein_coding
Species: Macaca_nemestrina
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10139 bases
Position: chrKQ009490.1:7295426-7305564
Accession: 105484237
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMNEP00000010525	APOBEC_N	PF08210.11	7.5e-28	1	1
ENSMNEP00000010525	APOBEC_C	PF05240.14	2.2e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMNET00000034704	APOBEC1-201	890	XM_011745712	ENSMNEP00000010525	236 (aa)	XP_011744014	A0A2K6BGI5

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	58	44.595	ENSMNEG00000043316	APOBEC3D	53	44.595

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	93.644	ENSG00000111701	APOBEC1	100	93.644	Homo_sapiens
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	98	80.087	ENSAMEG00000007098	APOBEC1	98	80.087	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	72	39.181	ENSACAG00000028578	-	93	39.181	Anolis_carolinensis
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	91.102	ENSANAG00000027743	APOBEC1	95	91.102	Aotus_nancymaae
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	74.153	ENSBTAG00000014683	APOBEC1	100	74.153	Bos_taurus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	94	89.593	ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	89.593	Callithrix_jacchus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	79.237	ENSCAFG00000013901	APOBEC1	100	79.237	Canis_familiaris
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	96	78.761	ENSCAFG00020003511	APOBEC1	95	78.761	Canis_lupus_dingo
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	98	75.325	ENSCHIG00000011898	APOBEC1	96	75.325	Capra_hircus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	60	83.688	ENSTSYG00000029141	APOBEC1	100	83.688	Carlito_syrichta
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	91	69.626	ENSCAPG00000015882	-	99	69.626	Cavia_aperea
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	99	68.085	ENSCPOG00000033068	APOBEC1	99	68.085	Cavia_porcellus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	92.797	ENSCCAG00000022258	APOBEC1	100	92.797	Cebus_capucinus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	98.729	ENSCATG00000021613	APOBEC1	95	98.729	Cercocebus_atys
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	97	71.616	ENSCLAG00000014645	APOBEC1	99	71.616	Chinchilla_lanigera
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	81	96.859	ENSCSAG00000009817	APOBEC1	100	96.859	Chlorocebus_sabaeus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	77	45.455	ENSCPBG00000017398	-	82	45.455	Chrysemys_picta_bellii
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	83	50.000	ENSCPBG00000014329	-	54	50.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	79	47.340	ENSCPBG00000014328	-	82	47.340	Chrysemys_picta_bellii
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	88	38.967	ENSCPBG00000014327	-	81	38.967	Chrysemys_picta_bellii
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	94	42.222	ENSCPBG00000014331	-	90	42.222	Chrysemys_picta_bellii
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	78	45.989	ENSCPBG00000014335	-	76	45.989	Chrysemys_picta_bellii
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	97	97.391	ENSCANG00000038359	APOBEC1	100	97.391	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	97	70.742	ENSCGRG00001011130	Apobec1	100	70.742	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	97	70.742	ENSCGRG00000008644	Apobec1	100	70.742	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	81.356	ENSDNOG00000010926	APOBEC1	100	81.356	Dasypus_novemcinctus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	90	65.888	ENSDORG00000023717	Apobec1	100	65.888	Dipodomys_ordii
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	99	79.149	ENSETEG00000004867	APOBEC1	99	79.149	Echinops_telfairi
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	98	83.117	ENSEASG00005015951	APOBEC1	97	83.117	Equus_asinus_asinus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	81	83.770	ENSECAG00000017163	APOBEC1	100	83.770	Equus_caballus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	93	65.158	ENSEEUG00000009112	-	98	65.158	Erinaceus_europaeus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	86	54.412	ENSEEUG00000007530	-	97	54.412	Erinaceus_europaeus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	82.627	ENSFCAG00000009350	APOBEC1	100	82.627	Felis_catus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	60	47.183	ENSFALG00000007257	-	70	47.183	Ficedula_albicollis
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	88	60.870	ENSFDAG00000018470	APOBEC1	99	60.870	Fukomys_damarensis
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	68	52.469	ENSGAGG00000004947	-	83	53.383	Gopherus_agassizii
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	83	46.000	ENSGAGG00000006624	-	70	46.000	Gopherus_agassizii
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	72	43.503	ENSGAGG00000021745	-	64	43.503	Gopherus_agassizii
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	77	46.448	ENSGAGG00000021744	-	71	46.448	Gopherus_agassizii
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	92	45.662	ENSGAGG00000011837	-	88	52.500	Gopherus_agassizii
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	99	66.809	ENSHGLG00000001495	APOBEC1	99	66.809	Heterocephalus_glaber_female
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	99	65.957	ENSHGLG00100002187	APOBEC1	99	65.957	Heterocephalus_glaber_male
