EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMOCG00000001204 (Gene tree)
Gene ID: 101993642
Gene Symbol: Ptrhd1
Alias: 2410017P09Rik
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Microtus_ochrogaster
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2597 bases
Position: chrLG3:46977872-46980468
Accession: 101993642
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMOCP00000001553	PTH2	PF01981.16	4.5e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMOCT00000001615	-	850	XM_005360871	ENSMOCP00000001553	140 (aa)	XP_005360928	UPI00038C245D

Gene Model

Click here to download ENSMOCG00000001204's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMOCG00000001204's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	89.286	ENSG00000184924	PTRHD1	100	89.286	Homo_sapiens
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	56.693	ENSAPOG00000024433	ptrhd1	100	56.693	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	84.286	ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	84.286	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	56.693	ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	56.693	Amphilophus_citrinellus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	56.693	ENSAOCG00000007632	ptrhd1	100	56.693	Amphiprion_ocellaris
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	56.693	ENSAPEG00000011491	ptrhd1	100	56.693	Amphiprion_percula
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	58.268	ENSATEG00000019199	ptrhd1	100	58.268	Anabas_testudineus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	87.143	ENSANAG00000019089	PTRHD1	100	87.143	Aotus_nancymaae
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	57.480	ENSACLG00000000814	ptrhd1	100	57.480	Astatotilapia_calliptera
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	89	58.065	ENSAMXG00000034266	ptrhd1	85	58.065	Astyanax_mexicanus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	85.714	ENSBTAG00000015012	PTRHD1	100	85.714	Bos_taurus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	81	44.737	WBGene00050885	Y94H6A.12	100	45.161	Caenorhabditis_elegans
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	87.143	ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	87.143	Callithrix_jacchus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	88.571	ENSCAFG00000024865	PTRHD1	100	88.571	Canis_familiaris
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	85.000	ENSCHIG00000014757	PTRHD1	100	85.000	Capra_hircus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	86.429	ENSTSYG00000009995	PTRHD1	100	86.429	Carlito_syrichta
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	84.286	ENSCPOG00000005561	PTRHD1	100	84.286	Cavia_porcellus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	87.143	ENSCCAG00000033856	PTRHD1	100	87.143	Cebus_capucinus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	88.571	ENSCATG00000033690	PTRHD1	100	88.571	Cercocebus_atys
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	85.714	ENSCLAG00000006505	PTRHD1	97	85.714	Chinchilla_lanigera
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	89.286	ENSCSAG00000008490	PTRHD1	100	89.286	Chlorocebus_sabaeus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	96	71.111	ENSCHOG00000001920	PTRHD1	97	71.111	Choloepus_hoffmanni
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	91	64.844	ENSCPBG00000022276	PTRHD1	91	64.844	Chrysemys_picta_bellii
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	83	51.724	ENSCING00000019647	-	97	51.724	Ciona_intestinalis
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	88.571	ENSCANG00000034444	PTRHD1	100	88.571	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	90.714	ENSCGRG00001003289	Ptrhd1	66	90.714	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	90.714	ENSCGRG00000011834	Ptrhd1	100	90.714	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	57.812	ENSCSEG00000006943	ptrhd1	100	57.812	Cynoglossus_semilaevis
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	56.693	ENSCVAG00000016345	ptrhd1	100	56.693	Cyprinodon_variegatus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	89	57.258	ENSDARG00000016122	ptrhd1	97	57.258	Danio_rerio
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	85.714	ENSDNOG00000043646	PTRHD1	93	85.714	Dasypus_novemcinctus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	99	87.050	ENSDORG00000026776	Ptrhd1	99	87.050	Dipodomys_ordii
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	83	53.448	FBgn0038446	CG14903	97	53.448	Drosophila_melanogaster
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	92	64.341	ENSETEG00000009379	-	96	64.341	Echinops_telfairi
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	60	80.952	ENSETEG00000001615	-	100	80.952	Echinops_telfairi
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	83	61.207	ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	61.207	Eptatretus_burgeri
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	99	59.712	ENSEASG00005001302	-	99	56.115	Equus_asinus_asinus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	91	64.567	ENSECAG00000005314	-	87	64.567	Equus_caballus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	87.857	ENSECAG00000017730	PTRHD1	100	87.857	Equus_caballus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	79.286	ENSEEUG00000004263	PTRHD1	100	79.286	Erinaceus_europaeus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	54.331	ENSELUG00000003837	ptrhd1	100	54.331	Esox_lucius
