EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMNEG00000044474 (Gene tree)
Gene ID: 105497594
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Macaca_nemestrina
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10831 bases
Position: chrKQ005998.1:340493-351323
Accession: 105497594
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMNEP00000043721	rRNA_proc-arch	PF13234.6	2.5e-41	1	1
ENSMNEP00000043709	rRNA_proc-arch	PF13234.6	2.9e-41	1	1
ENSMNEP00000043721	DEAD	PF00270.29	3.1e-16	1	1
ENSMNEP00000043709	DEAD	PF00270.29	3.5e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMNET00000068229	SKIV2L-202	3438	XM_011768804	ENSMNEP00000043721	1145 (aa)	XP_011767106	A0A2K6E6E1
ENSMNET00000068217	SKIV2L-201	4079	XM_011768803	ENSMNEP00000043709	1246 (aa)	XP_011767105	A0A2K6E6B6
ENSMNET00000068236	SKIV2L-203	210	-	ENSMNEP00000043728	69 (aa)	-	A0A2K6E6E0

Gene Model

Click here to download ENSMNEG00000044474's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMNEG00000044474's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	84	36.789	ENSMNEG00000032746	MTREX	89	36.789

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	98.234	ENSG00000204351	SKIV2L	100	98.234	Homo_sapiens
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.727	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	62.119	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.703	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	94.703	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.208	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.516	Amphilophus_citrinellus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.190	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	61.365	Amphiprion_ocellaris
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.032	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	61.205	Amphiprion_percula
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.146	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	61.316	Anabas_testudineus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	65.436	ENSACAG00000011746	SKIV2L	98	66.188	Anolis_carolinensis
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	97.512	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	97.512	Aotus_nancymaae
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.825	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.866	Astatotilapia_calliptera
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	98	59.777	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.920	Astyanax_mexicanus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.864	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	94.864	Bos_taurus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	96	39.188	WBGene00008502	skih-2	78	44.734	Caenorhabditis_elegans
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	97.352	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	97.352	Callithrix_jacchus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.703	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	94.703	Canis_familiaris
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.623	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	94.623	Canis_lupus_dingo
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.944	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	94.944	Capra_hircus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.382	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	94.382	Carlito_syrichta
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	92.295	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	92.295	Cavia_porcellus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	97.512	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	97.512	Cebus_capucinus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	99.358	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	99.358	Cercocebus_atys
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	93.018	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.018	Chinchilla_lanigera
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	99.117	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	99.117	Chlorocebus_sabaeus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	87	64.912	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	96	64.912	Chrysemys_picta_bellii
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	94	52.627	ENSCING00000005576	-	99	50.847	Ciona_intestinalis
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	99.301	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	99.518	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.066	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	94.066	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.465	ENSCSEG00000011326	skiv2l	98	61.514	Cynoglossus_semilaevis
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.532	ENSCVAG00000003072	skiv2l	99	61.316	Cyprinodon_variegatus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.757	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	60.880	Danio_rerio
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	94	94.103	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	100	88.301	Dasypus_novemcinctus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	93	44.749	FBgn0039117	tst	97	44.091	Drosophila_melanogaster
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	75	93.059	ENSETEG00000009522	SKIV2L	68	93.059	Echinops_telfairi
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	89	56.722	ENSEBUG00000013680	-	95	57.224	Eptatretus_burgeri
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	93	95.140	ENSEASG00005015534	SKIV2L	100	95.095	Equus_asinus_asinus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	96	94.622	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	95.254	Equus_caballus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	57	98.024	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	98.024	Erinaceus_europaeus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.522	ENSELUG00000000181	skiv2l	94	67.012	Esox_lucius
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	95.104	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	95.104	Felis_catus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	89.976	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	89.976	Fukomys_damarensis
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.234	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.347	Fundulus_heteroclitus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	59.552	ENSGMOG00000005926	skiv2l	98	59.578	Gadus_morhua
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	85	60.634	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.220	Gallus_gallus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.441	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.396	Gambusia_affinis
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.397	ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.516	Gasterosteus_aculeatus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	52	75.126	ENSGAGG00000015556	SKIV2L	81	74.183	Gopherus_agassizii
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	98.074	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	98.074	Gorilla_gorilla
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.667	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	61.706	Haplochromis_burtoni
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	91.506	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	91.747	Heterocephalus_glaber_female
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	88.942	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	89.183	Heterocephalus_glaber_male
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	98	59.886	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	59.886	Hippocampus_comes
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.111	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	60.225	Ictalurus_punctatus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.222	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.222	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	71	60.432	ENSLACG00000002986	-	73	59.698	Latimeria_chalumnae
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	93.981	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.981	Loxodonta_africana
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	99.920	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	99.920	Macaca_fascicularis
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	99.839	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	99.839	Macaca_mulatta
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	99.438	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	99.438	Mandrillus_leucophaeus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.111	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.062	Mastacembelus_armatus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.667	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	61.706	Maylandia_zebra