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	91	64.186	ENSSTOG00000021971	APOBEC1	100	79.592	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	97	75.109	ENSJJAG00000022108	Apobec1	100	75.109	Jaculus_jaculus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	94	78.924	ENSLAFG00000030837	APOBEC1	100	78.924	Loxodonta_africana
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	99.576	ENSMFAG00000000277	APOBEC1	100	99.576	Macaca_fascicularis
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	98.729	ENSMLEG00000036301	APOBEC1	100	98.729	Mandrillus_leucophaeus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	92	71.296	ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	71.296	Mesocricetus_auratus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	83.898	ENSMICG00000043645	APOBEC1	100	83.898	Microcebus_murinus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	67.373	ENSMODG00000018004	APOBEC1	100	67.373	Monodelphis_domestica
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	97	70.175	ENSMUSG00000040613	Apobec1	99	70.175	Mus_musculus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	97	68.860	MGP_PahariEiJ_G0022580	-	99	68.860	Mus_pahari
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	97	70.175	MGP_SPRETEiJ_G0029857	Apobec1	99	70.175	Mus_spretus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	77.966	ENSMPUG00000017532	APOBEC1	100	77.966	Mustela_putorius_furo
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	97	72.052	ENSNGAG00000022607	Apobec1	100	72.052	Nannospalax_galili
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	95.339	ENSNLEG00000005342	APOBEC1	100	95.339	Nomascus_leucogenys
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	66.525	ENSMEUG00000013406	APOBEC1	100	66.525	Notamacropus_eugenii
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	77	64.641	ENSOPRG00000009508	-	100	64.641	Ochotona_princeps
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	77.542	ENSOCUG00000025736	APOBEC1	88	77.542	Oryctolagus_cuniculus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	98	81.818	ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	81.818	Otolemur_garnettii
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	73.729	ENSOARG00000002072	APOBEC1	99	73.729	Ovis_aries
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	98	86.580	ENSPPAG00000027657	APOBEC1	98	86.580	Pan_paniscus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	82.203	ENSPPRG00000012182	APOBEC1	100	82.203	Panthera_pardus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	82.203	ENSPTIG00000020280	APOBEC1	100	82.203	Panthera_tigris_altaica
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	94.068	ENSPTRG00000004614	APOBEC1	100	94.068	Pan_troglodytes
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	98.729	ENSPANG00000021027	APOBEC1	100	98.729	Papio_anubis
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	99	41.702	ENSPSIG00000012568	-	99	41.702	Pelodiscus_sinensis
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	59	48.649	ENSPSIG00000012791	-	76	48.649	Pelodiscus_sinensis
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	97	69.432	ENSPEMG00000023841	Apobec1	100	69.432	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	68.644	ENSPCIG00000023973	APOBEC1	100	68.644	Phascolarctos_cinereus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	93.644	ENSPPYG00000004228	APOBEC1	95	93.644	Pongo_abelii
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	79	81.283	ENSPCAG00000008733	APOBEC1	100	81.283	Procavia_capensis
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	81.780	ENSPCOG00000013957	APOBEC1	100	81.780	Propithecus_coquereli
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	65.678	ENSPVAG00000010709	APOBEC1	100	65.678	Pteropus_vampyrus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	97	68.860	ENSRNOG00000015411	Apobec1	99	68.860	Rattus_norvegicus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	96.610	ENSRBIG00000031161	APOBEC1	100	96.610	Rhinopithecus_bieti
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	96.186	ENSRROG00000033576	APOBEC1	100	96.186	Rhinopithecus_roxellana
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	73	91.908	ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	91.908	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	96	70.485	ENSSHAG00000008925	APOBEC1	99	70.485	Sarcophilus_harrisii
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	73	67.442	ENSSARG00000000032	-	100	67.442	Sorex_araneus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	56	72.519	ENSSARG00000011972	-	99	72.519	Sorex_araneus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	88	41.038	ENSSPUG00000009044	-	81	41.038	Sphenodon_punctatus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	77.966	ENSSSCG00000000668	APOBEC1	100	77.966	Sus_scrofa
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	61	50.694	ENSTGUG00000013118	-	99	50.694	Taeniopygia_guttata
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	94	76.923	ENSTBEG00000010043	APOBEC1	94	76.923	Tupaia_belangeri
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	79	76.471	ENSTTRG00000014015	APOBEC1	100	76.471	Tursiops_truncatus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	98	79.654	ENSUAMG00000011636	APOBEC1	95	79.654	Ursus_americanus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	98	79.654	ENSUMAG00000016552	APOBEC1	95	79.654	Ursus_maritimus
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	75.847	ENSVPAG00000001343	APOBEC1	100	75.847	Vicugna_pacos
ENSMNEG00000029670	APOBEC1	100	80.085	ENSVVUG00000010522	APOBEC1	100	80.085	Vulpes_vulpes