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	87.143	ENSFCAG00000003648	PTRHD1	100	87.143	Felis_catus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	88.571	ENSFDAG00000004017	PTRHD1	100	88.571	Fukomys_damarensis
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	89	57.258	ENSFHEG00000009135	ptrhd1	100	56.693	Fundulus_heteroclitus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	83	60.345	ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	57.600	Gallus_gallus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	89	57.258	ENSGAFG00000005717	ptrhd1	100	56.693	Gambusia_affinis
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	54.762	ENSGACG00000006743	ptrhd1	98	54.762	Gasterosteus_aculeatus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	89	66.400	ENSGAGG00000023951	PTRHD1	98	66.400	Gopherus_agassizii
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	88.889	ENSGGOG00000043870	PTRHD1	100	88.889	Gorilla_gorilla
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	57.480	ENSHBUG00000014289	ptrhd1	100	57.480	Haplochromis_burtoni
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	83.571	ENSHGLG00000008203	PTRHD1	100	83.571	Heterocephalus_glaber_female
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	83.571	ENSHGLG00100012553	PTRHD1	100	83.571	Heterocephalus_glaber_male
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	91	84.252	ENSHGLG00100004341	-	93	84.252	Heterocephalus_glaber_male
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	56.250	ENSHCOG00000013504	ptrhd1	100	56.250	Hippocampus_comes
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	83	56.034	ENSIPUG00000004885	ptrhd1	97	56.034	Ictalurus_punctatus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	90.000	ENSSTOG00000006030	PTRHD1	100	90.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	97	86.765	ENSJJAG00000024180	Ptrhd1	98	86.765	Jaculus_jaculus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	81	55.752	ENSKMAG00000016961	ptrhd1	99	55.752	Kryptolebias_marmoratus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	56.693	ENSLBEG00000024406	ptrhd1	100	56.693	Labrus_bergylta
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	81	58.772	ENSLACG00000018052	PTRHD1	95	57.600	Latimeria_chalumnae
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	93	55.385	ENSLOCG00000015890	ptrhd1	100	55.385	Lepisosteus_oculatus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	84.286	ENSLAFG00000014453	PTRHD1	100	84.286	Loxodonta_africana
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	90.000	ENSMFAG00000040267	PTRHD1	100	90.000	Macaca_fascicularis
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	90.000	ENSMMUG00000009598	PTRHD1	100	90.000	Macaca_mulatta
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	90.000	ENSMNEG00000035044	PTRHD1	100	90.000	Macaca_nemestrina
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	86.429	ENSMLEG00000030314	PTRHD1	100	86.429	Mandrillus_leucophaeus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	54.331	ENSMAMG00000021201	ptrhd1	100	54.331	Mastacembelus_armatus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	57.480	ENSMZEG00005021808	ptrhd1	100	57.480	Maylandia_zebra
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	89.286	ENSMAUG00000019251	Ptrhd1	100	89.286	Mesocricetus_auratus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	85.000	ENSMICG00000001578	PTRHD1	100	85.000	Microcebus_murinus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	55.906	ENSMMOG00000015284	ptrhd1	100	55.906	Mola_mola
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	89	73.387	ENSMODG00000015895	PTRHD1	91	73.387	Monodelphis_domestica
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	54.331	ENSMALG00000003471	ptrhd1	100	54.331	Monopterus_albus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	90.714	MGP_CAROLIEiJ_G0017582	Ptrhd1	100	90.714	Mus_caroli
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	90.714	ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	90.714	Mus_musculus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	90.714	MGP_SPRETEiJ_G0018426	Ptrhd1	100	90.714	Mus_spretus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	84.286	ENSMPUG00000014016	PTRHD1	100	84.286	Mustela_putorius_furo
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	82.143	ENSMLUG00000014127	PTRHD1	100	82.143	Myotis_lucifugus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	87.857	ENSNGAG00000016335	Ptrhd1	100	87.857	Nannospalax_galili
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	57.480	ENSNBRG00000009690	ptrhd1	100	57.480	Neolamprologus_brichardi
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	88.571	ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	88.571	Nomascus_leucogenys
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	52	72.603	ENSMEUG00000010482	-	88	72.603	Notamacropus_eugenii
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	82.143	ENSOPRG00000008600	PTRHD1	100	82.143	Ochotona_princeps
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	85.000	ENSODEG00000007805	PTRHD1	97	85.000	Octodon_degus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	91	57.812	ENSONIG00000015722	ptrhd1	93	57.812	Oreochromis_niloticus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	80.714	ENSOCUG00000015432	PTRHD1	100	80.714	Oryctolagus_cuniculus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	83	56.410	ENSORLG00000028768	ptrhd1	98	56.410	Oryzias_latipes