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	68	57.480	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	97	50.524	Meleagris_gallopavo
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	93.103	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.184	Mesocricetus_auratus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	95.104	ENSMICG00000046331	SKIV2L	100	95.104	Microcebus_murinus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	91.740	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.981	Microtus_ochrogaster
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.093	ENSMMOG00000014547	skiv2l	98	61.251	Mola_mola
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	87.590	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.590	Monodelphis_domestica
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.064	ENSMALG00000010535	skiv2l	98	60.049	Monopterus_albus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	93.344	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	93.344	Mus_caroli
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	93.424	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	93.424	Mus_musculus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	92.783	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	92.783	Mus_pahari
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	93.184	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	93.184	Mus_spretus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.462	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	94.462	Mustela_putorius_furo
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	93.419	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	93.419	Myotis_lucifugus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.974	ENSNBRG00000018650	skiv2l	98	61.210	Neolamprologus_brichardi
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.000	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	94.449	Nomascus_leucogenys
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	78	92.920	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	92.920	Notamacropus_eugenii
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	93.981	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.981	Ochotona_princeps
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	91.734	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	91.734	Octodon_degus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	62.380	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.591	Oreochromis_niloticus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.462	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	94.462	Oryctolagus_cuniculus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.727	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	61.606	Oryzias_latipes
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.569	ENSORLG00020009462	skiv2l	99	61.446	Oryzias_latipes_hni
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.331	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	61.285	Oryzias_latipes_hsok
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.954	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	61.675	Oryzias_melastigma
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.864	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	94.864	Otolemur_garnettii
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	89.272	ENSOARG00000002411	-	100	89.272	Ovis_aries
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	96.962	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	97.349	Pan_paniscus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	95.104	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	95.104	Panthera_pardus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.703	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.703	Panthera_tigris_altaica
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	98.315	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	98.315	Pan_troglodytes
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	98.312	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	98.312	Papio_anubis
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.126	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.190	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.981	ENSPMGG00000019707	skiv2l	98	61.057	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.066	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	94.066	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	87.360	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	87.360	Phascolarctos_cinereus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.313	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	61.427	Poecilia_formosa
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.599	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.557	Poecilia_latipinna
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.392	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	61.508	Poecilia_mexicana
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	59.423	ENSPREG00000002277	skiv2l	96	66.909	Poecilia_reticulata
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	97.833	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	97.833	Pongo_abelii
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	77	94.602	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	94.602	Procavia_capensis
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	95.987	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	95.987	Propithecus_coquereli
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	93.740	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	93.740	Pteropus_vampyrus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.000	ENSPNYG00000017853	skiv2l	97	66.943	Pundamilia_nyererei
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	98	60.929	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	61.026	Pygocentrus_nattereri
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	93.745	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	93.745	Rattus_norvegicus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	96.394	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	96.394	Rhinopithecus_bieti
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	99.278	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	99.278	Rhinopithecus_roxellana
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	93	37.540	YLR398C	-	93	37.480	Saccharomyces_cerevisiae
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	97.432	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	97.432	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	87.190	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.149	Sarcophilus_harrisii
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.242	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.355	Scleropages_formosus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.894	ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.107	Scophthalmus_maximus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.464	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	61.526	Seriola_dumerili
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.821	ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.894	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	62.326	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	98	62.205	Sphenodon_punctatus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	94	61.371	ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.238	Stegastes_partitus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	95.185	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.185	Sus_scrofa
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	93	55.596	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.059	Takifugu_rubripes
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	59.681	ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.758	Tetraodon_nigroviridis
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	94	93.497	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.497	Tupaia_belangeri
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	90.048	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.048	Tursiops_truncatus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	95.185	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.185	Ursus_americanus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	93	95.234	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	100	95.181	Ursus_maritimus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	98	94.947	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	98	94.947	Vulpes_vulpes
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	58.413	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.287	Xenopus_tropicalis
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.649	ENSXCOG00000019517	skiv2l	96	61.650	Xiphophorus_couchianus
ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.203	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	61.316	Xiphophorus_maculatus