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	83	55.556	ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	55.556	Oryzias_latipes_hni
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	83	56.410	ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	Oryzias_latipes_hsok
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	53.906	ENSOMEG00000017594	ptrhd1	100	53.906	Oryzias_melastigma
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	80.000	ENSOGAG00000000756	PTRHD1	100	80.000	Otolemur_garnettii
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	85.714	ENSOARG00000018052	PTRHD1	100	85.714	Ovis_aries
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	89.286	ENSPPAG00000035395	PTRHD1	100	89.286	Pan_paniscus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	87.143	ENSPPRG00000022961	PTRHD1	100	87.143	Panthera_pardus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	87.143	ENSPTIG00000012136	PTRHD1	100	87.143	Panthera_tigris_altaica
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	89.286	ENSPTRG00000011716	PTRHD1	100	89.286	Pan_troglodytes
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	88.571	ENSPANG00000006781	PTRHD1	100	88.571	Papio_anubis
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	89	54.032	ENSPKIG00000015207	ptrhd1	83	54.032	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	83	58.621	ENSPMGG00000020297	ptrhd1	100	57.480	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	75	59.048	ENSPMAG00000007352	ptrhd1	91	58.621	Petromyzon_marinus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	84	73.729	ENSPCIG00000025242	PTRHD1	94	73.729	Phascolarctos_cinereus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	96	55.556	ENSPFOG00000004468	ptrhd1	95	55.556	Poecilia_formosa
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	89	57.258	ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	56.693	Poecilia_latipinna
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	89	57.258	ENSPMEG00000001321	ptrhd1	100	56.693	Poecilia_mexicana
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	89	57.258	ENSPREG00000017624	ptrhd1	100	56.693	Poecilia_reticulata
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	86.429	ENSPPYG00000012597	PTRHD1	100	86.429	Pongo_abelii
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	81.429	ENSPCAG00000007535	PTRHD1	100	81.429	Procavia_capensis
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	85.000	ENSPCOG00000003110	PTRHD1	100	85.000	Propithecus_coquereli
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	85.714	ENSPVAG00000017514	PTRHD1	100	85.714	Pteropus_vampyrus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	57.480	ENSPNYG00000016755	ptrhd1	100	57.480	Pundamilia_nyererei
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	89	57.258	ENSPNAG00000028214	ptrhd1	97	57.258	Pygocentrus_nattereri
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	90.000	ENSRNOG00000004059	Ptrhd1	100	90.000	Rattus_norvegicus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	88.571	ENSRBIG00000032190	PTRHD1	100	88.571	Rhinopithecus_bieti
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	88.571	ENSRROG00000029627	PTRHD1	100	88.571	Rhinopithecus_roxellana
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	87.143	ENSSBOG00000031751	PTRHD1	100	87.143	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	65.000	ENSSHAG00000005774	PTRHD1	91	65.000	Sarcophilus_harrisii
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	83	56.034	ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.034	Scleropages_formosus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	83	56.897	ENSSMAG00000004450	ptrhd1	97	55.645	Scophthalmus_maximus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	91	57.812	ENSSDUG00000004610	ptrhd1	85	57.812	Seriola_dumerili
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	58.268	ENSSLDG00000006231	ptrhd1	100	58.268	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	84	70.940	ENSSPUG00000002905	PTRHD1	94	68.000	Sphenodon_punctatus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	56.693	ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	56.693	Stegastes_partitus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	97	58.824	ENSSSCG00000040441	-	97	60.156	Sus_scrofa
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	87	55.738	ENSTGUG00000015169	-	89	55.738	Taeniopygia_guttata
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	54.331	ENSTRUG00000007201	ptrhd1	100	54.331	Takifugu_rubripes
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	56.693	ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	56.693	Tetraodon_nigroviridis
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	75.000	ENSTTRG00000015128	PTRHD1	100	75.000	Tursiops_truncatus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	86.429	ENSUAMG00000007305	PTRHD1	100	86.429	Ursus_americanus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	85.714	ENSVPAG00000005556	PTRHD1	100	85.714	Vicugna_pacos
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	65.079	ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	64.234	Xenopus_tropicalis
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	89	57.258	ENSXCOG00000019083	ptrhd1	100	56.693	Xiphophorus_couchianus
ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	89	57.258	ENSXMAG00000024458	ptrhd1	100	56.693	Xiphophorus_maculatus